Map Locations of contig_6116 (9567 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_6116

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72156 1 427 bp None Available Available None
MLOC_72154 1 626 bp None Available Available None
MLOC_72155 1 796 bp MLOC_72155.1 Available Available None
MLOC_72153 1 539 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_72156






CDS Structure of MLOC_72154






CDS Structure of MLOC_72155






CDS Structure of MLOC_72153






Contig Sequence (9567 bp)

>contig_6116 9567 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATATACTTGGATACCCCTTGGTGTGTCAAGAAACTTGAAGTCATCCCACTCCATTCCA
ACTACTGCAAGTTCAAGTCTTGAAGAAGAGAGCTCCAAGAAAGAAGAGAAGATAAAGGAA
GATTGTTTTGGGTGATTCCATGAACATTTCCTCTCTACTCTCAAGCACACGCTCATCCCT
TGTTCTTGAACCCCGGCTAGGTGTTCCTCCCATCTTACACCATTCATAACCTTTGTGTGT
ATGAGAGAGAATTTTTATGGGTTCTTGAGAACAGCATTGATTGAAGACGTTTTGAGGAGT
AGTACCTAGCGACTTGGCTTTGCTTGTTGCTCTTGGAGAATGTGTGCACCACCTAGGCAG
TTATGGGTCACATGATAGCCTTCATTATCAAGTTGTGATGGAACCAAGAGTTCATACAAA
GCTTAGGGACCGTCTTCTAAGTGTCGAGATCGACCCCTCAGTAAGGCTTCTTGGTTCAAG
CCATGATTTAATAGGTTGATTGTGCTTCTTTTGTCACTTAGTTGGTGACACAATCAAGAT
CTTTGTGATCTTGTTACAATTTTTTCAAAGACTCCTTCAACGTGGAGCAGATATCGTCAG
CTATCCAAACCATGAAAAAAATGCCCCGTGTCCCATATGTTTGCATTCTCTAACCCTTGA
ACTCTTACTTCCTTGCGGGTTACTCTTTCCGTTGCTATTATACTCTGCTTGCTAGGTTGT
TTAGTTCTAAAAGTTCTACTAGATTGTTGCTTCAAACTGTCATCTTCTAAAATTTAGAGT
AGAAGTTTTGATAGGACTATTGTTGCTTCAAACTGTCATCTTGCCAGATTGTTGATTCAA
AGTTTCATCTTCTAAAGTTCTATTACATTGTTGCTTCCTACTGCCATCTTGTAAAATTTT
GAGTAGAATTTTTTTGACAGTTCACCCCCCTAGTCCTTGGACACTTGATCACAACACTCG
GTAATATGATTCAGAAGAGTAGTGTGTGAAATATCAATAAGTGTTTGTACTCGGATTTAA
CTCTTGCTCACAATATTTTGCATTAACTATTTTTCAATATGTAGTAGCGAAACCTTTCAT
TCTTGTCCTTAAGAGACATAACTGGACACAAATGCTCGGCCCGTGGTAGTGCCTAATTAT
CATTGTTAGACGCCATAGTTGTGTCTCACAATCTCGATACAATAATAATTAGTGTAGACA
TCTTCAAAGAAAAGCCATCGATAATAGTGGTTACCTCAGATGGCTCTAAGTTAAAACCAT
CTGGAATAAGGAGGTTCAGAGGCTACTTTCGAGCCATCAAAAACACTAATGGCCATCACA
TGCTCCCTTTTTTAGAAAATTCAAAATAAATAAATTCAAAACATGCTCCCTTTTTGCAGA
