| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
| No map location |  |
No map location |
Predicted Genes from contig_58427
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_70721 |
1 |
676 bp |
MLOC_70721.1 |
Available |
Available |
LOC_Os05g47700.1, FRAME:+1, EVALUE:3e-37, 13105.m05055 protein LTPL152 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed |
CDS Structure of MLOC_70721
Contig Sequence (4324 bp)
>contig_58427 4324 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTGTCCCACTCAATTTTTCATCATGGTGGAATTAACAATGGACGGGCTGATTTCTCAAC
AAAATAGGATAGGANNNNCTACATTAGTTAGTTAGCTTATTATTGTAATAAATCAAAATA
ATTATAAAAAGATTAAAACCATGTGGTATTTTTCTCTCCCGTTACAACGCACGGGCCCTT
TTGCTAGTTACTCCTAAACATAGCATACTACTGTACTGCACAGGGCAGGTATCGACGTAT
ACAGCTAGCTGAGTTGCTTTCCGTAACAGATTCCAGTAAAAAAGAGGATGATAATAGACG
ATTATAAGAACAAGCGCGTTCATGCATGACACAATAATTTGAGAATGCACGCGCTATGGA
ATCGTAATCTTATTTTTCAACTCTGAGGGATTTGAGAGGCGTGATTCAGGATCATGGTTC
AACCGAACTTATGCTTCAGGTCGTACGATTCAACATCCTTCTACATGTGGATGCACGTCA
TGCATGCCAACTTCATTTAACACTTTGTGTCATGCATTGTTTAACTTGCAAAACATCTTT
CCTCATGCATTTTTTAATCAACCATGTATAGATCCACATGAACAGTGTTGAGAGATCAAT
GGTTTCAAACATAGGTTTGGCTGAACTGTGGTCCAGAAAAACATTTTCGAGGACATTTTT
AACTGATTCCTTAAATGTTAGTGGAATAAAATTGGAGTAAAATTTTACTCCATTAACAGT
GAGCGCACCTATCCGATCCCCAATAGTTAGCCGAGCAAAATCAAATTTATGGTTGTTTTG
CATACTAGCTGCACAAACACATACACAACACATATCTTTAAATCATTCAAATTAAAACAT
GGATAGCAATAATCGTCATAACATAAAGTTTCATCACCGCGTTTTTCAAATTTAAACATG
CGAAGTTCATCCAAAAAACATCACTTGAAACACAATGTTTGATTCAAAATCACCAGAAAC
ATAGCATGTATATGTTATGGATCGAGCCAACCTTTGGCATGCACCACCACCCTCCCGGCC
ACCACCACTCAAATGAGGTCATCGGCAAAGAAATCAACGTTGGCATCCTCTCGGTGCAGC
CTGGTTCACTTGGTCGATGCAACCGGACCATCTGTTGCATTGATCATGGATGGTGCTTCA
ACGATGCCCAAGCGAACCTTGTGTACGGCTTGATTGCACGTCCAGGAAGGTGTTGTGCAT
GGTCTTAGTTTGATCCGTTCTGGTCGTTGCATCCATGGAGATGGCACACAAAGTGTCGCA
AAGCACAATGTCCTCCTTTTGATTGTAGTTTTGGGTGCGGTCCTTGAAGCCTTGATGCTT
CCTTCGGCCACATCCACCACCACCTCTTGGACCTCCTCCTCGACTTCCTCCATGTCTTGG
TGGACGAATGATCCCAAAACGATGGAGAAGATCTATACAATCTCATGCAACTACATAAAC
TATGCATACACCTCATACGACTATTATATACAACATGCCATTGGACTATCAAAATTTGAC
ATGTTTGACTATGATGGGGAAGATCATCCCCGACCGCCCTTGCCCTTCCCAGTGCCATTG
CCGTCCTTCTCGCGGCAGTACCGGTCGAAGATACAATACGGATTAAGCCACATTTGCTCC
TCTCCGGAGCTGTCCTCATCGTCGTTGTCCTTCTTCTGTTGCTTTGGTGACAGTCCGATC
ATTTTATGGATCGCACAATTTTGTTCTCGGACGAGGGCACATGTATTCCTCCGCTACCCC
TTCTTCATAATGCGGATGCAGATGGTTTCCTCTGCGTTCGCAGCGCCGCCGCAGTCGCCG
CCATGTTCGCAGCTAGTCGGGCCTTAGCGGCCCTTATCCTCTCCTTCCTACGACAGGCAC
ACCGGTCCAGGTGGGACTCCTGCTCCGCCCAACCGATGATGGGGAAGGAGAGATTTGAAG
