Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_61377 (5206 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_61377

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72289 1 1621 bp MLOC_72289.1 Available Available LOC_Os06g36670.1, FRAME:-3, EVALUE:2e-87, 13106.m03794 protein bet v I allergen family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_72289






Contig Sequence (5206 bp)

>contig_61377 5206 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGTGGGGGTGATGGGGCGCGACCGATGGGGACGGGCCGCGGCCAACGGACGAGGGGGT
GCGGCCGACGCGCAACGGGGCACGTCTGATGGGGTTGGACGCGGTCGGCGTGGCCGGCTA
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GGTATGCAATGCCACCAGTTCGGTGCTCATGTTCATGATTTTGAAGAAGATTTGTTGCAC
CTTTGTAGTTTAGTAATGCGACTAGTTAAACTGAATTTGTGCAGTTAACTAAATTTTGGA
TGTAGTGTTTAGTGATTACAATGTACTATTTTGTAGTTAAGTGAATTTTGGATACAATGT
TCACTAACGCCACTAGTTAACTCAAATTGTTTTGTTAACTAAATTTTATGTAGTTAACTG
AGTTTTGTGCACCTTTGTAGTTCGGTTTTGTTGCTGATCTGTTTAGTGCTTACAGTGTCC
ACTTTTTGGATGCAATGTGGGATTCAACAAATGGGCAATGGGTGGATACTCCTTTTCTAC
GGCGTAACTTGAGCGTGGTGGAATTTTCCGTTAACCAATCAGTAAGCTAGAGTACCGGAA
CCCTTCTATGGAGGTTCTAGACAATGTTGATTCTACCACTTTCTCATATGTAGTCCTTGA
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AGGGCCTTTGGACCCGGATACACATCCGGTGCTACGTATCCGGGAC