Map Locations of contig_62599 (8609 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_62599

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72911 1 335 bp MLOC_72911.1 Available Available None
MLOC_72912 1 2947 bp MLOC_72912.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_72911






CDS Structure of MLOC_72912






Contig Sequence (8609 bp)

>contig_62599 8609 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGTGGCTAGAGGCGGCGGGGGGGCGGGGGAGTGGGAGGAGGGTGCCTTGCCTGGATCGG
GGAGGGTGGTGAGGAGGAGGACGAGGAGGAGCGCGCAGGAGAGCGCCCACTTGCGCATCG
TCGCCGGCCGCTTCACTCTGCCTGCTGCAACCAAAACTGGTGAGTGTTCGTCGCGTTCGA
CCAGGAGGAGATGGCCATTTAAACGGGCGAGGAGGAGACCCCGCACGCCCGGTCCGCGCG
GGCGGGGATGCCGCCACGCGGACGGACGGACGGCCGCGATGCGTGTCGTTCCACGTGGCG
ATCGTTTAGTGGATGGCGTGGGGGAGCTCGACGTGGAGCGCGTGCCCCGGCCGTCCGTCG
GGGCGAGCTGGACGATCGGACGGCGGGGGTCTCGTGGGTCTATTGAAGGGGCGGACACTT
GGCGGTACGGGATTGGTGTGGATTGGGTCGTCGACGTCGACGAGACGCGATGCGCTAGAA
AGTTCCGCCGCGGCTCAGTGGAGTGGATATAATTCGTTCGTTCGCCGGGGTGGACTCGTG
GTGGGCCAGAGGCCGTGATGGGTGCGTCTGGGCCGGCCTGGTCGGTCAACGGGGTGTAGA
CTCGTCGCCGTGCGTTGGACGTCACGACTGAGAGAGAAATTGCTGGGCCTTTCGGGCTGG
CTGGGCTACCAAGAGTCCCGGACCGATCCAGTGCAAAACCACTCGAGGTCTGCTCTCTCT
CAAAAAAAAAAGGAAATAACTCCGGGTCTCCAATGATAGAGCTGCGGCTTTCAGAAGATG
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ATTGAAACTGGTTGAGATCATGGAAGAACCAACAGGCACCCAAAAGTTCGCACAGAACGT
GGTTGTTATTATTACGAATAATTGGTGACACTTTGTTGGGCGTGGAGTATTTGAATAGTA
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AGGAGATTTAATTATAATGATTTTTTACTTACTTATTTATTCTTAAGTGGTAGTACCAGT
AGACACGTTTTTTTCTGAAATTTCAGTAGTGTATATATATATACACAATAATGTATATAT
TTATTTATTCTTAAATTTCAATATTGTATAAATTGTGTGTGAATTTTACATTATTTACTT
TTGTTGTTTTCACTTTCTTTTCTCTTAAATATTAATACCTAATTCATTCCATCTTAGAAA
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TTTCATTATTTCTAAGAAAACTTTATTGTTTTAGTTTTGTTTGGTTTTTCTATTTTGATT
TTATTTCTTCTTAAAGGGATACATTATTTATGAGAAAACTTCATTATTTTAGTTTTTTTT
GGTTCTTTTGTAAGGGTAATATCAATGCCATGAGTTCATTCTTTCGTAGAAAACTTGGCT
TTGTTTCTAGTTTTTATTTCATGAAGTTGCGAAAGACAGATATTTCTAATGTATGGTTAA
TGTATGGAAATTAAAAGATTGACTATTGTGTGGATGTCTTGATTACTGAAGCAGTGGCTC
TCAAATTCGGTCTAACACTAGAAAGGGCGGAATGCAATCGTCTCATTATTAACTCGGAAA
ATATAGACGTGCTTGATATCATGAAAGATGGAGGATGATCGGTGGGTGCGGCCGCGGCGG
CGGCAATCTTCGATGATTGTTTTTATTATGCACGTGATTTTGTAATTAGTGGAGTTGGAC
