Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_58871_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-MorexXBarke_maploc.png) |
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Predicted Genes from contig_58871
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_70974 |
1 |
577 bp |
AK358557 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_70974
Contig Sequence (7486 bp)
>contig_58871 7486 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTAATATACTCGGAAAATTGCCTATTTACTCAACACTCTCTCCCCCAATTCTTTTGTCA
TTAAACTTGACCATCAGTTTACACCTAACCAATTGTCAACCCAAAAGTGGTGGTCTTTTG
CAACAAAAACGAAAGGTGGTAGTTTTTTGATTTTGGGTCCCTAAATGTGGTGTTTTTTTG
CAATTTTCTCTTTGCATTATCCAGCCTTCTGCTTATTTAGCTGGGAATCAAAATGCCACT
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TCTTGCATGCCAAAATGTGGTGTCAACACATGCCCCTCCGTTTTTCGGCGAAGCATGAGT
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GTTATTAAAGTCCACAACCGATAAATCATTTTGTTTGGCTATTCGCAAAGCACTCAAATT
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AGCATCGTGCTTTGAGATTCTATATGCCCACAATGCCTCAGACAACAGCTCATGCTATCT
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ATTAATGGGCTTCCTCCGGTCTAGATTTTCACCTGTACTAGATTATTTTTGTTAGTGGCC
GAAGTTGTGTATTCTGCTTCGGCCTCTCTCATATTGGCAAAGCTTGACATCGGCTTTTCA
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GCTCTCCAATTGTCATGTCTATATATATGAGAATTGCTAAAACAATCCAAAGCTCAAATT
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GAATATTTGTTGCACCACTAATAATGAATCACCAAAAGCCTCAACATGTGTAGCACCTAT
AGGCAACAAACATCTCTAGGCCGAATAACAATGCTTCATATTCGGCTTGATTATTTGTGC
ACATTTTTTTGAACCGAAGCAAAAGACATGTCATTTCCATTGATTAATAAGATATTGAGA
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CACCGGCTAACCTAGCCACATGCCAACAGATGGCCACACGCACGAGCAACCGAGAACTCA
CTTTGATGACGAGCTTTGCAAGGAAAATATGCAGGACTTGCATCGACCGCGTCATCCGCA
AACGGCCACCGACTGTCAGCCATTGTCACCACATGGACTCGCTTCACTGCAGCTCCGACT
TCAAAGCAACTCAGCAACCAATGGAAAAGCACCCCAGACACGCCGGGAAGATCTGACTAC
CAAAGCCCGAGCCGCTACCCAAGCTCCCCTCGACGTCATGGTCGTTGACAAACAGAAATC
AGCGCCACCGAAACGGCCACCTCAGCCAACCACGCAACGAAGATGTGGCCTCCATGCAGC
GAAGATGCCGCCATCCACTGGACTTCAGGTTGTGCATATTTGGACAAATGGATTAGGAAA
TTATGGCTTGTAGCTAAGCAGATTCAAAATTTGGGTAATATTTTTTTAAAATTTCCAGTA
AATACTACATGTTATGAGACCACATATGTCGATCTACGTTGATTCTCTTTTAAACGAATC
CTAAAGGAAATTGTTGGAATTTCAGTGTCACTTAGGCATCATCATGTCTCTTGGCGTTAG
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TTTCTGTCCATACAGTCATCACCGAGTCCTCGTGCGTGTGGGTGAACTGCTCTTCGCCCA
CAAGACGCTCGTACATTGCTAGACGACAACTACAGTTTCGCATACGTGGCAACTAGGTAA
ACATACATGACAATTATGATTCGTTGCTAGATGACAACTGTAATTGCGCGTAGGTGACAA
CTAGGTAAACACATGTGACAACTATGATTAACCATACATGCAACTATAGTTGGACCACAT
ATGACAACTAGGTAAACACATATTACAAATGATAACTATCCCCGGGTAACTAAAGTATCA
TCCCTCCGGTAACTAGAATTAACCAAAACAGAGAGAGTTGACATGCGTTTTACTACATTT
GTCATTCCGGGTAACTAAAGATGCATGCTCGGAGGTAACTAAAGTGTCGTCTCACGGATA
ACTAACATAACTACGCCAGAGCATGTGGACAGATTTGTTTCGTGTCACACGTGCAGGGTA
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TTCTAATGTTCGTCTACACATAATCTATATGGACTGCATTCTATGTACGCCACACACGTA
CGATAGGTGAACGGATGTCTAATATGTCACATGTATGATAAATATTTAATCTCTTCAACA
ACAAGTATTTATGAACAGAGGGAGCAGTATATGAGGTTCTCGTTTTTCAGTTAATCTTGG
TTTTTCCCGTACAAAAAAAAGTTCGGTTTTTTGTATTGTGCCGATGTATCTATTCTGCAG
ATCCTCTGATGTCGGCTGTCTACCGAGAGGGCTCACATGTCAGCGACACCAAGTCAGGTG
ACATAGAGCCTATTTGTTAAAAAGTCCTAAGACTTTTTTTAGTCTCAATTAAAAAGTTCC
TAGTCTTTACATGTTTGATTTCAGGGACTAAATATGGACTAGAGGTTATTAAATGACATG
TTAAAAGATTATGTTATCCCTACTAATGGACTATATGTTATTAAATGACATGCTAAAAAC
ATGGGCATTGTTGAAGAAAAAATCTTAAAAAAGACTCTTCCTTAAAGACTTCTTTCTTTA
CTCTCAAAATACTCACTTTTAATCCCTAAAAGTTCCTCATGTTTGATTTACTAGATGGGA
CTCCATACACCCCCATATACGTCCAAACAATCCCAGCCGACACGAACAGACCACGATACA
AATGCCATGGTTTCCGCCGAAGTTACGATGGCGTCCTTTCGTTTCCCTGCGGCGAATAGT
TGGTGGATCTCATCCATGGTCCCGTGATCCCGTCGTCCTCCCCCACACAACAATAATTCA
TGTAGCCAAGGACAGCAACCAGGCTGCGGCCATTGAAGTGGAGGTCGACTGAGTGATCCA
TCAACCTGTGAGCACGCCTCCAGCCATGTTATGTTATATGAGTAACGCCATCAGGAGTTC
ATGGCCACACGCATAACACGACTTGTGAGTGAGAGCTGAAGCAAGCTCGATCGCTAGGAA
GGAAGGAAGTCATGGAGATAGCGGGGCCGCTGGCGCCGGGGGAGAGGCCGCACGCCGTGA
TGATCCCATACCCGGCGCAGGGCCACGTCACGCCGATGCTGAAGCTGGCCAAGCTACTCC
ACGCCAGGGGCTTCCACGTCACCTTCGTCAACAACGAGTTCAACCACCGCCGCCTGCTGC
GCTCCCAGTCCGCCGACACGCTGCGCGGCCTGCCCGCGTTCCGGTTCGCCGCCATCGCCG
ACGGCCTTCCGCCGTCCGACCGTGAGGCCACGCAGGACATCCCCGC