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GAGATATGAGTATACAAAATGGATAACACCGGATATGCAGTAAAGATGCACATGAAGATT
CATTATTACAAAGTCGCACTGATTACAATGTAGTATTAAATCACCTTTCACTTTTCCCTT
TTTTTTCTCCTGAAATGGAGGTAAGCTCTGGACTCTTAACGGGATAAAAGGCTACAGCCT
CTCCCAGCAGTTTCAGAAGGAAAAGACATTCAGTTTATTCTTACAAAAGTTCAGGTTGTC
ACTGCTGCTCAGCGTGTAGTCTTGAGCGTGTCCTGGATGATTGTAGCTACTGCAGACGAT
GTCAATTGGAAAATTCTTGTGAGCACAAGTCAAGGAACCAAGCCTATACATGTATTGTAC
ACACAAGAAAAAAAACTGGAAAACTTAATCCGTCAGGAGCTGCAGATTACAAATATATGC
ATCCCTACCTCTTGTTTTAGATGATTTGACAGTGCCGGCCAGACTGTTCTTGGCAACGTT
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AATGGCGAACGAAGGAGGGGCAATTTCTGGTGTGTGTGAAATGAAACTGTATGTACTACT
CACAGTTCAGTCAAGTCCCCAAAAAGAACAAGAGATAGGACATCCAGCGGCACCATGCCG
GTCAGCATGTTCTCCTGAAGCTCCAAAGTTTGAAGCTTCGTTAGATTGCCCAATGACGCA
GGTATACCTCCTGTCAGCTTGTTCCCATTCAGCCTCCTGAAGACACAGACACCAACAGAT
TGTTTTCAGAAGTTGGAGATAATAGGTATTTCAGCATTATATTGTCCGAAAAATGTTGCA
GCAAGACTCATCATACAGGAAACGCAGCGTCCCGATGTTCCCGAGCGAGGCCGGTATCAT
GCCGGTGAGACGGTTGTTGTAGAGGCCAAGGCTGACCAGGCGTGTCAGGTTTCCGAGGGT
TGCTGGTATCGGTCCACTGATGTTGTTCCCAAACAGCTCCCTATGAAGATGAGAAGGTCG
ACCGTTATGCAGGAACTTTTGAGTGTAACTTGACAAGTCTGCACTCTGCAGCAAATTGCC
GTAGTTTACTTACAGGTACTGAAGGTTCACCATTTGTCCCAATTCAGGAACCAGGGAGCC
TGAGAGGCTTGCATTCCCCAAGTCCCTGCATAGTGAGGAAAAACACAATTATGAAAACGA
GCCTAGTGCAGTTTTGGTCCAAGTAAAAAGTTCTTCTGAACGTTCAAAAGAATCGTGCAC
ACTGCATTCAAGCGGAGTAGTAACTTGCTTTCAAGAAACTAGTAATTTGGACCTTGAGAA
CAGGGAGGGAGGAGAAAAGAGGAGAGGCATATATACACTCGGACGACGGAGTTGTCGCTG
TTGCAGGTGACATGGAACCAAGTGCAGGGGTTGACAAGCGTGGGATCCCAGCTCGTCAGC
ACGTTGTTGATGTCCTTCAGTTCCTGCCTTTGCCTGTAGAGGATGTCGCCTTCGGTGTTG
CCGCTGGCGATGGCTGCAAGAGCAAGGAGACCGGCGAGGACGAGCGCTGCTCCGGACAGA
GCCGCCATTGCTGCAAGGAGGAAGCTTGAGGTGTGTTGGGTTGGGCACACTGAGATGCTA
GACGAGGGGGTCCTTATATGCGGTTCTAGTTGGTATCACATCACAGAATGGTCCTCTTGG
CCTCGAAGCTTTGAACTTTCTCCTCTGTTGACCTTTATCCTGTGCTATTGTGGAGAACAG
TGCGCAAGTAACTGGCGTTTTTCACCAACGAAAGTTCAGCCTGTGAAGATGTGAAGACCG
GTTGAATTTATGGAAGAATCGTAGACTGGCCTGCAGAGTACCTTCGCCATGCTCCATGGG
AGCCTCCGCCCGAGATAATTTATTTCGCAATCGATCTCAAGCTCTTCCACTCAGGCGGAC
TAGCTTTGAATATTCAGCTGAAATACATGTTGCAGTGACCAAGTTTGTGGTGTAGTTCGT
