Map Locations of contig_5946 (9240 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_5946

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_71267 3 1245 bp MLOC_71267.1 Available Available LOC_Os01g13130.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-90, 13101.m01443 protein aquaporin protein, putative, expressed
MLOC_71268 2 1513 bp MLOC_71268.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_71267






CDS Structure of MLOC_71268






Contig Sequence (9240 bp)

>contig_5946 9240 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTACTCGACCCCGCGCGAGAGTGCGCCGTCGCCGTTCCCCCCCTCGAGGGAAGGTGGGC
GACACGGCGCCCGCCCCCGCCGCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCGCGCGCTGGCTCCACAGTCGCGCCCTTCGGCGCCATTACCGACCTTCCCACAGCAG
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GTGGCGGTGTTCGCGACCGCCGGGTTCCACATCTCCGGCGCCCACATGAACCCGGCCGTC
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TGTTGTTGTTTTTAACACACATTCTGTTGCACTACCCTGTTGTGTATGTACCTTGAGAGG
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GAGTTGCAACTGTACTTGTCGCATCCCGCCTACAAATGCAAGTGGTACAACATGGCTACA
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TCGGCCAGTTGTTCATCACTAGAGTTGCAGCTGCATGTGTTGCAACCCTTCTGCAACTGC
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GACGGATCTCCAACCAACACCCACGTCAACTTTTTGAGGAATCGGAGATTTGTTAGAGCG
CTTTGTTCATAGGGATTCGTAGTTCGTACGCCCATCTATCGATTAGCCATGGCCTTGCGA
TTCTTCCTCAAGAAAACCTACCACCCGTTGGCCAGATCAGGAGACCTCCTACACGCGTCT
GCTCGGGCGGCGGCCGCCGCCGCTCCGGCTGCCGGACGTATCTCGGTACGTACTCTCAAG
GTGTTCTTGTGCTATTCGTTCATTTGAACAACCCCATGGAATTTATCTTGTTTCCGCACG
TGGGCGATTGAATGTCTCACATATGTTAGGTTGGTACTACTCAATAATGCTTATGGTGGA
GTTCTCTGTCTCCACCCAAGCCTGGCTATTGCCCAATAATATCGGGCTCCTTATTTGTTA
GGATGCTATAGCAGCCGATATACAAGACATCACCGGAGTTTAACCCTAGGACCAAATCAG
TGTGTCTTGCCTCCTTGAGTGAATGCAAAGACCTCCTATTCAAATTTTGCAAAATACAAA
AGCATGGCTCAACTGATAAAATTAAGTACTCTAATTGCAGTCTTGGACCCTGACGTTAAT
CTCACATGTATGTTTTTTGACTTGTTTTTCCTGATTATACTTGTCTAACTGGCCAAACCT
TACCTGGCCAGGTTTACCTTCTTGAGTGAATGCTAGGTCTCCTACCCTACTTTCAAAGGA
AAAAAGAAAACATGGTTCAACTGGTAACATGGTCTTTGGACCTGGCATTAATCTCAATTC
TCAAATTATGTTTTAACTTGTTTTTTGGGGTTACGCTCTAAATAGCCAAACCAACCCATT
GTCTCTCGCCTTGTGAATGCTAGAGGTTCTCTCCGAATTTTGATTAAAAAAACATGTAAT
TTAAAAGGAGTAATGTGATGTTGGACTTCCACATTAATCTGAATGTTCGAATTTATGTTT
TAACTTGTGTTTATCTTGAGTACATCTCAAGTGGATGCTAGAACTCTTATCCAAATTTTA
AAAGCTAAAAAAATGGTTCTGATAAAAAGTATATTCTTGGACATGGCAAAAAAAATCTCA
ATTCTCAAATATATATTTTCTCTTTGTTATATCTCTATAGATGGCCAAAACTGTCCCAGT
TTATCTCTTCTCCTTAAGTCAATGCTCCTGGTTTAAAAAGAAGTAACCTGATGTTGGGCT
TCTGCATCGATCTCAGCACTCAAATATGAAATATCTGTTGTTGTTCTACTGAACCGTGAA
GGGGTGGGGATTATTCTCCATTCTGGGATGCATGTTTTGATCTGTTCTTTTTCACTTTGC
TAGATGGTCAAATCTGTCTCTTAAGTGGAGCAATGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGG