Map Locations of contig_61996 (9861 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_61996

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72621 5 2315 bp MLOC_72621.2 Available Available LOC_Os12g03360.1, FRAME:-2, EVALUE:7e-154, 13112.m00292 protein EMB1379, putative, expressed
MLOC_72620 1 1221 bp MLOC_72620.1 Available Available LOC_Os11g03600.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-117, 13111.m00300 protein harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_72621






CDS Structure of MLOC_72620






Contig Sequence (9861 bp)

>contig_61996 9861 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTCACATACTAGGAGTATAAGCGGTTAAATTTATTGGAAGTTAGCAAACATAGCATTGA
TCACTTGAACAGTTTATGAAAGAATATTAAAGGAAGAGAGATTTCACATATAAATGTACT
GTCTTGGACATCTTCTATGATTGTGAACCCTCGTTAATTATTTTTAAACTTGACTAAGTA
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GCCATCCTCGAACTTCTCCTGGTCACCGCGGTCGATGGGCCTGCTTCTGCAGCTTCTTCC
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GGACCTTCCCCGCCGGGCTCGTTCGCTTCCTCGTCGTCCTCATCCTCGCCTTCCTGCTGG
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CGGCGCCATCGGATCGTGCAGCTCCTCTAGCGCGTGCCTTTGTGTAGGGATCTGTGGGGG
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GGGGAACGGAACGGATTGGGAGGTTTTTGCGGCTCGCGGGAAGACGTCCAAGATCGCGCG
GGAAATGTTTCGCGGTGGTTGTGTCACGCCCAAATCAACTTTTCTTTTCTAAATACAAAG
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TTAGTGAAATCTGTAAAAAAATTATATTTAAAAACGGATGAAGTAAAAAAAATACGATCA
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CCTGTTCTCTCTAAAAAAATAAGACGGCGACAATTTCCTTTTCGCTACATCGGCGAGGCC
GGGGGTTTCTTTCCCTCCGTTGGTCAGTCGGGCGACGGGTAGGGAAAGGAACCCCGTTTT
TTTGTCTTGTATATAGTTAGAAATAAGATTGTAAATTTTTTTTCATCAGCGTCTTGGATG
ACGATTGTGTTGACATTGAGAATAATTATTCCTCGATCCCAACCACATCTCGACGATGTC
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ACGACCTCTCTCGTACAGGGTTTGCGTTTGATGGTTGGCGAATCTGTCAGTCTTCTTCGA
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ATATGCCACACAAATAAGTGTTCTGATGTTCATGGCGGTCCTTTATTCGGTTCAGAAAGC
TTCGATGCGATGTGGCGTCGATGATCATTTGATTTGCGGCTGCTATCTCGTCTACTTCTC
GCACAGACGTCGAAAGAAGATGACAGCAGGCTTGGATTTAGTTCAACAATCTCTCCCTCT
AAGGACTGTGTTGTAATTTTTATTTTCTTGAAGATGGATATGTTGTTATTCCGGGACAGT
TGCTCACTCTGTTTTAGTGTGTGTCACACGCATTGTATGATGGATATTTGCCTAATGAAA
ATGTGGTTACACATAAAGAAACATTCACATCACTTCACCTCAATATGTCTACCCACGTCC
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TTACGAACTGTTAAAAATAGAATAGTTGCTTATTAATTAAACTAATTAGGATTAAACTAA
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ATGTAATTCCTTGGCACTCAAGTAACTATGTGTTTATTTGGGTGCTAAACAACATGTGTA
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AATGAGAAGGATGTACTTGTTGAAGGCACTCAAGAACGTGACCGCATCAGCATCCTACTA
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CCTCTCGGCCATGGCCCGTCTCCTTGATTTGGGCCGGTGCGCGACGCAACGCGCCCTCCA
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GCAGATGTTAATCCCTAGCTGCACAGAGGAAATTGGGGATTCCTATCCTCTATTTTATTT
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CCTCTGGCTTTGTTCATCATGCAGTATAGTCCTCAACTTCTACTGTCAAGTCATCTAAAC
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ATCTACTACATAATTTGCAGATTATCCGTCACTACTGTGAGGTCTACGTCTTGTCATTTT
AACAAGATGACTACCTTCGAAGTGCTCTTCCGAATATTAATATTTAGATGTGACTACCTC
AAGATATCATAAGATAATATTGGCATCTACTATAAAGTTTTGCAGACTATCCACTATTAC
TGCAAAGGTCTACACCATGTCATTCTGATAGACGATTACCTTCAAAGTGATTTTCTTAAA
TATAGCATAACCTAAGGTAATAGAATTATAAACATCTACTGACAAAAGTCAGACTATGTT
TTCTATTACTGCGAGATCTACATCATATTGGTGATTATCTTCAAAGTGTTATCATATATC
AATTGAGGTCTACACATATGGCTACAAGGCATCATCCATACAAAAAATTGCTCCTCTAAA
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AGTCACTGCATGCTAAATGGTATTTTTTGTGCCAATATGAATTATTCAAGCCTCAATTTG
CTTGAATAGGTCTTGGAAAATTATGCAAAAATTTGCATACTCCAACGATTACCTTCTATT
ACATTGGTAAAATACATGGCA