| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
 |
Predicted Genes from contig_59922
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_71480 |
1 |
677 bp |
AK365291 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_71480
Contig Sequence (5147 bp)
>contig_59922 5147 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATATATATATATATATATATCGTCCACAAAAAAAATCATTAAATAAGTGTATGCATGT
ATATATGAGCGATTGTATTTATATTATGTCCAAAAAACCAACCTGCGCCGTATAACATGT
GTATTTCAATCGGCGCGTCTTCTTCGTATGGCATATCCGTACAGCACGTACCCCGTCCGT
CCGCATGTACAATACAGTTAGTTAAGACAGTTATTTTGGGACGAAGGGATTATTACATAT
TTCATTCAGGCAGATACACTGTTTTCCTGAAAAAAAAATACACTGTACGCACAGCACAGT
ACATCACACGTATCATTTCATGCACTCACAGTGATAGCACTCCAGTCTCAATGCTGCACC
AGTGCGTGCGTCCGTACGCTGCGCGGCAGCGGATAAGTGGGGTGTGGGTCGGTCGCATTT
CCGCCACCGACCGCACAGTGGGTTTTGCCGGGAGCCACACACGAAGCCATTTGAACCAAG
GTTTATTATAGAGTACCTCTGCTGTGCATGCATGCATGCGACGCACGGCGGCTGCTGCAA
CTTTTGGCAGTGGCCGTTTAATTGGCGATATCCGGCAAAGGTGACGGCAATGCCTTTACG
ATCGGGTCTACCACCTGGACCGATACATTATCTAAACAGTGGACAGTGCATTGACACGTA
GTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGACATTTTAGGGATTTCACTAGAAGACTACATACG
GAGCAAAATGAGTAAATCTATAATCTAAAATATGTCTATGTACATNNNNNNNTAGTTTAT
AGTGCAATCTCTAAAATATAGTATATTTAGAAACGGAGGGAGTAGTACGTACGTACGTTC
GGGCACACCTGGGCTCCATGGTCCATGGATCGGTACAACAGCTGTTCCATATATACGTAC
GTCGCCCAGGTCGATCGTCTCAACTCGCTCGAACGCAGGATAAGTTCGGATTGCGAATCA
AATCGGTGGCCGTTGAGTGTGGATTTATACGTGGAACGCCCAACCCTCTTCGTTAGTTCG
TGATGAAACGTAACATCGAGCACCTATGCGATCGACGACACAGAGTTGCTCCATTACCAC
ACATTTTTTTTGAAAGATTTAATGGTTGGGAGATAAACCACTCCAACACAATTTTCCTAT
ACTATTTTTGACAAAACAAAATTATACCCGTGGGCCGTGGCTGATGCTATGGGGAAATAA
CTTGACCAAATGCATTCCTCGAATACTCTCCCACCCTCGAGACTATCCACGTACCCACAC
AGAAATCCTATCACCCGTGCGCGGGGCGGATTTCTCTAGCGACCAAAAACCCTAGCCGCT
GTCGCCGTAGCCAAGAGAGACAACTGACGTCGTTTTTCGACGGCTCTCATTCACGGGTGA
CCATTTGGTAGGTTTTAGGGCCATAGTAGCTTAGGTTTTTGGATCGTCCGACGTCTTGGC
TTCGGCAACGACGATGTTGAATAAAGAAGCTTCAAATTCTTCTCCGACGAGGCGATCGTT
