morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_58768
Source Contig contig_58768
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_58768 (7427 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
		No map location
Predicted Genes from contig_58768

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_70906	5	1985 bp	MLOC_70906.2	Available	Available	LOC_Os08g16010.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-133, 13108.m01710 protein acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed
MLOC_70905	1	350 bp	None	Available	Available	None
CDS Structure of MLOC_70906

CDS Structure of MLOC_70905

Contig Sequence (7427 bp)

>contig_58768 7427 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTAGACATACTTCGGATCCTACAAGCTTACAACTACCACTTATGTCATCGCATGTTACTT
ATGAGTATACATAGTTGACTTAGGTTAACAACAAAATCACAAATGTGATGAATAGGACAA
AGATTATGAAGTCATTTAGTCTACTTAGCCAAACTGACATGCAGCCTTGCGTACTACATG
ATTGCTCTTCTATTTGACTACGAACTTGGAGTAATAATCCCCTGCCCCGACTCACGGGCT
TCTCGACCACCATGGATGCATCTCGTCCCACCCAACTACACACGACCTCCCTAGAGAACA
CGGGGAAGAGAAGGGGTGCTGCTGCAAAAGGCACGTCGTGGGAGTGGCTTCTTGTGTGAG
TCTCGACTTGCTGGAAGGCGGTGTTGCAAGGACACACCACTGTTGCAAGTGTCATTGTGA
GGTCCTAAGTAGTGCGGCGATGGCAGGCGATGATGCTACGAAAGATGGCGACCATGTTGT
TGCTGCTGCAATGAGAGCAACACTGTTCTATAAGCGGCGCATTGAGTCAGTGGCGAATAT
TTGTGAGTGGATGGTGGCACTGCAAGGGATGTGGCGTAAGGTGAGAAGGAGATGACCCTC
TAAGTCTACAAGCAACAAATGATGTCAATCATGTTGTAAAGGGGGTCGTCGTAGGTTGGT
GCTGCAAATGATCAATGCCGCACAAAGGAGCAACTATCAAACATTAGTGTTGCAAAAGAG
ATGCGGGCTGCGAGGGCAAGAGACCCCGTGGGGGCGCATGTGATTCGAGGGTGTTTGCAC
GTCACAACAATTAGGGTGCTGTGAGGGATTCATGCAAAGTCATCCACCAATGCTCAACAC
GAGGGTGGCGTTATGACAATAACAGTGCGTGTTATTAAGATGACAATCCATGTTGTGGGG
CCAAAAGTGGTGCGAGGAATGTCCATGCATTTTGTGAGCCTAGTGGCGAGGGACAACAAA
GCCTGCTGCGAGAGAGGTCATTGAGTTCCCCGAGCAGCACCACAGCTGTCACAGTAAGGG
AGCTGTGTAGCACGTGGGAGCTAGAAGGGAGCGGGAAGGAACAAGATCAAGCGGTTCGTG
TGTTGCGTCACATAGTGCTGTAGGAGGCTGCTTAGCCCTTGCGCTACCGTCGACTGATGC
TAACGTGCTACGACTTTCATGCTAGTTGCTCAATCTGTTGCTTGTTTTGCTCTAACCAGC
TAAGCTACCGGAACCACTTGCCCAAAGACTCTTTTATTCATGAGTAAAATACACCCGAGG
TCCTAAAAGTATTCCAAGTGTGTCAAGTAGGTGCTAAAAGTTTGAAACCGTTCACCGCAG
