| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location | No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_62612
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_72916 |
2 |
793 bp |
AK374713 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_72916
Contig Sequence (4586 bp)
>contig_62612 4586 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGCACGGTTTTTCTTTCGCGAGAGACACGGCCCGTGCCTTTTGGAAGGGGAATAAACG
TGTTTTCTGTTTTTTTATATCGCGTGAGGCACGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTTGTGAAAA
AAAAATCGTCAAAACCTATCAACATGGATCTAGTTTTGAAGATCTCGACGCGAGAAAGCC
AACGGTGAAAACAATTCGAGATCTGGATGCACGGTTTATGAGATAAAACGTTTTGAAATA
CGGATCTACGAAAAAAGGGAAAACTTCAAGGTTGCGACAAGTGACACGCATGCAGTGCGT
CACTTGTCGCAAGCTGTGAAGATGAGACTAATCGTTGTAAGGTGTATTCGCTAACTAGTG
ATTCCACGTGGCTTCGGACTCGTTTAAGGGCGAGCGAGTTGGGCCGGCCCACGAGTGCGG
CAGACCATAGCCTTTTTTCCTGCATTTTCCCCGTTTTCTGTTTTTTTACTTTAAAATATT
CTAAATACATACTTCCTCTGTCGCAAAATAAGTGACTCAATTTTGTATTATAATTAATGC
AAAGTTGAGTCATTTTGAGTCACTTATTTCGGGACGAAGGGATTATATTATAAAAAACAT
TCGAAAATAATGTTGATCATGTATATAAAACGTTGAACAAGTATTTGAAATGTTGAATAA
GTATTTCAAAAAAAGTTGAACAAGTATTTGAAAGAAATGTTGAACAATTATTTGAAAATA
CTAAACAAGTATTTCAAAAAATGTTAAACAAGTATTTGAAGAAAATATTGAACATGTATT
TGAAAAATGTTAAACGTGTATTTAAAAAAAATGTTGATCATGTGTTTAAAAAATGTTGAA
AAAGTATTTGAAAAAAAGTTGAGCATGTATATAAAAATGTTGAATAAGTAAATAAAAATG
AGCAGTATTTGAACAAAGTTAAAAAAATATTTGAAAAAAATAATGATCATGTATGTAAAA
ATGAAAGGAAAATAAAAATAACAGAAAGAAAGGAAAATGTGGAACAAATATTTTAACAAA
TGTTGACGATGTATATAAAAATGTTGAACAAATATTTCGAAAATGTTAAACATGCATGTA
AAAAATATAGAATGGATATAAAAATAAAGAAAGAAAAAACAAAACATGAAACAATTTGGA
GAACAAAAAAAGAAAAGAATGAAAAGTCAAAGAAAAAAAAGAGAAAACAAAGAAAAACCG
GGGAAGACCGGCTTCGGCCGCCTCTAATAGGTCACGATCCTACTACTAACCCGTAACTAG
AAACTAGCGGAGTGGTTAGTCACGCATCACCTTGTGGATGAGGGTTTGATCCTTTGATGT
GCTTCAACCTTCACACGTTAAAATGGGTTGTCTCGACACTCTTTCCTCGACGCGAGACAT
TCCACAGAATCGTTTAATGCGATAAATAGTCAATGCACGGCCGGAGGGGATTTGAGGGAG
TGAAGATGCATCTACACAATGGCTAGACAGTGTATATGTACAGAGGCGCCCCGAGCCTCG
AGAATGGCGTTGCAACGACCAAGCTCCATGGAAGCTCGTTGCGCAAAAAAAAAAAAAATC
AAAATATATTTAGATGTTTCAAAAATGTCAAACATTTTTCTACAGACACATATCCATATC
CTTGAAGTAGGTATATCTAGTTTGATTATTTGCATGCCACACAAAAAAGACAAATATCTA
GCCCAAATACAACAAAGGAAAAATCCATTTTAACATGTGTACTTCCTTCGTCTGGAAATA
CTTGTCCTAAAGATGAATGTATCTAAACTTATTTTAGTTATAGATACATCCATTATATTC
ATTTCTAGGACAAGTATTTTCGGACGGAAGGAGTATTTGTCTTTTTTGTGTACATCACAA
ATGAATATATATGTGCATGAAATTTTGTACATGTACACTACAAATATATGTTTATCCATA
TACTTCCTCTATCTCAAAATACGTGATTCAACTTTGTACTAGGCTTAGTATAAAGTTAGT
ATAAAGTCGAGCTGGCCTCTGCAGGAACTTTTCGCCCGAGCCTCCTCCTATAGACATATT
ACCGCCCAGGTCCTACGAAGATCAGCCCAGGTAACCCAGACCACAACGTCCCGCGGAACA
