Map Locations of contig_62875 (9009 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_62875

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73062 5 1972 bp MLOC_73062.1 Available Available LOC_Os02g33710.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m03658 protein decarboxylase, putative, expressed
MLOC_73063 1 445 bp MLOC_73063.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_73062






CDS Structure of MLOC_73063






Contig Sequence (9009 bp)

>contig_62875 9009 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCACTCCTCCCCAAAAATATCTGTTAGAACCCCACCTTCAATAGCAA
CAATACTGTGGTAAAATCCAAAAAAGTCCAAACTTGTTAAAATAAGTATCTCTGACAAAA
ACAGATCATCCATATTGCAACAAAAAAACCTGGACAACCACTAACTAGTGATTGCCTAAG
AGAATATATCAGAATAGCCAGGAAAAATGGAACATGTGTGAGCACACCTGTTGGCCGATT
GTATTAACAGATAATTCCCAAGGTGAAAGCTAACTATGCAAAAAAAAAAAGTTGAACAAA
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GCCACCGGATTCGGATACTCCGTGAGAGTATACGGTAGGGCGTCGAGCAGGCAGTTCAAT
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ACGGCGTTTGAGACCAAGAGGGATGGTTCAACGCAGACGGAAAACAGGATAGGGAACCCC
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AATTGGGATTCACCCGTGCGGGAATAGGCGAGGAGCGGCTCATCCCTTAGATACTTTGTG
TGGAGGAGTTGTAGCCACAATCCACCCTCGTTACGGAGAATCCGCCATATCCACCGGAGC
ATGAGGGAAGTGTTCATAGCGCGGGAGGCCGTGATACCCTACCCGCCACGCTCCTTGGGC
AGGCAGATATCTGCCTATTTGACCATGTGGTAATTTTGTTGGCCGTCAGCGCCCTGCCAG
AAGAACCTCGCGAGTTTCTTATTGAACGAACTATGAACACTCTCCGGAAGGGTGTACATC
CCCATCATAAACATAGGGAGGCTTGCCATGTTAGCGCTAACCGGCCTCGCCACGGCTCCG
CCTGCGAAGCTTCCCGACCAACGAGGGGATCAAACCCCGTCGCTAGAATCTTCGACTCGG
CTAGCGGCATCTCCAGATACGTTGTGGGGAATGTCGAAAGCTTGCAATTTAGGTTATTGG
CAATCCTAAATTATACTTGCAGAAATGGTACTAGATCTTATGAGCTCAAATAATGACATA
GTACATTTTGCAGAAATAGTTCATGACAATAACAAATATGCTAACCTGAGTACATACATA
GGTTGTGACAAGTATAATTTTACTGATAAAACATACTCCCTCCGTCCCATAATAGAAGAG
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TTTGATGAATCCCTCAACCTCCCCTTTTCACTGCCCTTACAACCAAAAAACAGTGACTTG
ACGTAAAATTGCTCTATTGAGTTTCACCCTAAGCACAGTGTTCACAAATGACAAGCACTC
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TGAATATGGGGCCCAAGCACTGTCAACTCTGCATGCAATGCAACAAGATGTATCTTTCTG
AATTTGAGTAGTCTGTCGGCTTATTGTGTACTTCCACTGTAAAGAAATATAAGAATGTAG
AGGAATGTAGATCTCTACATTCTTATATTTCTTTACAGAGCGAGTACCAACTTGGCATGA
