Map Locations of contig_58449 (12121 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_58449

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70736 2 898 bp AK356588 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70736






Contig Sequence (12121 bp)

>contig_58449 12121 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGTGAGGCATCGGCGGTAGCAGCCGACGCCATAGCAGCGGTGCAACCCCATGTACAT
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CCAAAGAGACAGAGACTAACCGGTAACCACACGACCATCTACCAGCCGCACTCTTAACTC
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GCTAGCGCCGTAGTTCACTTCAGTCCAGTCGGCATGGCGGCTCCGAGGGGTGCGGCACTG
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GGGACGCCGGCCCGGGGCTGCTGCGCCGGCATCCAGAACCTGCTGGCCGAGGCCAACAAC
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GGGAGCGAGATCACCCGCGCCGCCGCGCTCCCGTCCAAGTGCAACGTCAACCTCCCCTAC
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GAAAAACCCTTCTAGAGAGTATTATTTTTTCTTTTGTTTATGTTGTATTACATAGCTAAT
GAAAACCTATCTTCTCTCAAAAAAAAGCTAATGAAAATCTCCCTCAACACAGGAACAAAA
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AAGCATCCGGGCTAATCACGTACACTGACACACTAAACGACATTGGATAAGCATCCGGGC
TATTATAGCAACCCGTTATGCTTTTGAACCCAAAAAACCTTATTTTTTTATAATTCAGTT
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ATACCAAATCTGAAGCAGAAACTGAAACCCGAAAGAACCAAAATTTCGGTTCATTTGCTT
TTTTGGTTTGGTTTTTGGTTTTCAGTTTGGTTTTGCCGCATCCTACGTCTCCCACGCGTC
TCCACGGCCCTGCAGACCACATATCTCCTTCATTCGTATCTCCATTGAAACCATAGCTAC
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CCAACCAGGAGGGAGCGATGAGGGAGGGCAACGACAACGACACAACCTACACCGACGGTG
GCCTCCATGACCACGGCGGAACGACCAAGGTGGCCGAGCCCGAGCAGTCACCATCGAAGC
TATACAGGTGCCAAAAGGGAAGAGCGACGTGCCGTGAGCCCATGTGAGGTCGAGACCACT
GCACAACAATCCGTGGAGAACCTATGCGCATCCCCCTCGCCGCCGTCTCCATGGTGTGAT
CCTTCTGAGGGGTCCCCGTCGCTAGTGACGAGGTGGGTCTAGGACCAGTATTACGCCACT
GTTAGCTTGGCCTCATGCAATGGAAGCCACCCGTGCCCTCCAGGCCGTATGGATGTATGA
CCACGAGTTTCTACAATAACAACGGAGTTGCAAAACGGCGACGACAACGACGAGGGTGCT
GCTGCCACACCTTTTCATTGCAAAAAATTCTACAACATCATCAATATTGCATAAGTCCTT
CCCGCAACATCATCTATATTGTAGAAAGGTGAAACCGATAAAATATGAATTCTGTAACAA
ATCATATGTTGCAAATGTTTCTACAACAGAAGATCTGCTACAAAGGTTTCCACAACATTG
CATTTGTTGTATTAATGAAGACAGAGTTGGGTCGTTGGATGATGCTGGATCTAACGGTTA
CCGAGGCGAAAAAGATCTGCCTTTTTTTGAAGGGGTGCGAAAAAGATCTGCTGGCCCACG
ACGCGTAGCAAACCCCACAAACCGGGACGAAGCCAACATGCAAGCATGGGGACAAGTTTG
TTCATAGAGGGAGCAAAATTCATATGAAGTAAAAAAAATTAACTAAAACAACCATTATCA
CAGTAGAAAAATCAATTTATTAGAAAGAGTCTAGCCCCCCTCGCCCCACTAGAATCGTCC
CCCACAAATTAAAGAACGCACATACGGAAAATTAGCCGTGCTACATGGGCTGGCACATAA
CATAAACAGTCATGTGGGTCAGAACATCTATTTGCTGCATGCAGACATCAAATGGGATTT
CTCCAACGCGATGGATACATCAATTTTGGCACCTTCACGAGCGCTCACGTAGTGTTGGCT
CATATTCGGGCTTCTCCCGTGTCTTTCTCCTACCTGTTTTAGGAAGGTTTCCTGCAAGAG
GTCTTTGTTTTTGCTATGTTTCTTTCATGTTGTTTCTTCTTCCAAATTTTCAAATTACTT
CTGTTTTTTATATGTAGCCAATAAAGCTTTAATTTAAAATATTTATAAAATTTGTGCACG
ATTTTTAAATCCAAGAAATAGAATACAAATTCACATTTGTTTTTGAATGTGTGATTTAGA
AAAATCTTGAACATTTTACGATTTCCTGATTTTTTTTGAACTTATGAACATTTTTTTTAT
TTCGTGACTATTTTTTGAATCATTGATTCCTTTTCTGCAAATCAGTAAAATTTTATCAAT
TTTTTTGACAAAAAAATTGCTACAGTCGCTGTTATTTAGGAGAAACTCAGATTTAAAAAC
CAGTCTAGTGGCCCGCTCCATGCCACCATCTAAGGGCATGTTCGGAACAAAGGTGCACAA
AACGTAGGAATGGAGAGAGACATGGGAATAGATAAGGAATGCCATTGTAAAACATAGGAA
TGAGATAGCACAGGAAACCAAAGCGAAAACCGGACGAAGGAGCGTTCGCCTTGATTGAAA
A