Map Locations of contig_58983 (14640 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_58983

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_71026 7 3208 bp AK366112 Available Available None





CDS Structure of MLOC_71026






Contig Sequence (14640 bp)

>contig_58983 14640 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACCGTGAGCGGGAGCCCGCGCCGCCGACGACCGGGCTGACCTAGGTTCGTGCTCCCCCTC
TGGTAATTTCGGTAACCCCTACGCGCACATGAGATTCGTGCCGCCGGAGAACCACCTCTC
CGCCACGGGGACCGGGACTCCACTGGCTGGCGGCGGCGGCCTCGCCTTCCCTCCCTTGAT
GCTGCCCCCGGTAGAGTAGTTCCAATCCAGTAGATTTTTCTTCTCCTAGTACTAGTTTAA
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TGTAGGCTATTCGAGCTCTGAATTGGCCAAAGCTTGCGGGCAACGACAAGGATCCACATC
TCCTTCCCTACCAGGGCTTGGTCGGAAAAGAAGCCAGTCCCCAAATCCCAACTACAAAAA
GAGCAGTTAATCTCCTCTGGCTCTGGCTGCTACCGTAGATCTAGCCCTCTTTTGTTGGTA
AGTCCTCGATTCGTTTCTCTCTGTCGCAGTTTGATCTTACTTCCTGCCATTAGCAGTCAG
ATCCTCCAGCCACGACTAGTCAGATCTTCTTGCAGGATCTGATCCAGTTCCTGGTTGCCC
TTTTTTTTGCCAAATAATGTACTGTATAAAAAAGTAAAAAACCAACGCTAGATCAGTTTA
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TGCAGTAAATTCACACCAGTACATCCGTCAAGCGCATCCACGTTTTCATACTGGTACCTT
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ATATTTCCCACTTCAAATTTCAGATCTCAACTGCTGAGACGACTCTTAAGTCTTCTTGCA
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AAAGCATGGCATCTTAAGATGCTGAGCGGCAAACACTATTTGTCACCGGGTCTCTTCCTC
TTCTGCCAAGCCACTCTGATCTTATCATATGGTTGTGATGGTTATTTCTTTCAGGATAAT
CTTGGTTACCTAGGTTCAGTTTTTAATGCCATTTTACTGATGCAATCTGTTCTTTGTGCA
GGCACTTCTTGTATGTGCTGATTTTGGTGGTCTCCTGTGACCCAGTGGGAGTCGAACTGC
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TTGCTGTTACCTATACCAACGTTTTATGGCGGTAAGGCGAGGCGCTGGGGGGTGGGGGGC
GCCTAAGCGCTAAAGCGTAAGGCGACCAGGAGATTCAACAGCTAGCATTAACATAATAAA
CTGTACATACATATATAATAGATGGCAGCCAGTTAGAAGATTTAACAACTAGCATTAGCA
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GTTTAAGGAATTGTGCATCTCCATGCTAATCTCCACGGATGTCTCGGGGCACTTATCCGC
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TGGGGAAGGAGAGAAGTGTGGTGGTGGGGCTGCTGCCTTCTGGATGGAGAAGGAGCAGAC
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TGGCAAGCTTTGGTGCTGGATGGAAGAAAGAGCAGGGGGGGGGGAGAGAAGAGAGGGCAG
GAACCATACCTTGCTGTGGTGCTGATCTGGTGGAAGAGGGTTCGCCAGAGGAGGAGCTGC
AGCCTGAGAGGGAGTTCACGACGCTCTGCCATCAGGGAGCGCCTTGACGCTTTGCCTAGG
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GTATCTTCATTGCCTGGTAGGTAGGTTTGGTATCCAAATCCCATGGTCTTTTGGCACTGT
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AAGAGTGTACTGTGAAGCATGTCAGGTCTGATGTCTTCAGGTTTATATGGGGTTCCATGT
GAATTTTGATGGTAAATGTCTATCTCCGGCGGTTAATGATTACTCACAGGAAATATGTAT
ATTAAAGTTAGCTAGTTATGTTATGTGGACCAGTCAAGTTGTGTTGTATGATGATGGATG
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GATGCAAAACGAAAAAAGAGGTAAAATTATTGAATGAACATAAAATGAAGCATTTCTCAC
TCTTATGGGTGCATTGTTTCATATTTAGCTGAGCATCTTGCGAGTGCTTCTCATAATAAT
TTTCATCAATTCATTGCGTACTAGAAACTTGAATGGTAGATCGGTCAAACAAGGCCTAAC
AGGTTACTTAAGCTATTCTCAAAAGAGTACACTTCGTGATATAGTGTGGCATGATTAAAA
GTTGAAGCTTGTTCCTGGCAAATACTGACCTGTGTTTGTGCTAATAAATTTAGGATTCAG
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TTAGTTCATGGAAGGTAGTGTTATGTGTCTATCAGATGGTCTCTTTGCTTATTGGTAGCT
TCACATTGCAGCATTCTCCAATGTATCGGTTCAGCCGGGCTTTTGTCCTGACTTCCTTCC
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TGTCGACCTCCCAAGGTTCCAGCGTCAACATTATCCTTGTTAGCTGTGGTATGGTCCGCA
TCCTATGTGATTATTTGTGAATAACACTTCTTTGCAGTCATAAAATCTGATTCCATTTTT
CTCTTCATTTCAAAAGGCCGAGGTGGACAGAATCTTGGTGAAAACTGCTCAGAGAACCAT
ACGGAGTATTCTTCTCCTCAAAGTAAGTTATGACTGACATTATGTGGTATACGCTTAACA
GTTGATACAATATACTGTTAGTTTGTTATATTGGGGTTGATCTATTTTTTCTTCTAAACA
TTAAAATCTTGGCTGAATGGATGCTAGAAGCCTTTGCTCAACATCTGCATCCAAAAGATG
GAAGAGGGCTTACCTTACTCTTCTAGTCTTAAGCCCAACAATATTTTGTATCCAGCACAC
ACCCTGTATGAATGGCAAACAAGCAATCTCATTATTGTAGCTATCACTGTTAGCAAATAT
AGTCTCGAACTTGTGCCTTAAAAATTATTAAACACCGGTTTTGTATCTCAGGAATGAACA
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GTTTCATAGAGGTATGCTCTGAAGTTATTAGTATGTTGCATATTCTGACGTTTTATTGCA
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TGTTATATGACACTTCTTTCACGAAAAGAAATCACCTTACCACGTTCACTTTCACTTTGC
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CTGCCATTTCTTTTATATTTAACACAAAAACTGTTCGAGCTTCAGCATATGGAGCATATT
TCCAATTGTACCTTTATGAATGGTGCAAATTAACACTTATTCTTCCATTGAAAATTTTCA
ATGCTTGCTAAAGCAGAAGGATAGGCCTGTAGAACAGTACTTGACCTAAGGTGCTTGTGG
TAAGTTGGCATCCAATGACATGACAGTGGCAAATTGCACACAGTGAAATGTATCTTTTGC
ATAAACTTATAGGTGCATGTGATAAACTCTCAAAGTTAACAGCACAACAGTCTACAACCT
TTGCATTAATCTTGAACATATCTCCTTGCTTTCATTCCCAGCCCCCTCAGATTTCTCTAT
CATCTTTGCTTTCTATGTAAATTGTTTCCTGACTCAGCTTTTCTTCTTTTGGTATGCACA
CAGCCATCACTTCTTGAGCATGGCAGTTGCTTGACATTTTGTTCTCTGAAGGCAGATGCT
ACAGTAAGCTCTTTTCTGTTTCTTCTTGTAATCTAGTCATTATAGCTTCAAAATTTGCTG
TTTTTTTTTGGAGTATAGCAACACCTCAGTTTACTGAAAATTGTGAGTTATTTTCAGTAA
CTTTACTTAGATCCTTGACCTCTTTGTGTTACAGGGTTCATATAAACTAAAAGCAAGCAT
AGATGTACAAGAGGCAGGTGCAAGAGACATGCGTTTATCTCCTTACAATGCTTACTCATA
TGATGATGTCCCGCTTTCGTTATTACCAAAAATCTTAAGGTAACAATAACTCATCGTACA
TAGCTCATTTCTGAAATATTAATGAAGTTTTGTTCCCTACTTCTAGTCCTGCCATTTTTA
GGAAATGCATGTTCTTAGCGCTTGTTACTTTATCCCTCAAATTTGAGATTTTATTTGCTC
TTCTGAGTAAAATAAAAATCATTACATATCATCGTCCCTACTTCTAGCCCTGCCATTTTA
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ATAGCTTCTGGTGCCACCTAGGCTCTCTTTGTAGCAACTATTGAAGTGGGGTGAGGAAGA
TAGGATTTGACAAGGAAAGTCAAAGGGGCGACAAGTGAGAAGGCAGAGATCATGCGAGAG
GAAAGGGAGGGGAAATAGGGCAGGAACAGAAAGCATGGACACTCCTAGGATGTGTTCATT
CCTTGATCAGATCATTGTGTGCTGTTTATGTGGCGAACTGGGGATTGCAAAGGCTTGCAA
GGGTGTCACCTGGATTTTTACCCAGCAGACGTACGCCACTTAGCAACACCAAATTAATAT
GTTATTCACACTCACATTGGCCTTTCGGATTCTGGGGGTGGGTGTGCATAGTCTTGAGCA
CAGGCAGAAGTGAGAAGTCAGCATATCCTGTAACCTGGTTGGGCATAGCCAAGGGTTACA
CCAGGTCTAGTTGTCGCATGTTTGCACCTTGCTTGATTAGTTGGGTTCAATTTTTTTTGT
CAAATACACTTCAAGTTTGATATAACAAATTTCACTGTAAATGTTGATTCTACAGGTTAA
GAACAGGCAATGTTCTCTTTAATTACAAGTACTACAAAAATTTGCACAAAAGCGAAGGTT
GGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCNCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTGGTCTCTTTCC
AGTGTCACTTGTTTGCATCATGTATTGGCATCTGTCTTATGTCCAATGCTTGTCCCATAT
CCACTTTTTGTATCTTTGTTTGGATGGAAACTAGTATCTTTTGTATCTTTGATATTTAGC
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CAAGCTGCATCTGATTTGTCATACTTGGTACTTTCTTTGATTGCTGTTCATGGTCAAGAT
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CTTACCAGTTACAGAAGGCTTTACTTGCCCTTTTTGCTTGGTACCGTGTGGAAGCTTCAA
GGTAAAATCTGAAGCGAGATTCATTTTGTTTAGCTCATGTCATATACTCATGTTTCTCAC
TGCTGCTGAGCGATGGTTCTAAAGATCATCTCACTTGCTACATTTGTGACTGAAGAAAAT
ATTTTCTTGTTGTTATTTTGCACCACTACGGTGATGTTTCCCTTTTCTACGCAGGAAATT
CTGCTTTTGTTTTCTTTCTCCATAGTTCCACTTCACCTTTTTGTTGAAATCGATAGACTT
TTACTTTTTGTTGGCTAAAGTCATATTTCATATTGTGATACTAGGGTCTGGAATGCCATT
TAACCTCGTCGCATGACCTATTCCACTTCGAGTTCTGGGTTTGTTTTCCTCTGAAATTTC
CATTCCAGAATCTTTTTCAATTGCACTGTTTGATAACTAGCTCTTTTTTCTTATTGACAC
