Map Locations of contig_62296 (10155 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_62296

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72751 1 860 bp MLOC_72751.1 Available Available None
MLOC_72752 2 849 bp MLOC_72752.2 Available Available None
MLOC_72750 1 598 bp MLOC_72750.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_72751






CDS Structure of MLOC_72752






CDS Structure of MLOC_72750






Contig Sequence (10155 bp)

>contig_62296 10155 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATTGCATCAGGTAAACACAGTAACCTGTCGAACTTACAAATGAAGAGGAAGAAAACACG
GCACTCATTCGATGTGTGTGATCTGTGATGTGAAACATCATTATCTAACTTCCCTTTTGT
ACTGGTTGCAGGTTATAGGCGCTGGGCTGATCGATTCCCGAGTGTTAGAAATGTCGTACA
TGAGCATGTATCTGTCTGATCTTCTCTGCCCAAAGAGTTCTCTGTTGCGAATGTAGCCAT
ACAGATGGGGAACCCAAAGTGCAAGCATCCTGTCGCATCAGGTGTAATCTCATGCGGGGT
GCCGTAACCCGTTCCCCTCGCCGGCATCCACATGTAGCCGTCGGTGGATGACTCGTTATT
CTGTGTAACGGCCGATGCCTTACATGAAGGTGCTGCTAGGGCAGGCAGGGTAGGGTTGCA
AACATCACTTGAACCCTCAGTGGCTAGCTGGCATGGGTTTCTCACTACACTGGATTACAT
TAAGTGACAGGCTGGCTGAGATGTTAGACCACATCTGTTTTCTCTGCCATTTTGTGTAAA
ACTAACTATTTTAGTGTAACAATGACACATAAAACCACTAAATCTTACTGTAGGTTACAC
ACGACAAAATCGAAATCAAACAGAACACCCAAAATTGGTGACCAATGTCCTTGCATGCAT
GTCTCACGAAATTTTATTACTGGACATCAATGTCCATTGTTTTCGCATGGTGCTAGAGTG
CAGCTCTAGTGACAGACGACGCAAATGCAGTGACTGTGAAGAAGAGACTTGCCGGTGCAG
TGGGCACTCCTGACGTTCTTCTTCCAAGTGCCCGAGCACCAGTACATGCATATAAAATCG
TTGCAAAAAACGAAGTCCGGTACATCGTATGTTTTGCAATGCTCTGTAGACAACGCACAC
ACACACACACACACACACACACATCAGTAAAGCAACCCCAAGTTGAAAGCGTCCGGAGAG
ATTCACGCGGTTGAGTTGACACAAATATTCATGGCGATTTTGTTCTACTTCAGTTGGAAG
TTGGAAGGAAACGCATATATAAGAATAGGGAGATCGATTTTGTACGTACCAGCGTGAGTC
GAATTTCCTAGCAGCACAAGCATCATAAGGCAAAGCAGAATAGTTTTCCTCTCCATGAGA
TCAGGCACAAACTTCTTTTTGTTCTCCTTTCTACTAGTATTTGGGCTTCAAGCAGCATAC
ATGACGTGCTATATTTATATATAGGCTTATTGATAGAGAACATTTACTGCTAGTTCACTA
ATACGATCAACGAGATTTCTGACCGTACCATTGTCAGGGCAGTCCCAGTGCACTATGGCT
TAACCTATATCTAATAGCATGGAATATATATTTGATATGCAGTAACATCTACATAAGAGG
GGCCTAATAAACCCATGCAGAGGGAGCATATCTTAGTGTTGTCTCTCAAACAACTCTCAT
TTAATATCTTTTGTGAGAGAATTGAAGTCTTGGATTTTCTGCCAAGATCTATATGTGGAT
TAAGATATTGTTGCTCTATCTTTCCTCATCAAACGATGTGTCGCATTAGAGCATCTCTAG
CAGACCCGTAAGACACCGACCCGCAAAACTCATTTACAGTTCGCGAAAAAACAGTTTTAC