GTCCTAAATATGTGTAAATCGTTCACTGCGGGTCCTAAAAGTATTCGAAGTGTGTTAAGT
AGGTCCTAAAAGTCATGCGTAAAATACACATATAACCCGCGGTGAACGATTTCAAACTTT
TAGGACCTCCTTAACACACTTTAAATACTTTTAGGACCTCCGTTGTATTTTACTTTTTCT
TCATCTATGAACATCCTACTTGCAATGAAGGAGCTTGCTCAAGAATCGAGAGCCAGCTAG
CCGTTCAGGGATGTCTTCTTTGCTATGGACGCTACGAAGAATAAGAAAGGGGAGCTTTGC
TAGTAGTCACTAAAAACAGAGGACAGACAAGTCATTATGCAATGTAAAACCTGGATTACA
GTTTATGAACGTACTACGTAGCGGCGCTGCATATATGCGTTGTCGTGCGGCACTTTCTAC
ACACTCTCTACCACTGCCTGAGCTAGAGCTACGCTTCCTGTCATCGCTGATGCAAAGTAG
TAAAGAAAAGGAGCATGCACCAGCTGTCTTGGTAGAGCATGCAGTAGTAGGCCCCTAATG
CATATGTCACGTCATAGGCTTAGCTACTGCAGGCAGCCACTAATACAAACTTGCTAGCTA
CACTAAAAGGCCATCAGCCGCTATTCACAAAACTGTGTTGTGTGTTCTTGACTTTTTCTT
ACAAGGATTATCGCTGACCAAGTACGAAAATGTTTACATGTCCAGAACAAAAATTAGCTT
AAGGAAAAAATTCATTTGCATTGATTTCTTCTTCTTGTATAGGTCGTTGCCAAATTTCTA
ACACCTATTTTCCATAGTGTTTGCCCCACTCGTCAATTTCATACTACTAAGTTGTCTTTT
TTACATGAAGTTTTGTGACAAGATGTAAAACCTAGTTGCCATGCTATTTTGCCGTGCTTG
CCAATTTAAAATCAAGTTGTGGCATCGTAAGCTTGTTGGAGGATTGTAAAACCTAGTTGT
CATACTGTTTTCTTGCACTTACCAATTAAATTCTACCAAGTTGTCGTTTAATAAAGCATG
CCGTGGCTTGTCAGACCTAGTTGTCATCATGTTTTCTTGCGCTTACTAGTTTAAAATCAA
GTTCTCGTATCTAAAGTTTCTTGGAGGCTTATAAAACCTACTCCCTCCGTCCGGAAAAGA
CCGGACATCTAGTATTTATAAATTGTCCAAGAAAGAGTGTTAATCTACAACCCCAATGCA
TATTGTATTTTATCCAGCCGTCCTTAATTGACTCATGCATCAACTTGTAGCCTAGTTATT
GGTCGCATGCTCATTTTAGCCCCTTTGATTTCTGCCTTAATTACTGCATGCAACCAATAT
TCATTTAATGGTCTTTTTTCACTGGTTGCATGCACACATGTGTCTTTCAATGTTCTGTGT
TAATTAGGTCATGGGAGCAAAGTCAGCTCTTTCCTTGATCTATGTGTAAATCACTAAACG
TGCAGTCTTTAGCGGACGGAGGGAGTAGTTGTCATGGTGTTTTATTGCACTTGCCAATTA
AATTCTATCAGGTTGCCATTTAATAAAGTATGCCATGACTTGTAAGACCTAGTCGTCACC
ATGTTTTCTCACGTTTTCCAGTTTAATTGTATCAAGTTGTCATTTCATAAAAGTTTGCCA
AAGGTTTGTAAAAACATAATTGCCATGGCGTTTTGTCGTGCTTGTTAGTTTGTATGTACT
AAGTTGTCATATTGTTTGATAAAGCTTTCGACTTTGGTAACAATTAGTTGTTAGGGATTT
TTTATTATGCTTGTCTAGCCGGTTGCCATTTTAATTCTACAATGTAGTTTGTCTTGAAAT
TTTGTTATGCATCTATGGGTGGCTGCACTGAAAAAATAAGATATTTTCTCAATGTCGAAA
AAGAAAACAAAAAAAAAACACAATCATTACTTACTTGGTATGTTACAAATAAGAGTAGAG
TAAAATCCTGAAACAAAGTAGAATAAAAAGGTTAACCGTTATGCAAGAGGGATAGTATAG
AAAAAGTGAAAAGGACAAAAGGCACATGCTGTAAAGTGCTACAAACACACCATATATGTC