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AGGTAAATTGTGATAAAGGATTTTGGATGTACTCACCCTCCACTAACAGAGTAACAAAAT
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TAACATTCCTATGGATGTTACACTAATACAATCTCAATGTTGGTCCTAGCTTAGTTTTGC
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TTTTGAGTTAGCTGGGATCGATAGGATCCTGGTCCACATGATCTGGACATAATTTGGGTG
CACCCTTGCCTTTTGCTTGCATTAAAGCCCCATTTCATAAAAAAAATACTGCTTTTATAT
TGGGAAAGCTAATTCTCTGTTTATTTTCCCAGCTTCTGACTATCGCAGGAAATGATCCAG
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GGTTCCTGCACCTACACAAATGACTGAATCAAGATCGTCTGAAGATGGCCAGAAAGGGTC
TGAGGTGGATTATGTCCCAAAGGAAAATGGTACATCTCACATCTAATGGGCTCTTGGTAT
ATTGAACAAACTATTTGCCACTATCGTTAGCCCTGTTTCACCAACCCTCAAAATATTGTC
TAAGTTTTGTGTTGAAATGCCTATCTTGCCGTTGAGTATCCGGTCAGATTGCACCCAAAT
GCAAGTTCTTCTCCCACGCCCCATCCTAATCCCAAACCAACCTCCAAACAATTTTCTTAA
CACTTCATGCACTGCAGCATGCTAGGAACCCTAGAAGGTTCAGCAATGTCAACCTTTTCC
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TAGCTACTGTCAGGTGAACTGGTTAATTGTAGATTTATCATTATAATTCTGCTAGCATGT
AGAGGAAAACCTACAATATTGCCTGGATTTCTGTTTTTCTTGTGCTCTGGCATTCCTGGT
GTCGGGGTGTCCTGTCCGCATGTTTACTCTCTTTTGCCTGAAATCTGTTGCATATATTGT
TCCTGATGTTGCCCTTAATTTTCGCGGATTTTCCTGATGTAGTCTATATTTTCAGGAATT
AATGTACCAGAAGCTTCAATCGATCCTCATCGACTATTGCCTGGTAGAAATCATTCAGAA
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TATTCTGTTTATGTTCTTGATATCCTGTTACCATTTAAATGTTCCCTGAGACTCTTCTGA
TAGAAGTTGTTCAACTAACTTGTTTGTTTGTGGTTGTATCATCTGACAGTCTTGTACTGC
TGAAAAAACGCGAGTTCTTCCATTCTCAGAAGGCACAGGTGATTGAAATCATGCAACAGT
CGCTTATCTTTTGTGCGTGCTTGTTGCAAATTGGACTTTCACTTCTCTGGTCGTATATGT
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AGGATATTTAAACATTATATTTACACTTTATTTTGTGAGTGCTTGATACTGCTTCAGGTG
TATATCATGTATGCGAAAATAATAGTTGAACCTTTGTGTCTATTATTTCTTCTCTTTTTT
TTTCTCAAGTATTGAGGTCAGTCACTAGCAGAGGTTGGTGAAAAGTAGTAGTCATTGTTT
CCCTTAATTACTGTTATATTCAAGTGAATTAAGTAGAGGAAAAAAAAGCATTTGAAAAAA
TTGTCCTCGAAGAAAGTTCACCATGCTAACATGGCGACTACTCGAGAGCATTGCAGCTGC
ACAATGTGTATTAGACGTGGCTATATATCGTTTACATCTACAAGTACATATTAAGTGGCA
ATCGTACTAGTATGCTTTCTTTTGTCTACAGTATAAGACTTGTGAAATTTGGTACCAATT
GTTCGAAGCTGCTTGGTGGATTGGAGCATGCAAGCATATAGTGTTTTGTTAATACTACAT
TTTTACTGGTGACTTGTAGATCTATCATTTTAATGGCCAACACTGGTGTTTGTAGATGAA
GCATGGCAATATTAATTTTTCCAATGTTATTTTTTTAAAATTTTCTGATGTCAGTTTATA
