Map Locations of contig_58303 (10780 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_58303

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70654 1 456 bp MLOC_70654.1 Available Available None
MLOC_70655 1 914 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_70654






CDS Structure of MLOC_70655






Contig Sequence (10780 bp)

>contig_58303 10780 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGGACTATAACCCCATCACCTTGGAAGTAAAAAAGCAAGCAAGCACATCATCTATGGGC
CTATGGGAAAGAAGTTATCAAGCAACACTGACCCCTCATCAGGCCAACAGTATGAGTTGC
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AAAACATATATTTGGAAATATGTCAATCATATATGTAAAAAGGCTACTCCAAATGTTATA
AAAACAATATTCCTGATGTACACAAAAATATACAATGTGTATGAAAAAGGATAAGAAAGC
AAAGAAAACTAAGATTAAACAAAGAAAACGGAAGATTTTTTTTTTGGAAAAACAACAGTA
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AAAACGTTAGGGAAAATCCAATTCTTCGCATTTTGTGGCAAAGGCTCCGCACATCCCCGA
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TCGAAAATTGTTCTTAAAATTCCTAAATATTCTAGCTTTTAAAAATTTATTCTAAATTCC
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TCATTTGATTTTTCGTGTCGAGATGATCAAAACTAGATTCAATGTTTATAAGTTTTGATG
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TGCCTCTCACAAAGACAAAATCGTGCCCCTCGCAAAAAAAAAGTAAATACGTTCTTTTTG
CAATTTTTTCCGTAATAAAACTAAGAAAGACACATAAAAACTGAAAGGCAAAAAAATAAA
AAAATAAATAAAAAAGCTAAATACATGTACGAAAAAAATTAAAAAAACGAAATTAAAAAA
ATGCGTTTAAAGCACGACATGCGTTGGCTGCTGAAAAAGCACCATGTAACGGATGGTGAA
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GAAAAATCAATGAATTATTTTGAAAAATTAATAAACTTTTTTAAAAATCTGTGAACTTTT
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TTAAAAATTGATGAACTTTTGTTTTCCAAATCAATGATTTTTTTTTCGAATTTTGTAATC
TTTTTTAAAATCCATAAACATATCCTAAAAATCTGTGAATTTTATTGCATAATGATTGGC
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ATTCACGTTTTCAAAAATTAATAAAAAAATTCAGCGCCTGCAGCGGAGCGTCAGGAAATG
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TTATCTAAATTTTCCGGATTTTTCATAAAAATGTTCCGAAATTGTACAAAATGTTACGTA
ATTCGAAAACATGTAGAATTTTCGAAATCATGAAAACCATTCTGAAATATACGAATAAGT
TTTGAAAACAAAATATTTTTCAGTATATGAATAAATTTCATTATCGCTAACAGTTTAAAA
TAGTAGACGAAACTGCAGAAACGCGCGCGAGACCTATAAAGCCCGCCAGGGAGACGCCTC
TGTGCAAAAGGACAGCACAACTCGTCATATAGGACCTCCCGTAGTTAGCGGCACGGCATC
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AAAGTACCAACGCCCCCCTCAAAAAAAGAGAATACTTTCCCATTTCTCCTTTTTGCCAAC
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GAAGGCGGAGAGTCGAACCTCTCCGCGCTCCTCTACGGTACGCGCACCTAAAACCCTAGC
ACTCCCGTCTTTGTTGTGGTGCTTGTTCGGTCGCCTCGCTCTCCGGGTTTGCTCGTCGCA
GTCGCGCGAGTTCGTGCTCAGGGCGTGTGGTTCCTTAGGTTTTACAGACCAGTTTGCCAT
CGAATCGAGGCGATTCGACACTACATTGGGAGCGCAGGACATCCAGCTATTTTAGATTAC
GGGGACTAGTTTGATTTGGGGGAAGGGGATCAAATCCCGTGTCTTGCATTGTTTGAATCG
ATGGGAGACATCGATCGGCATCGCGTGTTTATAATTGCAGTTTGGTGCTAATACAGAGTA
TTGTTTTTATTTAGTTTCCCCATTCCGATTCGATATATCCAGACCAGTTTGGTTTGTTTA
TTTCATCCGAGTCATTTCTTTTATTTATTAAAGCAATTCGGACCAACAGTTTCAGATTCG
CGAAATTGGAGTGAGACATCGCCGGTGAGAATCGCCACTACTTCATATGTGTAGGTCGTT
TGCTAGATTCCAGAACACATACGCACCATACACATGAGCGTACATCTGCTCGCCCATTGT
