Map Locations of contig_58812 (7437 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_58812

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70940 4 1526 bp AK248495.1 Available Available None
MLOC_70942 1 988 bp None Available Available None
MLOC_70941 1 395 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_70940






CDS Structure of MLOC_70942






CDS Structure of MLOC_70941






Contig Sequence (7437 bp)

>contig_58812 7437 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGACATGATCATATGCTACATTCATTGTTTGGGTCTTGTCCATCACATATTCTTCTAAT
GATGTGATCCCGTTNNNAAATGACAACTCATGTCTATGGTCTGGAAACCTTGACCATCTT
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NNNNGTATTTGAGTTCCAATCAATACAATTTTAGCATGAATCATTAACAATTATTATGAA
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AGCCCGCCGCACGAAAAGGACGCGATGCGGGGTCTTTAATTTATATTTCCCCTTTAATAA
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AGCCGCCGCGCCGCGCCGCACCACCGTCTCCTCCTCGCCCGCTGCTCTGCTCCCCCTCCC
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GTACCACTGAGAACCGATCCCGCCGCCATCCGCCGTCGTCATCCCCGTCGACCGCCTCCG
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GGGCCGGTGCTGGTGGCGCCCGGGAGCCCCATCATGGACGCCGACTCCTGGCCGGCGCTT
CCTGGGCTGGCCTCTCCCCAGCCGCCCACGCCGCCCAAGGCGTCGCCTAAGGCCACTCCT
CCCCCTTCCACTGTGAGTTGTTTGTTATCTCAGTGTCTGATTTACTTAGTGATTTCGTAT
CAGTGTCGGATTTACTTAGTGATTTCGTATCAGTGTGTGATTCATCTAGGATTTGTCGGG
GGTTAGATTTCGTACCGATTGATGAGATTGCATTTTGTCTGAATGGTCTCAGGTGGTGGC
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CGCACTGGTATGCTTCTCTCCCTTCCACTGTGGGTTGTTAGTTGTATGGTTTATTTCAGT
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ATTTAGGATTGTTGTTGTTAGATTTTTTATTGTCTAACAAGATTGTGTTTTGCTTCCTAT
TGTGGACATTGTCTCAGGCGGCGGTGATTTCACCGGTGTCTTTGGACACCGCCGGTGCTC
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GGTACTCCCCTAATGCCCGGAGCAATGGTACCGGTGTTCATCATCAGAATGGCCGTGTTG
GTTCCCATTCTCATGGCCGTGGTGGCAGTTATGGTGGGGGGAGCAGAAGGGGTAATGGTG
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GGGCGCCTATGGGATTCCCTGGTACGTTATGCATGATGTTTGTGGGAACGTGGCTTTGTG
TAATTGTTATGTCACCTTAATTTGCTTTATGTTTAACAGCAGAGATGGCACCTCATGTTT
ACTATTTTGCCGTGCCCACCTCGGATGGCCTTCAAACCCTTCCTTTTGCGCCGCCTACAC
CAACCCCTCCAGCCATGCTAATTTCTCCACTGGAACAACTTCAGAGGGAGCTACTGGTGC
AGATAGACTACTACTTTAGGTATTTGTTTGTCCATATTTGTAGGAAATACTTTGCCACCA
ATGCGGTCATTTTATTGAGCCGTGTGTTCAATTTTTGCAGCGATGAAAATTTGTGCAAGG
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GCTTTAACAAGGTTAGTTTGCAGGTTTTACACATTGTTTTTATTTTAGAAAATCCCCACT
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AATGTTCTGGTCACCTTCTAAAGTTGTTTGCTTGCTGATTGAGTGGGAGATGGAGAGTTG
GCATTTAACATTTTTGATCCATTCAAACCGAGTTTGCAGGTTTCCCATTTAGACTAGTGA
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TGGATGTATAGTTATGGCGTGGTTGATATAACTTGGGTAAAGAGCTTTCCATCAGCCTAG
