| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_63378
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_73319 |
1 |
1200 bp |
MLOC_73319.1 |
Available |
Available |
LOC_Os01g27720.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-130, 13101.m02879 protein E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, putative, expressed |
| MLOC_73320 |
6 |
1375 bp |
MLOC_73320.3 |
Available |
Available |
LOC_Os06g45330.1, FRAME:+3, EVALUE:5e-76, 13106.m04771 protein endonuclease V, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_73319
CDS Structure of MLOC_73320
Contig Sequence (10973 bp)
>contig_63378 10973 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGTTAACCGGAATGGAGGTGCCCCTACCAGCTCACCGTGGTGT
ACATGTATGTGCCAGTTTTGATAGTATGCCGAGCACAAAGCAATAAGTTGGTCATAGAAA
AAATGAATTAGAAAAGAAAAAAATCAAAATACAAAATTAGAAGAAAAAAACGATGCTTAC
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TGCCCCCGGGGCATCGTCCATTGGCGGCATTAATTTTTTAAACCAATCAGACGATTGACA
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TGTCTTGGTGAAGAATAGACAACTTCCTTAATATATTGGAGTAAGTATTTTATATTGTTT
GCTCGGCTTGTTGTTGAGTGGGAAATTGAATGTTGAAGGAAGCAGCCAAATTAGGTCTAG
GTATGGAATTCTGAAACTTCATCGTATTCATCTGGGTGGGAATGTGAAAAACTCGAGCTT
CAATTGTCTTGGGCTGTGTACTTCCTTTTGTATTTTACCATGGCAAAGCTGCCTATACTT
ATTGAGATTCTCCAAATGCGGTCTGGCTCTGTCCCGTTCTGAGGCTAGGCTATCCCATTT
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AGTGAGCGTCGTACTTCTTTTTTCTTTTGGCAAGACTGGGGTGTTACTTTTATTTAAATA
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GTTTGAGGAGTCTGAGCTAACTAAGGTTGGGGAGGATCGTGTATTTCCTCTCGCATTCAA
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GAAGTCTTTGGTTAAATTTGCTGTGTTTGTTAAGAAAGACAGTGCTGAATATGGGATCAA
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TGTGGTCTGTCTTACAGAACCAAGAGATACAACTGTTCTTCCATGCAGGCATATGGTAGG
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TAAATATAAGACCTTTTATAGATTCCACTATGAACTATATACGGATGTATGTAGTCATAT
TTTNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGCTCCGTATCTAGTCTATATTGAAATCTCTAAAAG
GTCTTATATTAAGGAACGGAGGGAGTAAAAAATTGGAGGTCATGATTGTCATAATATGAT
ATTTTATACTATGTCTCTTCTAACATGTACAAAAAGCAACGATGAAAGATGATTGCTGGA
GGTCATTTCACTGTTTAAGACATCATTCTATTTTTAATAGAGTTAGTATCAGCTTTGTAT
AGTTCTTGATTCTCATTTCGTTGTGGAATTTTCTGTATTGATTTTTGTTAAACTGGGCAG
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TGTAATTTGGTAGGAAGTTAGGAGTTCAACATAATAGGATGACTAGTGAGCCCCATGCAT
GTTCATCATTGCATATTTAAAATCAGAAAGTACCTACAGTTGCTGTGCAGTGCACCCAGG