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GAAACCCTAAAAATATGGTATCCCCCGATCTCTCCAAACAAACAATCCCATATGCCCAAA
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TCCTTTCGTTGAAAGAGGGATTGAGAGGGATTAAATCCCCTGCAAGTCAAATTCCACCTC
AATCCTCTCCAATCCCCTCCTCGCCGGGATTAACCGAACAAGCCCTAATTTACCTGCCAT
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GCTCAGCTTGTGTATTGGTCGGCCCTTCCGAGGCCCGAATCAATCAATCAATCAAGATTG
GGCTTTGGAGATCTTGCCGGGGCCCACACGATCACGACGGGCCAATCAACCAAAGCCTTT
TCTTTTCTGCGAGGCACGCACGGGGCAGCCTAATCAACCATACCATATTTCCATCCAGAT
CTCAAATCAAAGCCTCCAACCAAAGCCTCCTCCTCCGCCCTCTCCAATCCCACCACTCTC
GTCCCCGACGCCGACGCCGACGCCGACGCCGACGCCATGACGGGCGGCATCGCCAATGGC
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GCCACCATGGCCGGCGTCCTCGCACGCTACCGCCGCTCCCTCGTCGAGCGCACCAAACAC
CACCTCGGTAAAGTCCCCCCTTCCTCCTCTGCTCGTTCCTTTGATGCAGTGAAGAATGAT
CCGGTCCGATTAGTGTGGTGATACAGTGATCCTAGCCCCGATTTATGCTACTCACTTCGT
TTCATAATTACTGTCGTGGTTTTAGTTCAAACCACGACAATAATTATGCAACTGAGGGAG
TACTCCCTCCATTCACTATTCAGTATTGTAAGATGTTTTATGGAGTCGCTTTTTTTCTGA
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TCTTATAATAGTGAAGTATTTGCCTGTTAACCTTTTGGTGAGGAGGTGGAACGTGTATTG
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ACTTTTATAGCCATCTGCTTCCACTCTTACGACACTCTCATCTGTTTGCATGTAGGCTAC
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AACCTGGGCGACCCATTCATTGAGAGCAACTATGGCGTGCACTCGAGGCAGTTTGAAGTG
GGTGTGTTGGATTGGTTTGCTCGCTTGTGGGACCTGGAAAAGGATGAATATTGGGGATAC
ATTACAAACTGTGGCACCGAAGGAAACCTGCATGGGATTCTTGTCGGGTCAGTACTTACA
ATATACTGTACTACATATATAATATAGACAGAGATATACCTCTTGTTTCTGAAATCTTAT
TTACACCTACAAACTGTTTAACAGAAGAGAAGTTTTCCCTGATGGGATCTTGTATGCCTC
TCGTGACTCCCACTACTCAGTATTCAAAGCAGCGAGAATGTACAGGATGGATTGTGTCAA
AGTGGATACTCTTGTCTCTGGAGAAATGGATTGTGCGGATTTTGGAAGAAAGCTACTTGA
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GTTCAAGGATCGGTTTTATATACACTGTGATGGTGCTCTGTTTGGTCTGATGATGCCATT
TGTTAAGCTGGTAGCTCTATTTTTGCCCCCTAACGCCATATTGGTTGCTTCTTTTGACAC
ATTGTTTTATTATCCTTGATTTTATTATTGCTGATCAACAGGCACCTAGGGTATCCTTTA
AGAAGCCCATTGGGAGTGTGAGCGTGTCTGGTCACAAGTTTGTTGGATGTCCCATGCCCT
GTGGTGTCCAGATAACAAGGTTGAATCACATAAATGCCCTTTCTAGTAATGTGGAGTATC
TAGCTTCACGTGATGCTACAATCATGGGAAGCAGGAATGGTCATGCTCCCATCTTCCTAT
GGTACACCCTGAACAGGAAAGGCTATAGAGGTTTTCAGAAGGAAGTTCAGAAATGCTTGA
GAAATGCACATTACCTTAAAGATCGGCTCAAGGATGCTGGAATTAGTGCGATGCTTAACG
