Map Locations of contig_58752 (10176 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_58752

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70898 4 2996 bp MLOC_70898.2 Available Available LOC_Os06g37010.2, FRAME:+2, EVALUE:6e-123, 13106.m10553 protein metal cation transporter, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_70898






Contig Sequence (10176 bp)

>contig_58752 10176 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACACAAAAGGGTCAGGCCGGTGAATTATTTCTCCCGAGGGATCAATCCGTGAGTTCTTTC
GTCCCAGGGGTCATTTTTGTTAATTTTGGCCATGTGTTGCCGCTACATTTTCTATTGCTG
GAGGCATCGCAAGTTCCAGAGCTGCCACAGTGAAGGGTACAAGTGCTCCAATTACAGCCG
GTACTTCCCAGTTCTGAAAAACTATTGCCGAAGATGGAGGTGCCAATGGCTGCAAGCTCT
CTAGGCATGTGAGCTCTCTCTCCCTGCCAAATAATTTTGGAATAGTAATCTCTATTTAGG
GTCTATAATAAAGCATATAACAAGGTGCGATGTTTGGTTCAACGAATTGAAATTGGTAAT
TACAACACCTACTATGGACAAATATGTTCAGTCTTAATCCGAGTATAATTCCTTTTGTAT
TATACAACATTTGTAACCATATTTATTGTTTCTCTTATGTTAGTACTATTTCTTTTATTT
CATTATTAATATATTTGTCCCTACGATTATTAATTATTTGCCAATCAATAATACGTGCAT
TGCACGGGCACACTTAATAGATAAAGCAGATCAATATGTCATCATTGTAATTTGTAAATT
ATTTCTTCAACCACTAAATAAACTAGATGCGAATGAGTTAATAGTTGGTGATATACTAAA
TTTACCAACAAACATACTATTGGAGATATTCTGACCCCTTTCTCGATTTTGTCTTGTGTG
AATTTAAAGTCAGCATGAGCATCGATCTTTTTGTTTCAGCATTTTATCTTTATTATTGGT
TAAAAGCAGAGTGATTGTATTAAAATTTGAGGTGATTAAGTGGGACCGCTTACTCGTATT
ATACAAGTGGGACCGCCGAGAACTAGCAGAGCCTGAGACTTTGCTGGGAATTCCTGAGAG
GCTTCACGTGTAAAAACCGGGCGAGTGTACCTTTCGTCGGAAAGAACTAGTAGAACGCAA
CACAACTCCTTCCAATAGATTATTGATTTATTGTGTGTGAGATTCGTAGACAATGCATGT
AGAGCCAAGGCGGGATCGCAGTTGGCAATCCGGGCGTAGATCATGCCGCCCACAACGACC
GTCCGGCGGCACAGGCACGGGCGCGAGCCGCTCGCCATAGTGTCGACACCGTCGTACCTC
CACGTCCACTTGCCCGCGTCCACCGTAACAAAATGCCGGCCCACGCGAACCACTGATAAC
GGCCCCCACGCACGCCACCCCGCAAGCCTGACCGCTCCCCTCCGCGGCGACCCACTGACG
ACAGGGCCCGCGTGACCCACTGCCCCGCACGCCCTACCGGGCCCATCCGCCGGGGCCCGT
