Map Locations of contig_64033 (7689 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_64033

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73611 3 839 bp MLOC_73611.3 Available Available LOC_Os01g62040.3, FRAME:-3, EVALUE:1e-36, 13101.m06632 protein ruvB-like, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_73611






Contig Sequence (7689 bp)

>contig_64033 7689 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTAAAGAACAACATACTTCCCATCGGCAGGGAAGCACGCTGAAATATTCTGGACCAGCG
AGAAGCAGAATGTAGATCTCGAAAATAAATTCTTAATGACCAAGACAAATGGTAACACAT
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TCTGGGACCAAGGTAGTCATCAATTGGTTGTGAGATGTAGCAGGTGTACATGCTAATGCG
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ATTTCGTAAACGCACGCAAGTTTAACTGTGCCTNNTAAACCGTGACGGAGGGAGTAGTAC
TTTCGGTATGACTATACAATGACAGTTACTCTGCTATCCTATTTTACCCACGCTTAATTT
TCATGGGAATAAACTCTTGATCTACCATAAGATTCCTGATCTCAGCCACCAAATGCCCAT
ATTTCGACTGAGTTAAATTGTCCCCGGCCGTCAATGCCTTCGAAGAGTCTGATTGGACTA
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TAATCTTATCAATGATCAAAGTCAGCCTCAGAAAATGTATTAGGCCTCATATATTTATTT
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GGGCCGGGGTTTTCGGTTGTGAAGCATTGGGACCCCTCGTCGGGCTGCTTGTGCAACCAT
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TTAACTAGGCAGTTCTATTATGGCGAATTAATCAATGATGTAAATCGTTTACCCCATTCC
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TATGTAGCAATTGTTGCCACACTCTATCGCTCGGTTGGCACACTATTGAAGCACTTGGGA
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TTGTATTGATTTGCTGCGTCCATTATTCCCCTCGTGGAGTGAAGTGGAATGCTAAAGATG
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TGGGAGAGAGTTGCACCACCTAATAAGGTGAGATCTTCTAGCGCTTGTACGAGCATGACA
AGAGGAGATCTACATGCGCGCTCCCCCTCCTCGCCCGCCTCGCCACGCCACGCCATGCCT
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GGGTTGTTGTCGACTCGTGCGTGGATCCAATTCATGTGTCTCCTCCCAAATGCGCATATA
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ATCATTGCGCCACCACACAAGTCTTCTCCATCCATCCTTCTGGCGGGCGCCGCGAGAAGG
ATAGCAGGCCTCTCAAACCTCGTCTCTCGTGATACTGTACGGGAGAGGGGTGATTAGTTT
TTTGGGCAGCACACTCGCGCGACTGCTCGCAGTAACTACTTTCCGTACGACGACTTCTTC
CCTGATCTTACGAACCTCTTCATCAACGACATGGCCGACAAGACCGACGTTGGTGGTTCT
GGTCCCGATGTAGAGTATGCAACCTTGTCCTCTGTGTTATCATGCTAGAATTTCTTTATC
TAGTTTGTGTCGTTGATTTGATCTATTCGTCTACTATGCTAGTCTGCATGATTAGTTCAA
TCTCTGTTATTGTCATCATGATTTATTTATTGCTTAGTCATATTAAATCCCGTAGTAATT
TTCTCATATACTCAACAATCCAAAAACTTGATTATAGGCAATTTACTCCAAGTGGTTTTG
CTGCGCATTTGAAGCCGCCCACCTTCAAGGGGGTGCAATATAAGAGGTGGTCTACTGGTT
TCAAACCATGTACTGCTATGACGCCATAGAGGGCAAGCCTGAGGGAGATCTTAATCCTGC
ACAACAGGAAGCCTTTGAGAAGATTGATACCCTCTTCAAGGGCGCCCTTCTAAGTGTTCT
TGACGATTCCATTATGGATTCATATATGGCGTTTGATAGCGTCCAGGACATGTGGGTTGT
GCTCGAGGCCAAGTTTGGGGCATTAGATGTTGGAATTGAGTTGTATGTCATGGAGCAATT
GTATGACTACAAGATGATCGATGATCGCTCTGTTGTTCAGCAAACGCATGAGATACAGTC
ACTCACGAAGGAGCTTGAGTACATCAAGTGTGTTTTGTCGGACAAGTTTATAGCCATAGG
CATCATTGCCAAGCTTCCACCTTCGTGGAATAATTTTTCTACTTCTCAGAAACACAAGAG
ACAAGAGTTTTCTGTTTAGGATCTCATTGGCTCCCTTGATGTTGAAGAGAAGGTGATACG
TATCCAATGTATCTATGATTTTTGATTGTTCCATGCAGATATATTATCATTCTAGAATTA
TTTTTGGGTATTTATTTACCATTTTATATTATTTTTTAGCTCAAACCCGTGTTCTTGCTC
TTTGTGCTG