Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_6167 (2514 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_6167

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72444 3 1885 bp AK377027 Available Available None





CDS Structure of MLOC_72444






Contig Sequence (2514 bp)

>contig_6167 2514 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTGTTGTTGAGACTGTGAATATGATGCTTCCAAATGCCGTTGCTATCTATGTATCATAC
TTGTATTTCTTCACTAGGTATAGTGTGGCATTCTAATTATGCTTCTATTTTGTATACTCT
TGTTTTATGTTGAGATAGCATGGAACTGATGCCTCCAAAATCCATGATTCCTAAGCATTG
TAGAGTTGTTTCTTCGATCTTGGTAGTTTGTGGCAATATACCATAATTAGCTTGCTAAAA
TAGTTTTTCTTACTGAAAATAGTTTGTTCTTAGTTCATGTTTATGGTTATATTGGTTATA
GTTACAATATCTATGTCATATTAGCCAAGATTTTATATTTTAATTTGTGTCTTCCATTAT
GTCTTATATATGGTGTGATAAAATGAAGCTATCCTTCCTGTCAACCATGTTTGCTCCTTT
AATTTCTTGCATATTGGTGTTTAATATATTTTTGCTTCTAACATTGTAAGTGTGTGCTAC
TTTTACACAAATGCTTGAACTTCAAGCATTTTCAGATACCAGTAACTATTCCAATTGGCA
GGTGAGGAAGTGCTACTTGAATGGATCCGAGATGCGGAACCAGCACCAGAGTCTCGGCTT
GCCGCGGATGCATTCTGGATAGAAATAAGTAACAAGTGGTTCACCCTGTTCCCCACAACT
AGGCCGTATATAATGAGGGGATTTGAGCAGATTGCTGACAATGTATGCATACCATACTTC
TCACACTATCTCCAATCGGTTGACCTACTCATGATGATCTCAAGATCTGTCTGGAATGCA
GGTGGCCTCTGGTTTTGAGACGATCCGTGATATAAATGATGCTTCTCATCTTATCGGAGA
TGCTTTTGCTTCAACCTTGGATGATCCGCTGTCTGAATGCTATAAGAAACTTGGTTGTTC
AATCAACAGCGTTCCTGAAGATTCAGAGGATTACAAGATGATCGTCAAGTATCTGGAGAA
AACATATGAACCAGTCAAGGTTGACGACGTGGTGAGATGTTGTCTTGCTGCTATGCTTTC
AGCTTTTCTCAAACCCATGGTTCTGCCTCGTGATCTTGTGCTCTCTTTCAGGTCTATGGT
GTTTCTGTTGACCGGATATATGCTGTTGAATCCAGTGCATTTCCTTCTTACAATGAAATA
AAGAAGTTACCAAACAAAGTTCTACTCTGGTGTGGTACGTCCGTGCTTATGTTTCTTTGT
GTTTCGTTGCTGATTGTTTATCTTGTCACCTGTGTTTTGACCTGTCAACCTCTTGTTTTG
TGCAGGAACTAGAAGCTCAAACCTGCTTAGGCATCTGCACAGAGGTTTCCTGCCTGCTGT
TTGTCATCTGCCTGTGCCGGGATACATGGTAATTTCTGTGTTAAGTGGTCGATTCCCGAC
GGTAGATAGGCCGAGCATCATGCTGGGATCTCATATGGTGTTAATGTTGGTGCAGTTTGG
TCGAGCCATCGTCTGTTCGGACGCGGCAGCTGAAGCTGCTCGTTATGGCTATACGGCGGT
GGACCGTCCGGAAGGATACCTGGTCTTGGCAGTGGCCTCTCTGGGGGAAGAGATCAAAGA
GATAACGGGCACACCAGGGGCCGAGGTACTCGACCCACCCTGTGTGTGCTCGCATGTTTC
AGGATGTTTTTAACCCTATTGTTACTGGTTATATTACTTATGCTGTCCTTGTGTTTCGGA
CACAACAGGATGTGAAATCTCTGGAAGAGAAGAAGCCTGGCGTGAAGGGGGTGGGGAGGA
AGACGACCGACGAGTCGGAGCACTTCACCTGGAGGGACGGCGTCAAGGTGCCGTGCGGCA
AGCTGGTGCCCTCGGGGAACGAGGACGGCCCGCTCGAGTACAACGAGTTCGCCCTGTATG
ACCCAAAGCAGGTAGAGCCTTCCTACCAAACTTGACGCACTTGTCTTAAAGCGGTCGTCG
TGAACTGAAGCGTTTGGTGATGAGCTTCAGTGATGGATGCCGTTGTGCCGTGTCGTGTCG
TGGTTGTGCAGGTGAGCATCCAGTTCCTGGTCGGGGTGAGGTACGAGGAGCAGAACATGG
AGGTGGTGCCGGACGAGTGAAGGATCCGGTGGTTCGACGGTTGCCTGTATTCTGGAAGGC
TTTAGTGGTAGTGAGCATTTGACGGTGGTGGTGTGATCGGTGCGGCGATGCGTTCGGCGA
TGGAGGTGGCCTGTACCCCATTTTGGGCTGCCTTGTGGTTTCGTCGCCGCCCGCCCGCCC
CTGTTTGTAGGCGCTGTTAGGAGAAACGCTTGTGGTAGCTTATGCTGGAATGGAAGAACA
TGATGTGCCTGGCCTGTATATATGTCTAGAAGAATGTATGCATGTATGCATCTGCCTGGG
GTCCTGATGCTGCCTTGGCCTCGGGTAGCAGGAATGCATGTGGATGATGGTTTGTGCACT
TTTAAAGTTCGCGCTGTGCAGCTCAAAAAAAAAAAAAGTTCGCGCTGTGATGCATACTGC
GTCGTGTCACTGGTTTTTTTATTTATTTTAGACATCTACTCCCTCCGTTTCTAA