TTTATGGTCGGTGATGCATTTGGAAACCAGTCTATCCAAACAGGGATATCATGCCGACGA
CGACATTCTTGTGGTGGACTTGTGTCCTCGGTCTCCGCCGTTGCGATGACGTTTGCTCGA
GCGTCGATGCAGAGCTTGGAAGGTAGTTCAGGAGCGGATGCAGATTGTGGTCTGCATCAC
CTGAAATACGGGGCGTGTGTTGGGTTCGTGGTTGCTGGATGGCAGGTACGGCTTCCTTTT
TCGGCATCTTAGTTGTGGTGGGGTGTGAGTTCTGGAGTTCGATGGCGTGTGCGTGGTGTT
GCCCCGGTCTGATTTGTCCAACGACAACGACTTCATCATTGATGAGCCATCTTGGAGGTC
CGCAAAGTTGCATATTAGCGATGGAGCCGCGTCAAGCTCGGGTAAGAAGGTGATATGTCA
TTTTTTTTTCTTTGGTGGTTATTGTGGTAGTCCCGGATGCAGAGGCCGAATGTTGGTGTC
AAGCTCAGTGATTGATGTTCTGCCGTCTTTTCAGGTTTATCATGTCGGTTGTTACATGAC
TTGTCGTGTCAAGCTTACAAAATCTATATGCGGATTAAAAGGAAACATATGGAGTACTAT
TGAAAACTGATTGAAAATGGTGTTAATTTTCCACACAGTTCTATGTTGAAAACTAAGATT
CCATTGACACTTCAGATCTCTATGTGGTATTTTCCACACGGTTCTATGTTGAAAACTAAG
ATTCCACCAAGAGTTCAGATCTTGTGTGGCTATGTTCCACACGGGTTTGTGTTGAAAACT
AAGATTCCACCGAGAGTTCAGATCTTTTATGTGCTTATTTTTCACACAGTTTTATGTTGA
AAACTAAGATACACACGAGAGTTCAAATCTTTATGTGGTTATTTTTTAGGAATAGTATAT
TAACAATAGACAATTTAATCAAGATGGGAGGGGTTGGTTGGAGATCTTGGCCTTTTTGTG
GTTTGGATGAAACATGTCCTTTCTATTGTTTGGGTAAATTTATTGATCATATTTTCATAA
AGTGTTCCTTAGTTAAAATGTTGTGTATTATTATAATATGTGCTTTTAATTTGCTTGATG
TGCATGTTAATCTGAATGGTTTGCTTAATACCTGGATGAATAAGTACATATCTGATGAAA
AATACTTGGTGTTTGCAAGTGTATTCGATATGTTTTGGACCATTTAGAAAATAAGAGATA
GCACCGTGTTTGATAATGTTGTAATTACTTACCCTTGTGTCCCCATTAACATGATTGCCA
TATGGTGGCTAGATTATTTTGCACAAAAGCAAGAAAATGAGAGAAAGCTGAAGTTGTTGG
CAAGAATACTAGACCAGACAACAAATGAAGACTCGCGTTTTGGTGTGTTATAAATAGAGT
GATGGAAGATCTGGGGAAGTCAGCATGTACTAGGAATCTTGTTAAAGAAAAAAAATCTTT
TGGTTCTTCGTTGTCAGTTCAAGTAATGTTTAGCAGTTTGCTTGTGTTGTTTATATGGTT
GTCGGCTCGTTTTGTTGAATTGGTATAGGAAATGTCTTAAACATTGCTTTCTATGTTTCT
TCGGTATCTGCTGATGATGATCTGAGGCTTCGGCTTGTGGCTCCCCTAGATCATGGTCAG
TTCGCGTCTTAATAGGTGTTCTTAGATGTCTGGTTGTGGTATTTTTATTTACTATTTAGT
TGTTTGTAAGAAAATGCATGACAATTTTTGATAAATAAAATAAAAGGGAGAGCCCGTTTT
ATTAAAAAAAGTTACCCCATGTTACTCACTCTGTTCCAAGGTACTACTATATTAGTAAAC