GCGATCCCAACCGACGACGGCGGCGGCGTGGGGGGATGACGACACCCTCTCCGTGGTGGT
GGTGGCCCCGCGCGCCGATGTGGCGACGCATGTGTCTGCTCCCCCGCCGCATGCAGGCGC
GCCGCGCGGTGATAAATTGGTTTTAATTTCATTCCTCGATTCCGATCGAACAATCCGTCG
ACTGTCGCGTGGAGAGTGGAGACCTGCGGGCGGAGCAGGATCGGATTGTCATTCTATTTC
TCCGCGGCTGCCATGGCGTTCATCGAGGTGAGCGCCTTCCTTCCCCCCCTTGTCCGTGGA
CTGCTGGCTCGCTAGCTTCTTGATTCCCTCGTTGACAAGCACACAGCGCTGAATTGCGAG
GCGGAATTCGTTTGCTTTTGGTGATGATCATTCGGTTATTCTGATTCTTGTAATGGCAGG
AGATGGAGTCGTACTACGTCCCCTATCTCCGCGCCCACCTACACCAATTCGCAGGTACGA
ACACAGACATGATGATTAAGGGGCTATTTATGGTTATTTCCTCGCTAAACCCATCATGGG
AGCTCGTGATTCTGACGCGGCGGGGCACCGCTTGGTCGTCGGCGATGGCAGCGTCCGTCT
CCACGGCGAGCTGCGAGGAGGGGGCGGGCGACGACGAGGAGTGCCGCGACGAGGCGGCCG
CGCTCAGGCTCAAGATGGTGGCCGTCGCCGCCATCCTCATCGCCGGCGCGGTCGGCGTCG
CCATCCCGCTCGTCGGCCGGAGGCGTCGCCGCGGCAGCGGCGGCGAGGGCGCGTCCTCCG
GCGGCGGGACTTTCGTGCTCGCCAAGGCGTTCGCGGCGGGGGTGATCCTCGCCACGGGGT
TCGTGCACATGATGCACGACGCGGAGGAGAAGTTCGCGGACCCGTGCCTCCCGGCCACGC
CGTGGCGCCGGTTCCCCTTCCCGGGCTTCATCGCCATGCTCGCCGCGCTGGGGACGCTCG
TCATGGAGTTCGTCGGCACCCGCTTCTACGAGCGCAGGCACGGCGAGGAGGCCGCCGCCG
CCGCGGCCACTGCTGACGACACCACTGCGCTGCTCGAGGACGGCACACTCGCAGGGATTG
CTGCCGCCGCGGTGAGCGGAGACGACGAGAAGCAGGACGCCATGCATATCGTGGGCATGC
GAGCGCACGCGGCCGCGCACCAGCACAGCCATGCGCATGGACATGACGCGTGCGATGGAG
GAGCCGTGTACGACGCCCACGCCCACGCCCACGCCCACGGCCATGGCCACGACCATGGGC
ATGGGAGCGAGGAGAGGCCGTCCCAAGCTCATCATGTGGTTGTCTCGCAGGTACATGCAA
TTTAATATTGTTACCAGTTCTTAAGGCAACGAACTTTTAGTTAAACACAAGTCACATCTT
TTATGCGTTGAATGAAAAATTCAGAATCGAATAATATTGCAAGTCAATCTCCCAACGAAA
AAGCCAGTGATCCAAAGATCAGACAACTTGAAATTCACAAAACCTAGAATTATTAGAGCA
TCTCCAACAGCAGCAAAAAAATATCGCGTCCAATAAAATTTTTAGGGCGTCATTGTAGCA
TTTTTAAAACACGGGGACCATAGTATCTCCAACAGACGCTCGCTAGTGGGCGTTCAATCC
AGCCCAATCCAGCGACCCCACCGGCAGCAACACAGAGTTTGCTGCGCGCGCAAGCTGGCG
CACCAAATATGCCGCGCGCAATAGCGCTTTTCAACGCGCGCCTAATTTTTTTTAGCGCGC
GCACTGTTTTGCAACGTCTGTTGGAGCTGTTCGGCGCCCAAAAAACGAATCTTTTAGCGC