CTGCGATTATTCAGTCGCCACTATAACAAATTTATGTGGCCAGCAGGCCGGCCGGCCAAG
GTACGCCATCTGGAGAACTTTCTGCTGTAGTTCGTCTGTTTTTTGGGACGTAGCGAACAA
TTTTGTTGCAATCGGCCGCGGCTCATATTCTTCATAGCTGAAAATGACAAAATTTCTGGT
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ACAGTAGAGACATTGTTTCAGCGCTCCAAGGTTGTTTAAGTGACCATTTAAAAAAATAGT
TGTTTAAGTGACACGTGACGGGCATAGACCAGGCCAAATACGCGCATAGAGTTTACTACT
CTCTCCTTTCGAAATTACTTGTTACAAAAATAGATAAAATAAATGTATCTAGAACTAAAA
TACATCTAGATACATCCATTCCTTGAACAAGTATCCGGACGGAGGGAGTATTAAATTTGG
GTCTAAACTAAAGAAAAAACTCTTAACCTAAACTATGAACTATTTTATGTTACTGAGCCG
GTTATTCTCTAAGTCAAATTCCAAAGCTTTGAATGTGATTAACCCTCGACGCCAGTTTTG
ACCACCAAAGCTAAGCTGAATTTTGCAGTCAGATTCGTTGGATACTTAATCTCGCGCACA
AGCTATCTCTTTCAACCTTCCATTCATAGTGATTCGCAGGAAAAAAAACTTCCATTCTTA
GACGCAGCTTTCCCGGCGTCACGTCTGTCTTGGACCTAAATGAATCAATTATCCAAAAGC
AACTAACAGTCAACAGCGCTTTCCACATAGAGTACCAAGATTTTCTAGATTAATTTTGTG
ATATCAACTCTGAAAATGAAAGCAATTATCACCAGTGTCATGATGTAGTCAATGCTTATC
AACAACAGTACTGTTGGCCACTTAGATGTCGAAGCAACACAAAAAAATCGATAGAAGCTA
CCAATGGCGCATGCATGCGCCCAGGTCCTGCAGCGATTATATATATGTTCGAGGGGCCAT
TTCTTCTTCCTAGCTACCAATTTTGTTTGCAAGGTACCCAAAGAGCATCGTAACTCATAA
GCTCTTTTCTATTTATCAATTGCCTCAAAAGCATTTTGGATGAGTCGATTTTGGGGGAGA
AACAGATCAGGGGCGGCACTCCAACGCGAGACAGGGGAAATTTGCCAACGGAGGAGAGGA
AGATGTTAGGTCAACAGCTGGATTGTAATCCGATTTCTAATGCTAAATCAACTAAAAATG
CATCATTTTCACGCAACTAAAATTTTCATTTTGACAAACTTCAAGCAACTAACTAATACG
GCTGACTGGGTTACCTCCTGATGTAATGGGCGATGTGGCCGATGATTTAGTCGAGCCAAC
TAGTTAATGGAATGTATGGTGTTTAACTTGTATGCAAAATGTTGAATATTATTTAAAAAA
TCTTTATTTTGTTCTTCATTGATAATCATGTATAAAAATTTAATTTTTAGTATATTTTCT
AAAAACTCCTTGTTATTTTATAAATAAGGAAAATGGAATAACAAAAACTTCAATAAAGAA
AATATGAAAAACAAGTGCCTAAAAATAAAAAAGAAAGAAAAATTCAAAAAAAATGTAAAA
TAAAGCACAAAAAGAAAATGTAAGAAAGCACACCCTAATCTGACTTAAATACGCTTGTAC
AACACCCGCAAAATAAAACGGAAAGCAAAACCATCCGCACTTATTGGGCTGGCCAGCATG
ACATCCGGTCTATGCATGCCCTATATTTTGCTGGAAATGAGTGATACTGTAGATAGCATT
TGCTGCTATTGTCCGCCGTTTCTTTAGGAAATCGCTTGGCATTACCTGACGGATTGCAGT
GGGTGTGTCCGTCACCTCGCTGGCACAATACTTGTCCAAGTGGAGGCTCGCCTATCACCC
ATATCTCTTCTTGTGTCCTCTCGCTCCCCACTTCTGTAATATGGGATGTGATGTGTGCTG