AACGAAACAGACGAAGAGCAAGTCTAATAAGTCCTAATAAGCAGAGTGTTTGCCATGTCA
TCAAAATCTTACGTGGTAGAGAGAGAAGGGAGGAGAGAGATTGAAGCGGACGCTTCGTGT
GTAGCCCGGCTCCAACACTGCACACGAGAAAAAAGTTTGCATGCAGCCTCGGTTGCCTCC
TTTCTTTCATTCATCTCTCTTCATTTACATGCATGCATTAATTGCTTTGAATAATTAATA
GCTCATCTACAGTCAGCTTACTATACAAGCAGACTTTTATACAAACTTTAAGTGACATGA
CACTTTTTATAGCCAGCAGCAAGCTTTGTTATTAACCATGCTCTAAGTGGAGCGAGGCAT
GGCGAGGTTAACGAGAGGAAGGGGCGGACCGCGCCGCCGCGGCGCCTCGTTCTCGCCGCC
TGTCCCCGTCTCGGCAGCTCCGCCGGCCGGGCGGGTCCCTACTCTAGTACCTCCTCGGAC
CCCCACCCTCGCCTCACCCCGCGCCTTCCCCGCCTTCTCCGCCGCGATTCCCTGACAGAA
CCTCGTCGGCCTCTCCGCTGCGCCGCCCCGCGATGAAGCTGAAGCCAGGCATGTCGGCCC
TCGTCACCGGCGGCGGCTCCGGCATTGGTAATGAAAGTCCCCCATTGCCAATGCCAGCCG
CGTTCCGTTCTCTGTAGTCTGTTTGGGCTTCACAGCCTTTTGCCTATGCCTCAAAAGTCA
CAGTTAAATTGATTTTGTGTAGTAGTAGTAGGACAAGAGCTTTCACTAGATATATTGCAC
GGTCTAACACTCCTTGTTTGTTCTTCAAAGGGAAAGCACTTTGCGTTGCTCTTGCACAGA
AGGGTCTAGCTGTGACTGTCGTCGATTTCTCTGAAGAACATGGAGGACAAGTTGCGGCAT
TAATTCAAAAGGAAAGCAAACAGTTCCGTGGAGATTCTAAAGTTCCGTCTGCTACATTCA
TCAAGTGTGATGTTACTGATGCTGGTAAGAGGTATTTTTAAGTGGAAGCGGGTAGTAGCA
ATCAATTGGCTAGTTACAACAGACGAACTTCCTGAATCAAACTTATAGCTTGGCTATGCT
TGATTTAATGGGAAAATGGGTTCAGGCCGGCTTTTGCCCAACGTAGTTTGCTAGAATTTG
GAGGCAACCGTAAACATAACATGAAAACTGAAGTAATTAATCGCATTAGTCTGGTGAAGC
ATAATTAATTGCATTCGATAAATTTGTCAGGCGTAGGATGCAGTATAGTTCATTACTTCG
TTAACATTTGTTTTGTTTCAAGCATCTCCTGAATGAATCACCTAGGATCTTAAATATAAT
GGATTGATAGATATTGGTTTCATAGCTCTCGAGAAGCATCAAATTCCTTTTCGACATGTC
ATCTTGTTGTGGCGTGATCTACTCACTCATGGGCACGGTATTACATGCATCATGGGTTTA
GCCATTAAACAGCAATATAATTTCCCTTGCACTCCATGGTCACACTGATTTTATGTGCAG
ATGCTCTTGCTGCCGCTTTTGGGAAACATGTACACTTGTATGGTGGATTAGATGTCTGCA
TCAACTGTGCTGGATTTGTCAATAAATCCTTAGTTTATGATGATACATCCAATGGAACTA
AGACATGGAGGCGTGCTGTAAATGTGAACCTTGTTGCTGTTATTGATGGTACTCGCATCG
CAGTAAGTCTCATATTGACTATTGGAGTAATTTTGTCAAGTTAATTTATTTAGCAACTTA
AACTATTTGTAGTAACAGAGTGCTGGTACCATCCATTGACACATGTACACTATTTATGGT
TGGATTTGTTCACTGCAGACTCTAATAATGCGTGCACAGAAGAAGCCTGGTGCCATAATA
AATATCGGTTCAGTTGCTGGCTTATACCCTATGCACTATGAACCCATCTATAGTGGGACA
AAAGGTCGGTCTCTCTTCGTGTATTAAGAAATGTACTTAAAATGGTGGTTTTGTTTGTAA
TGTGTAAGCTGTGATGTTTTGTGGTGACTCTCTTTTTCGAATTTAGTGAAGATAAATACG
TAGGCTGGTACTGTAGTGACAGAAGGTATACACTCCTAAAAAATACCTCCTCTGTCCCAA
AATAAGTGACACAAATTTAGTACTAAGTTAGTACAAAATTTGTACTAAAGCAGCGACACT
TATTTTGGGACGGAGGGAGTAGTAATCAAGGTGCTTAGAAGTCATCATGTTGTACTAAAA
TAAACATGCTATATTCTCCGATATCAGGCCATCCTTATAAAATTGATCTTGGTCTTTAGT
GCAGTTGTCTAAACTTATTTTCTTGCTGTGTATGTATCTTAGTTTTGTGCGTTCCTTTCT
TGAACCAAGGTAACAAGTTAGTAATGATCAAAGTTATCCTTAGAATTTTCATTGGAAATG
GCATCCGGAAAGAAATAAACTTCATTGGGGATGGGTTATTTTACTTTACCTTCCACAATG
CTCTACTAAATCCACTTTGCAGAGCC