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AGCTTGCTTGTGAGGGAAGTATATCACATGTTGTGGTAATGCCCAGTGTCACTGTCGATA
AGCTGGATACTTTCTTAAATGAGTTGGTGGAGAAGCGAGTAACCTGGTACCAGGAAGGAA
AATGCCAATCTCCTTGCATTGCAGCTGATGTTGGCCAGGAGAATTGTCTTTGTACTCTGC
ACAAGAAATAAGTTTGTCAGGGGACACTCTGTGAGTTCAAATGTTGGATACTTGAGTATT
TACATTGGTTGGTGTCGTATTTACCACCTCCCAATCGTGCATCCTTTATTGTTCATTGTT
GTCATGGACTCATTTAATGCTAGTCCTCGCTTTATATCTATACGAGACAGATCTTAGCAC
AGTAGCATGCTGAACTCTATGTGTTGTATTCATCGTCCGTCTTCCATCTATTCTTCAATA
AAGTTCTGTGCAAATGATGTATCCAAATGAAGTTACTGGTATCTTGTCCTGTATCGGCAT
GCCATATCCGTAACATATCTTGTATGTTTTACAAAGTTTAGCAACTCATTAGCTAGCCAT
AATTTTGACAAGACAGAATGCTTATCGCTATGTTACCTTTTTTCAGCATGTGCTGACGAA
CATATGGTTAAAATTTGAATCGATTTAACTAAGGACAATATCGTCAATTTTTGTGTTCTT
GAGAAATAATGGGTGAATGGCACATAAAAATCCAAAAGAGTCCTAACACAAGAACATCCT
TTGCACATTTCATAGTAAAACTTAACTATGTAAAGTGCATTTATCCTAGCACTAACTTAG
GACTTATTTATTCTTTCATCCGTGTTCTGGCAGATTGTGGTGTAGATACAGGTGATAAGT
AGGAATGCCACTTTATGCATAAATGGCCTACCACTAGCAGCAAAAGGGTAATCTATCTAT
CAGATGGTCGGATAAGGTCAGATGTCTAGTGTGGCTGCCTCTCCCTGTCTAGTGTGGCTG
ACTCTTGCATAGAGCTACTTAAGTTGACCCATGTCAAATATATCTGTGTTCTGACATTGG
ACTCTTATCCTAACCCTAAGCTTTCCTAATATACTACTGACTGCCTGGGCGGCTGGACCT
TCTAACTGGAATAGGGAGTACACACAATACCATACAATAGACTGCCTTCGTAGGTGTTTT
TCAGTTTACAACTGATATGGGCCTTAGATTTATGAAAGATAAGCTAACTAGAAAAAGACT
GGAGGCTGCATTTTGCAGGGGTAAGAGTAAGACTAGGTTCCTATAATCACTCCCCAGACC
TCATCTTGTGTGCTAGCTCTATGCACTCGGTCTGTCAAACTAAGCTCTTTCACCATGCAA
GCGATGAGATGCTGCCTCATAAATAAAGTAGGGATATAATATGTCAGTGCCTCTTCAATT
CAGGTGATCCATCTCGCATTTGCTGATAGAGTTTATTACTTGTTTTTTGTTGTGTTTATC
AGTTCATGCTCACCTTAGCCCAGGTGATACTTAAATAACCTGTGGATCAGCTTTCACCAC
AGAGTTCTCTGAGCCTATTGTGCTTTGTTCTTCTTTTGACTGTTAGTCACACCTGATTAT
TTATATGCTACACTTCTGATGTTCTATGGCTATTTAACCTTGTATTGTTATGATAGTTGG
TACGGATTAGATAACAACGGTATTAATTCTTCTGTTTCTTTTTTAAAATTTCCTGTTTGA
AGTCTTGTTTTCGGAATTCAATGTCTTATGAAGCAAAACAAGGATAACAGGAAAGCATTT
ATATGTATGTTTACTACGGTGAATGCTTATATTAGAACTATGATGAATGTTTGCTTATAT
TTAATATACCAAATGAACACGAAAACACTGCACATAAAGAGCATTATTGTCACCTGACAT
TTTTCTTACTATTCATGTGCACTAGCTGAATAGGGTCTGCTCTATATATGCTTATGGGCG
GTGGTGGGGGCAGTGCTCTAGGATATGGCTGGGTTTTCCAGATTTGTGATTGAAGCAGTT
TCATCAAGATGCATAGATTCAGCTTCAAAAAAAATGCAGGCTGAAGGGATAGGAGGTGGT
ATTTTCACCTTCACTTACGTACAAGTATAAAGAACCCACTTCATGGTGCATATTTTTCGA
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TCACTCTCCAGTCCGGACAGACTTCTAACAAATGGATCCTTGTCCTAACAACATTCCCTT