ACGGATCACTTTTTGGGCGCCTGTTGGAGATGCTCTTACTACCTTTGTATGCAGGTTAGC
TATGTAAACACACCCCCTCCGTCCCATAATATAAGATCTTTTTCAGGCCAGCGAAATTTC
CTTTGCGTTATATCTGAAAAATGTTGTACAAGTGCACATATCTATGAGTAAAACTATTCG
AAATGTGCTACCGTGATAGATGTTTTTAGTTTGGAAATCTGCAAAGCATGCTAAATAGTG
ATTTTCTGTATTGTTGGCAAGATTCTGGAAATGGGGATTGTATCACATTCCGTGATCATC
GGGCTATCCTTGGGCGTTTCGCAGAGCCCGTGTACCATTAAGCCTCTTGTTGCTGCCCTC
TCCTTCCACCAGTTCTTCGAGGGTTTTGCCTTGGGTGGCTGCATTTCCGAGGTTAATATC
CACTTCATTTCTGCACTATGGTTAACAGTTCCTCACTCGAAGTTAGCACTCATGTGCCTT
GATGTTAATTGCATCAATTCATCACATTCTGTATGAACAAATGCAGGCTCAGTTCAAGAG
TTTCTCGGCGCTCCTGATGGCTTTCTTCTTTGCTATCACAACACCAGTTGGGATCACTGT
CGGGGCGGGGATCGCGTCGTTCTACAACGCCAACAGCCCCAGGGCATTGGTAGTGGAGGG
TATTCTGGATTCAGTTTCATCTGGTATACTGATCTATATGGCATTAGTGGACCTCATTGC
TGCTGATTTCCTTAGCCGGAAGATGAGCTGCAATCCGAGGCTGCAAGTGTGCTCATACGT
TGCCTTGTTTGTTGGGGCTATTGCCATGTCATCACTTGCTATCTGGGCTTAGTGCCAGTG
AGGATTCTTGAAGAGTGGGGTCTAGGCGTTCAATGCACTACGACCTGTTGCCTAGCTACC
GGTAACTGAGTAAGATGGAAGGCCTTTTCTTTCTCTGTCCATTCTTTTGTTTGTTCTTCT
CATGGTGCTGGGCCGTGTAATGTCCAAAGAAAAGGAAGTCCCTCTTTGGGGTACATTGTT
GCGGTAAAGAATTGGGACAAGTTAGTTAGGTAATAAAGAGTTTTTGAGTCCCAACAGTCT
TTGCAAATGTACAGTCCATCCTCGGTGTTAGATAAGCGGACTTGTCTGTTCTCAAGTATA
ATCTTACACATACATCAATGTGGATCTCCTGAAAGTTGCTTCAACTGTTCGAATACAATG
GCATGTGCTGTTTGAAATGAGGATGGTTATGAACTCACGCCCGACTCTTTTGCCGCACCT
GTTAGAACTATTTTGGTTGTATATATGGAATGAAGGTTACTGATCTTGCCCAACTTAGGC
TGTGTTTGGTTGAGCTGCAGATTCTAAAAAAGCTGCCGTAGAAAAGCTGTTGTGGAGAAG
CTGCTGTGGAAAAGCTGGAAGCTGAGAAGTTGGGATACCCCAGCTTTGAAATTTACACTA
GGAAGAAGCTACAGATTCTCAAAAGCTGCTTTTAACATTTACCCCTTTGGTTAGCTTTTA
GCTTTTCAAAGCAGAAGTTGGTAAAAAAAGCTGAACCAAACACAGCCTTAAATACCAATC
ATATGAACAGCGATATGATGCAGCAGAAATTCTTTATCCTTTATCCTTTTTGTAACTGAA
GCAGTTTGCTGATACTGTTGTTGCTGGGCTGCAGATTCATTTGTAAACCACAATTAATAA
TGTCGACATACAGCTCATTCATCTAGCTATGTCTCTACTTATAATAATGTAGATTTTTCC