GTGGTCCCCTAATATTTCCTCGATCATATGGCTCCCAAGCATGCGGTCCCCTTCGATCTA
ATTAGATAGGACCATGAACGTGACATGCAGTGGATCGAACGCTCGAACGTCCGCCCATGT
AAACGCAGCCGTGCGCACGTTGTAGATTAGATTTCTCGTACAGTTTATATAATCTGACAT
CCAAACATGCTCACATAAATTATTTTTATAAATCAAATTATATAATCTATTTTTATAATC
TAAATTATCATAATCTATTATGATTGCAAATAAGGCCTAATTATCCGTGGATGCTAAAAT
TGATCCAAACCCGTTCTCCAATGGGTAATTACCCGTCGGGATAGAGTAACGGGTACCCGT
ACCCCGTTCCGTCTTGCGTCGACGCATCCACTCGGGCGCACCGCCAGTCCGCCAGGCAGG
TGTGGCGGAAACGACTCCATTTCCCAACCAACCAACCAACCAACCAAGTACCAACAGCCG
CCCGTGGCCGATCCATGGCGACGGCGTCGCGGCTGCTGCCGCCCTTCCCCCCTCCAGCGG
CCCCGACATCCCGCCACGCAACTCTCCGCGCCGCTCCTCGCAGCTGCAGCCTCGCCATCC
CGAGCCTCCGGTGCCGCGCCTCCGCCCCAGCGGCCGTTGACGCTGCTGGCGCGCCGCTGC
TGCTGGAGGACCGCGCCGGCACGGTGTCCATCCGAGAGTTTGTCACGCTCGATGAGCTCC
ACGCCGCCGTGCGCCTCCGCGTGCGCACCTTCTACGAGTACGCCCGCGACACTGTCGGGG
CCGAGGTGATCCATCCCTTCAATCAGTCTCATATATCCATCTCTTTCCTGCTTGTGTGCC
ATGTGAGCTGTTAGCTTTCAGAGAAGTACCAACAAGCGAGGAGGCAACCAAAGATCTGGG
TGTTCGTTTCCCGAACGATAGTGTGCCAAAATTGATCTCTTTTTGCAAACACGCAAAATC
AGTCCTGGCCTCGTAGATGACACGACCTTGGAAATTGATGTACATGCATTGGTTTGTGAT
TATAATAATGAGAGCTTCCATTTTGCTAGTGTATACTGTTTGTTTTTTCCTTTCATCAGT
TCTATGAAGGCCAGTAGTATAACCGATCCGGAATATCCTTGTATAGAAAAAAATGTTGCT
GGTGTAAGTAAGATAGAGTATTTAGGAGTAACACGGTATCAATAGTACTCGTAATAGGAA
GAGTGACTTCAGGAGGACTTGAACTTGACAGCCTTGTTCCCAGGATCACAATTTATGCCC
TTTCTAAATCCAAGTTTTCAGTGATAATTGTTTTAAAAGAGGTGTTGGATGGTGTTAAGT
TGTGAAGGCAAATTCATTCAGATATGGCCATGTTTTCATGTTTTTCCTTCGCAGGCAGAA
CGAAGTGTTGACTATAATTATTCTTATAGTCCATACTACTTTATTTCTGCTCAATTCACT
GCCTTCTGGCCAAGTCTATTCTAAAGTTAGTAGACAGTCATCTAGTTGCAAAACGGTGCA
ACCTTGTTCAAAATTGCTTTCCTTCTATGTTTATAGTATGTGTGTTTTTCTTTTGAGGAT
TTATAGTATGTGTTTTCCTTCTATACTTTCCATGCATTTCCTTCCTTTTTTTCTTTCCCT
GAATGCATCATTGAATCATCATATTTATGAATTAATAATTTAATTTTACTTATTGTCAAG
TTCTATTAGGATCACAGGAAAGGTCTGGCAGAGAGGGAATATGAAGCATTACAAAATCGG
ATTTCTGGGAATATGATTAATTTTCGGAGAGTCTCTTGTATAAATGGGACAGTGCCACTG
TTGCCATCGTTGATGCCAGCAGAGGAGCTTTGTTCAACATGCAAGGTATAATGGTAATAT
AGACGCTGTGCCCTTGAATAGGCACTTATTTCGGCTCTAGCTAGACCATAGAAATCTGGG
TAGCAGAATCTTTTTAATTGCCCTGGCATTCTTCTGTGTTCACTTGGACATAAAACCTAA
ATAAGAATGATAATTGCAAACGTGCATTTTCCCTTGACTTACTTTGATTCATCTTATGAT