CAATCGACGCTTTCAAAATGGCTCAACGGTTAATTCAATTTAAAGGAGCATTAACTTGTA
GAATTCTCTCGTAAATTGGAAGATGATTTGCACAAGGAAGAAGTTTGACAAGTTTTGCAA
ATCTCTATGTGAAAGATGGACTTGGTTCTAGTGGAACAAGCCTCGGCTTGGCTGATGTTT
TGTGGCCCCAAGCTGCCTTGCAATCTAGCTTAAAGGTAGCTTAATCCATACCTCGACGAC
CATCTTATTCAGTCATCACCTGTGGATCCAAGTGCTCATCCAAATGTACACATGTTTTCT
CATTCTTAAGGGAAATGATGTAAATGCACTTTTATTTTGACAATAAAAGGCAGGGGTTCT
GACGATTTTATTAAGACGGAGAAACAAAACGTATAGTGAAACGTTTATTAGGGAAACTAG
GCAAAATCCCATAAAGCCCAGCAAAAGACCGAGAGAAAGCCAAAAATCGAAAATACACTA
GAGCTTGAGGATAGGGACTCGACGTACATCTTCATAGCAAATGGAAACTTTTACGAATGC
GGATTTTGGGTTGTGGGAATCATAACCTCCCTAATAAACATTAAAACCAAAATGAATATA
GTACATAAAATTTAAAAATTCTGACTGTTTTTGTAGATATTAGTGTGGCAAGTGTGCTTG
TCGGTTTTCACGCCATATGATATAGCAGCGCTTCGTCGGTGAAAAATCAAAATCAAGTGT
AACATTTGACGTTGGACTTGTTTTTGTCATTCACATGTCAAAATGCTTTTTCACCCGCAA
ATTTGCATGTATCATTTGGACGTGACAGTCAACCCATCATTTTCTCTCAAATTTTTGACA
CTTGTAAAATTCATTTTTGGCCTAGAGCCAAATTGAGTATCTGCATATTTTTTTTTGAAA
TGCACATTTAATAAACTTTTTAAAGGTTGCTATAAAATGCAGCAGAGAAACATGCGCCGA
CGAGATTCCCGCCGGCCGCCGCCATTTCCGGCCGTCAGTGCCGTTGCCATTTACAGTTAC
AGTACTATACTACTACTACCGGACACTGCTCCGTGTCACCGCTCCACGTGGCCTCCACCG
CGGGCCTACGTGGCCAACGGCCCCACCTCTCCCGGCCGTTGCCTCCTCCCTTTTAAACCC
CGGCGTCCACCCCGCCTCTCTCCAGTCACTCACCGTCACCGGCCGCCTCCAACGGTCACA
TCCCCTTCATCACTCTCCATCGCTCTCACCATCACCGCACTCATCCCACAGCGCCCGCAG
ATTTCCCCCAGATTCGATCACTTTCCACGGCCAAGAAGCTTCCAGGATCGGATCCGATCC
CAGGCGAGGTCCGTCAAGCAAGGAGCTTTTGCCCCGGCCATGGTGGAGATGGAGGAGGGG
GCGCGGCGGCGGGTGGTGGTGGAGGTGTGCAACGCGCGGAACCTGATGCCCAAGGACGGG
CAGGGCACGGCGTGCGCCTACGCCGTCGTCGACTTCGACGGCCAGCGCCGCCGCACCGCC
ACCCGCCCGCGCGACCTCAACCCGCACTGGGGCGAGCGGCTCGAGTTCCTCCTCCACCAC
CCCGACGCCATGGCCGACACGCTCGAGCTCAACGTGTATAACGACAAGAAGGCCGTCGCC
GGGACCGGGTCCGGCCGCCGCGGGGGCACCTTCCTCGGCAAGGTCAAGGTCGCCGCCGCC
TCCTTCGCCAGGGCCGGGGACGAGGCGCTCGTCTACTACCCGCTCGAGAAGCGCAGCGTC
TTCTCGCAGATCAAGGGCGAGATCGGCCTCAAGATTTGGTTCGTCGACGACCCCCCGCCC
GCCCCTGCCGCTGCCCCTGCTCCCGCGCCGGAGGGGGAGGCGGGTCA
