Map Locations of contig_58922 (4945 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_58922

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_71000 4 598 bp MLOC_71000.1 Available Available None
MLOC_70999 2 1749 bp AK360005 Available Available None





CDS Structure of MLOC_71000






CDS Structure of MLOC_70999






Contig Sequence (4945 bp)

>contig_58922 4945 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCCTTCCTGGAGGGTGTCGGTGGTAGTCATCCCCTACCTCCTTCCGCGTGCCGGGGGAAA
CCCTATGATTCGTTCGGGCAGCAGCGTTGTCGACGTCGCATCCCTTCTTGGTGGTGCTGC
TTGGCACGCGGCGGATCGGAGCCTTGGGCTGTGGTGGTTTGTCTCCGAAAGGCGCAACGC
TGGCGGGTCATCCGCTCTTTGTTGAACTGCCGTTGTTGGCATTTGTTTCTTTTTTGTTTT
TTGGGCTTGATATGCTATTCACCCCAGCAATGTTCTCTGTACGGTGTTGGTTGCTTTGGA
ATACAAAGCGGGGGGAAACCCTTTTTCGGTAAAAACAACGTTTTCCCTTTTTTAAAGGGA
TTAATGTTATTTTCTTGGAATAAAATACCTCATTTGTAATATTTATATTTATTTTCATCA
GAAAGAATAAGAGATTGTCAAACTGTGCCAGCTGTAGTTCTGATTTTGCTTTGGTTTTTA
AGTGTGCTACTATGCTATATCAATGCTGTAGGCCGATGCAATATTGGATAAGATGCAGAA
CAATGGGATGATGAAAGAGATTGTTGATTCTCAAGAGACTACCTTGTTGATCACTGCTGA
CCAAGTATGTATCTTACAATATCCCCTCCAAAAGTCTTTTTGTGGAGTGATTTTTTCTTA
TAATTACGATGTTAGTTTCATACGGTGATGTGAATATAGCAGAATATTAGTCACTTTACA
CTGTGATTTTCTAGAATCTGGATGGTGTGATCCTGGAAATAGTTATTATTATTTGACTCT
AGTTACATGATTATGTCACTACTACTCCCTCCGTTCCTAANNNNAAGTCTTTTAAGAGAT
TTCACTAGACGTCTACATACAAAGCAAAATGAATGAATATACACACTAAAGTATGTCTAT
ATACATCCGTATGTAGTCCACTACTGAAATCTCTAGAAAGACTTATATTTAGGAACGGAG
GGAGTATATTTCAAGATTTATTGCCTTAACAGTTTTGGTTCTAGTGTTTCTGGAAACATG
ACCCAACCTGTGTAAGAGTAGATATTTTCTTGATCACGGTTTGGTTTAGGAGTTAGGCAT
ATACGCAACATGTCTGTTGTATCTCACTATTGCTTGTTGAATGTTGAGGTGGTGCTCAGA
CAATAATCCATATCAAGAGGCATAAATTGGTGTCTGCATAAATTACTCCCTAGATAATCC
AGATATCATACACATTAGGATAGCAGTTAGGTCAAAGGAGTCCACATAATATCTGGGAAC
AAGCCAAGATGCATAAATTGGGTACTTGCTTGGACCATATTCATATCTTACTGAGTCATT
TTTATATGTGTTTTAATCATGTTTGGGTCTTTGGTTATGAAAGATAGATAATTATAATCA
GGAGTATGTTTGTATCTTTGATTTAGAAGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCTTTACTA
GTTATTTTTGTTAAAATTGCTGAGACAAACTAGTGTTTGTAGGGCACATTATGACACCCA
AAAAATGGACTCTCGATAACATTTATAGTGGAATGTTTACTTAGTTTCTTGAAAATTAGT
GAATGTTTATACTCTGTGTTGCATGCTTCTGCATGTACCATGTGTGTGTGCATACATTTT
AATGCTTATTTGACTCTGCCCCTTGTTTTGGTATTTTTATTTTGGAGGTTGTGATTCATG
ATGGAGTTATTCGAGAAAAACCTACCACTCCAGAGGAGGCACGTAAATTCATCCAAGGTT
TGTCTTATGGACTGTTGTATATCGGCGCATGAGCTCAAATTATTTTAAATCATTTGTTAG
GCTTGTCCGTTTAACCACATACTGGTTACAGGATATTCCCAAAGCCATGCAGCGACAATT
GGATCTGTGCTTGTTACAAATGTGAAGACTGGTACTAGAAGGGAAGGCTGGGATAAATCT
GAAGTAATAATCATTTTTTTCTGATGTTCCATTGAGAAATGAGTACCAAAGTCGTCCGTT
CATATAGACATCAGTATTGATTTTAAATTATCAACATTTTTTGAAGGAGCAACCTAATCA
GTGAATTTTGGTCTTTGATTCAGATCAGCTATACAGTAACATGATCTGGTGTAGTGCTAG
CTTCGTGTTAAAAATCTGGTTCAGCTTTCAGTCCCAGTAAACTGACAAATAACAGTGGCC
TAACTTGAGCACGGCCTTCTGAATAACAGAACTTCTGTGCGCACGACACTTTTGTGTCCG
