Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_60602 (3503 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_60602

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_71850 8 1706 bp MLOC_71850.7 Available Available None
MLOC_71851 1 367 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_71850






CDS Structure of MLOC_71851






Contig Sequence (3503 bp)

>contig_60602 3503 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTCTCTCCACTCTCTCTGGAACCCTACCCCCCCATCGCATTCCTCCTCCCGACGGCGCC
CGACCCTCCCCATCTCCCTCCCTCAGATCTCGATCCGCCGCCGCCCCCACCCCACCATGG
ACGACCACGGTATGGCACTCCACGCCTTCCCTCCCTCTCCCGGCGCCGCCGCTCCAGCCC
TCATCATCTTCATCCCCCGGCGCCGCCGCTCCTCCACTCCACCTCTCCTTGCCTCGCTGC
GAGAGAGAGAGGACCCGCCTCACTTTTCTGATCTCAACCCGCGTCGCAGCTCACCTCGCC
GGCGGCCATGCACCACCACGACGATGATGAGGGCCCCTTCAACGACTCCAGCCCCTTCCT
CCCTGACCCCGCGAGTGGCGTCGGTGACTATGGAAACTACGAGGGTAGGCCATCCATCTC
CTTCCCTCGTCTTTCTCTCGACATGCTAGTAGATGAATCTGTGTTTGCCGTTCTCCTCGC
CATGCTAAGATCCGTCGGTGCTTGGGAGCGGCCTGTTGTGCTCTTCTGCTTCTCTGTTTT
CTAATCTGCCTGCTCGATCTGTTGTTCTCACAGGGGATCCGCATCCGCCGCCACGGCCGC
CCCGTCGCGGCCCGGGCTCGGTCTCCAGCGGTACCGGGCGGAGGAATCGAGGCGTTACCT
AGCGGGCGGGCGGTAGGGGGCTGAAGCTGGGTTGGTTGGACAGTGGCCGGCTCAGATCCA
TGAGCGCGGGACCAATCTAGTTCACCGACTGATGCCACGGCAGGGGTACCCTGTTTATCT
ATCTTTTACTGCTTTTTTGTTTGTTTGTTTGGGTTTCTGCATGATGATGGATGGGGCTGA
AACCATGCCACCGCCTGATCGATGCTGGATGGTAATTGTGCTATGTTTTGTGCATGCCAG
TACTAGTAGTACCACTAAGTTCGTTCCTGGGCAACCAGCGTACAGAGGATTTGTTCGTGC
CTGACCTGTACTGTCTTGACCTCGTGTGTTCCTTATGGTGATTGAACGGCACTACAGATT
ACGTTTCGGTAGTACCATCGGTTTCCTGACCAAATTATGTCGAATTGCGTTGGCGGTGCT
TTTCGATTCGATTCTGATCCTACTGAACCATGCTGCCGTAGACCATAAAAGGGGAAGCTC
TAGTTGGCTATGGGTTTTAGATTTGGCATGTCTTTATCTTCACTGCATAAGGGGCTGCAT
CTAGTGGTAGTTGGCTTTGACTAACTGTGCATTTATGAGGCACTGTGTATTGTTGTTCGG
CAAACAAGCTCATAGTTGCCTCACGTGTTCAAGTTTTACATGGAAAACGAAAGATGAGAC
ATATTTAATTGCAGAGTAGCATATGTGTTTGCATCATGTGCAACTTTTCTGGATATCCTA
TATCGAGAGACGTGGTATACATTTACTTGAAAAAGGGAAAAACAATACCTTAATACAGAA
CCAGTAAGCAAGGTTTGATTGCTGCTATAGATGGCAATGAAGTGCAACAAGCAGAAGCAG
GTTGGCTTTGATGTCATTCATTGGTTTGTGGCATTGTGCTATTCTTGAACTGTGTATATC