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TCGCTATTTAGCCAGTTACTTGTAATATCCATTTCTACTTCTTTCTAATTTCTTCGATGC
TTGCGATTTTGGCAAAGATATATCTTGCATTGCTTCCATGCTTTCCTGGAAAACTGATTC
ATAGATGGACGAACTACTACAAAATGTACTTGCATGTAACAATAGTTTGAAACACTGCAA
AATATTCATAGTTAGTACAGATATGACCCATATGGGGCATATATGTCAGTGCAGCATGGT
ACAGTATATCAACTGCAAACTGTCCCCTAGCTTGAAACCAAGACAAGAATATTATGTACT
TGCATCATGTGGCCAACGTTTCTACCTTTTGTCATACATCCAGCAGATCTCCTCAAAATG
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GTGTGCTCAGACATTAAGGTTCCAGACCAACAAATGCCCCATGTGCAGGCAGCCTGTTGA
GAGCCTTCTTGAGATTAAGGTTGACAGCATGCCCAGGCATCATCAAGGAGGAGATCAGTA
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ATATATCGTGTGTTAAAATGAAGTTACCCTGATTTCGGCAAAGACCATAACGTGAAAGGT
ATTACACTGAGTTGACCGTGATGTTCTGTTTGTGGGCGACATGGAATTTAAAACGCGCAA
CATCCCTTGTCTTGTCTTGAGCTTTTAAAGTTTACCATCTTATGCCCTGTTTGGAACCAC
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GTAGATTATAAAAACTAGATGGACAGATTATTAAAAATTCATAATCTACTCTACCCCAGC
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GCAATGTAAAACTTGGATTACAGTTTATATAATTTGACCTCCAAACATGTTCAACTAGAT
TATTTTTATAAATCAAATTATATAATCTATTTTCATAATCCAGATTATCATAATCTANNA
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AGAAAATCTGGTCGGCATAAATATCTAGTGATCTTGTTGATTAAGATTAAGATGGGATTG
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GCATTTTCTCAACTCTTGTCAGTCTACTCTACAACTATCAACTATAATACCTTCTCAAAA
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TGGCCCATTGACCATCAAGTTATCAAGCCATGTCAGCAAGAAATTCAAAATTTTCAGGGA
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CTCAAGCCCGTCCCAAATATAGTCGGGAGGCCCGAAAGCCCGACCCAATGATGTTTATCT
GTGCGGTCACGCGTAAGCCCGACCCAAAGCTTGAAAGCCCGACCTGAAAACTGCATAAAT
GAAAGCCCGATCCCGGCCCGAATATATTTTTGGGCTGCAAAATAAAGCCCGAGCCTGGCC
CGGGTTTTTCGGGCCGGGCTGCCCATGAACAGGTTTAGTTGAGTGGCCGGTTACAAGAGT
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TTGAGGGTTGAAATATGTACTTCTTTTGAAAAAATTTCCTAAGCTGAAAAAGGAGCTGGC
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TATCAGCCCAAAGCCCAAAGCCCAAGCAAAGCCCCCCAAAAAACAGAAAGAGAGAGAGTC
GTCGGCCTGTTCCCGGAGAGGAAAAGCTCGCCGCCGGCACCGACGGGGCGCCCCCGCCGT
GACAGGTGAGAACCGCGGCGCGTTTCTCGCTGCTTGCTTCGCCCGTCCGTTATCCCGCCG
GTCCTAACCGGAAGCCACCGCGCCGAGTAGGCGCGCGCGTAGCTGCTGCATAAGCCGTCG
ATTTCCTCAATCCCCAGCAGCGCTCGTTACCGAATCGCCCGATCCAACTTGAAATTCCTA
GGTTTCCACCATCCCCCGAGAGCTCCGAACCACCGTGCGGGCAGGGACCGGAAGGGGGAT
GGATAGAGGAGGAGACGGCTCTGATCTGGAGCTACAGAAGCAAGAATGGGCGAGGTCTGT
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TGCTCAAGGGTAGGCTCGTCCTCGAGGATGATTTCGAGTGGTCTTTACCTTCGGTGAGCC