TTTTGAAACATGGATATTGTTGCAATGGTCTGCAATGGGGCTATGCATTTGAAACGTGTG
TGGTGTTGCAATGATGGCAACGGCGTGCGTCTGCAACACGAGTCTTGTTTGAAAGGAAAA
ACGACTCAGTCAAGATAGAGGTCGGACAGATCAGACGGCCATTTGGGGTTCTATCCACTG
GTTGCCGAGGCGATTGAGCATTTTGGATTATCACCCGACCGACACGTAGCACTACCTACT
TTAAGAACAAAAAATCCACTCTATTTTTTTTAGAGGTGAGCTTGCAAAACGACGGGCATG
TATAAATGTTAGCCTTGGTAATTCGGGCCCATATGCATGAGCTAGTATAGGTCAACATTA
AGTTAGGAGCCTATTTATCACGTAGTTTGGGGATAACGATGTAACTCGTATACCCGACGC
GAGCACTACTTCGTTTTTTCACCCATCGATTTTGGAAAGGTTCTAGAGCCTTCCCTGAAC
CAAATTTCACTCTTTTCACGCTTTCTATCCCTTTTTGTTTGTTTCCTTCTATTTATTTTT
CTAATTTTCGTTTTTTTCAAACCCACATATTGTTTTAAAACTCATAAAATTTATAGAATT
CATGAACTTTTCAAATCCAGGAATATTTTACAAATTCGTGACTTTTTTTGAAATCATGTA
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TTTTCAAACCATGCATATTATTTGAAAGACGTGAACATCTGTTAAACGACTGGAAGTTAC
TTTTAAATCTAGAACATTTTATGAAATTTGAGAAGAACTTTCAAAATATTTGAACATTTT
TCAAAGTTCATAATGTTTTTTGAATATTTAGAATTTTGGAACAACTTCCAAATGCATGAA
CATTTTTCGAATTTGCAAATATTTTTCAAATACATGAAGATTTTGAAAAATTCCAAATCT
CCATAATTTCTGAACATTTTTAGAATCGAGAAACATTTTTTGAATCGTTGAACATTTTCT
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TAAAAAATTGTAAATAAAAATTACAATCTTGACCGTACTTTCTGATTGGTTCACATTTTT
GAAACCTTGGAACATTGTTTCTAATTTGGAATATTTGTTAAAAGTTTGAACCATTTCTGA
AATATGTGAATATTATTAAAACTTGGAACATTTTTAAAATCCAAAGTTTTATTAAAGAGG
TAAAAGAAAATCACAGAAATGATTAAGGAAGGTGAAACCTAAATCTGAAAGAAGGGGCAC
CCCACGACGCACATGGCCACGGCAAGTGGTGCCCGTTTTGAGGAGCTCCTAGTCAGTGCT
GCAGGCGCCCGTTAACAAACCGGTGCCGGCAGCATCGCTGGCCTGGGTGGACCCACTAGC
ACGCACACGAGCAACTCTGTTTTTTTGTTCTGTTTTTTATTTCTCTTGATACGGTAGGAA
AAACCATCCAGTTTTCTAATTGTTACAAAAATGAAAATGTGAAATCAATAAAGATTTATA
GATTTAAATAAAAAGATCCATTCGTTTGGAAAAAAGTTCATATCTTAAAAAAGTTTCATG
AATTTTAAAAAAAGTTCATAAATTTGAAAAACAGTTCATTGAAATTAAAAAAAAGCCATC
CACTTTGGAAAAAAGTTCATCAAACCTAGAAAAAGTTCATTAATATTTAAGAAAGTTCAT
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ATCAATTTTCAAAGAAGTTCATCTTTATTTAAAAAAGTTCAAAGAATTTCAAGGTTTATC
GTTTTTCAGAGAAATGTTCATCAATTTTTAAAAATATTCATCAATTGTTTTATGAATATT
AAAAAGTTCATAGAATTTTGAAGAAAAAGTTGGTCACCTTGCGTCTGAATTGGCCAGCCC
