Map Locations of contig_62992 (9610 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_62992

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73113 2 2021 bp AK368631 Available Available None
MLOC_73112 1 1230 bp MLOC_73112.1 Available Available LOC_Os05g06070.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-45, 13105.m00646 protein E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative





CDS Structure of MLOC_73113






CDS Structure of MLOC_73112






Contig Sequence (9610 bp)

>contig_62992 9610 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACGATGGAGACGTATCAGTGTGCTAGATGGAAAGGATCCTTAGGGCATGCTTTATTAACG
TCAAGTCGACGCACAACCACCAAGATTTGTCCTTCTTTGGTATCATCATGAGATTAGCCA
ACCACTCGGGGTGGTTTATGTCTCGGATGAATCCGGCCTCTTGTAGTTTGGCCAATTCCT
CACCCATGGCTTGACGTTTGGGTTTGGAGAATCGTTGGAGTGCTTGTTTGACTGGTTTGG
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TATATAACTTGCATTTCCTATGTCAGAATAACTATCTGGGAATATGAGCATATGCCTTTT
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ATATTTACCCAATCCAATCTAAACAACCGGAAGCAATCTACGACGTGCTGATTTCGATTT
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GGGCTGATCTTCTGGGCGAAGGAGGCGCAGTGCCATCTCAGCCTCTCCTACTCGCGCAAC
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AATCAAGTATAATAAATTTCATATGTATTAATATTTTCATGCTCATATTGTTAACTATAA
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TTAGGAATTGTGTTTGGAATGCACTCATGACAAGGTCCCAAAGCTTTTCATGTTACTAGT
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TTAGGTATACAATGACAACAAGTTCGATGTAGTACCGCATGGATGATTTCTGATAGTCAT
ATGGTCAACCATGATGTAATAAATCATTATGTATCTTCTATTCTTAAATAGTTGCAACCC
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TTTTTCTGCTGTTGTCTCAAGAAGACCTGGTCAATGGTACCCTCGCCTCGTACCGGACGG
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TCGGGACCGGCCGGGCTGGCACGACGGTTTATGGCGACGTGCTACCCAACTCCTGCCTGG
CGATGGTACCGGCCGCGGCCGGCGGCAAGCACACCGGCCCCGGTCCCGGAAACTTCTTGG
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ACGCCTCACCGCGCGGTGGTCCCCGGCGCCCACGGGGCCCCGCCCACCAGCGTGCCACAG
GTCCCCCATCCCAACCCCACCCACCCACCGTCGCTGTCCGCTTCCGCCGCGCATCATTTC
CTTTCCTGTCCCCGTCCCCGTCCCGTCCCCTCGCTTCCAAGCTACTACCCTGTCCCTGAG
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GGGGAGGAGGGTTCGGCGGGTACGAGTCGGCCGGGGACCGAAAGTGGTGGCCCTGGCTCG
TGCCCACCGTCATCGTCGCCTGCGTCGCCGTCTTCGTCGTCGAGATGTGGGTCAACGACT
GCCCCAGGCACGGCAGCGCGCTCGGCGGCGGCTGCGTCGCGGGTTTCCTCCGACGCTTCT
CCTTCCAGCCGCTCCGCGAGAACCCGCTCCTCGGGCCATCCTCCACCACGTACGTCTCGG
CTTCCCCTCCCCCTTCTCCCTTCTCCCTTCTGTGTGGTCGAATTGTTGTCGGGGACGGGG