GCAGCCGGTTGAGTCGACGCTATGAAGTCGTGGCGGACAGATCCTGTTGTCGGCCAGGCA
TTGTCCTCTAGGAAGCGACAGAGTGCAATGCTGAGGGCCATTGCCTCCTTCAACTGCACA
TGATGACAACCCAGTCGATGGATCTGGACTGGTCAGAGTCAGATCCGCTGCCTGCCATGT
CGGGGAAGACCGGAGATCACCGGAGGTGAGCTCGACTGGCGTAGGGGAGTGGAGTGAAGG
GAACTGAAGTGGTTAGGGTTTGGTCCGGCGAGCGAATGAGGAGGAATATATATGGGGTCG
GGTGGGCCACCGTGGGCCGGGTCCAACGTGGCGGACGCGCCCGGACGTCTCATATCTGCC
TTATATTTGCGATGGATAGGAGGGATGTCGGTCAACCTGAATGTTTGAGACTCGTTTGAG
ACACCCATTTGGATCATTTTTTTTATGTCTGGTCAGTGATCGGACGACCTCTTTGGACTT
TTGAGAAGTGTTTGAGAGGTCGTGGTGTAGATGCTCTAAACAAACTACGAGTGTTCTCGA
CCTTCTGATGTTTTTTAATAGTCATCAGTTAAGAGATTGATATGGTCAGAACATATCAAG
GGCAGTCTACCTACCCTGATTTTTTTCGGTTGTGACACTATTTTTTAGATAAACAAGGTT
ATGACACTTGCAGTTTTAGAGCTAGTTCGTGCAGTTTTCAGCGCGACAAAAATTGCAGAT
GCTCTCCTCCTTTAGTTCTCCATCTAGTAGCAGTCGGTGGATTATTTTAGTTGATCACCA
TGTCTTCCATGAGCGCATCGTGCTCCTGAGAAGAAGGCACATATTAAATTCAGGCAACTT
CTACGTTGCACACCAGTATGTACTGCACTAATCATGGCCATTTGGCCCATGTTTGCACTG
CCTTGATGGAAAGCCTATAAACACCACTGCTCTCATCACATTTCACAAACGCTAAAACAA
TCCAAAGTCATCCTTGCACACACGCCACTGCTGCTAGTCGATCAGTCTGTTTCTCCCGTC
CAGGTTTCAGGGGGAGGCGCCATGAAGTACTTGGGGCAGCTGGTGGTGGCGCTCCTGGCC
TTCTCGGCGGTGGTGCTGATGATGGCGCCGGCGGGCGCGGACGCGGCGACCTGCAACGCG
CTGCAGCTGACCCCGTGCGCGGGGGCAATCATCGGGAACGCGGCGCCCACGGCGTCGTGC
TGCAGCAAGATGAGGGAGCAGAGGCCGTGCATGTGCCAGTACGCGCGCGACCCCAACCTG
AAGCAGTACGTCAACTCCCCCAACGGCAAGAAGGTCCTGGCTGCCTGCAAGGTGCCCGTG
CCATCCTGTTAAATCGACGTATATGGTCAGAGATGAGAGAGCAGAGCTGCATGTGTTCAT
GTGTGAGTGTGTTTGGTTGCCGTGTGTAGCTACCCCGATGTATCTGTATCTGAAATTCTG
AATAAATACAGTAACAATGATGTGTGTTGTTTTTCCCTGTAAAAAAAAGTGTGTTGTTGG
TTTAAGGTGTCATCGTGCGTTATGTGACCGACTTCGATTGTACTCTGCTCAAAAAAAGTC
TCATCTTGCGTTATGTTCGGATGGTGCTAGTGTGAGCACCACTAGATAAGAGATGGGCGT
TGACTGGAGAAATAACTGTTCGTTCAAAAGGCCGGCCATCATATATGGCATATGTTTTTC
TCAAACAGGCATGTAAGAGGTGGGCGTTGTAATTCATGTTTTTTTCTAAAAAAAGGATAA
GCCCGGCCTCTACATCATTAAAATGCATATAACTATATTTATTAAAACATAAGTATCATC
ATTCCATACACTCAAACCAACAAAAGTAGATACAGTGACAACTGAGTGAAAAATTGAAAA
AATATGTATACAGTTTAACCTCAATTTGACCATGTATTTTAGGATTCCTATATATTTTTC
TATTCCCACGAATCAAACAAGCACTTGTTAACATTCTTGTGTTAACACAATCATATGTTT
TGCTCATTCTTGTGCTTTCATAATCATCTGTTTGCGCATGTCAGTCTGCAACGATGGACT
AATGATGGACCATCTAGAAGCAAGCGGCGTCAGAATTTAGACAATGAGGTGAATTTATCT
TCTGGTCTCAACTTTCTCTTATGTTTGCTCTGGTGCTTGGTTATGGAGATATGGACATAC
TATGTTGTGCTCCAGACATGGAGCCAGTGATGTAATGCTTGTGTTTGCTATGGGACCATC
TTATAATTCTCATGTGGATATGATAGTTGGTAATTGGTTATTTGATTACTAGTATTCCAT
ATTGAATGTGTTGAGTTTTACTTGATGCTCTTAAATGTTCTTAGTACGAAGAACACCTTA
CTGTTGTTGCAGTCCAATATCTTGCAAGCGAAAAAAAACCTCGCTCTCGCGACCGCGTCG
CCCG