Map Locations of contig_58220 (5345 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_58220

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70597 2 1841 bp MLOC_70597.2 Available Available LOC_Os03g48090.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m05189 protein WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_70597






Contig Sequence (5345 bp)

>contig_58220 5345 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGGAGCACCGGTGGTCCTCCCAGGCGACGCACGGTGACTCTTCCGCCTCTCCCGCCCCC
CCCCTTGCCCCCGGGGCGGCGGCCTAGGGCTGGGTTTGGAGCTCGCCGCCGCCCCGTGCC
CCTGCTGGCCGCTGTCGAGTGCTCCTCTGCTGGCCGCCGCCGCCGCCCCCTAGGCCTTCT
CCCGCGTCCTCGATCTGTCCGCTCGTGCTGCTACTCGTAGCCGGCCCCTGTTCTTCTTTC
CTGCTGTTCGGCGCCGGCAGCACACGGCGTGCGCGCTGCTGCTTGCTTGGTTACTCCTAA
CGTGCATCACTGAATTTGGTTGCTGCCACATAACTGCGCGGGGCGGTGGCGGAGAGCAGC
AAGGGGCGCTTGCAGGGAGCAGCAGGCGGCGGCGACGGAGAAAGCGGCTAGCTGACTGTA
CATTAAAAGGGAAAGCGAGTTCATCGCTAACATTGGTGAATTTCGCGTGAGTACTGCTCT
GTCCAGTCAAACAGGACACGAATGGCACAATAGTCATATGTCCTCTTTGGGCAGATATCA
TCAAAATACAATTGGAATCATCGTTTTTAAAGCAAAAAATGCAAAACATCCAATTCCCAA
GTAGGGAGTCAATTACAAAGTAACCAATGGCAAATTATCAAAGTCCAAAGTAAAGAGTGG
CAAAAGAATCGAATTCCCCAAAGAATTGATACCGCCATGCTAATGAATTTGTTTGTTCAC
GGGTTCAGTCTCTCCTGTTCTGTCAGGTAACACTCTGCTCTCCGACTGTGCTCGCGACAA
CCAAGCCCCCACGGCATCACCGGCGGCCATGAGTATCTCAGGTGAGGTCCCCGAAGAAGG
CTCTGACGGCGAGGAGGTCTTCATTGACGAGCAGGACATCATCCAGGAGATACATCTTGA
TGAGGAAGGTCAGTACTTCTCCTCACCTACCTGGCGGGCAATCTCCCCCATTTTGCTTGC
TCCATGCTTATTGGCTTATTGCTACCATTTTTCAGATCTCCCTGACCAAGACGATGCCGA
CGATGATGACGAAGAAGACCAAGAGATGGGTATGTAGCTGATAGTCTACTGTTGAACTTG
CCAGGCCTGGTTATATTCAGGGCATACTAGCCCAATTGATAGTGTTCACTCATGGGAAAT
CATGTTGATCCTCCACAAAACAATGATATTAATTTGGACTATTTCCCTGCTGCTTTTCGT
CTACAAAATTACACACTACACGAAACTTGATCCACCGTAGGATCTTCTTCAGGATTAGTA
TTATCATACTGTTTACAAGGTTAATGTTTTACGTTTGCATTTGTTCATACTGGAGAGCGA
TGATCTTACTGGAATAAGATACCGTCTTTTAGTAGTGATGAAGGGATGTCTTTTACACTG
AATCTTCTTGTAAGTGAGCTCAGTCATGGCTCTTCTTCCAGGGGTGCCTTGTATTTTCAT
TTTGATAAACCTTGGTGCTATGCTACTAGTTATTTGCTTGTTCACTTCACATGCAGTTTA
CTACGAATAATCTGAAATACTTACACTGTGAGATTAGAATGCGCTAGTAATTCAACTTTT
ATTTTATTCATTGTTGTTTCAGATGAGGTTGAAGATCACTCAACTTATGCATTTCATGGG