CTGGCCGGTGTTCTACTTCCTGGGTGGGTGTGCTCGAGGTGAATTTAGGCGCGCGGATTT
GGGGATTCGTCTTCAGATTGGCTTGTTTTATCCGCGTTAGTGGCGGATTCGTTGGCACAA
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CGGAAATGTTCTCTCAACTTGAGCTTCTGATTTCCGATGCCTTTTCCTCTTTTGGAAGTT
CGGGAGACAGGGGGTTCTGTCCTGTGATGGCCACAGTTCAGATCTCTCTCTCTCTCTCTC
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GCTTCCACCACTACACAACGCAGACAGCTTAAGCTTTCTTTTATTTGTTGTTTGTGCCAA
AAATAGCTTGCTGAGACAGTCAGGGATGATATTTTCTATACTACCTTTTGCTGGATTGTA
GCCCGTAATTAGGTGTCCAGTTTGTGCTCCAGGCGTAGGATTCTGTGTTATTGTAATCTA
GTAGATGGATTTATGGGAACTGTTTTGACTTTTGTTCAGTGATGTATTACTAATGCTATA
AAACAACCCAAGCTGCTTCTAGACCATGTAGTTTTCTCGTTGACAGTAGTGGCATGCTCG
CTTATTTTAATTGCAACTTGCCATGTTGTAGTATCTCATGAGATTGCAGGTCAGTTACCA
ACCGTTGACAACAAAAGTTAGATGTTTTAGATCATATTTATCTCACGAAGCTACTGTAGG
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TCTTGACTGGAACAAGGTCGTCCATCAGCACCAGGGGTGGCGTCTCATTAGCTGCATCTG
GCTCCATGCTGGTCTCATCCATTTGGTTGTGAACATGCTAAGTCTGCTGTTTATTGGGAT
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GCATCATTTTGGCTGTTCTGTATTCTGCAAGTTCAAATACTACAATAATTTTATTGCTGA
GATGTTGACAGTATGCTTAAATTTTACTTCAGTTATGTAATTAATATTCAAATGTAGATA
GAATTTTTTGATTTTGAGCATTTTTACTATCTAAAAGGTCCAATGGTTAATTACCCTGTA
GCTGTTCTGCATTCTGCAAGTTGAAATACAAAAATAGTTCAATTGCTGAGATGTTGACAG
TATGCTTAAATCTCTCTAGAATCATGTTATTAATATTCAAGTGTAGATAGAATATTTTGA
TGTTGAACATTTTTATTCATTGCACAGAACTACTAATGTGTGCACTGACACAAGTTTTTT
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TCCGCACTTTTCCTACGGAATAACTACATCTCCGTTGGTGCATCGGGAGCTTTATTTGGG
CTGCTTGGTTCTATGCTTTCTGAGCTACTTATGAACTGGACCATTTACTCCAACAAGGTC
TGAGATAAATAGAAACGCACATACATTCTCCTCTATATATTCAGTTGCCTGAACCTGTTT
TTGCTTATCAAATTGATGTGCTACTGCAGGTTGCAGCCATAATAACTCTTCTGTTTATAA
TCGCGATCAACGTGGCGATTGGGATACTGCCGCATGCTGATAACTTTGCTCATATTGGTG
GATTCTTGACCGGGTTCCTTTTGGGGTTTGTTCTGTTGGCAAGGCCACAATTTGGTTGGT
TGGAACGCAGTGAGCTGCCCCATACTAATCAGCCTCCCAAGTACAAACCATACCAATATG
TCCTGTGGGTTGTGGCATTCGTCTTGCTGCTTGTCGGGTAAGTCTGGGAAATCACTCGAC
AGTTGGATATATTCGATGACACCGTGATTTATACCATTCTTTGTACATGTGTAGTCTAAT
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GGACATCAAATGAATCTGATACCAAGAACTCGTGTTGCAGGTTCACGATTTCATTGGTGA
TGCTCTTCAAGGGCAAGAACGGGAACGACGGCTGCCACTGGTGCCACTACCTGAACTGCG
TGCCGACGTCGAGGTGGAAGTGCGATACCTAGGCGGTTCCTTCTTTCGGTTTTCGACGAA
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CTGTCGATTATGTTTGTTCTTTAGCGAATCCTGTATATTTGTTTGCCAGGCCGTGTAAGT
TTGTAACTCGAGCACTCTCCAGTGATTTCCTGCATGTTGTTGTGTAAAAGGCCATATCGT
TTTTGATCCTTGCTTTCGTGTTGGGCCAGGCAGTCGAACAGTGTGGCGCTTGACGTGCTA
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GGTAGAGCGC