Map Locations of contig_58866 (12350 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_58866

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70973 1 1882 bp MLOC_70973.1 Available Available LOC_Os04g41910.1, FRAME:-1, EVALUE:0.0, 13104.m04121 protein RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MLOC_70972 3 1295 bp AK251314.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70973






CDS Structure of MLOC_70972






Contig Sequence (12350 bp)

>contig_58866 12350 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GATGCTGAATTTCAAGCATACTGCCTTGTATGTGATGCCCAAGTTTGCTTTAGACTGGTA
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CGCACTTCCCCTGTTTTGCTGACCTTTGAGTCTCTCTAGCGCCTGTTTGCCATCAGACAT
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CGATGTGCTCACTTCTGCATTCTTACAGCACAGAAGTTTGTCAGAAAGTTCCAGCTCATC
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ATCAAAGAGAAATAAGAAGGATAAGAAGCACAGGTCCCGATCCAAGCACGCTGGAAGTGA
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AGTTTCCATGGTGTTTCTCAACAGAATGCTTGGTAATCGGAGGTTTAGGTGTTGAACCAT
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TGATAGTGACAGTATTCATATTCGATTTGAACTGCTTTAATTCTTTTCAGAATCTGTTAT
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ATGTATTTGCTGTGGGATACGAAATATACAGTCCCTTCCATTCCGAATATATCAACAACA
GGTAGGCTCCCCCTTCTGAAAGAGTGTTTCCTGGGCTTTACAAGCTGCAAGAAACTTTTA
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TTGTTCCCTTAAAGTCAGATTTTGGGAGCTGTTTGATATCTGCAACCAATAGGAATGCTC
GGTGTCCCAGATTTGGGATGGGATAACTCTTAAACTTTTCTTTAGACGTTGTGTGGATCA
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ATCCCAGGACTTACCTGTTTGGCTCCTAGAGCCTGATGGTAAATGTTGAGTGAAATCCTT
TTACAAGTGCATTAACTTTGGTGGTGTTATTTCTCTTTTGGAGACACTATGAAAAACTTT
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GGATAATGTGGCTAAAAGGAAAATAGTGGATGATCTATCCTACTTGTTTCGTAATGAAGC
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ATCTGAGTTTTTTCATATGCGTAGAATCCAATGCTTTGATGATGTTTCCTCCCTATGGAG
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TGTTTTCTTGCCGTTTGCTGGTCGTTTTCAGCCCCTCCTTCCGGACATTTCCTGAGTGTT
GTGTCTGGGTTGGGTGCTTTTCGGTTTAGTTGTTGGTGATCGTTGATCTGTAATTTGGTT
GCTTGACTGCTTCATTTTAATAAAATGGAGCAGGGGGGCAACCCCTTTCTTTCGAAAATA
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TCTCGCAACCAAATCATCCTTGTTCATGGCTAGTTTTTGGGATACTCAAATCCTTCAGAT
TTTTTTAGGGACTCCTTCCATGTCAAGTTCAGCCTACTCGACCTCTTTTAAACATTATTA
ACACGCTTTAGTTGTCCCTTATGCACTGAAGCTTTTGGAGGCTTGTGTTAAATACGTCTA
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AGGATACAATGTTTCTATGTTTGATTAAATTCATAGAAAAATATTATTAATAACTTCTAT
AATACCAAATAAGTAAAATATAAATATATTACCATATACCATAGTGAATTTAATGATATT
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TATAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGAGACAGTTATTTCAGGACAGAGAGAGTA
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TGTATCTGGGTACACAGCATAGAAAAAGGTTGTTAGAAATTTATCCGTGGAAAGAAACAA
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AAAGTCTGGGTGGTGTAGTTGGTTATCACGTTAGTCTCACACACTAAAGGTCCCCAGTTC
GAACCTGGGCTCAGACAATTATTTTATTTTTCCACTTTTTTGTGCGTTGCTATCTCTTTT