CTCAGTACGTTACTGGTTAATATTACTAGAATTAGCTTTGTAACATCTCAAAAGAAGTGT
ATAAATTGGAAAAAAAAAGTCGGATACGATGATAGTTTGTAGGGCCCAGGGATACATGGT
AGTGAGCATTTCCAACTAGATGATCTTTGTGATGATATAGATGATTACTTTGTTCTTTAC
TTACCCTATGGCAAAAATTAAATTTGCGGTTGGTCAGTGTATGCACTTCTCTTTGACTAG
ATATATCATTTGATTGTTAGGTCGAAAGATCCAAGTGGCGTGAAAATAGCTACACAGCTA
CACGTCTTGTCCAGATCATTTCCTGAATCTGACTTGTGTGCACTAATCTGCTGGTGCGCT
GGACTGTTTGCTTAACCCTCTGTGTGTTTTGGTGTGCGCAGACCAAGGCTGACGTGCCGG
CACTGACGCGCACCAGTATGACGACCCGGAGGACGCCGCCATCGCGGTGCTGCTTGACTC
CCGCTTCGATGGAGACAAGGTCGATGCGGTCAAACGCCCTCCTCGCCCTCCTCGCCCAGG
GCGTCGACGTCGCCCGCCTCTTTCCCTAGGTTTGTGAGCTTATGCTCTGTTTTGTCTTAG
CAAGTCCAATTAGGCGTGTTCTGATGATAGTGATGAACAATAGTGTCTTCTGATGTGGTG
GTGCCAAACAAAACTTTTATTCTTATGCTGAGCTTACTTTTAATATTGTGAATATGAAAA
TTCGGAGGTTGTACTGAAGTTCCATTCATTTTATTCTGTGTCCTGAGCTTACCTTTGTAT
CTCGGGATTTTTTATTCATATGTCGCCCTTCCTTTGGATGTAGTTTATCTTCGTACATAA
ATCAATCATGGCATTCTTCCTATTTGCATTTTATTATGTTTTTAAAATTCCCTAGCACAA
CTACATATAAGAATGTGGGTCTGTGTTTTCTTATTTCAGTGTCTAGGCATCTGTGCATTT
GCATGATGTTTAATTATGTGCTATGGAATATACATTAGATGATGTAAACTGTTCTTCTTC
TTGCCTAATTAAATGCGCTTTGTTTTTTCAGTATGGATTCCCAGGTCAAGCTTGAAGTCA
TGGTGAAGGTGATGATATGGGTTTCCTATCTTCAGAAGTAAAATGTTTGCTTGCTACCTT
CTTTAGGGTACTGTTTTCTAATCAAATTGTTGGACACATGAGTTATTTATACATATCATG
TGCTATTTATGGTTACTTTTATGCACTGATGGCCACCTTCTTGATTACTTAGCTGAATTA
TGTTTTTGTGTATTAATCATCAGGTGCTAGCATTTGGCTTCTATGTGCAAACATGATAAG
TATGTATACTTCTTTGAGGTTCAAATTCTACAGATGTTGCATAATATTGGTGTCAAAGTG
TCTCTCCTTAGGGATTCATTTAAACCGCATATGAGCTACTAAAACAATTGTTTTGCTGTT
CAAACATGAAATTGTAGTTCTTTGTGTCAAACATCGAAATGTTGTTTACCTTGTCCTTCT
ATGCTTAAATAGTAAAAATGTCGCATTTATAGGATTGTACACCTGATTTGATCGGAGTAG
GATTTACTCGCTACTCATAGTTACTACCTGTATTCACTGATTTCTATGCATCATTTTGCT
TGTTTTACTCTTATTTACATAGACAGACTGTAGGAAAACGTTGCATGGGAAACAAAAAAA
TTTTCTACGCACACGAAGACCTATCATGGTGATGTCCATCTACATAGGAGATTTGGATCT
ACGTACCCTTTTAGATCGTACAACAGGAAGCGTTAAGANNNNNNNTTGATGTAGTGGAAC
GTCTTCACGTTTCTCGAACTGTCTCATGAACCGTCCCGCGATCCGTCCCACGATCGGTTC
CGATCTAGCGTCGCACGGAAGACACCTCCGCGTTCAGCATACAACTCGCCGCTGATCTCG
GCCTTTCTGATCCAGGCAGAGAG