ATTGTAAAAGAAAAGCAAATAAAGTTGTTTATGCGCTCGAGACTAGACATGGTTTGAGGA
ACCTTTAAATGGAACTGTAATGATACGGTGTACTCCCTTCGCCCTAATATAACTGTTTCA
AGTTACTAGAGCTTTATATTGGAGCTACTCCCTACGTTCCATAATATAAGTCTTTTTAGC
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ATTTGAGACGGAGGGAGTATGGGTTATTTTAATGGATAAAGTTTTTTGCTTTGATTTTTC
TTTGAAGTAAGAAGAAGAGAGCTACACGGGAGATTAGAACCCGCGGGCGTTTCGCTGGTG
AAACGCCCACACCAGCCTGGCAGCAGGCCAACTTGTGCCGTGGGGAGCTATGTCTATGTG
CTGTGCAGCAGTAGCGCTGCGCGGTTGCCCGCTCGATGGGTGCCTGCGGGCACGAGCAGG
CCAACTGCTGCGCTGCTGTACATACTACAACCGCACCATTGTCCTGTCCCCGGACGGCGA
CGGCGACGGCGACGGCCGGACGGACGGTTCCCCTTGGCCCTCCGACGCCGACGGGCCCGT
ACGTGCTGCCTTTTGGGGCGGGCAGAACGGCGTCGCGGCCAGCCAGGGAATATTCCTCGT
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CGTGCGAGCGCACGGCTCCGTCCGTCACCCCGGCCGGGCCGCGACGTGCCTTGTTTGTGT
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CCGTGGTGGCGCAGCGGCGGACCGGCCGAGCCCGCCTCACCATGCATCCTTTCTCGCATT
GGGCAGTGGGGCCGACGACGGCGCACCGTCGAAACGAAATCGTCTCCTCTCCACTCTCCA
GCAAGTGGTACCCCCGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAGAAAAGAA
GAAAGGTGGTACCCCCGCTGCTTGATATTATTCTCCCTTTCTCAGATCCAAATAGACTAC
TTTTGAACTAGCGCTAGCGCTACTGCCTCCTACTGTATTATTCCTATTCCTTCCTTGCTC
CTAGTAGACCTCGTCCTACTCTTCAGTGGGGCCGGCGTACTGGTACGGACCACACTACCT
CTCGTTTACGACTACTACGGCGTGCATGGACATTAGGCCAATTCCAAAGCAGTGACGCAT
TTTCTCCCTTTGGATCCCTTCAGATTTCGTAAGGCCATCTGCAGCCGTAACATGTAAATT
TGAATCCTCAAACGTCCGCGAACGCGACGACTTTAATTCTACCATTTGCAATCACAATTC
TTGTTTTCAAAAAGGGTTTACGTGTAAAACATGCACGTGAATCATTACGTTCGTGTTGGG
CAAACAGGACACCGAATAAAATTCTTACACTTTAGATTTCTACATCCGGATTGGCCAAAC
GGGTTTTGGATGTTTTTTAATCCAACGGATCGCCTCAGGAGCTAATCGATCGGTTTAAAT
AGTCGGGTTATCAAAAAAAAAGAAGTTTCGGTCACTATTGTGTCCATTGTGAACTAAATG
GACTAGCACTCACAACGCGCACAAAACCCGAAGCCAAAACCCCACTACTGTGCCCTTTTT
GAACTAAATAGACTAGCACTCACGGCGGGCACAAAACCCGAAGCCAGTTGCCGAATAATC
CGAACCCGAAATACCCGATCACTATATCGGGTATCAATTTTGGAAACCCGAATTTAATTT
TGGTAATTCGGATAATAGGCCACGGTACCCAGATTACCCGAATAGCCCGAATTATTTGAC
AGCCCAGTAAAAATGCTCCACGCATGGAGAAGGCCCAACCCAAAAACTGCCATCACTACT
CGCTTCCCAGCAAAATCTAGGTCGGGTCACCAGCCGCCAGGTCACTCGATCGTGGTATCG
TTTCCTTCTTCCTTTCTCCTAATGCACATGCGCTACTCGGTTGTACGACGGCCACCACGA
CGCATGGGTGCCACTCAGCTCCAATCCTCCACCTTCCTATTGTGGTGCAACATTGTGCCG
CGCCGGACGATCTTCCTCGAGCCTCGAGGGCGTGCACAAGTGCAGCTCCGCGTCCAATCC