AAAATTTAGACTCTACCTCATGATGCTAAAGTTGCATCCGATTTCTGTTCCTGCGCATCT
TAAATTAGATAAACTTGTTCCAAGTTATTTTTATGATACTTTATTCCTTTGTTACCTGAT
CGGTGTATCTTCTTGGGTTACAAGAAGAGACACTCAAATACTCTTTAAATGTGGCCGTTT
GTTGTGAAATTTAATAAAATGAAAGCTGAGAACTTGTATCCTGTGTAATTTTGCTGTTCT
TGATTACACTGGGCATACACAAATAGTAGCATTGCCGCTTCTAAGTAGCATCAGTTAAAG
AGCCTCAGTCTATGCAATTATTCATGGACTTTCGAACTCTACCGTTGATAGTTAGTTAAT
TTGGTGCACAGTGTGCTGCAATGCTTGTTTATGGTGCTTCTGTGAGTCCTGGTTGTTTTT
TCCAAATGCAAACGCTGAACCTTATGATTCTTTCTTCTAGTTTCGGGTTTCGGCAAATCA
CTTACTAACATTGGCACTTGTGTTCTGTTATCTGTGTTCCTTCCATTCAAAAATATAGGC
CGTCTTAGTATGTGTGCATTTGTTGCTTGCAAATGGAACCAAAACATGGAAATGTACACC
AAGACAATTTGAATTTCTGTTTGGATGAAACTTAAACATGAGCTGACACTTCTTCCTTCA
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ATTTAATCTCGATATGCATTACAAATGCTAATGTTTAGGTAAGACAACTAAATAGTAGAA
ATGTTTTGCATAATGATGCAGGTTTGAAAAAGGATCTTAGAGTGTCTAGGGTTGGGCCAG
GAGGGTCTCTTAACGATAAAAAGAAAAAGGCTTATGCTCTTTTATCTTAAAAGAACAGAC
TAACAGGGTCAGAGAATGGAGAAAATAAAACATTGTAGTTGCCCATAGTTGTTCTTTAGA
CTGTAGTAGGAATGTTTGGATGAATGACCAGAATAGAGGAAATAAAAATTTGAAGTTGTA
TTTAGTGGTTTGTATTCGACGGACTTGGACATGGCTCTCTGGACATCGATAGTAACATTT
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ACAATATAGCTAAAAAAATGTATTACTTGCATTTTTTCAACCAACCAGCAGGAGTGCTGC
CTTCTCATTAAGAAGGAATATAGTATTTACATACTACTCCTTCCGTTCCTAAATATNNNN
NNTTTTAGAGATTGCACTATGAACTACCTACGGATGTACATAGACATATTTTANNNNNNN
NNNNNNNNNNNTTTGCTCCGTATGTAGTCTCTTAATGGAATCTCTAAAAGGTCTTATATN
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GCCAAAATTCACCCTCACTCAAAGGACCACTGCTCGTGGTCGTGTGCACCACCAGTGTGT
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TGGAAAATAATATCTAAATTCCTGGGGTCTGTTATGAATATGTATGGTCTGGTGATATTG
CACTTGAATTCACCTCAGCTTCTGCTATCACAGATTTATATGAAAATTATATGGACTGAC
GGTTTGTGTTTGTTGTAGCTCCACCTGTAACATCTATGCTGTCCCACCACTCCACAAGCC
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CACTTTGTATGCCACCCGTTATCAAGTACTGTTTCGGGCAATTCCTGTCCAGTTTGTCAA
TGGACGCCACTTTAAAGGAACTTGTAATTAGTTGAACTCACTTGAATTTTTTCTAGAACA
TTTTTTCTATTTTTTCTTGTAATTAGTTTGTCAATGTCCAGTTTGTCAATGTCTGGTGAA
AAGCAAGTTATGTTCTAGAACATTTTTTCTATTTTTTCTTGTTCTTTTGCTTTGGTTTGT
AAAGGGCAGTCAACAGTTTCGGTCTTGCTCATATTTTTGCTAGAATTTTGCGTTCCCTAA
AACTCACTGTTTTGGACATTAGTAATGTTAAACTTCAAAACTTTGACTAGTAATTTTTAA
AATATATTTGGATTGGGTACTTGAAAATTATGTGTACATTTGTCCCAAAAAGTACTTCCA
TGATATATAATTTTGTGATTATATAGGTTGAATGGTGAGAGCTTACCTTGCTGTAGCTGG
TTCTTGTGTATTGCGGTGATCACATCGAGACATCTTCTTGCTCTCCCTCTTCTAGGGGAG
CCTCCACATGGGCTTGGGCCCTATGAGTGGGCTAGAGTAGTCATGGACCAGGCCCATTGC
TGGTCCCAATCCCTTTGTCAAGCAATCTGCACATTGTTGCTCAGAGCTGACATGAGCAAG
GTTGATGATCCCAGCATCAAGTTTCCCCTAATGAAGAAGCTGACTGATTGTCACACCACA
CCCTCAAGGGTCCTTCCCTCGGAAGTTCCAACTCGCGCAGTAGGTGCTTCACCCAGAACA
TCTCACTCAACCCTTGAGATAAGGCTTTATACTCAACTTCTGTTGTTGATCTTGACACCA
TTGTCTGTTTCTTGCTTCTTCATGACACCAAATTTCCTCACACAAACACACAGTAGGCAG
AAGTTAATCTTCTATCATCTTGGCAATTGGCCCAATTAGAGTTACTATAGTCATCCA