CGAGCTCGGATCAGAGTGGTGCCAGGGGCAAGCTGAAGTACATAGGGGGGGTCGACATTA
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CCTTGGGAATTGTTCACGAGGAGTTCGATGTTGTCCGAATGCAAGTTCCGTATATCGCTG
GTTTTCTTGCTTTCAGAGAGGTATTGCACATAATACCCGCTTCTTTTCGTGAATTTGTTT
GGAACCGAGAAAATTGAGACGCGTGTACTTTATCCATGGTAGCGGCTTTATATGCACTTC
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TGTTGTGTCACTGAACAATCTTGTCTTACTTGCATCAGTGGTACAAAGTTTATTATGTTT
GGACAGTAGCCTCAAATGCGCAAACCAGGCTGAAAAATTCTGACTCGATCAGTGTTATTT
GGTACATGCTCCACATGCCTTCAGCTTATTGTTATCTATAGAGTCAGAAGTGAGTCTAGT
ATTGCCAGGGCAATGTCTAGTTATCATAGAGCATAGGAGAGGCAATCGTGATTGAATTTG
CTTCCTTGTTTGGTTTCAAACATCTGTGATCATTTATCTTTCTTGTATGCTTTCAGTTTA
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TGGTCTCCTGGAGAAGATTAAGATCAATGCTCATCATTTCTACCCTCAGGTGAAATACAA
TTATCCTTTTTGGTGCTTGCAGCTTCACTAATCTTAGATTTTGTGCTCTGTATTTAGTCA
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GAGAACAAAAAGTACAGTACTATTCAGGCAAATAATTCGTTTTGGATTAAAATCTCATGT
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TCTTTGCCAGTGCATTTTCTAAGGTTTATCATTCTGCTTTGGCAGTTAGTCATGGTTGAT
GGAAATGGGTTACTCCATCCACGAGGTACAGTCACACTTATGCACTCTTTACAGTTCTCA
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TGTCATCTCGGTGTCCTTGCAGACCTGCCGACCATCGGAGTTGGAAAAAATGTAGGTTAA
CTTTACTGCTGTTGCAAGTTTTTTTTTTGTAGTGTCTCAAGTTCTTCTCCTACAGTTCTA
CTTTTAGGGAAGACTAAATCCTCAGTGTTTTCAATGCCCCAGTTGCACCATGTGGATGGT
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GCTCTGGTTCATCGAGGCCAATCTACATCTCAGTTGGTCATCGCATTTCGCTCGACTCTG
CCATTGGGATAGTGAAGTATTGCTCTAGATATCGTATCCCAGAGCCCACACGCCAGGTTG
AACTTCAATAAAATCATATCTCGAGTTTCCACACGTCGACAGTTGTATTTTGTGTACTAA
TTGGCTATCATTATCCCAGGCTGATATAAGATCAAAGGTATTCCTCCAAAAGCACCAAAG
ATTACAGCAGTAACAAGAGTTGACAATGGCAAACAGTACCTTTGGCAATCATATATTTGT
TGTAAAATTGGACCAAATCATTTTTATAAAATACTATGCCATATTTAATGTACAATTGAC
GAAAAAGCCATTAGTTGAAGAACTTTTACAGCTGTGCGATAAAAAAGGTGTACGTGTGTG
GGANNNNNNNNAACAGCAGGAATTTGACCTACGAGCGATGCTGTTTGTAACCATCAATGA
TTGACATGCTCTTAGTAACCTTTTAGGACAGACAAACAAGGGGTACAATGCATGCACGCT
CTTTAGATGAGACTGAAAGTATATATTTGGACAAATGCAAGAATAATGTTTACTTGGGAC
ATCGTCGATTTCTTTCAAGTAGGCATCACTTAAGAAAGAAAGGCAGACATTTCAAAGGTG
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AGGATTTACAAGTAATCTTTGTAAAGGGTCCTCTCGGACAATCTGTTTCAGATGACGGTG
AAGGACACGCACCCATGTGGAAGAAGAAATCTATATTTTGAGACCTACCTTATTGGTGTT
TGAAGAAAATGAGATTCTTGATTCAATGACGACAGAGATCTGCCATTTTATACAACGGGA
GGAGATGCGATCGCAAAGGGATGCGTCGGTTCCAGGAGAGACAGAGAGAGAACCGTCGTT
GCGGGAGGAACCGCTTGACGGTTGGTTAAGGGGAGATTTTCCCCTAATTACAT