GGGTCGAAGCAGGCGACACGTAGCCGACCCGTAAAACAACATATTCTACGATCGCTATGC
GGGGTCTGCTTGGCCGCAGCCCGCTTCGGTTTGCGCCACCAGCAGTCGGTTCTCCAGCAG
AGGCCACACCTCCAACACTGCCTGCAGTAGCTGCCCCTGGGACGGAGAGAGTACTGTATT
GTAGTACTATTTAACATTGTAATTAGAATCAGGCATACTTGAGGAATTACTTTCATATGT
TGGTCTGTGCATAGTTTGGAGGATACGGCGAGGTTACTTTTATCCAATATGGTTGGCGGG
TTGATCTACGGATTGGTCCTCCGTAACCATAAGCGGTCTATAATCTCTTTATGATTACTA
CTTTTCGTGTTCTCCTGTTTTTTCCTTTTCCGAACCTGTTAGGGTTGTGCATTTTAATTA
TGTAAAAGTTAGGTGTAATGCTTAAATATATTAAATAATAAAAATGTGCTCTTTATCGAA
AAAGCCTTGGAACCTTGCTGAGGAGTTGAAGTTAAAATTATGCAAAATAATAATGTGGGC
ATGCTTAATCGCAACTTGTTAATATATATTCTTGCTCTTGTGCAAAGCTTATACTCCCTC
CGAAAAGAAGTACAAGAGTGTAGTGATCTAAACGTTTTTATATTTTTTTTAGAGAGGGAG
TACGATAGAACCGGCCTAAACTATATCCAGTTGCAGTTTTGAAGATGCACTTTAATTAGG
CAGGTTCAGAGCACAAGATTCTTGTAGCACCCAACGCGGATAGTGCACATCTTACGTGCA
GACTGCAAAGGCTGATGGTGCCATCACGCACTTCAAAATTTTACTGTTAACACGAGTAGC
AGCACTTTTTTGTTCAATAAAAAGAGGAGTATCATTTTGGTCCTAAGATCCATGGGTTGG
AGTTAGTTTGAGCTAATTGAGGGTCAAATAGCCCTAAAGTATTCAAACATGAGGGTTAGA
TCGGAGCTAGTTACATCTTATCCATTCAAAAAAAAAAACTATCCCACCCAAAAGATGCTA
ATTGGAGCTAGTTCTCATGGGGACAATCAAAAAATCACTTTTCTCTCTATCCCACCAACA
AGAGGTGCTAATTGGAGCTAGTTCTCGTGGGGTCCACTGAAAAATCACTTTTCTCTCTTC
ATCAAGTGCATCTATTATCAATCTAACCCTGTCATTCAAACATCTCTTTGGTTAGAGTTA
GTTTAGGGTTAGTCATGAGCTAGCAACTAACTCTAACCTCTAGCTAATTATAGTATCCAA
ATAGGCCTTTGTTTGTGAAGAGGGGATTAGGCTCGTGTAATGAGAGTATCATACCTAGTA
TCATTCATGTCAATTAGACAATTTTAATGAGGTGTCATAGAATTAAATGATGAAAGAGAG
GCTTGAGTATCATATCATGATACTAAAGTCATATATGATAATTAATAACATATAATTTTA
ATGAGTACCATGCATTATAAAGATATAGTATTATCTATTATGCACTATAAAGATAGTATT
ATCTATTAGTATCATATGCATGATGCTCTACTAAGTTATGATAGTACCCACTACGTGACA
TCATTATACGTGTAAGTAACATAATTTTAGGAGCAGCTGGAGTAGATAGTGTTTTCTATC
TCAAATAGGCCACTAACGGAGTTTGAAGTAAATACCGATTTATATACCTCACCAATCTTA
CACTCCATACATTAATTTCGTCAGACAGTTAAAGGTGGCAAATTAATCAAAAAGAGATGT
AGTCTTCTACCACCAGAGTTCACTTGACATGAGCATTACACATGCATGGCTGATCACCCT
ATATTAGCTAAATAACGTGCACACGCATTTAAAAAGAAAATCCTTGACAAATAAATAGTC
AAAATAAATGAGGTGTATTTGACAAAAAGGAATGATATAATTAGAAAGTGTTTTTTTACC
AAAAAATTCAAGTTATTGTTGTGCAATCTTTTTGTTAGATATTCATCTCGAGAGCATGTG
TGCCTTAACATACGACAGGCAGGTAAGCCTTATTTTGATATTCTTATTCAGTAAGCACAG
AGCAACCCCACGTCCACGAAAACGACACTGATCTCAAATAACAACAGTACACAAGTAAAC
TTAAAAAGAAGAACTACAACGAGGAGATCGATCGATGCGCAACGTCATGACCAACAGTAT
