Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_61882 (5117 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_61882

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72556 1 2042 bp MLOC_72556.1 Available Available LOC_Os05g03780.1, FRAME:+3, EVALUE:4e-98, 13105.m00370 protein cation efflux family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_72556






Contig Sequence (5117 bp)

>contig_61882 5117 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACAAAGGGATTCACCCAATCCCCTGAAATCCCTCCCTCTCAAAACCTCNNNNNNNNNNCT
TAACCAAACGAGGCCTTAGGGGGTTGTGGTCCCGGCGTGCCATTTTTATGAATTGCATGC
TAAAATATGCTAAACATGATCCGCCTGCGCCAAAGTTATGTTACACCATATCCTGTGGAT
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CCAGCGCCCCCCCTCAACTTGGGTCCCAGGAGGGGACGCTCTGCTGCCGCCATCGCTCCG
GCCTCCGCGCCTCGCACATCGAACAGTAGGGCTATGGTTTAGATACTCCGCACTCTCGGG
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CCCGTAGTTGATCTCCTGCCCATGTATCCAGGTCCTCAGATTGCTGTTTAGAATGTCAGG
GGCTTGAACTCGCGCGCTCGGCGCTGCGCAATTCGCTCGCTGATATGTACCACCCGTGCA
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ACCCTTGGGTCCGAGTTTGATGGCTCCACCTACCTCCCGGCCGACGACACCCGTGGTGGC
ATTCTCATTGCTTGGAAGAGTAGGGCTGTCACCATCTCCGACTCCCNNNNNACCCAAAAC
GCGATCACGGTTAAAGTTTGCGTGCCCAGCGGCACCCCGTGGTGGCTAACCACGGTGTAT
GGCCCCCAAAGTGATCCCGATAAGCTGCTGTTCTTGCAAGAGCTGCGGGACATTCGCGTC
GCCTGCCCGGGTCCTTGGATGTTATGCGGTGACTTTAACCTCATTTACCGCGATGCTGAC
AAGAGCTCCGATACCCTGAATCGCCGCATGATGGGAAGGTTCCGGCGCGCCATCAACGAT
CTTGCCCTGAAGGAGGTATACCTAAATGGGCGCCGCTTCACTTGGTCTAACGAGCAGTCA
CCGCCGACGCTCGTGCACCTCGATCGAGTTCTATGCACCGCGGAGTGGGAGGACTACCAC
GGGGAGTGCCACCTCCGCTGCCTTGCGTCCGTCGTGTCCGATCACTGCCCGCTGCTGCTG
GATTGCTCCCCCATGCC