TGCAATCTCCCCAGCTCATTTCTGCCATAGCTCCATACCGTTCCGCGCCATCTTGGTCTT
TGCTTGGGAGAAGATTTTTGCAGTGATGATTTTCTAACAACGGCAGCATGTACCAGTATC
ATGATCACAACGGGACGATGAAAAAAAGCAAGATTGTACTACATGTTAGCATGGCAAAAA
TGCTCAATCTCTGTAATGTGGGAGTACATTTGGACAAAGTTTAGCTGATGTAACAACTCC
GCTGCTTAAAGCTAACCCAGAAGCAGTCATATAGTATGAATAATCGGACAAACAGATGAC
CCAGCTGCTCTTTTCTGTTTTGTTCTTGTATAATTTCGCGCTATCAGCTACAAAACAGCC
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GCTCCAGCCTTGACACCTCAGCGTCGTAGTCACGGATGAGAGCGTGTTTGATCGAACCGT
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AACACTTCTCCTAGGCAAGAAACCAAAGCGTGCACAATCTTGACACCAGCTCCTTTGTTT
CTCCTAAGTGTTCACAAGATAACATGTGTTCTATAACACTTGAAACGAATCTCTCAGGTG
GGTTTGACAAACTCAAGATGCAGACCAAACATAGCTTTATTTTAATGCTTTATTTATGAC
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TTCCGTTCATCTTCTCTACGCATTTGAGACCATCTTTGCGGTCTTTGAATTTTACCAATA
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GCTGGAAAAGAGAGAAAAGAAACCACAAATACTTGCTGGTCGTTAGGGCCAGTTTGCTCA
GTTACGGCTCATTCTGGGGATTTTCTATATATTTCATCATTAATAACAACAAAGCTTAAC
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ATATACTTGCTACCAAACACACCAGACCATACTTATGTAGATTAAAGACCTTGGCTACTC
AGCTTGCGTACTCTCACTCGTTAGTCTGTTTGCCTTTTCCAGACTAAGTAACACGTTTTC
ACAGGAGAGTACGCATATGGCCAGCTTTGGCATAGCAATAAACAAGGATCAGTCAGTTTG
GTGAAGAAAAAATGCAGATGCAGTTCTCCAGTATGTCTTTCAGAGACTGGTTACACAGGT
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CTCTCAATTCAGCAGGACTGAACATATTCGCCAAAATCACCTGAGTAGGAATCATCACCT
TCTTATCATCATGTCCACCTAATAACAGAAAATTATCACGAGAACAAAAATAAGTGAATG
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TAAGTGCTCATCAACCAACGGTGTAATGATAAATGAACACCCTGCGTACAACAATAGTTT
TTGCAGCTTAAGTCTTTTAGGGCTATCTGCTAGTAGGAGAAGATTTAGAAGTACAACATA
TTGTTCTCAACATGCTGCATCCCTAATTAGCAGGAAACATGCAAAGCTTGAACATGACCT
ACAGTTCGGTTGCATCAACACTGAAGCAACAGAAACACATCGCTGCTTACACGTTGTCAA
ATCAACCATAATAAAAACAATTGGCATCACTTGAAGATAGAAATTACCCCATCCCAGCAT
CTTATCTTCAACCTTCTTGCCTTTCTTTTTCTTTTGCTTATCTGCCTTCTTTGCCAAAAA
AACGTCACCTGAAGAAGACGCAAGACATTAGTAATATATATTTTGTAGTTCGTGTCACTT
TAATAAATCGTGAACTTACCTTTCTGCTGAAATTTGGCCACGCTAACAGACATTAGGGTC
TTACCACCAGGACGGAATGATGTTCCATCCAATAATTGAATTGCTAAAGGTACAGAAGGC
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TGTCTCTGGATCCTATATCATGATAAACATGTTAGAAGTGCATCAGTAGTTCAGTACTCT
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GAAAAACAAACTGAACAGCTTTGACATGAAAACATTTAGATAACAAGATTCTGAACAAAT
CAAATTACGAATTTTGAGCCACAGTAGACTCACAAGCGGCAAACATAGATCTATGAGTGT
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ATTAGTCTGATCAAGTTTAAGCTGTTTCTGCAAGAAATGAAAAAAAAAGTATACCTCCTT
TATAATTCCACACTTGGAAAATACCTCTACAATCTGCAAACCAAATCCACCACCAGATGT
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GCTGAAATACTTCTTCCTCAAGTGCAAAAGTCATGTCTTCAAGTTCATAGTCATCCTTTT
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GTACACAAGGAATCAGGTTAGCTGATAAACCCTGGCACTAAGGGAAGTTAAACAAGACGA
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CGATCCCACTTGTAGATGGTGCCGTCATCATCAGTAAATTCTTCCACACCATCTGGTGGG
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GCCTTTGCTTTCAGCGCTTCCACCTCCGACTCGGCTTCTATAACCTCCTTCTGGAATTTC
