Map Locations of contig_63064 (11596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_63064

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73156 3 1132 bp AK252056.1 Not available Available None
MLOC_73155 2 2627 bp AK252056.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_73156






CDS Structure of MLOC_73155






Contig Sequence (11596 bp)

>contig_63064 11596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCACATGGAAGTCATATAAATGGACCTTAATGATTATTTCTACTTACCATTCCAACATA
ATTTCTTTATCTAAAAGCATTGCAAAATTTGCATGCTTAGCAGAATGATTAACCACACTC
AAAATCATGTGGTTGAGATTCATCTGAATCACATAACTTGATTTATCAAGATGCGACTAC
TTGTATTACTCAATACCTACAGGTTATATGAAGAGAAATATCATAAATCACATTGCTCGA
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GTGAAAATCCAACAGATTATTCATAATGTCATGTTCATCTTAATGAAATTGGTATGATGC
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TTCTCATATTAGTTATCAAGAGTCAATAATCACTATATGTTGTATACTTTTCTCCTTATT
TTTTCCATTGGGTATAAAGGAGTTTTAACAACAGGTCAAATACTACTCTCCTCGTATTTT
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TAACCTTAGTCATAATCAATAAGAGAATGTTCAATCATTTTACTTTTACATCTACTCCCC
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TCCCCAAAATGCCATAAGCCCCGAGACGCCGCCGTCTCCCCCTTAAACCCTAAACTCAAT
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GGTTTGATGGCGGTGATTTCGGCGGCGAGAGGCGTGGTGGTCGGTTCGACAGCGATAGGC
GTGGTGGTCGATTCGGTGGCGATAGGCGTGGTGGTCGATTTGGCAGCGATAGCCATGGTG
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GGTATGGTGATTTGGATGATGAAGAGTCTGGGTTTGGGTCTCCCAGGGGAAGACGAGGTC
GTGGTGGAAGGACATCAGGTTTGTCAGGCAGAGGACGCATGGGAAGCGACCTGGATGATG
GCGAGGATGACAGCGGTGAAGAAGTTGGCTTTGGGTCTCCCAGGGGAAGACGAGGCCGTG
GTGGACGGACATTAGGTTTGTCAAGCAGAGGAGGCAGGGGAAGCGATCTGGATGATGAAG
AGGATGACAGTGGTGACAAAGTTGGTTTTGGGTCTCCCAGGGGAATTCGTGGCCGTGGTG
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ATGATGATGATGATGATGATGATGCGATTGAGTTTGGAGCTTCTGGTGGAAGGCATGATC
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ATTCGTATTTGAGTCAGAGAAGGTAGCTCTTGCTCAACCTTTCTCTAATTCACAATAAAT
ATATCCTGCCATTGTTATGGAATGTTTCTGTATGTGTTGTGTATTGTTTTCTTTTCTCTA
TGGCAACTAGTTAGATTGTTACTTTGTGATCATATATCCGTGCATAGGATAGATATGTTA
GGTCGTGCATATATTTGAGTTGTGAAGCGCGTGAATGGCTGCTTGGTATCTCGGGTCTTT
CTTATTCACTTTTGTGATATTTGCCTAAATGTTAGTTTAACAAATAGAGTGCTTTCATCC
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AACTTGGCCGCAGCCTCCTATCCTTGGAAGTGCAAACAGATATTTAGTATTTGCCTGTTG
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ATCTTAATCTGGTTTGATTTCATATAGATGCATTAGTTGGCTTTGTATTGGAAGTTATCC
TTAATTCTAATAATTTTTAGGACCTTAGGCCAGTGAAGAAAATATATCTTGTTCAGAGTC
ATGCTCTACTAGAAACTGTTATTGACTACCATCCAAGTATCATTATCTTCTTAGTGACTC
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GAATGGACATATGAAAAACAAAAATGGAGGTAGTGTCTATTTTCACAACCATACCATAAT
TTGAGTTGCTTAATGATTCTTTTCTTAGTTTTTAAGATGTTATTTTGTGACCCCACCATG
TGATAAGAAAAATAAAATATGTGCTATCATTATGGTCGGATTGTTTTGGCTTATTACGTC
CTTATGATCGCTAATTGGCCATCTGCATTGTTTCTAAATAGTTGCAGACATGTATTGAGA
TTTAAGAGCATATGTGCTGATAACGCAGCTATCAACCTTTTAATCTCTAATGCCCTGTCC
TGTTGGATTTTCTTTCGTTTTACATCACAGGTTTGATGAATGTTCCCTCTCTCCTGCGAC
GTTAAAAGGTGTTAAAGCTGCTGGTTATGAACGGATGACTGCGGTTCAGGAGGCCACTCT
