Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_60972 (4744 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_60972

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_72059 3 1343 bp MLOC_72059.3 Available Available LOC_Os11g31770.3, FRAME:+3, EVALUE:2e-37, 13111.m09235 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_72059






Contig Sequence (4744 bp)

>contig_60972 4744 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGCCGTGGACGCAGGGGCGGGGCAGGGCGCGACTGGCGAGGCGCTATGCGGGGCCGGCGG
TGTGTTGATGACGTCGCGGAAGGACCGCGTGCCGGACGACTCGCCCGTAGACCCGCTCCA
GCTGATGCGGCCGTCGGGGCTGGAGTCGTCGGAGTAGGAGCCAGCGGAGGGCATGGCGGG
GAAGCTCGTAGGAGAGGGGCGGTCGATGAGGTTTCGACGGCGGCGGCACTGGCGGGGAGC
TAGGCTAGGCAGGGAGCGGGGCGGAGGAGAGATATAACCCTAAGGTAACTAGCATTTGAA
GTGAATGAATGCAATTGTTGACTCGTTGTGAATGAATGCAATAGTTCATCATTATACTCG
TTGGTTCAACTTCTTGTACACTTCTGCCAGATGACAATCTTTGATTTTTTAAATGATTGG
ACATACTTGTAATATCTTTTTGAGGGATCAACCTGGTCAGACTTGGTGAGTCTGGCATAA
GCTACTTTATTGGAAATATATATTACAAGCAAAGATGGGGGAATGGCACAGTTGTTAATT
TGCCTTTCGGTGCCACCTAGCGTCGGTTTTACTTGTATAGTGTCCTCACAAATATGACTC
CCTCCGATCCATATTAATTGTCACTGATTTGGTACAACTTTGTACTAACAATAATTAATA
TGGATCGGAGGGAGTAGTATTATTCAAGGCAAAGAAGCCAGAAAAACAGCCTAGTCCAAT
TTTTTTGCCAAAATTGAGATTCAGGATCTTTCGCAAAATCATATATTAGCTTTTGATTAA
TCTCTGAAATCCGTCTCAATAAACTCAGTTTTTGATTTGTTTGAGGTTAGTAGCACCAGG
TTGGGGGGCAGTAGTTGACAAATCCAACTTTTGGAGAACCACCATCCAGACTTGCCATGA
GAACACACAAGAAACTAGATATGCTGAATTTCTTCTTCCTGATCACCCAAAGGACAAGCA
GCAGGATGTGGCAACCCACACCTAGATAACTGACCAGCTGTCCAACAGCGGTTCTTGACA
GCCAACCAGATGAAAAGTTTACAATGCAGCGGAGCCCCAGATTTCAAAACCCTTTCCCAG
GGCGCGAACTCAGTGGATCCCAGAAATAAAGCATCGTAGGCCGACTCACTGGTGTAGGGG
CCTGATTGAGTTAGGCCCCATTTGTGCTGATCCGGCGCATCATGGTATAAGGCTTCCTTA
ATGTCAGCCACCCATCTTCGGTTGGTAAGCGCTTGAGCCACTGTTCACCGATTTATGTCT
TGGGAATTAAAGAGTAGGAGACCTTGCAACTAGCGGTCAGACCAGAACTTGGTCATCCCA
CCATTGCAGATAATGGATTCAACAGCCACTCCAAATAAGGCATGGGTGTTGCGTGGATCC
TGAATTGGCAAACCAGCCCCTGGCTGAGCTGGTTTGGCCCAGTGTCTTACAATTCTCTTG
AAATTCAGTTCTAAAAGTATGTGTTCTTGCTTTTCGACCCCACTCTTGTATTCTCTAACA
TATCACGTATCCTTTAAAATACAACAATGGAAACCTATAATTTTAAAAATGGTAATCAAT
TGGTCATGTTGCTTCTCTATGCAGCCTTATATTCTGTCACCTATATTGTTGTTACCATCG
CAGGACTACTAAACTTGGACTTGTTAGCTCTTTTAATTAACTTGGTCACCTTCTAGTCTG
TGTTAACTTGGGAAGTCTTTTCTCCAGTATTATACAGCTAAAGAACAAGTACGTCTGCAC
CAAGAGTTTGATAATTATTTGGCTACATGGAGATGGGATCCTGCGGTGGATGACTTCTTT
TCTTTCATGGTAGAACATCATTTTCTGTTGTTGGAAATGTTCCACTATATGGCTCTACAC
ATCTATCTATTAATTGCTTTATGTATTGTTTGCATGCTGACTTTTTTTTCAGAGAACTGT
TGGTGAAGATGATGAGAACGGTCAGTTTGCAGAACTGGATGCCGATCTTGCCAAAATGTC
CTTTGAGGTACTTGTTACTTCGCAGAATTCCTTGGTCTATTTTACACTCTTCTAGTTCTA
TTTTTGATGATTATGTTACAAGTTATTCTCCTAAACATTTTTACTCTTTTATAGCGAATG
GCCAATATTGCTGTGCGGGAACGCGAAATGAACAGTTACACTCAGAGTTTGGGAGCTCTC
