Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_61828 (4866 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_61828

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72527 2 879 bp None Available Available LOC_Os12g07450.3, FRAME:+1, EVALUE:4e-19, 13112.m00779 protein WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
MLOC_72528 1 1250 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_72527






CDS Structure of MLOC_72528






Contig Sequence (4866 bp)

>contig_61828 4866 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTTAACCTCACACTCCTGGATACGTCGCACAAAGCACATGCTGGTATCATCTAGTTTCA
TATTATACAATATACATATTTGGTATTGTAGATGTTGATATTTTTTAACATAAATTTGGT
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ATTCCTAAAACTTGAGGAGACAACTTTAGTAGGAGTGTCCCCGTCCATATAACTTTTGAT
CTATTTTAAAATGCTTAATCTAGATACTTCAAAACCATATATGTAGATTTATCTCAAAAT
GCCTTTTGCAACGTCAGAATTTCATCGTCTTCAATAAATATGACCGAGTACAAATTTGCA
ACCGGATTACGTTCTTCATGCCTCGTTGATTCTCACAGTGATAACCTTTAAAAAGAATTC
CAAAGGTTTACCAAAACTCTTCAAATTCAACTTTGATCAATTTCTATGTGTATATGTTTT
ACTAAAAGCCTATATAATTGTAAGAAAAACATGTTGAATATTTTATAGTTTCATTCGACC
TCGTTGAAGCCAACACTCTTTAGATCGTCATCTCTGTCTGAACAAAAGCAATATGTACTT
CCTATCTTTTTTCACCAGCCATGCATACGGAAAAGATACTAACACACAAGGGAGTAAAAG
AAAATTGAATAGACATACTCATCTTAATTGATATGATATAATTAAACCACATAACATTTT
TGAATGCCGTCGAATCAAAAAGACATATCTGGTAGAATCNTAACCATAGAATACGACCCT
AATCGAAATGCATACATTTGTCTCATACACTATGGGGATGGTGAGAAGAGATATATTTTA
CATCCC