ACTTTCAAACACGTACTTCTTCATCAGGGAACTGGCTTCATCGAATCATGAAGCACGAGT
TAGAAATGCAGTTGCAGTTAGGGTTCGTGCATGGAGTCCACCTACATGACCCACAGTAGT
ACCGCTGCTGTTGCACTCCATCCTCGGTCACCATCACGATGGTGGTCTCGTTTGAAGCCC
GCGGCAGGCGAGCCATGGCCGTCGGAGCTACCGCGAGCTGCAAGACCACCATTGCAGCCA
CCAGGGCGAGCACGGCGACCGCCTTGTTGCCAATCTTCATGCTATATGTATGATGTGCGA
GCTACTAGACTGGAGTATTGTGATTTGGTAGGTTTGTTGGTGTCTGATCTGCTCAGCTCG
TACCGTTCTCGGCCCTTTTATAGGCAGCAGCGGCGAGATAAGATCGGAGCCTGCTCTTGA
TCTTACTATATGCGAACCGGTTTACAGTAAAATAAAAGCCCCATAACAGAGATTGATGGC
AGTACCAACGTCCAACGGATACAAAATATGGGAGTATGGGATGATGGGTGAGATTACCAT
GTGATTTTCTCTTGTCTTTTGACTCTTGGTATCATTGGGAAGGGTTACATGCACGTTAGA
AGCACGTTTTGACCTGCCAGAGGCAGCGCCACCAACGATGCGCCGCAAGACGTGGATCTT
GTGGCCCTGAACCGGGTAACAAATTAACGAATCTCAACGGGCACTAGTAAAAAAACTGAC
TCCACTTCACTCCAAATGAGCCAGACTAACATATTAACAACTGATGACTCCACTTCACTC
CAAATGAGCCAGACTAACAGACTAACAACTGATGACTCCACTTCACTCCAAATGAGCCAG
ACTAACAACTGATGACTCCACTTCACTCCAAATGAGCCAGACTAACAACTGATGACTCCA
CTTCACTCCAAATGAGCTAGGCTAACATATTAACAACTGGCTCCACTTCACTCCACCGTC
AGACAATTTGGCTTAGCCACTCATTTGGACTAATATCTAGTTATCAATAGATAACTTTAT
TACAACAAAAAAATCATCACACAATCACAATCAGCAATTTGACCCACTAGTACAGAAAAG
CCTACTAATGACATGTCAAAAATGTTATTAGTAGCGTGGGGGCAAGACACTGATAACATG
TTACTGCTGACACATGCCAGCCCCACGCCACTAGTCTAGTAAACAGACACGCCACTAATA
TTCCAAATAATAGTGGTGTGCCCTCAAATTGGCACGCCACATTATTCTAATTACTAGTGG
CATGCCCCTTAAATTGACATGCCCCTAGTAACCATTTATGATTTTTTTAATGAATAGGGG
GGGGGGGGCTACATGCACTGGGGACGGAACATGGATTGTGTGTGGTGATGATGATCACAT
CGTCGTTGGCGGAGCAGGGACAACCTTGATGTCATGGTCGTGATAGTGATGGTGGTCATG
ACGACGTGGCGGGGCTCAGGTCGGCAGTCGTCCTGGTCTGGTCGAGGGATTGTGGTGGTG
CTAGCACTAGTGGAGAAACGGGCTATAGTCCCGATTCACCAACTGAGACTAATAAATAGA
GACTAAAGGCCCCCCTTCTTTAGTCCCGATTGGTCATGAACTGGAACTAAAAGTCCCACC
ACGCAGCAGCTAACGTGAGATGATTGAGGCAACATGAAGTGGTCGAGATGGGTCGAAGTA
GGAGGTGACCCGAGGACGCCAACCATGATTGAAAGGTGGCGTGTCATGATCTTGCTCGCC
TGAATGAATCGACACTAGAAGGAGGCTGCGGAAGGTGTTGTGGTTGGCCGAGAACATCGC
CAGGGAGAGAAGTGAGAAGAGTTAAGAGAGGTTGTCGGGGAGAGAAAAGAGAGAGGGAGA
GAAGAGAAGAAGAGTGCCGTTAGTAGAATAGTCCTAAAGTTGAGAAGTGAGAAGAGTTAA
GAAAGCGTCGTCGGGGACAAAAGGAGAGAGGGAGAGAAGAGAAGAAGAGTGTCGTTAGTA
GAGTAGTCCTAAAGTTGAGAAGTAAGAAGAGTTATGGGAGCGTCGTCGGAGAGAGCAAAA
AGAGAGGGAGAGAAGAGAAGAAGAGTGTCGTTAGGTGAATATATAGTCCTAAAGTTGAAA
