Map Locations of contig_6146 (7975 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_6146

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72341 5 1989 bp AK374606 Available Available None
MLOC_72342 1 726 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_72341






CDS Structure of MLOC_72342






Contig Sequence (7975 bp)

>contig_6146 7975 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCAGCTCTGCTTCGATGTTTCTGCGGGATCACGGGGTTTCCGCCGTGGTCTTGAT
CCCCCCTTATTTCCCCGTCGTGTTTTTAGCTTCGACATCGAGGGCCATGTCGCCGGCTTT
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TTTGTTTGGTACTTGGACAACAACCACCTTTTCTTACTAGACCAACCAGGCACTAGTTCC
TGGTGTCAGTTTTTAAAGAAGAACGACCCAGACTTCACTCCGGGAATAAATTTTGACCCA
CAGTTTTTTAACCCTGGTTGTCAGGTTGGTGCTGGCGCACCCTGCTACCAGGTGACTCTC
GGTTCACAACATCCTATTCTTACATGGACTAGATTATGTTAAGAAGGAACTGATAGTGGA
TAACAATTATGCCTATGTTAGATTGGAAAAAGGGAAACACTGTAATTCTACATGATTTAA
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TATCACACACTGTGTCACCATAAGTGTTCATGGTAAATTTATTCAACACCATCTCTTTCC
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TGTTGCCATTTAGGATACTGGGATTTTAGTTCTGCCAACCATGGCTGGACACCCTTTGAA
AAGGAACTCCAAACAGAGATTGTCATCTGAATTTGAAGATAAAATGTACGCATTTGTCAG
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TCCCTTGGGAAATCACAATGATCATCCTATATCTATTTCATTTGTAGCAGCTCATGGATC
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TTTGGCATCCAAGTTGACACTCCCACCAGTAATCGATCGTGATGTTGATGCATCAGAGCT
GTTGAAAGAAAAGGTATATCCCGTTCATTTGTAGCAGTGCATGCATCATACGAATTCATT
CATCATCTTAGCTTGGACATTTATTTTCCAATCCAAGAATACATAATTTGCATACAGGTC
AGCACTCACCAGTAACCGGCGGCTTTTCGATGTGTCATAGCTGTTAAAAAAGTTATTTTT
TATGAATGATATGTTGACAATTTGGTTGCTAAGGGGTGTTGTCCCCGTCTCTTTATCAGT
TCTTCATTGAAAATGCCACTTTTTTTGCCGGTCGTTGTTGGGAATAATCAAGGTTTATGC
GTAGTTCTGGAAAGTTGGGCCAGTCGGTGTAAGCTTGTGTTAGTTGTGCCCGTTTCCTAT
CTGGTCCTAGACACTGGTTTTGGTACTTAGGGAGTCTGAATAGTTTTTTGGTCCTGTATC
AGAGTGTGAGTACGTAATCCAGAGTAGTATATAAGAAGAATTGTGCGTTGACTACCAAGC
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ATTCCGGGGCAATCAAATTGAATGAGACAAATGCGACATACTATTGCAATAGGGCAGCTG
CTTATCTGGAACTTGGCCGGTATGCTTTCTATCATTCCCTCGTATATTTTGAATGTTATG
AACTTTCAAGCTTATGTGTTTTGAATCTTATGCAGTTTCAAGCAAGCTGAAGCGGATTGC
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TTATGCTGCCTGCTGTGGCCTCAGAATGTGAAAGCATATCTCCGACGAGGCACCGCAAAA
GAAAGTTGTATGAATTACCAAGAAGCTCTACAAGGTTTGGAAATTTTCTAGCATGAAATT
ACTTCTTACTAATATATCTATATGCAGAAGTGTTATAATTCATGATACTCTTGCTGGTTG
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GGGCTACCTAGGATGGATGATTGAACTTTCTTTTCGAGGAAATGGCCAAGAGTAGAGTTA
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TGTACCTTACATATCATCTTCTTCGTGTACAGATTTCAGGCATGCTTTAGCTTTGGAGCC
GCAGAACAAAACAGCCCTCGCGGCAGAGAGAAGGCTACAGAAACATCTCAGGTGAGATAG
GGGCGGAGGAGCTGGAACCCTCCGAAGTAGCGAATATTTGGTTGTAAAGAAAGAGCCCCT
CTGCTCTGTGAGAAGAATTGCCCTCGAGACACTGGAGACTTGGCTTCTGTAGTGCTGGGT
GTCGTTGTTCTCATTTCATAAATTGAAATTTTGTCCGAATTTCATGAAGATATCGCCCGT
CTTCGCAGTACAGCGGAAACTGGCATGCTGAGAGATTGTAGGCCAGCTGCTGTTGCGCGG
AACATTCAAGTGTTCGGTTGAGTCTGTAAAACTTGTACTTGTGCTGCCATCCAATCAATC
CAATACGGCAACGTGTGACGACGGTACCTCAACGCCTTGCATTAACCGCGGTACGTACCA
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ACAAGTCCACAAGAGAAGGATAAGTCAGTGAATACCATACAGATATCCACGGTTCGCGGG
AAAAAAACAGCCTGAAGGCGCCTAACACGTAGAGCCGCGAACGACTGAACCACGTTCTTC
CCCGTGGAGTGGCGAAACGCCCGACCGCCGGTTCACGCCAGTTGGTCGAAGCAAACTGCA
CCGATGAGTCGCCCGACGGCGACCTGCAGTTTGTCCCCTTCGCTCCTTCCTCTTCGTGTG
AGCACGCGCGCGGCCTCGGTGTGTGTTGCGCTGCATGTCCGGGCAGTTGCTTGGATAAGC
AAGCAAACGCCTTCGTTTCTTGCACCCCATAGATAAGATCACTTGGTCTGCAGTAGCTCT
TTCCCTGGGTGATCGGTCGAATGGAGACGCAGCAGCAGCAGCGCCGGCACCAGCTCCGGG
CGCCCATGGACCCGCTCCTCTCCCTCGCCGCCAGCTTCCTCTCGGCCTTCTCGCCGCCGT
GGTCGTCCGGCGAGCAGGGCGCCACCACCACCTCCACGATACTCCTCCTGCCGCTCCCCG
TGGCGGCGGCGCGCGCGCTGTCCGTGCTCCGCCGGCTCGCGCTGCTCGCCACGCAGGCCT
TCATCTCCCTCTTCTTCGCGTTCCTCTCCGCGCTCTCGCCACCGCCGCCACCCTCGCTCG
CCCCTTCGCTGCCGCCGCCGCTGCGCGGGGACCGCGCGGGCGCGGGGGCCACCGC