ATCCGCCTACCGACCTCCTGTGATGTGAAGTTCTTCTCCTATTCATGTAATTCAAGAAAA
CCCGAACCCGAATTTTCGGGTACCCGAATTATCACATACTGATATTTTTGGCAATATTTC
GGGTTTCATTTTTCATAACCCGAATTTTCAAAAACCTGAACTACCTTTCGGGTAACCCGA
ACGCCCAGCCTGAATTAGCACTGTGAATCCTTTCAGCTTATAACAAAGAAGATCCATATG
CATGATCTATCTCTTTCACAAATGGAATATTGATATTTGCACACGTTCTTTTCATATTAC
GAAATATGTTGGCACGACTCTTTTTGAATAACACTCCTTCTGTACCATAATACTATAATT
ATTATGATATAGAGGGAGTAAAATAAAAAAAACTCTTTCATTGTAGTAGAGCTATCAATG
AACATGAATGAGATGAATCTGGCACTTAATTTATAATTATGAGTTGATGAAATGCAATCT
AGTGTCGTGTTACCTCATTCACACATCATGAATCGATTGACCTATGCAATTAACAGAGAA
GTTTGATGCCACCCGCCGGTGCGCTATTTAAGCCGGTCAGCATTTGGCTGGCGCTGCAGA
AGCACGCAAGGCCAACTCCTCTTCGAATGGTTGTAGGTGGGACCACTATGAAATGAAACA
GGGTGCCCGCTTGGGTCCGGGCGCCCTCATATCGTCCCTACATTTGATCCCAGTTTGAAG
GTGTCGGTCAGTCCGGGCGTATAGTGACGGTGAGTGGTCCGGTTAGGATAATTTTTTTAC
GGAGCATTGACGAGACGAGCGTTGTAGATATTTTAAAAGGAAATGTGGGGTCCGAATGTA
GATGCTCTAGGGATAAATTGTGTGGCTCAACGTGCCGAGGTAAATAGACGGATGTCCATC
ATTTGTTCGCTTAGACTGATTTTCGGCTCAAATTTGGGTCAGGTTTGCACCCGCGTGGAC
ATGCGTCGGGCGCATGCGACCTTCTCTGCATGACCGCCCATGACCGTTTTGTATGTGGCA
CACCGTCTTCATTTTTATTATCCCTCCCTCGTTTTCCTGCCATGGCCGACACGCCTAACC
CCTTCCAGGCCACCCCTATCCCCATCGTGGTTACCCAGGTTGTGGCCCCGAAGAAACCGA
TAAAGGAGATCACCTCGGAGTATAGGGCAGCTGATGATCCAGAAGTATAAAGGATGCAAT
AATCTTTAAGAACAGTATTTGGTTCAAATTTATTGATTCGATGCAAGGAAAGTCAAAGAA
TATTTATAAGCCTTATCGGTTGAGTTGTCAATTCCATCACACCCGGCATTCACTTTCTTG
CAACAATTTATTAGTAGCACAATAATATTTTCGGAACGATATCAATAATAATGGCAACAG
TAGCAATAGCAACAATAATAACAAATTTATACCAACAAAGTAATAGTAACTTGAGCAAAG
ACATTAGGATAAAAGCGTAAGCATGAAGTGGCCATGGATACTTAGAAGAGATTTATTGTG
TAGTATAAAATGTTAGGGTTTATTGGTGTGACGTTCTGGAGAACGACAACGCTTCTTCTC
AAGTTTCTCTTCTCAGCTTCGATCCCCTTAAAATTCGTTCATTTGAACGTAGTCCACAGA
ACTCCGACGTAGATTATGGTTTCTCATCATGCAGCGATATTTTATTGTTTTCGAACCGAG
CTTCTCCCCTTTCCATTATATAGCATAACGGAAATACAAAGTTTTCTCCGAACCAGAAAT
AGAGAAAGGGAAAGGAAAGAAGCGAGTTCGGAGCAATACCAGGAAACCCACCGTCTGCGC
CTGTCATCAGGAACACAAACTATGGGGTGAAAACCTGGAGTATCACCCTAAACCGCCTAG
AACAGAAGATACTACCACCACATAGTATCACAAAAGACCCTACCAGACCAACATAACCAA
ACAACAAGTACTTAACAGACCACTCTAGGTCAACAGGCATATAAAGGCAAGCCAATGGAA
CATCTCCAGCTTACACTCTGCTATTCAACCAACATGATCAACATTACCAGGTCACCATTC
CTCCCGCCCGTCTCCTTCATCAACATGCTTGCTTGATTCTGGCATTGGTGGCCCGCATAG
CAGCATCATTTGCGACGCGTTCTCCTTCAGCATCTCTGCGCCCTTCTTGGTTATTTCAGC
CATCCCCGGCTTCTGCAGACCTGCCCAGTATTGAATAAATCATCTAGACAAAGGCTAGCA
ATATTACCTTTATTTAATTGAATGCCTCTACCAGCCATATAGTAATCTTTAACTTTCAAT
AGCGCTTTCGAGCATGGTGAATCATTAACTTTCTGTTTAACCATAGTCACTGATGATTTT
CTTAGATATTTGGCTCTTACAATGTCTTGCCACAACACCTCTTTTTTCTCTATCTTCCAC
CACCATTTGGTAGCAGGCTAATATTCTGTTTTCTTAAGTCCTTCACTCCAAGCCCTCCTT
TCACTTTAGATCTGCACACCCGCCCCCATTTCACCATGTGATAACTTCTTTTCTTACCAT
TACGGTGCCAAAAGAATTTCCTCCTAGGTTTGTCCCATCTTTCCAGAGTTGATTTACTTA
TCAGAAACATAGACATGTAATATAATGGAATGTGTGATAATACAACATTAACTTTGATAA
GTCTGGCACCACTAGATAAGGTTTCACTAATCCAGGATTCCATATGGTTAATAAATTTGT
CATCCACAAACAGCCAGTCACTCCCCTTAAGGCCAACATAGCTGACTCGGATACCTAGAT
ACTTGATAGGAAAACACCCAATCTCAAAGTTTAACATCTTAGCCTAGTTTCTCATAGTTT
CATCATTAGCCCCAACTGACAAAATCTCACTTTTCAGAAAATTATTTTTCAATCCCGACA
TGACTTCAAAAAGATATAACAACAACTTGATATTAAGCGCATCTATTGGGTTATCCTCAA
AACAAAGGATGGTATCATCCGCATACTGTAAGATAGCAACCCCATGTGCTACCAAATCAG
CTCCAGCCCTGTAAAAAGCCCATTCTCCTAAGCCTTAAGGACCATTTTAGTCAGGCAATC
AGGTGCCAAGTTAAACAGGAATGGAGAAAGGGGATCACCCTGTCTCACCCCTTTGGCACT
TTGGAAATATTCTCCTACTTCATCATTCAGTTTCACACTAACTGTACCCCCCACCAGAAT
CTTCCTAATCCATTCAATCCACTGAGGATTAAAGTATCTTTTCTTATGACATTCTAGCAA
AAAAATCCCAGTTTACTTTATCATATGCTTTCTCAAAAGTCTAGCTTAAGCACAATCCCA
AAAAAAATTTGAGCATATGAATGATGCAGAATCTCATGGAGTGACATAATCCCATCCATA
ATATCTCTACCTTCAATAAAAGCATTTTGGTGTCTACTAAACAAAGTAACAACAAAAGGT
TCAAGTCTGATAGTGAGTACTTTAGTAATCAGCTTATGTATACATCTAAGCAGACATATA
GGTCTTAATTGTTGGATTTTATCAGCCCCAACCACCTTGGGGAGTAATGTGATAATACCA
TAATCGAGCCTATCCATATCAAGTTTATTCTCATAGAACCAGTCAAAGAGCAACATCACG
TCATTTTTCACCACACCCCAACAGTATTGAAAAATTCGATTGGAATATTGTCAGGACCAG
GAGCTTTGCTATGCTTCATAGAGAATAAAGCATTTTTAATTTCAGTATCCGAGAAAGGTC
TCAAGAGAATAAAGTTGTCTACCTCGGTCAATCTTTCTTGTTCTTTCCACATGTTACTAC
CTATCCCACATAAGTTTCCAGGGGCAGGTCCAAAGAGCTCTTTATAGAAATCAGTAGCAT
TCTTAAGAAGGTCCTTGTTCCCTTCAATAACCATATCACCACAACTAAGAGAAAAAAAGT
ATTTCTCCTTCTCCTACCATTCACAGTCCTGTGGAAATACTCAGTATTACTATCACCCTT
AAGCAACCAGTTGTCATGAGACTTTTGTAGCCATGATACTTCCTCCTCAATTAATAGGTT
ATTTAATTCTACCGAAAGGTCAACTTTCTTGCAATACAACCGAGATGTTAAAGTATCAGT
TTCTTGCAGTCTTTCTAGATGTCCGAGCTCCTCTCTCAACCACTTCCTTCTTTTTCTAGC
CTTACCAAAATCGTTCGATCCCCAACCTTTAAAGAAGTTTTTAAATCTTTTTAACTTGAT
ATTCATAATGTCAATAGGATTCCTTGAACACACATGACTCAACCATATCTTGGCCACCAG
AGGTAAGAAGTCAGAATTTTGCAACCAATTTAAGTCGAATTTGAAACCCCTATTTTTTGA
AATAGTGGGAATATTATCATCGGTATTTAAAATCAAAGGGAAATGATCCGAGATCTCTCT
CACAATCTGAAAAGGACGTGGATGTCGCC