TCCTATTATACTTAAAGGTTACCAGTGCTATTTGTATACGTGAACAGTTATGATTTTACT
TTATGGTATGCATATCTTTCCCACGTTATGACTCAACAGGCTATACAAAGGGATGAACAT
TATCCATCACCACTCTCCTTCTAGTATTTTATCTTTTCAATTTCCAAAATATGTCCCCAC
AACTCCCATTTTCTAAAAATCTCTTCCACTGTTCCTTGGTTAATCCTTTTTATTTTACTG
GGTCCCTGATGCCTAAATGCTACCTATTATTCGCTTAGTTGGCTTCATTTCCTTCTCTTT
TCTTCACATGCATTTTTGCACCACTCGCCGATGCCACTTTCTCCTTTGTTTTGATGGACT
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TTTTGGTTACTCAAATATTCAACAGGTTAACTTCAATAACTGGCAGGAGGATTTGGGCAT
TAGACTATAATATGGAAACACATAAGGATTATTCTGTTTGTAGTAATTTCTGTGGTAAAA
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CCACCTCATCCTTCACCAACCACCACCCTCGGTTTTTTTATGTCTCGTCACTGCCACTGA
GGCACAGCGGTATTGTGGACAGAACAAGGAATTGGGGATCAGTGAAGGAGAAGATGCTGG
GGGGAAAGACGACAAAAATACCTCAATATTGACCAATGCTGAGTTTACCCTTATACAGCA
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ATCTTACTAAACAGAACATGCCCGTCAACTCAGTACATACAGAGCATTGCCCATATGTAC
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ATTGCAAAAATCAACACACTACAATTAATATGAAAACACATCAGTGGAATTGACCATATG
GCCTTATAGTGATGACACTTCCCATAGTTTCTCAGTAGCTAGAACTATAAAAGGTCTAGA
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GAATAAATATAACTGAGACAACCTCACTGAACTTGGACATTGAAGATGGACTTGGCGTGT
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GCTAACAAACTTCTTAAATTCCATCCATCAATTGGAGTACAACTTGTAATTGGTGGCACT
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ATGCAGATTCTGGTAGCTACACCGGGAAGGCTTAAGGATCATATGGAGAACACACCAGGA
TTTGCTACTAGATTGATGGGCGTCAAATTCCTTATTCTTGATGAAGCTGACCGCTTGTTA
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ACACTCCTATTTTCTGCTACAGTTCCAGATGAGGTATAATGAGTAAATCCACTCAAGCAA
TCAGTTTATTTGGTCAACATATACTGAATTTGTACTAATTTTAGGTTCGTCAAGTATGTC
ATGTTGCCATGAAAAGAGATCTTGAATTTGTGAACACTGTTCAAGAAGGAAGTGAGGAAA
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TCCAACATGATGCTTATTATTACCATATTCAGGTGAAACAAATGCATTTGGTTGCACCAC
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ACTACAAGGTAATTTAATTGTTGACTTTGTGGTGTTTTCCCTAGTCATTATTATACACAT
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TGTTGCTGAACTCCTGTCTGAACTGAAGTTGAACGTACGTGAGATCCACTCCAGAAAGCC
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TAGTTCTGATGTATCTGCTAGAGGTGTTGATTATCCTAATGTCACACTAGTTCTGCAGGT
AACCAACCTCTTGTATTGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATTTGTCTTTTTAAAGATTCAA
CCACGGACTACATACGAAGCAAAATGAGTGAATCTACACTTTAAATTATGTCTATATACN
NNNNNNNNNNGTCCGTAGTGAAATCTCTAAAAAGATAAATATTTAGGAACGGAGGGAGTA
GTTGTCTATGTTCTTAATTTATTTATTGGGCAGATAAGGATTTTCTTTTCTATTTGCTCT
TTACAACCACCCAGAAAGATATCTTCCACATGAACTATAAATAACTAGTTATAACTAAAT
ATGAACATGCTTATCTTTGTGTCCTTACACATGTTATTATAAATCGGAGTGAACTGATAT
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GAACTGGCCGCAAAGGTAATGAGGGGAGCGGTGTCTTATTGTTGGCACCATGGGAAGAAT
ACTTCTTGAGAAGTATCAAAGATTTGCCTATTACAGAGGCAACACTACCACTAATTGATT
TGGACACTAAACGGAAGGTACAATAGCTCCTTAAGCAGTGCATAACTTATTGTTGGTGTT
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GAAGAAGTGTTAGACCCTACTTTGATTTAGGAATGCGCTGGTTCTGATCGTTTTCCGGTT
GATTTTTTTCCCTCTGTTGACATTTTCATAAATTTCATCACATTAGCCATGGATATGTAG