TGATGACTTGAGATGAACCAACTTTGGTAGATTCTACTGCAGTATATATCTTATATTTGG
GTTATGTATTTATCAAGTTCCAGTAAGTTGTCCATGCTTGCACTGAACAACACATGTGTA
TTGTATCATTTATTTGTTTTCCCTCTCGAACAAAAATGTGTATTGTATGATTGGTGCTGT
TTCCTATACAGTATAATATCCAGATATTCCCTGTTGTTGGCATTACACATACTGTTGACA
AATGTAAGATGATCTGAGGGTTTTACCTAGAGTGCATCTGTATGGTTTTCCAGCAGACTT
GTGAGCAAATATATGATTCAGGCAGCTTCTGCACGGAGGTAACCCAGCTACATATAAGTC
CTTATAGGACAGACATATTGTTCCTGGACATATAAGACGCCTATTTTTCAAAATTTTAAA
TTGGTGCATTCTTTCAGCCTTTACCATCCTCCATTGCTTTTACCCACCGATAAATATGGT
TGTGCAAGTTATCACCATTACTTTATAGGGGACTGGTTATTCAGGCCTTCTTTTTTCTTG
TTTTCCGGTATAGTAGTGACGTTATAGTAGAAAAGATTAATAATCTATGATGAACCTTTG
ATTAGCGTGCTCAAATTCAACGATAGTTTTTCCTTGAATTCCCCCTCCTGAATTTTATAT
ATCTTTGTGAAATCCCCCTCCTGAATTTTATATATCTTTGTGGGGCGAAATCCCCTGATT
GGTAACAGCAGGGATTTTTACAGATGTAGCCGAGCGGCTAAACACAGGAAGGGATTTGCG
CAGAGTTGGGAGAGGGAACGGGGCTAGCAAGGAGTTTCTTCTCGTTCAGTGAAAGCTATC
TCTTTTCTTTCCGTTTTTCTAACTTTGATGCTTTCTACTCCCTCCGATACATAATAACTG
TCGCAATCTCGAACTAAGGTTAGTTCAAAACTGCACAAAATGGATTTAGTTTCGCCTACA
TACGTAGTCCATATTTGTGAAATATCCAAAATGCCTTATATTTGTGAAATATTCCAATTC
ATATGTAGTCTATATTGAAATATCCAAAACAATTTATATTTGTGAACGAAGGGAATATAC
AGTTAGATGGGTCTCATCTGCCTTTTTTGAGTGGCAGTGCACAAAATGGATTTAGTTTCG
CCTACATAATTGCTTATTATTGTGATGAAAATAGCACTACTATGTGCCTAATCTTCCTTA
GGGTAGTGCTTGTGCCACCACTATGCTGGCAACGGAACTCTTTTAAACTGTGGAAGTGCA
GATAACAAATGTGGAACCAAACACCCACTATAATTAATTTCTGATGCAAAAGTTAAATTG
TTGACAATTCAATGTGTGTACTGCTGTACTGATGTTTCTGTATTCACCATGCTATGATAC
AAACAGGTCTTGCCAACGTAGAAGAAAAGGGGTACTTGACGCGAAGGCGAGCACAGTCAT
ATGGATGGATGATGATGCAAGGTGGAGCCAACCCTTTGCTCCCTGACAAATCTCACTGAA
ATATTGATCATTTCATACTGAGTCGATGGACGTAGACTGAAAGGCTACGGATAATGCATC
TGAAGCCTGAAGCTCGTTCATCATCAGGCGTGAGCAATCCAAGAGGCTGTTGTGATACCA
TCTATGCATCCGCAGATTCTCTTGTCATATCGTTCCTGGACCAGACACCGGATCATGCAA
AGCCTGGAGGGCATCTTCGTTGTTGAGATGGAAAGGGCTCAGGTCCGTGTGCTGTTGCCA
GCTTTGCTCGTGCTGCTCACATCCAGAACCACGGCTAAGCGAGGGGACTGTTTGGGACAT