CTAATGTACTCACTTGTATTGTGATTTTATGCCCTGCAACTGAAATTTAGCTTGACTGTG
GCTTTACATTTTCTAGAGAATGGAGATGGACGTACTTTACTCAGATCATGACAGTGAAGA
CGAACTTGATCATGACATCGCTGACTTCGAAGATAGGACGGTAAGATGTTGTAATCCTCT
TGCTCTGCTCGTGCAGAAACTTGGAACATTTGCATGCTTCCACATTCACCTGAGCTCAGT
CGATTCCTCTATAAAATATTTTATTCAGGCCATTTTAACTTCTGATTACATGCAGCTGCT
TAATGGTTTTTCTGATGTTGCAAAAGAGGAAAAGCGTATCATGCATCTGTGGAATTCGTT
TAAGCGGAGACAGAGGTCAGGCCTATCCCCAGTATTTCCTCCTTAGGTCTATCACCGTAC
ATAGGAGTATTTGACCTGCAGCAACTACTTATTATTTTCGGTGGTACACAGCTTGGGCCT
CGGTGAACCGACTCTTGTAGTTTTTACTTGTTAGTCATGTTTTAAACTTTTAATCACTTT
TGTTCCTGTAAATGCTGAGATGAGAAAAAAGGCAAGGACTAGGTAATTTCCTTGAAGGGC
ATCAACATAGTTTAGAGGAACCAATTTATTAATGAGTCGATCTGAATGGCTGAATGCTGA
TATATAGCCGCAGAAGTAATACTTCTATGATCAGATGGAAGTCATAAACGCAACAGTATT
TTTTGCTGAGTTGATTCATGTGCAATCATCACCGCAACAGTATTTTACCGCATTATTATT
ATTAATGCCAAACTTAGTTATTCCATTTATTGTTGTTACTTAATCATCTCTCACTGGAAT
TTCTTTAACGAGGACTTAGAGCACCGTTCTCACAATTTTACTAAAAGAGATGGCACGGAA
GGCCCCAAGATGTCCAAACGAGGAATACTTACGCTCGTAAAGTTTGAATTATGATATCTG
TTGCATTCTCTTCATAGGAAACATGCACTGGAACTAATAGTCATGCCCCATCCTGCTTGA
TTGTTTTGTTTGTTTGGTAGAGTAGAGCCTTCGGAACTAATGGATGTGGTATGTTCTGTT
TGCTTGCATCCCGGAGGTACACGTTTCCATTTCTCATGCTGAAAAGGCTAACCGCAGGAT
ATTAGCCGATGGCCATATACCTTGGGCGTGCGAGGCATTCACCCATCAGCATGGACAGGA
ACTCGTGCAGAACCCAAGACTACGATGGTAAGCGACCGGTTTTGAGATCTGCAACTATGA
ATGCCTCACGCAGCATATTCATGTCCTGATTCTGTAATTTCTTACTCTGGATGAACAGGT
GCTGGCGCGTACTGATGATCAAGCTCTGGAACCACGGCCTGCTAAATGGCCGCACCATGA
ATATCTGCAACAAACATCTCGAGAGCTTGGCAAGCCAAAGCGCCGACCCCAAGTGGTCGT
GACTCGGTAGGAAACATTGGGCTAGCTGAGCAGGGCTGGTCCAGCCGGCAATGCCCTTTT
TTGGCAGTGCAGCATGATAACACTTTGATTTCTGGCGTCCTCGTCGAGGCTGCATCCGAG
GACAAGACGGTCTCTTACATTGGGGATTATTTTGGGTTGGGCCGAATCGGCAAATGTTGT
TTTCTGTTTGGATTATTATTTTCATTTCTTATTGGTTTGTTTCATGCATTGCTTGAAACA
CCTATTAACATTGGGACCCGGCCACGTGGATTCGTGGGTGTATGCATGGAAACACAAACA
CAAAAGATTGGGGATATCTGTTGTAGCTGGGATGGGTGTACGGGGACACAAAAGGTTGGG
GATATCTGTTGTACCTGGGGGTTCAAGCAATATAGAAATGTTGTGCATTTGTGACTGATG
TGATGTTTTTGCCAGATCAGTGGATTAACGCATACTTTTTTACTGACTTGGGTTGATCTC
GAGCGAGTTAGGGGTGGGGTTGTGTAATGTGGTTTCTCTAGGTTGCATTTTGGAATTGCG
TTCCATTTGTAATATGAATGTTTTGGATGATATCCCCCCCTGAGATAGTTACATCTTTGC
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GCGATTTGGAATGCAAAGGTTTTATGAGCTCTAAGCAAACAAACAACGGTCCGTGTGATA
