Map Locations of contig_6193 (7024 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_6193

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72582 1 1177 bp MLOC_72582.1 Available Available LOC_Os07g44744.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-11, 13107.m04710 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_72582






Contig Sequence (7024 bp)

>contig_6193 7024 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCTTGGTGAAGCCACTAGGGGGGATGAGGAGGTCCAACGGGGTGCCGACGATGCGGTCG
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GCATGCTCGATCTCTACCCCGTCGTTCGGTCCCGCGACTACTGCGTAATCCATCTACTCC
ACCTCCTGCCCTCTCCGAATCCTCTCCTGTTTCCTGAGCAAATTAGTGCGTTTGCGGCGC
TGTAGTGGCGGACCTTGCCCTTGCGGGTTGTGAATCGGAGGTTAGAGGAATCGCGGCTTT
GCTGGGCTGGGCGATTTGGTGCGGGTGGCTGTTGATTGGGCTAATCTTAGGTTTGTGCGT
TTGGAATATGGCTCTGGATTTGGATAATCATAGGGTTTGGTTCTGGCGATCTGTTAGATG
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GAATGCGATAAAAACGTATATGTATCTGTGTCCTAGCTTAACAAAAATGGCAACTCTTCT
CCAGCCTATTTATCTGTACTTCTGATGCTTCTGAATTTCCCAGGTTCGACCAGTTACTCC
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TATGTTTCTCTGATATTATTTTTACCAGAGTTACATCTCATAACTATTCCGGAACCACAT
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CCCTTGGGAAGTTATTCGTGACTACACATCCCTAATCTCTAATTGGTCCTAGGTCTTAAG
CCTGCGCCCTGTTGCTGTTGGCTTTTGTCTTTAGTCTCAATTCTTCCTCTCATTAGTCTA
CCGTGGAATTTTGTTCCTTCTAGGATTAATAACTCTTCATCTATATCAATTTCTCTTATT
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AGTCGATGAGTCGCACTTCCAAGGTCGACTCAACCTCTCGACTCAACTCTTCGGATGAGT
TGAACGACTCGAGCGACTAGTCACGACTAGTCATGGTTTCTGGGTCGAACGACTCATTTT
TTTGAGCCCCACCTGTCATATATTTTTTACTGTATTTCCTTGGCAGCCGCCACCACCCCT
GGTT