GCCACAGTGATGAATTGTGGGCTAATGTTTTGCTGAAATGGAGAAACATATGTCGGGTTA
CTTGGAGAGCGGATCATTGCAGTGAGGATTAAACGCCTGCCACCCCTCATCAGGTAAATT
CAGGTTCATCCATCAAAAGAAGTTACGAGTTAGTGCCCTTGCAAGAGATACTACTACTAG
ACACGAGGAGACGGCCTGGTAAGGTAGCCACGCAGAATCTCTTCAGAAACGTTAACCTTA
TCTTTCCCAGGTTCATCAACTGCCAAGTTATTTGAGACTTGCTAGCTAATTAAAACGCAC
GGAGATGTATCAGACAGTGGAATCTCCAAGGACCGGGACAAAACAGAAAGAATGCGAAGG
AGCCATTGGTCGTCGTGGACATCGGTCCAGTGCCCGGGACCGGGAGCTCTAGCCAGGGAC
AGCATGATTCAATTGCCACTGAGGAGAGGACGAGTGAGGCTGCCACGGCGTGGTGGCCTA
CCGGTTCTGGCAACCCGCCCAGACATGTTCCGAGGCCCAAAATGGTCGCCCGTGGAGGAA
TATTGAGCACGGAGCACCTAGCGGTGTGCGTGTCAGAACTCGGAAGGAGAAAATGTGGCA
GCCTGCCGGCCTGCCATCATGAACCTCCAGGACTTGACGGACGGAGCTCGGAGCCTCGAG
CGAGCAGTTCAGATTTCAGGCAGATAGATAGATAGATTCTGCGTCTGAAACTCTGAAATC
TCTCTTGGCGCATTCGGGTATAAAGGAGAAGCTCGGATCAATCAGGCTCAGGGTTCCGTG
GACGAGTGGCACCCCCTGGATTTGATGAGATGGCGAGGGGTGTGGCATCTCATGAGGTGA
CGCGGTGGCGCCGGAGGCGCGCTAGGTTGACGTCTTCCGCAGGTGCTCCGTGATGCTCAA
CAGAGCCTCCCGCGCTAGCTAGCATCCTAGCAGTGGATAGGGTACAGTACTCCGAGGCTC
CTGGCTTTTGGAATCTTTGCCAAGGAATGGCACGGGTGGCGAGCCAGGCAGCTCCCAAGA
GTTACGGCATCTCCAACGCCGACCCGTTATCGATTTTTTTTTTTTAACTTTCTGAGCAAA
TAAATTTCGAAAACAACCTCATTTTCAAATTTCTTTTTGAATCTGACCTCTTCATCCCTG
GCGTCCGAGTTTCATGGAAATGTCATGGTCCCTGGCGTCTAGTCCGTGGCTCGCACGATC
GGCTGACCCATTATGTAGTTGACGTGGCAAAGGGCCAGTCCTGATAAGTGACCAAACGTC
AGGGACTTTGGTGTCTGGTCTCAACAGATCACACAAACAATTGTTTGATAATATGTGCCA
CGTCAACCAGACGATAGGGTCCCTGGCGTATGGCCCTTTGCCACGTCAACGAATTAAAGG
ATCAGTCGGTTGTGCAGGCCCGTACCATACGTCAGGACCTAGACGTCTCGTATACAAACC
AATACTAGGAATGTTGACGTCACTAAAAAATGTCAGATTTGATTGTTTTTGAAAATGAGG
TCAATTTTAAAATTTGTTAGTATAAAAGGTCAAAACAACAAAATTATCCTCCGCAACCGG
CTCAGACGTGTTTTGCAAACCGAAGACAAATTGGGAAGGCCTTTGTGAGCATCCGGCTGC
CACGGTCGTTTCTAACTATCCAGGCTTATTAAAATCAACTGCCCGCGGCCGCGTGCGTTG
CCGCTCAAAAAGGTCAGCGCCGGTCCAGGGCATTAGTGTAGTCAATGGCGAATCTAGGAA