CTGATACGGCGACACGTGTTGATCCTAGTAATCATGGGTGATTAGTCCAGCTGGGTTGTG
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TCTAATGCAACATGTACTTGTGCCCCCCATCACCTGCACAAGTCAACGGATGCCAATGGC
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TTGTTGGGGTCAATGTTTAGCATCATCCACAAGATGGTCCCAATTTTGTGAATTTCAATA
GTGAAAAAAAAAATCTAAGTTTCAAAAGTAAGGAGATATGGTAACATGGCTTCAAACATA
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TTACTGATAAGTGACAAAATGTATATGAGCATGTTGCGTTGCCGTTGCCGTTGCCGTGGA
ATTCTACGCGGTGGCGGTGACGGGATCGAGAGTGCATGGCAAGCAAAGAGGAGAAGGCGA
TGTGAGATAAATAAATAACCATGAGCAAGTTGCAGGGCATAAATCATGAGTTGGCCATTG
GAATTTTGTTTGACGCAGCTGAAGAGCAAAGAAGGTGGCGTAGAAGCAGCTCCCTCCTGC
AGTAGATGAATGGGCACACATCTCCTCCTCATTTGTTTGGGCACAAATCATGCATCATGC
CAAACTGTCCATGACATGGAAGGTGGCACCCATGTCCACTCTAGCTAGCTACCCTCAAGC
TAGTATTCATCAAAGAAAATTCATACCCAAAGTTTTAAATATATTATGATGAGAATCTAT
CTTGTGAACATCATCAAGGCCTCCTTCAATGAGATCATGCCAAAATTCCATTTCAGGGAA
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TTAGAGAGGGAGAGGAGGAGTGTGGAGCAGTTGCTTACACCATCTCCACTACCAGGCTAC
TACGGCTGCTGCTACCAGTACACACCAGCAGCAGCAGCAAAGCAGGCAGCTGCAAGCACA
CATAAAGTAGTAGCATACCATAGCTGCAACTTAGAGGAAAGGCAACAGCCGTATGCAGCT
GCCTGATTTTAATACACAAGCAAGCCATCCAACCTCTGACTTCTCTCTTCTTTTCTCTTT
TTCTTTAAGGCTCTGCTTAACATGCCAATCAAGCATCAATCATTTCTCTCATCAACATGT
TGTGTGTGGAGTGTGCATGATTCTGTTGATTAAAGGGTAGAGATGTGGAGGCAGTTGTAC
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TACGCCGTATAATGTAAATGGATTTTCAAAACAAAGATAATGACAATGCCTCTAATTTCC
TCTTGATGCACAGTAATTTATAATTTTGGTAACACTTTCCACCCATTATTTATCAGAATC
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GGAAATACGGAAAGAGAAAACATAAAGCGAAGCAACAAAAGAAGTGAAAAGGAAGTAAAG
GCACATCATCATCTTTAATATTTTTTTTCATGTTCAGCCCTTTAACTTGATATTTTGGAA
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CTCTCTTTTGAAGCTTAAAATCACTTCATTTTCACTTCAAGTCTCCATCAAGACTTGTCG
CCTTTATTTCTCCTAATCTCTATATGCCAATTTCATGCTAGCCAACTACTGAATTCACAT
GCTAATTACATGGTGGTTGTACTTCAAGGATGAAAATATTGGCTTCAACCGTTGAAAAAT
CGAAACAGAACAAAGCTACATGGAGTCATTTCTTTTAAAAAAAGAATCAAAAACAATAAT
TTGAAACCTTCCAAAGTTCTGGAAAAATTACTCATGTGCATATAGATGTGTAGTGTGTAC
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TGTGCATCAAAACAGAGTTACTTTTTTGGAGGCCACAAATTTATATTTTTGTGTAGCTTA
AAAGTTAACACATTCTTTAATGGAATGAACATATATGTAAACACACACACACACACACAC