AAGTAGCAAACTGAACCTATGTCTGGAAAGTCATCACAATATTTTTAAGGCACACAATTG
ACTGAATGTACCAAATAAGTAGAAATATTTTTCGTAAGTGCAACCGTTGAGGGTTGGTCT
CAGGTGACTGAAATAGCAAAATGAACCTACATTTGGAAAGCTATTTACATGGAATGTTAT
CATTAATTTATTTTAAATATTTGTCGAGTTCAATGTGTCATAAATCGTAATGCTATGTTG
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TCGCTAGGCATCTGGGAAACAGTATCAGAGTTGGCTCTTGACCTGAACTGGTGATTCTGC
CCCCCTTCATATTTAGAGTTCTGTTTCAGTTTCAGTTCAGCCATTTCTTGTATTTGGCGA
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GTAGTTTCTTTAACAATATTCAGGCTTATTAGATAACTAATACCACACCTGATCCCATGT
TTGCGATGTACTCCTTTCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTTGGAGGTTCCACTAGTGAACT
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AGACCCATAATGAAATTTCTTAGAAGACTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTAACTTGCAG
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ACCATACAGGCACTTAGGTTTGTTATATGTTTGTTGAACTGATGTAGTATGAATTTCGTT
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TGACAACCCCATATAGGCTCCGAAAAGATATCTCTCACGTTTCGCTTCAATATTGCATTG
AAATGTGAAGTCACGTCTCCAGTAATGAGTTTGAATTACCAGTAACCTTGTGACAGTGAC
GGACACCTAATTGCGATCATTTTTTGGAGATTGATAACTAGCAACTTGCTAGATAAAACA
AAGGTGACAGCCTACTAATCCTGGCAAAATCGTGCGCAGCTTTAGTAAGCTTTGAGTTCG
ATAGCATGTCGTATTAACATTTTTTTCTTTCTAAAATCTGGGTTATCTCTTCTGGCTTGG
AACTTGGGTCCTGAATAGAAGTAAACCTCTTGATGGAAATTTGAATAACCGAGCACATCG
CAAGACCTGTTCGTAAGTGAAAACTTGAATGGTAAATTGGTCATGTAAAATGGCACCAGG
TAGATTCTCAGCTGGATTTTTCAAGAAACGATACAAGCACACCACACTGCAATACCCGTT
GAAAGCATTGCTAAAAAAAAAACCCCGTTGAAAGCAAGCATGTCGGTTAGGACCGGCCTC
ATTTTCCCCATCGCTCCAGACCGGCCTCATTTTCCTCATCGCATCAAGCCGCCATGGCCT
TTCTCGTGGCCCAGGCTGGTAGGCTACGTCGCATCATGTATTCTTAAATAGTTGTAGTTC
ATTATCTATTTTTTCTCTTCATGTAACTATGACACATTATAATCTATTTATATAACCATG
CCACCTCAGCAATCATGTATGTTACTTTGTTTCACTTATTTTTGTGCGTGCGTAGACGGT
CATGTTACAAACTTTTGTAGCATGATCTACATATATTTCTACCTTGTATGTTTGGGGCAA
ATATGTGTAGGTCATGTTACACATTTTTGTTAATAATAGCACCCTGTTTGATTTCAATCC
AATAGATTTCTCTTTTTGTACAACATTTTCTCATATGCTTCATGTACTTCATTGTTTTCA
AAATATATCCCAAAAGCATTCTTATTTTTTTTTTTGCAATACTTTTAGTTTTTTAGCATG
TATTTATTCATGCTTTATTAAGGATCTCGCAGCAACGCGCGAGGCGTCATCTAGTTAAGA
AACAAGTTAATCAGGCTCTTTTATCTCTTAGGGTTGGCTGCCAATTAGGCTAGCCTGGCA
TCCCTATTCTTTTAATAATTTAGGCCAGCTTGGCAAAATTCCTTTTATCTTTGTAAACAC
TGTGATAACTTAATAAAGTACCGTTGGTTTTGGCCCAGTTTCGACGCAAATTTGGCCCAT
ATTCGGCATTTTCAGCATAAATTGAACAATAGCTATTTTTTTATCACATAGTTCATCACA
GAAATCAATACAAATCAAAAAATAGTTTAACAATTCAATACAAATCAAAAATCAACGTAG
GTGTTGTCCTTGAGACTCCATAGGTGCTTCACCAAATCGTGCTGCACTTGTTGATGCACC
TGTGGATCTCGGATATCCTGACGCATGTTGAGGAAGGCGGTCCAGGTTGCCGGTAGGTGG
TGATCAACCTAGGCAAGAGGACCTTGCCTGTAATATGGTTCAGTGTCAAACACTAGCTCC
TCGTGGTCGCTCTCAATGATCATGTTGTGCAAGACAATACAACAAGTCATGACTTTCCAC
ATTTGATCTTTCGACCAGGTCTGAGTGGGGTACCGGACATCAGCAAAACGAGATTGAAGC
ACACCAAATGCCCGCTCGACATCCCCGGACATCAGCAAAATGAGATTGAAGCACACCAAA
TGCCCGCTCGACATCCTTTCGGCAAGCTTCTTGACGCTTGGCAAAATAGGAGTGCTTGCC
TCCCGGTGCAGGATTTGAGATAGTCTTCACAAATGTGGACCATCTCAGATAGATGCCATT
TGCCAGGTAGTATCCCTTGTTGTATTGGTGTCCATTGACCTCGTAGTTAACCGGAGGAGC
ATGGCCTTCAACAAGCTTGGCAATGACATTCAAGCACTACAATACATTGATGTCATTATG
AGTTCCTGGCGTACCAAAGGAGTGCAGAGGAGCGTTTGCAAAGTAGTCGTCGTAGAGCAA
GCAATAGCCTTCTAGT