Map Locations of contig_6234 (8061 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_6234

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72774 4 1862 bp AK363899 Available Available None
MLOC_72775 1 712 bp MLOC_72775.1 Available Available LOC_Os05g50654.1, FRAME:-2, EVALUE:5e-12, 13105.m05435 protein mitochondrial import receptor subunit TOM7-1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_72774






CDS Structure of MLOC_72775






Contig Sequence (8061 bp)

>contig_6234 8061 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCCCGCCGGTAACACGCCCCGCCGTCTGACATCCCCCCTCCCCCCTCTTTGTTTGGTCC
ACGCGCGCACCGGAGGTTCAGAACTGAAGTTGGCGGCGGATTTGTGCGGTTTGGAATAGT
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TCTGCCTGGGGTCTTGAGGCTCGTGTTCCATTCCTCGACAAAAACTTCATCAATGTAGCA
ATGGACCTGGATCCCGAATGTAAGATGGTATGTAATATCTTGCGATAATACACTAATTTC
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CTATCCCAAGGTCCAGAAGCCACAACCAGCCTTTAATCTGCATCATGATATTCCAAGCTA
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CCTGGTCCAAGCTCCTCGACCCGTCTGGCCGCGCCGCTCTTGGCGTGCATGATGCGGCGT
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GTTCCTTCAATCACGCCAGTGCGGAAATTGCTTTGCTCTACTTTCGTTCATGTTTTGCTT
TCACATTTATGTACCAATTTTGTTTATGCAGTGAGCATTTTGGTTGTAAATATTTCACCG
TGGTTGATATCCTTGAGTTGCTCAGCATTTGGTTTGCAAACTGCAAAGCTGCACTAATAA
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GGCACTCCTTTCTTTGAACCTCGCCGAGAATGTCGTGAATTTTTTCACAAAAGGGAAATA
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TAACAAAGATCACATAAAAGTAAGGAGATATAAGTACATAACCACAAGCTCAGGGTATGC
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ACAAAAGTGATTCTACCTTTGATATTTACCTATTGAGAACACATGGTCAAACAGATGCAA
GAACAGTAGGAGCACATGCAGTGAAACTTCACAAAAAATTGACTCAAATAGTCACCAGGA
TACAATCACAACAACTGACAATTTGCAAATAGTCATCCAGGATACAATCACAACAACTGA
AAATTTATCACAACAACACGAGATTTATCACAGATATTTCCAAATAGTCATCCAGGATAC
AATCACAACAACTAAAAAATTTGCCCAAAGAACACAAATTCAGAGATTCCTACTGTGCAC
ATCAGCATCTGAGGATGCAAAAAGGACAATCTTTCATATGCGAAGGCAGGAACTGACCAA
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CATGGACGAAATTATAATCATATATATAGTGATCCAAGTTTACTGATTGATCCCGAGCAG
AATAGCAGGTGCAGCACAGATACTAATACTAGAGACTTTACTTATGATAATTAATAACTA
ACTACCACGGAAATTTTCATCGCTCGAACGAACCCTAGGGAAGCGCGGTCATGCTGACGG
GGTGCGGGGATCGATCAGACCGGGGAGAGGAGCTGGAACAGGGAGGGCCTTGGGTCGGAC
TTGATGACGCCGACGGCGATGACGAGCGGGATGAAGCCGTAGTGCGCCACCACCTTGGCC
GCGCCCATCGCCCACTCGCCCCACACGCGCCACTCCCGCGCCGTCGCGGAGCGCCGCGCC
GCCCTCTACCGCGCCCGCGCC