ATTCCTGTACGACAATCCAGTGGTTTGCCATGATTTTTTTTCCAAAGTGTGGACAGTTTG
ATGTGCACCATCGTAGAGGGATTGGACGAAAAAGATGGTATGCATATCAGCATTCTCTGA
AAAATTGATGGGCTAACATCAATTCAGTCTTAGTGTTCAGATGCTCTTCTGCTCTTTCAT
AAAGCAGAAACCCATCTTAAAGTTTTGAGACTAATTTGACATTTAGCAGTTTAATTTATC
ATATCATGGCTTAGTTGGTGCATGCATCAGATAATTAACTCTTGGTGAGTCTGATGTTTA
ACGTTTCACTGGCACAAAAAAACAAATGAATCCTAACGAATACGCATAATCCAGTTATGA
TCCCATGTTTCCATCACTTTGAGTTCCGTGTTGCAGAGTTTTGGCCTCACACTTTCCACT
ATAATTGTCCTTCTGCAGGTTTATTTCCACAAGATACCCAATGAAGTTGTTGAGAGCTTG
GTAGGTCCGAAAAATAAGCATTTTAATTTTGGCATGTCTTGCGGTGCTCCTGCCTGGTTT
ATCAAGAAGCGGAGTATTAATTTTGAACCCCCCGTTATCGAGTTACACCCACTGAAACTT
TTCACTTGTGTGTATTTCAGATTGAGGAGGGCAACGTCTTCTACGTTGCTGGAGGCCTTC
TAGTAGAGCATCCACTGACTTCACCTCTCGTGGAAGCCATTGTGAGTCACATCCTGACAT
CATGTTCTCATTCTAGGCTGGACTATATTTCCATGTCTGAGACAAATGAAACAGCATCTC
AACATGGGAATCTGTGCAGGTCGGTACAATTGATAGCGTAATGGGGCTTCCTAAAGCTCT
CACAGAGCAGCTCATCAATGATTCCCTCCAAGAGCCGTAGCTGCAAATTTCCAAACTAAG
CTGGCTGGCGCTGTGGAAATCTCTTTGTTGGAAAATCACTATTCTTGTGCCGAACAAAAT
TAAACACTCATCCTTTCTGGCAAACGGAGTGGATTCTAATCAGCGTCGTCAGCCTCGCTA
TACCAAATTTATTAGGCTGAATTTTAGCAGCCACTAAATTCCTCTTGGTGGCCAAGTGAA
CTGGGTAGGTAACCAGTAACACTTTTGGAGACCTTTCTGTGACTAACACCGCATCAATGG
GCTTCATTCTTCCATGTGATGTTATTAAGGGTCTGACGGACCAAACATAGGCTATGAATT
TATTCTGAAAAGGAGAGTAGGCGATTTCGTTTCTCCCGGCCTTTGCACCAAGCAATTAGG
GTTAATCTTTTTATTGATGAAGCAGTGCACGCCTTCTTTCACTGCGTGCCAAGCTTGGGC
TCCATGAAAAATAAACGTGAAAAACCCGTGTAGCAGGAGACCATATCCTGGCTTCTGGGG
TTCTATGAACAGTTCATACTAATCTTCAAACCTGCGTGTGTTTGGTCTGGTCTTGTTATG
TTTATAATAACTAGCACAAAGGTCCGTGCGTTGCAACGGAAGAGACAATTAACAATAATT
ATGAATTAGGTTGGCAAGTTAGAGGATATGTTTGCTGATGACAACAATAATGGATAAATT
AACAATTGGATTTTCTTGGGCGCTAGTTTGAAACATGAGACATAAATCGTACTCATCTAA
TCGGATGAACAACCATATCTTTAGATTATTGTATTGATAATAAAAGTATTGTACAAGCAA
TGTTTTTTTATTTACTGACATCACACAATAAAAATGTGGTATAATTCGTCCCGCGTGACA
TGTATGCTTCTGTCGTGTGTGATAATAGTGAAGTCCTTCGTAACCTGTTTTTAAAATGGT
GCAGCTATCGTTAAATAATTATCGAACTCGTTCCATTGAGATCAATTAAAGGCTCTATTG
CCATGACATATAAACATATGTGTTTTGGCATCGATTATTTATTTTGCACGTTTATGAACC
GGGATCAACAATGCCTGGAGGCAATGTATATTTGTTGCACGTGCAGACTATTCCCTCGGT
TGAAAATAAGTGTTACAAATTTAGTATTAAGTTAGTGTAAATTTTGTACTAAAACAACGA
CACTTATTTTGAGACGAAGAGAGTATTATTTTTCGTTGATCTATTATTTTCATCTAGTGT
TTCAGTTTTCACGTCCTAATCATGAAGGGAACAAACAGAGCAAAATTCAACCTAGATAAA
AAAGAAGCCATATCCAAGTTAAGAACAAAAATATCTAGCAACGTGTGCAGTCCTACGCAC
TACGCAACACCATATCTACTTTTTTAATCAATCTTATTTGACGATCTATCTTATCACTTA
GGACACGGGCCTCCACTTACATTCTATCTCCTTTCTCACTTTGCAAATTTCCATTCTCTC
CCTAACACTGCCTCCTCCGTGCCTCTTCCAACCGTGGCTGGAGAGGAGCTCGCCTGAGAC
CTGATCCGTCTCTCAAGAAGGCTAGCCAGCTACCGTCCATCTTGTTCTCTCTCGTTCTCT
CCCTCGGCTTTCCCTTCTTTCTATTATAATTTTTGTTTTCTCCAGTCCAGGGAAGGGAGC
CGCCATGGAACCGCAGCACCCTGCCTCTCGTGGAGCTCGCCGCCTCCGGCCACATCTCTG
TTGATCCGTCCGCCCCACGTCGGATCCACGCCGGAGCAGCCGGATGCGTCGCCATGGAAC
CGCAACACCCCATGCCCTTGGAGCTCGCCGCCTCCAACTACCTCTCCATTGATCAGTCCG
ACGCCTCCGGCCACATCTCCGTCGA