TCTCACTTGTCATGTGCAGAAAGCATAAAATGTTAATATGTCCTGTTCTTCTAGATACAA
TTTCCTTTGCTCATCAAAAATTAAAATGCACTTAGCCTTTCTTGGTCTCGGTATGATTTT
TCGATGTGCATGTGTTTAAGTCTATGGTTGATTATATTCATTTCTAGCAGGAATAATCTG
TCAATGTTAGAGGTTAACCTATGAATTCTGACATATGCAGTTTGTTGAAGATGGGGAAGA
GAGAATAGTGGTTGGTAGTTTAGACCTGAATCAGTGCCTCTGGCTACCAGATGAACTGAC
TGGAAAGAGGCCAGGGGTAAGTTTCCAACAGATTGAGAGGGTTTACTGGATGCAACTGAA
GTTCTGGAATAGTTGGTTCGATACCATTTGCAGTTCTATTGTCTAAATTTGTATTAAATG
ACGATTTTTATAAAGCAGTAGTTGCCATGTCAAATATCCTTATCTAATCCTGTATCTATT
TAATTATATTAGTACAAACAAGATGCAAAATGCTTATTTTAATTTACTTATAATCCTTTT
GTTTTGCTTTTTCAAAGATTCTTTATTTTTAATATTTATTCTGTATTAATAGGTAACTGA
ATCAAGCCATACACGGGCATATCTGAGCAACGTATGTGTTGCTAAGGAGCTCCAAAGATG
CGGACTGGGCTATGCATTGGTTGACAAGTCTAAGAAGCTTGCTCGTCAATGGGGTGAGTT
CATTTCATTTAGTTTCCTTAACGTGTTTTTAAGTATTTAGCTGATTTTAGACTATCCTTA
GTTGGTACTTGGTAGTTAGATTACCTGCAACATGACAATATATACTGATAGATTGAGTTT
TCGGTTGTACAAAAACGTGCTTCTTATGTTCAGGTCGAAACATCTATTATCAAACGTGTT
CTTTCACCATTTTCTGACAACTGTACAAACATATGTTGCTACTCAAGATATGTGATCTAT
TCCGATTTAGTTGAATCATATGATTGTTGCGCAACAGTTTTTGTGGATCGACAGAAGTAT
GATAATTACTTCACTTCTTAAACCCTTTGAAATTCTTGTCCCTTAATGCAATTTCTCAAG
TTGGATGCGAACACAAATATTTGCAGGCATAACAGATTTGTATGTCCATGTTGCCATCAA
CAACGAGGCGGCACAAAAACTGTACATCAAGAGTGGATTTGTGTATGAAAGTGAGGAGCC
TGCCCAGCAGGCTAGGCATCTTGGGCGCCCTCGAAGGCTTCTTCTTTGGCTTGATATGAA
GAACGAGGCCTTGTGATCTTACCTGTAAATGCTTCCTTTTATAGCTATACAGTATTATCT
ATATATAATTCCGATTTTACTGCCCATTTCAAGTAGTAGTATTTTTTTCCTTGTGGAAAG
AAATACAATTCCGAAAATTTAAATTCAGGATTCTCCCCATAATTTTATTTGTTCTGCACA
TAGTACTCATTTTTCGATGTATATTCAGAATTCCCCCAGTGGCAAACAATGGTACGGGAT
AATGCAGTGCTATCAAATCTTCAGCATGGACGGTGGTCAAGTGCTTGGTGGACTCGATTG
GAATCGGCACACACTCTAGCATGGGTGCAACAATGACCTTGTAGAAGTGGCTTAGGCCAT
AGTCCTCATGGAAATGGCCACAACTCTTCAGCCTCTTGGGGGCATTGACGAGCTCCACCA
CCGTCTTGCCCTTCTTGCCGAGCAGCACCTCCTTGTCCTTGGAGTAGTTCCCGAAACACC
GTTGTCCATCTGCATTTAAAATATGAACATGAGGTGAATGAAGCGACAAATACAATTCAC
ATATGAGCAACACAATCATGGTATGCATAAAATCTACTACGCTTCATCTTCATCATTCAT
CCATCTGACCACCTATGCACCACTTGAACCTCCAAAGCCCCTATTTATCTACCACCACAC
TACATTCTCTCCCTCCATCACTCCCTCCAAAGCCCCTATTTATCTACTACCACACTACAT
TCTCTCTCTCCCTCCCTCCCTCAATCCCTCCCTTCCTCTCTCTCTCT