GAAAATTGAGCATAGGCTCATGTCAATGACGAGAAAACTCAAGTCAATGACGAGAAAACT
AAGCGCCATTTTGAAAAGAAACGACCAAGAAGTCCTAATCTTGATGTCAAAATAAACTCC
CAAATTACCACTAAAAACATGTAGCATTAACTATCTTTTTAGGATTTTTGAAAAAAATAT
GACGCCTAGGTATGGCCGGATACCCGTCTTGGGATCTCTACCTGCATTTTGCACGCTGCA
TTTGCCGGGTTCACACGTGTTAACCAGCAAGTCAACCAAACTATCTGAAGAGACCAAAAA
GAAAAACAACTAATACAACAAGAAATATAGGTGAATTATTTGATGGATATTTGTACCGCA
TCATCCATGCCCATCTCTTATGGAAAATGGCAACTCGAAAGTTAAGTAAACTATTTGAAA
CACAAAAGACGCCCATTGTAATGGATGACATAGCGGATGACCCGTTGAAGTAAGTCTGTC
TTAGCTTCGTGTCTTCAAATCTAGTTGCATTCATGTTTGCATTGACACTTTTATTTCAAC
ATAGTTGCTATTAGAACTAGTCTTGGAATAGACTTCAACAGAAAGAAAAAAAAGCGCATA
GATTGATCGATAGCTCTATATCCGAGATGGGATTGTCCAGTCGGCATGTTCTTTTTGGCA
TATCACGGTATCGGTCTTTGTTCAAACTCTCGAGAAGACGCTCTTTTGAGCAGCTATGGC
CAAGACACATGTCCTTTCGGTCACGAAAAATGATCACCACTGCATCGCGACGTACCCGAC
CGCACCGAGCAGCCACCTACATAGGGAAAGTTCGAGCAAGCGTCGTGTGCACACCTGGGA
CAGATGCAATCACTACTAGGAAAAACCCTAGCTGTAACGCGGGTGGCTGTGCTACTACTA
CGACGCTATAAGTAACTGTTAGCAATAGCGCCGGTTGTCCAACGCTACTGGTACTGCATG
TTTTCTAGCCCGTGCCATTACTAACCATATGTATTTCTTTTTATATTTATATTGTATTTT
CACACGATGTTATACATATTAACATATAATATCAATAAAAATTGTGGATGAAAGAACATT
TAGATTTAAGTAGATGGGTGCAAGTGGCCAAGTTGAATTAGAGGAATATATGTTGTTGCA
TAATTTAACTTGATCACTTGCATCCATCCACTTTAGGGTGTGTTTGGTTCAGCTTTTTTA
CCAACTTCTACTTTGAAAAGCTAAAAACTAACCAAACGGGTAAATGTTCAAAGCAACTTT
TGGGAATCTGTAGTTTCTTCCTAGTGTAAATTTCAAAGCTGGGGGTACCCCAATTTTTCA
GCTTCCAGCTTCTCCACAACAGCTTTTCCACAACAGTTTTTTTAGAATCTGCAGCTCAAC
CAAACACAACCTTAATCTAATATATGTCATATAACTTATCATCCTCTTAATCATCCAACA
ACTCATCATTATCTTAATCATATCAAGTTAAAATGTCATAAAACAAAAAAACATGATAAT
CATCATCATCATCATAATCAATCATGGCAAGTTAATCAGAAAAACTTCTATCTCATAGGA
CCTAGTCCCTTCTCCTAGGTAAAATGTTATAAAATAGAAAAAACACATAAGTCTTCATGA
TGAAGCAAAGAGATCCAACGGTCTCCAACTTGTGGTGTCGTGGTTTTGTTACGGAAGATG
TCCTCGTGAAAGGACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGGTGGCGACTGAAAGGGGTTA
AGCGGGAGAGACACGGCGATTTACCCCGGGTCGGCC