CCCTTGGTGATATAAAGTCACTATTGGTGGAACCTTACTTGTGTCGGGCACTACTAACTG
GTCCTTATTATTTACAGATTAAATTTAGTTTTTTCTAATAAACACAGAAATTTTTAGAAG
TGCCAAAAAATACAATGCAATGTCCTTTATATGGATATTTCTTTGTAACTTCTCAAGAAT
TTTGACGCATACAAAATTAACTGTATTTAACCTTAAAGTTATAGCATAAATGAAGCATCT
ATTTATGTGAGGTAATATAACAATGTAAATTAATGAAGAAATAAAACTATTGCTTGAATA
ACATTTTAAAGCTATTTAAATTATTTTTTTTTAACTGAATCTAAATCATCTTAGGACTAT
TGGATGAACGACATATATAGTTGAAGTCATGTATTGAATGAGCTATAAATTACATTGTAT
TAATATGAGATATTTAAATTCTGTTAGAATATCATGAAATTCTTTATAGACTTTAAATAA
TATTACAAAACTTCCTTCCAAAAATATATATTACAAAACAACCATAATTACAGGAAATAC
TTCCCCTAAACCGATGGATAAGTTGGCTTCTTCTACCACCTCCTTTGCGCGACGTGTGTC
CAATGAGGATCCCGCACCGCTGTCACATCAAACCTTGTCTCATAAGATGCGGCTGGCAAA
GCTCGTGGTTGGCGACCGACTCAAAGTTCAGACATTCATGTGTGTATATATGCGAGGACC
CTGATTAGCCTACTTATGTTCACATACATGACACAACAAAAACTTTATAAACCTAAAAAC
AAGTTCGAGACAAAGCCCCTAAACACATAAATCCCAAGTTCTAAACTGTAAACTAAATCC
AAATAACATTCGAGAGTATAGATGGATTACGAGAAAACTTACTACCGGCGGGTGGCAAAT
AAGCATTAGTCTCTGACTACCAGTGCCAAACAAGCAACAATCAGTAGTTTGGCCGGTTAG
TGATGTTCATCTTATTACAGACAAGCCGAAATCCAGCAAGAACACACATATGAATCTAGC
CGGAATCCATAGCACAGCAATACAGAAATTTAGAGAAACAAACAAAATTAGGAGTGCAAC
ACAACACGGATGCATCCTGCCGGCGGTAGCTGGCTTCCTCCCCGGCCGGCTAGCTGACCC
TGACCTTGCCTGGCTGCATCGATCGATCTACTCGCTCGCACTACAGCTAGACGGCGAGTC
CGGCGTGGTGTTGCACATGCTGACGCACTCGGTGTTGCAGGACTTCTTGGTCGCCTCCTT
GCAGGACTGGCATGTCGGTCTCTCGGAGGAGACGCCGGCGGGGACGATGCAGAGGCCGTT
GCACGCGGCCGACTCGAGGTAGGAGCACGCGGTCTCGCAGAGCGAGTCGCAGTCCTGCGG
CGGCGCCGTTCGCCGCATGGACGACGCGGCGAGCACGGCGCAGAGGACGATGGCGCCCAG
CTTAAACACGGATGAAGCCATCAAAGAAGAAGCCATGGGTGGAGCTAAGTTGAAGAAGGG
CAAACAGCACTACTATATAGGTAGATTGATGATTTATAAGCCTTATAAACTGAAAAGAAG
GTAGTATACCCACTCTGGTCTGATGGAACGTCCGATCTAACACTTTTTCCATCCCTGACC
GTTCGACGCAACTTACTCTATGAAACTTGTTTCTCGTGCAACACATACTTGTCCATTAGT
TGTTTTCTTTCCGCAAGTGGCATGTGAGGGTTTTTTCATCTTTACCCTTGTTTTCTTTCC
GCAAGTGACATCGAGACTAGCGTTGCCAAGATCGAGGCAGTCATCGAGATAGTTTCTTAA
CTGAGGTAATTATCTTAGAGCAAGTACAATAGAGCTGAGTCAGCTGGCTATAAAAAATAA
AATAATATATTTATACTTACTTGAAGGGAAGAGAAGGGGAGAAAGAAGGTAAGTGGGCTC
TTAGTTAAAAGCCAGCTCTAGCACGTGCTCCTAGATACTTTATGAGAGTGAAAGGTGGGT
CATATAGTAAAAAAATAGTACTACACTTTTGAAACCAACTATTGTACATGTTAGCTATAA
GATGGGCTATATGTGACATGACAATGCCTTACATCCAACAGTTGGCTATGAGCTTGGACC
GTTTGGTAACACAAGAAACTCAAAGATTTGCGCCTCACCTTTCTCTATTTTGGTCAAACA