CTTCTCGATAATGAGGTATGGAAACCTGTTTTGTATCTTCACCTTAGCTTTTCAGAGAGG
TTAGGTGTAGTCTTTTCTCCCTGGTGATGCTTGTCCTTTTTCATGGAGGGCTCTACTTCT
CAATAATGCTGAATTTCCTATTTGTATTACTTCCCAAGACAAGATTTCTGTAATAATTTT
GAATATCTTGATTATCGAGTAATTTGATTTAGTACAAAACCCTCAACTGGAAATATGAAT
TGATGTTGATCTGTTGTGGTTATGCTCAGTTTTACCATGTATTTGCACTGAAAACTTCCA
GATGAAGGGTAAAGTTGCAAGTTTGATGAATCTGCTGGATGAAGAAGGCTTTTTCAGTAT
CGATGATGAATCTATTGATTGGGTACTTTTCTTAATAGTGAATGTTACTCCCTCCGTTCC
AAAATAAGTGTCGTGCTTTTAGTTCAAATCTGAACTAAAACTACCACACATATTTTGGAA
CGGAGGGAGTATATTTTAGTTCCATATTTTGTGTAGTGACCCTTTTTTTTTGCTTTTGAA
GGCTAAGAAATCATTTACAGACTTAGTGGAGCAATTTAATGCTTTGACCGGGCATTGCTT
TGATGGATGTTATGCAATCCAAGGAATAATGGTATACTTCTTTTGCTATCTCTATTGTCT
CATGTTACATGGTTGATTGGGCTCCATTCTTCTTCTCGAATATCAGGATCTTAAAAAATT
CTTACCAACGAAGGATGATATGTGTGATGATGCGGTTAAAATGGTAGGCTTCCTCCTAAA
GTTCAACCTATAACTCATTTTGTTCACACGAATTTTCCTTTAGATAAATGCAATTAATCT
TGGTCAACTTTTGACAGGTTGGTTATGCAAATGAGGCGTGGAATGAAAATATTGAGCAGG
TATGTTGAAGTATATATCTTGCTATAACTTTGGGACTTGTGTTATTGTGTTCATTATTTT
GTTTGGTTCTTCAGTTTTGGAGGGACACAAGGCATTATGAACATGAATACTATGACATGC
TCAGACAACCTATTGAAAAGGTGAGTGTTTTTCTTAATCCTCATGTATTGTACCTAAAAA
TTTTGTGTGTATGAAAATATAAATGTACCACGTAAGCTGCCATATAATGAATCTGATCCC
ACATTGCAGCCGCCCCTATCTTTTTCTCTGACCTCCCTTGACCTTTGCCCCCACTCCTTC
CCATATCTGGAACTGGCTCATTTTTGTCCGCTTGCCGCCATTAGCGCCCTGACTCCGCCT
CATGCCTCACCACCATTATTTTTTCTCACGTTTGTTTGCGCTGTAGTCAGCTTATATGCC
AAGCATAACTACAGATTAAGCAGCATAGTGACAAGCTTTGTACGTTTTCCCACAAAAAAA
GTTTTCGTAGTTGGATGGCGCACTGACGATTGGTCTTGTGTCAACCATGTTTGTTCCCGC
GCTGGTGGATTGTTGAATGATGATGATTGTAATGCGTGTGGTCTCTTCTGTCAGTGTCAC
TAGAGGTCTCATTGTTGTTTGCTTGCCGGCATTAGCGCCCTGACTTCGCCTCATGTCTCA
CCACCATTATTTTTTCTCACGTTTGTTTGCACTTGTTTGCACTGTAGTCAGCTTATATGC
CAAGCATAACTACAGATTAAGCAGCCTAGTGACAAGCTTTGTCCGGTTTATCCACAAAAA
ATGTTTTCGTAGTTGGATGGCGCCCTGACGCTTGGTCTTGTGTCAACCATGTTTGTTCTC
GCGCTGGTGGATTGTTGGATGACGATGATTGTAATGCGTGCGGTCTCTTCTGTCAGTGTC
ACTAGGACGCAAGGTTGTCAGGATCGTGATTCTGTTGTGCGATTCTACGACTTCACGATC
CAAACAGACCCCTCCGATTCTACGATTTTGGTTCATAGAATCTACGTTTTTACGATCCTA
ATAGTGAAGATTCTACGATTTGCGATCCTGCCATCGGAGCTCCGATCCGATTCAAAATCG
CGATTCTGACAACCTTGCTAGGACGAGACCCTAGAGGTTGTGGACGACCAGTGACACGGT
GCAATGAAGCATGCCAGACACAGTTTGTACCCCTGTATCGAGCAACCCATGGTGAGTTGG
AACTTAGGCTTGGTGGCGCCGCGTCACTAGTCTTTATAGGGTTAACCACTGGTTTAGTCA
ACGACGGGCTCGATGCCTTCCGCGACCAGCGGTGGGGCACTCGACCCGTCCGTCAGCCAC
GGGTTGGGGTCACCGACCCTTCCTCATTATGCGGTGTGACAGTCATTAGAGCAACTCCAA
TGTGTCAACGCAAACAGACGCAGATTTTGTCCGGTTTTTGTCCATTTGAGTTGATGTTTT
GGGTGGCACCACCCCCTTTCGCGTTTGGGTGGTCAGAGCAACTCTAGCAGATCCCGCATC
CCGCCCCGACCCGGAAAATAACCGCCAAAATGCGGGTCGGGGCGGAAAAACCTGCCCGAT
CAGACACCGCATCCCGCCCCGGTCCACAAAAAAATTTGGGGGCGCGGCAAAATCTCGGCC
CCAACCCGCGTATTCGCGGGTTTCCCCCTCGACGCTACGATGCCCTGCATATAAGCGGAA
GCGG