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AGTTTTTAACACACGAGTGGGCTAGCCCATGTAGTGTTCTCATGTTATATGGGTCTTCTA
CTAGTATTAGCATTTTCTTCGCCGCAGGTTGCGAGAACAACTAGTTGGCGAGCGCTTTCT
CGGAAGACTCCAATGATCACTCAAACGGTTCGTTACTTGACGCGTTCATAGTCATCACCA
AGTGTCGCGCTCTGAGCATTCATTTCAGATTTTGTCTTTTATTTATATTTTTTGCAAGCG
TTTTTGGCTTTTCGGGTGGTTTTTTTCTGGGTTTCGTATTTTCAGCAGTCTTTCTTAGCT
TTTGGACGAAATGCGAAAAAATGCATTTTTCATGCAAAAAAACGCTTTTTCTTGCAACAG
AGGCACATATTTTGTTTCTACAAGACGCACGTCCGTGCCTCTCAAAAATTAAAAAAACAT
GTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTCCTCGAGAGACATGATTTTGCTTTCACAAGAGGTACTGA
TTTGTTTTCGCGAGAGGCACGGGCGTGATTTTCGGAAACGGAATAAAGTGTGTTTTCTTT
TGTTGTTCTTTCGCAAGAGGCACGACCGTGTTTCTGGAAAACGAAAAAAAACATATTCCA
TTTTTTTTCTTTCGTGAGAGGTACGGATTCGCCTCCGCGAGAGGCACGACCGTTCCTCTC
GGAAATAAAAAACATGTTTTCCTTTTTTTGGCCAAAGGGACGGTTTTGTTTTCGCAAGTG
ACATGAGTTTGCTTCGGCAAGCCTTGCCTGTCGAAAACAAAAAAAAATGTTTCTTTCATT
CCACGAGAGGCACGGTTTTTTTCTTTTTTTTCGTGAACAAAAAAATTCGTCAAAACCGAC
CAACATAAGATCTAGTTTTGAAGATCTCGATGCAAGAAATCCAACGATGAAAACGGTTCG
ATATTTGAAAGCACGGTTGAAGAGATAAGACATTTTAAAAATACGAATCTACAAAAATAA
GGAGGAACTCCCAGATTGCAACAAGTGCCATATATGTAGTGTGCTACTTGTCGCAACCTA
AGGAAGTGTGACTGATCTTTGAAAGCTGTAGTCCTCATTTAGTGATTTCGGCAGGTTGCT
CTATGTAAAAATAAATTCAAAAATAAACAAACATGTCCTACTATAGAAAAAACTGGTTAC
CAGTTTTTGACAGATTAAAAAACTATTGATTTTTTTAATTATATTCATGAATTTTGTAAA
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TTTGTAAATTTTCAGTAAATCTTCACGTATTTGATTATTTAAATATAATTGCAAAATTAC
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AACAATTAATTTAGGAAGCAACAATGAAAAGAGTAAAAACCGGAAAACCCAATGAAGACC
GATACACAAAACAAGGGTAAACAAACAAACTCAGGCTGAAGCGCAACCCTTATGAAGTTA
TTCACAAGTCATATCGATCTATCTCAAGAAGCACCATTGTGATTGCTTGTTTAGACCTGA
CCTAAATTAGTTGCCACTAAGCATTGATTGTATTCAAAGAATAAGGTTTAAAACGCAGGA
AATGTAAAAAAGTGAGAATCAAATGCAGCACGTATGGCCTTTTCCATCTCGAGGAGCGTT
TTTTACATATCTTTCGACAACACAAACGATGGAGAGTACATTATTATGTCACGGTAAACT
GTGGCCAGCAAAAAACAAGAAAAATAGTCCAGAACAACAGACTACCTACTTTACAAAGAA
AATGAAACAGAGGCCTCCTCTTCGATTTTCGTTAAGAAAATCACCTGGTCCCAAACAACA
AATGCTACCCCCTCCGTCTCATTAGTGTTAAAAAACATCTTACATTATGAAACGAAGGAA
GCATTAAACAAACAGGTAGCTAGTAGC