TTGCAAACCAATACTGGAATTTCTGACGGCATGCTGTATTGCGACTTGCTCCCAATTCAT
TTTTCCTTCTCTAGTTCTCTTTTTTCCTGATTCCAGTTTTGACACTTTATAATTTGTAGA
TTTCAGTTAGCAGCATCATATTTCCAAATAAGGGGAATGAACCTTCTGTACAGATCAACT
CTACTTGATGTGCGGTGTGCATATCTAACTTGTTAGGTTGATAGATTCCCGGACTAGAAG
CCTAGCCTGACCTCACTTACACTCCTTCTCAAAGGATCATCATATTTAATCTCCATAACA
TTGCCACTTTGGAGGATCTTCATTTGCCTCTATCAGTAGAAGCTTTTGCACAATTTCAAG
AGATGATTAATGAGTTGCAGGCTCTGGAGCTCTCTATTGAGCATGTTTTAAGGCAGCTTC
CTGCAGGTGCTTCCACACATTCAGTTTCTAAGGCATACAGGCTTCTTACACCTGAATATG
AGGTCCTGCCTGTTCTGAAATAGCTATGGAAAACTGTTGCCAATTGAAACATTTTTCTTC
TTCTTTTGGTTTCTCATTCAGAACAGACTCAACACTAGGGTTATGCTCCAGAGGAAGAAT
TTCTTCATTGAAGGTTACACTTGTGTAATGTGTGGCACGCAGGTGTTAAAAGCGAGAGAT
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CTGCTATCCTATCAAGGGGTACAACATGAGTTTGATCAGCTCTGTCGGAGTTTGGGATCT
GCGTCCAAGAACCCCTTCAAAAACTAGGGTTTGAACACTAGGGGGCTTTGCTTGGCAACC
TAAGACCCGACGACAACTACGGTGAGGCCACGACGAGCGCGCTCACTCATACCGGACATG
ACGGGGACGCACGAGCTACGCAGGTTCAGGCCACCATGCGGTGTAAGACCCTACTCCTGC
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ATATGAGCGGGAAAGGGTGGCCATAGGGCGGCAATTCCAAAGGGGACAAGCGCCCTGGTC
TATCCTGACTAAAGGTGGTCTCTGCCTCATGAAGCAGTCATGCTGACGTGCCGGTGGACT
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ACCTTTGGGACTTGCTTTGGGGTTGGCAGACGCCGTTGCTCCCTTATCACCAGAATGGAA
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GGCGCGGCTGGCGCCGTACGACATGCTTCGTGAGGCGGCTCGCGAGGCGATCTGGTTGGT
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GCCCGCGTCATGCACGTTCCGTCTGTTAGGAACGAAACGACGCGGGGCCTATCGAGTTGT
CGGGCCCAAAGGCGACGCGTGGCGGCTTTTCCGGGCATGGCACCTCCACTTGCCACAACG
CCTCAATAATCGCCGCATCAGCAATAAAGTCGGCCCGCGCGGGGCGCAGACACACCATTG
CTCCTTCACCCTGTCCTCGGTCTTCCTTGCGACTAACTCTCCGGCTTCCCCCTTTGTCTC
CAACTTCCAATATCCGTCACGACCGTCGCGGCCATGGCTCCCAACAGGAAGCTCTCTGCA
ACTGGAAGAGCGAAGGGAGCGGTTGAGGTGGTGGAAAGCCGTAGCCAACGTCGGCGAGGA
GCAGAGTCTGGGGCCGTGCTTTGGCCGCGGCGACGACGGTTCCCTCCGGGCTCTACGACC
ACCATAGCGGAGGTCAACCCCAGTGTCCGTGGAACGTCCTCGACTCGAGGCCGCGGGCAT
CGTGGTGCTCGCGGTTGTGGGGGGCGCGACGGAGCGTGCGCCCCCTCTCCCCTGGCTGAT
GCCCACACGATGGAGGTTGCGCACGAGTTCATCGTGTGGCTGCACCGTCGGCCTTGCAGC
TGGCTCCGGCTTTCGGATTCCTTTGCGAGGGCGATGGAGGACGGCGAGCCCTTGGGCCTG
TGGTTTTAGGCGGACGGTTGATGCAATGGCCCCTTCTGGGTGGCGGTGAAGTTTTCCCTG
GTCGGGTTCATGTCCATGGCTGGGGGTGGAAGTCGTTCGCCCGCTCCCACGACCTGCAGC
GCGGGCAGATCCTGCAGTTCAGGTACGACGAAGTCGCAACCCTCCTCGTGAAGTTCTTTG
GGGTCGTCGACGACCGCGTGGAGTGCGAGAGCGGAAGCGGCTCCGACTCCTCCAACGGGA
ACGAAAGTGATTGGAGCTCCCAGAGCGTCAAGAGCGAAGACGAGGATTCAGTCTAGGCAA
GGCCGACGCCTGGGGCGGACCCCTGAGGGTGATTCCTTCCTTTTGGCCCTGCGGAATCAA
TGTAGCTCGGCGGGGCTTGAAAATATCTTGTATGGCACTATATGTCTAACTACTTGATGC
CTCCTGTGTTTTTCGCTTTCCTCTCGAGGGCTTTCATTCTCTTTTACGTTGCCTTTGTGC
CCTACGTTGTTGGGACCCAACCCCCGAGGCGGGCTACAACTGTCGCTGGTATGCCTAGAG
TGTGCGCTCGGAAAAGCCAGAGGGTGTAGGGCTCTTAGGGCTGGTAGGAGTCCGTGAGGC
GTGATGCTCAGGGTCCCCCCCTTGACGCGCAGACTGCTCGTGCCAAGGAAACCAGGATGC
CTCGAGAGGGAGGAAAACCGAGGGGTGCTTTACACTTAGCTCCTTCGAGGTGTGCGGGTT
GGAGCGAGTCCTCTGCAGGGAGCGGCTCGTGAGGCGCGGTTCCTCGCGAAGCCTTCTATC
GAGGGATGGCGCTCGCGAGGCCTCCCGAGGGGGCTTATCCTGCACTAGGAGTGATGGGGT
CATAGTCCTATGGTAGGTCATAGGCCTGCCCTGTAGGTCC