TTGTCTCACACCCACTCTCATCATGTCGGTTTTGCTAATCGCTGCCACTGGATGATGTGT
AAACCCCCCACTATCTGGGTATATCATCTCTCATCGCTGTCTAGTATGGCTGCCTCTTCC
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GCCTAATATAACACGGTTGACTTGACCCTATTCCTTATATCTAGTATATATCTGCTAACC
TGATGTGGTGCAAGAGTGTGTTGGCAAGGGCTAACTGCATTAAAGGAAATTGCGACACGG
ACTTTCTTTCCGTTTATCGCAGCAAGTTATCTGGAGCAGCATTCATCAGCATCCATACTT
TTTACATTGATTTCTCTTTCTTGTCATGGGTTGCCTTTTGTTCTTTTTGTTGTACATGGA
CCGAGGCTATTTCTCCTGATGGGTAACCTATAGATTTGAGGCATTGTGCTCTTCTTGTAA
CCTGAATGGTTAAATATACCAGGTCTAAAAGGCACAAAGCGACTTAAGATAAGGTTAAAT
TAGGGGCAGCTTGGAAGGATCGCATGATTTACACGTAGATGTCTACAAGTTCATCACTCA
AGAAGGCCTGGTGCAATGGTCAGAGCTTGTGGCAAACAGTTTATGTGTACGTTAGAAACG
AGAAGTTGGACCCATTGGTGCGTACTTTCTTGACATCATAAGAGAAGCTCATAGGATAGC
TTTGGTCTTTGCAGATAAGCATGAGTAGAAATTAAAAACAGCGCCCATGGGCACTAACAG
GCTGTTGATTATCCTACTGAGCTGACCCTTCTGATCTGCGTGATGCCTGTCAATGCTGTT
GCCTGAATTTCATTTTCAAAAATCTTCTCGCCATTCTACGATCTTGGGCGTTACCTCATG
TACATTCCCTAGTCCAACTGCCGCAACATTTGATCCTTCGTCATCCTAGGGCCAGGCTCA
TCTGAAGCAACCAAAGTCCTTTAGTTCGCAACATTTGATTATTATGTACCGTATTTGACA
TGGATATTTGCTAACGGATACATATTTATGAAACACCCCTCCTCGTGCTTCATTGTTAGG
GTACTCTGAATTGTGTCTAGTAGCTTTACTAAAGTAGTAGCTATTGTCATGATACACTGA
TGCACAAGATCTGAGATGTAACTGGCCTTGATACAACAGAAAACAGCAGCCATTATGGTT
GTAACTGTCAGCAACGTGCGAAAGAAACATACGTTTTGATGGAGGAAGCAGCACTCATCA
TGGTTTATATATGTATGATGATGCTTCGTTGCACACCATATAACTTAACTTATTTTTTTT
TATGCCAGAATTGCTTTGTTCTGGACTAATCAGTCATCTAAGAGGTGCTTTACCCACTAG
GACTGCTGCTGATGACCCTAGTAGCAGTAGCTCTCATTTGACAAATCACCCTCCGGTTTT
GCTAGCTGTGCTGTATGGCTGATTCTGATGCACTCAAAGTGGAAAACTGAAGAATAATGA
TCCTCCTTTTTCCCTTCCTGTCTTAGTATTCGCCGCAGTCCTTATCGTCTCTGTAGCCGC
ATAGTTAATTTCAAGTTGCAACAGCTATGTAAATCTACACCAAGTTGCAGTTGATTCTCC
TTGGATCAAAATATTTGCCGGCAAGTTTCACGATCTGCCGGGCTAATTACATTCAATAAC
ATATCCAGAGTGCACTTTCCTGCAGTTATGAGTAGTGTTTCTGTAAACTTGCAGGAATGG
CTTGGCAGTAAAAAATTGTTGTTCTCTTTCAGTGGCTTATTTAATGGATTTATGCAAGTA
ATGCCTCGGCACTGTGTTTTCATATGGAACCAGACAGGGTCTCATTCCATTTTATACAGT
TCCGATCTCCCTGCTTCTATATGTAGCATTATTAGGCAGACAAGGCATGGTGCTCCGTAT
GGCCCTCTGATTCCCAGAAAACGCACCGAGATCAGATGCAGCCCACTTGCCGCGACCAAA
TGAATTTCCAACTCTGCACCTTGAGGCCCTGTTTGTTTCAGAAGTCTCGAGACTTTTTTT
TTGTCTCAACTAAAAACTCCCTAGTCCCTATCCGTTTGTTTTTTGGACTAAACATGGATT
AGAGGTCATTAAATAACATGCAAAAAGACCATGTTACCCCTAGTAATATACTACTCCCTC
CGTTCCTAA