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CAGGTTGATCCTTCTTTGTGACCCCGGGATGCAGCTCTGGAATCGAAGATAGTGGTGTCC
ATTCACTCCTCCCCTCTGCCCAGAGCATTGTGCTCTCGTTGAGGTACCCATTAGCAAAAT
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TCTTCAGAAAGTAAAAGAGCTAATAGCGGCAATTCTGAAGCAATATGCGCCCAAAAACAA
GCGAGCAACCTCACAACATGGCATAAACCCTATCTCGCAACCTGCCAGTGCTAACAACTA
TACTAGCTGCAATCCTGAAACAATATGTGCCTACAAAACAAGCAAGCAACCTCACAACGT
GGCATAAACCCTATCTCGCAACCTGCCGGTGCTAACAACTCATCGATGTTATCCAGCTTT
GGAGTTAGGAACTATAACACAACAGTGGTGGATGATGCAGTGAATGTCACTGTAGAATGA
TACATACACTCTACGGATAACCTCACAGCACCGAATTCAAAACTGTCATCTCGGCTACTT
ACATTACTTCCATATCCACTGAAGCATCAATTTACTGGTTACAGAGGAAATTGCGAGCTT
ATGAATAACACGCCCAATTGACAGGATCAAACAATACCAGGTACTGGGATTCGCGCCACC
TCACATTCAGACTCGACACTTGCTGATACTCACAGGAAATACAAACTAGCGAATAGGGGG
CCTTCCGGATTGCAGCAAGGCCGCACGCGAAATTTCTCTGATTTTGCGAGGATTCAATCC
CAGCTTGCGAGCTACCGGCGTCCGCATTTCTACTAGTAGGTATAGCGAGAAGATTGGGTG
TCGAAGGGGTAGGAGGTACCTCGCAGCTCTGAGAGCGCGTAGGGGCCGACGTGCTCCTGG
CTCGGGCCGAGCACGTACCAGCCCACCTCGCCACCGCCGTCCATGGACCTCCACGCGCGG
GGAGCGGAGGCTGGGGCCGGAGATTCCGGTATCGTCGCCGCAGGCGATATGAAATCGCTT
TCGTGAAGCCACCGCCGGAGAGGGGGAGGAAATTTTGGGGGCTGGGGTTTCCAGAGTGGT
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TTCACGATCAATGTCGGTCCAGACCACACATCTGTCAAGTTTTTTTCCTTTCTTTCGAGA
ATTTCATACACCTGTAAGCTATCCTGAGAATAGTTGCGTCAAAGAGTGAAAATATAAACG
GTTTTGCTCTTTATCGTCCGGCTGAAATGCAAATCTCCTTTCATTCAAAATTTAGGATTT
GTGTTATTTTTTGTCGCAACCTCATATTTCGAACATGTCTTTCTTTTCGGATTCCCCGTT
AGCTATCTATTATTGGTTGTCTTTCTTTTAGTGTTTCATATTTTTCACTCGTGCCACTTC
ATTATCCTCTTATTTATTTTACATTATTTTAAAAAGAAATAAATAAAACTGTGTGTAAAG
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GCTTTGAGTGTTTGTGCTTCAGTTTTTTTCTCCCGCCATAAATTCATGTTGGATGTAGCG
ATCTATTAGCACGTTTGCTCATCCCTCCTCTTGCTTCTTTTGATTTTATCGTGCATGTTC
ATTTTTAGATCCCTTTTCGATTTGTTTAGGTTGCCCTGCCCCTCCCTCCCAATTCCTAGG
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GTAGAGGGTCTTCGTTCTAGTTGTTCTATTTCGTTTGGGTTGGGATTGTCTTTTTTTTAG
GGTTTGTAGTTGTTGAACGGGGCTTTGTAGCTATAGATGCATTTGGTTCAGTTAATTGTG
CTTAGCCTAGAGCTGGGATTTGTTAGATTCTGCTGGTTTCCTAGCCGATGAAGCAAGAAT
GTATTTACCTTATATGCTACTGTGTTATGTTGTCTTTGCGGTGGCTGATTTTTGTGGTTT
TGCATGTTCGGAATCTGGCGATTAGGTTTGTTCGTGGTTTGTTTAGTGCAAGTTTACGAG
GTTACTATAGTAACTGGGAGGGGTGTTGTGTTTAATTGGAGTATTTGATGTGTTGGATAG
AGTTTATGTATGCATGTAATTGTAGGTTTTGTAATGTGTCATTCTACAATGATAATGCTT
GGTAGCTACTTTCTTTATACTAGATTAATGTGTGCCACTTGCAATGTTTATTCTGTTGAA
GACATCCTATTTCAATATGTAATTATTAGCTTAATGATGTGTTTCTTCTTTCATTTGTCA
GATATCAACATTAAGTATAATTGAGTTGACCCTGAGATCTCATGATTCATTTTTTCATAT
TGTTTATAGGTGTTATGTTTTAGGGATGTGATGTGGTGTTATTGTTTTTGTTCCTTCCAT
GTTGGTGTTGTAACTTGTATGCATGTGTTTGTATGTAACTATTTAGTGAGGTGGTTGATG
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AGGCTAGATCCTCGACTTCATCATCTCTCAACGAGGCATAGAAGCAAACTCGAAAAACAT
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ATGTGTGGCTGCCCTAAGCCGGTCCTGTTGGAGAACGTTGCATGTGGAAAAAAATCTACG
AACATCCAAGCTCTATCTATGAAGATGAACAACTACGAGAGGGGGAGTGCATCTACATGC
NNNNNNNNNNNNNTAAGCGGAAGCATTGAGAAACATGGTTGATGTAGTCG