AAACAGTATGATTCGCGTGTTCTTGGTGTTCTCCTGCTGGCCCCAACACCCACAAACCCC
GCTTGCAATGTCGCATATGTGCATACTTCTTTCCTCCGGTGAAGAATGTACCTTTAGCTT
TAAAAGTTGTCCATAAAAGTAAAAAAAATCCTTTTTCCTCATCACACGATCATCAAAAGC
AATAATATTTTACTCATAGTCTTCTTAATTTTTACATGCACTTAGCTCATTGGAGATTAG
AGATGTCCGCTTGCACCTTTTCAATGCAATTTTTACTTCATTTCATAATTTATTATAAAC
TTTATATGTACAATTTTTCATCGGACGAAGGGAGTACATCCCTTTTCTAGTGATACCAAT
GGGTAATCGCATCTACAATGCGATTCGGTCGGTCCGTCTAGTCAGAAAAAAGCAATCCAA
CTAGATTTCTTCCTAAACATCCGGAATGATAACCGGCAGTGCTCAAACCAATAACAAGAC
GAGGTGTAGACATGCCCGGTCACCCCGCTCCACGTCATAGCCAGCCCACTCGGCCCACCT
ACAGCCACCCAATCCTCTTTCCCCTCTTATCACTCTATCGTTTAAAGGTGGCAATGGCGC
GGGTGGAGGAGTTGGTGGCACATGGCGGCGATGGCATGGGAAGAGGAGCCGGCTGACGAT
GGCGTGGACTACGGTGTATACATAAGTGCGCGTTCGTAACATGTTTGCTTTGTTTCATAT
ATGTGCGCATCAGCGCATGCATTGATAAGTTATGAAAATTCATGTCTAACGCAAAAACCA
CTGTACAGAAATGGTTAGCAGATCTAATCTCCGGACTTAATGTGCTCGATGATGCCTGAA
CCTTAAATGTTGCACAAGCAGCCAAGAGAACCTGATATTCGTTTGAAATCCAAACACAGA
AGCTATATGAATAAAATGGTGCAATGCTTGTAGATCTCAATCAAAGATACAAGCAATGAA
AAGAGATTACAAATCGAAGCTACTGCCATAACATACGCAAGAACTCTAGCAAATTCCTAA
CACAGATCTCGCATTATCAAAACAGGACTAGAACATTTGAAGCATATATTGGAACATTGT
CGCAACGAAATGGTAGGTGCAACTGTCCACCAAATTTACTTTCACATTTTTGCGGTTTCC
AACTTCTGCTGATATATAACAAACACGAATTAATAGCCAAAGACTGGACTTAGGGCAGCC
GACCTCTTTTCCTGTTTCTGTTTTTGTTCGTTCCGTTTAGACTGTCGTGGCTTTGAATCT
CTGATGAGAAGCAGACAGATCTGGCGGCTCCCTGCACACCTTCCTGAGAGATCAGACAGC
AGCCTATAACGGTCAGTGACTCTAACTTCTGTGAACGTGCCAACGCAGCCATTCCCTCAT
CTCTCACTTTCTCACATTTGCGAAGCGTGAGACTACTCAAGCAAGGAGCCTGTATAATGA
AATTTATACCAGCATCAGTTATAGAGTTGCAATCCACGAGCTCAAGATTCTCCAGAAACT
GTGAGGATGAGAGGCCCTTCATCCCCTCGTCATAAAAAATGCTGGCACCATTTAGCACAA
GAACACGAATCGGACATGATTGGATGAGTGTTACAATACCCTCTTGTGTGAAGCCTATTT
GAGAAGGATATCTGGGCTCACAAAAATGCAAAGGTGAGCTCAACAACCTGAAGCATAGAG
CAGCTGAGAGCTAGAGCCTTAAGGCTAACATCAGTCAATGGCGTCCTAAACTCATAATCT
TCACAATAGAGAGGAATGAGTCGAAGTGAGATTGTTTTAAGGTTGCTGCACCTCTGGAAT
AATGCAATCATCTCATTCTCTTTTAGACCAATAACATACTCCAGGTAAAGTGTCTCCAAT
GCTTTGCACTTCCCAAGGAGAAAACGAAGTCCAGTTTCTGGCTTGGTTATAATATAAGCC
AACCTAAGATCCTTCAAGCTATCACAGCAGATGTCATAAGTACATGTGTAGGCAGGCATG
TAGGAAGGGTCAGTGGCCCCTGTCAGCCTTGAATTTCCATTAACCTCGAACTCAAACTTT
TGGAGGTTCGACCATCCTGGGCCAAACATTAAGAGATCATACTGGCTGATTCCTGTTGGG
AACGTCGCATGGGAA