CATACAGGCAAGACACCATCGAGCAAAGGAACCATGCATCTGCAGGACTTAATTACATTC
ACCATGCAGAGTACCTTTGCACCGAAAAACAATTTTGGTAATAATTGGCTTTCATGTCTT
GTATACAGATGAGGTCTTTGCTGCTGCATGCAGTCCTGCAGATGCATCACTTGTTGTTTC
GGGAGGTAAAGATGACAGAGGGTTTCTTTGGAGGATTGGGGCAGCACAGGATGTTCAGGA
GCTGACTGGTATGGTTAGCTCATCTTCCGTAGTCCAATGAGATTTCTGTACTTGATTTTT
GTATATGCAAATGTTTCTCCATCTTTCTCTATGCTTCATCACCTATCACTATTTGTTCTT
AAATATGCCTGTTTCTATTTCTGATATCTATAACTACAAAAGTATATTTGATACTCCCTC
TGTCCTAAAATTCTTGTCTTAAATTTATCTAGATATTAATGTATCTAGTCACGTTTTAGT
ATTTACATACACTCATTTCTAAACAAATCTAAGACAATAATTTTGGGGCGGAGGGAGTAT
GTTTTAGGAAGATTTTTTCATCGTTTTTTGGACAAAGCTTTATCTTATTGTTTTATTTGC
ATCGATATGTCCTTAGTGTGCCGATGTATAACTGGAATTGTGTGCCAAGCTTACAATACC
GGTTGCCAATACAGGACATGGAGACACGGTGTGCACTGTGGCTTTCAGTTCAGATGGGAA
TTTGGTGGCTTGTGGTAGTATGGATGGACAGATAAATGTATGGAATACAGCTACACGGAC
GCTTCAGGGAACCCTTGAGGGTTCGTCTGGATCGGGCTTTGAGGTGAGATGATGCTGGTC
TCTTTCATCCGTTTGGCTGAAGATATTTCCATAACCGTTTCCATTGAGGTACTCAATGAT
TAGTTACACGGTGTAACTATACGTCTTTGGTTTTGTAGTGGCTGAAATGGCATCCACGGG
GTCACTTGATAATTGCAGGATCAGAAGACTGTAATATATGGATGTGGAATGCTGACCACA
ATGCCTTTCTGAATACATTTGCTGGTCACAGTAGCACGGTGACATGTGGTGATTTTACCC
CTGATGGTACTGAGCAATTTTCTCTAGTGTTATTTATATTATGCATAACGTTGTTAAGCC
GGCTCTGAATAAGGTATAATATATACCACCCCAGTCTGGACTTTATTGTGTCCTGTTCTT
TTCGGAATGGCTCAGCATGAAAACCTTCCATTGTTTGTGACCATCTGTTTTAAGTTATCA
AGTATCAACACAGAGCTCCTTCATATCAGTTCCGATTTCAGAGAAACATATGGATTGTGG
TGTATTTAACATTTCTGCCTCTAACTTGTATTCTAAGCTAATTTCAGTGGAACTAGAAGT
GTGATAAAAAAAGGGCAAATAACAGAATGATTTGTATGATACTTTAACATTTTAGTTCCT
TTTCACCCGCGTAACTTGGGAGTTCAGATCTTTGATGTACTATATCCACTTTTAGCTAAT
TCACATGTTTCATTATGAAGGTAAGCTTATATGTAGTGGATCAGATGATGCAACACTTAG
GATATGGGACCCCAGAAGCGCACAATGCAGACATGTTGTTCGGGGTAAATAATTTTCTTT
GTTGTAATTATCATATATTCATATGGTTGTTTCTGTATATTCTCTGTCAACCCTGAACTT
TAATATCTGATCCTTTTCCTCAATCTAGGCCATGGCTATCATACTCAAGGATTGACATGT
TTAGCTATTACTCCGGACTCCCAGTCAATTGTTAGTGGCTCGGAGGATAATTCTGTGCAC
ATTGTGAGCATAAACTCAGGCCAGGTGGGTGCATTTTATGGTTCAAGTGTTTCCCTCTCT
TTCCATGTTCTTTCTCTGTTCAAATAAAAAGGTTGATAAATCCCTTTAGTGCAAGTTGGC
TTACTTGATGCAATTTGTGGTTCTGACTATTGTTTTGTTTTGCATGGTACTCCCTCTGTC
CCAAAATAAGTGTCGTGGAACTAAAACCACGACACTTATTTTGGGGCGAAGGGAGTAGGT
TATATAAGAATATTTTGATTATTGATTAGTGATGATTACCTTATTTTGGTTGTAGCAATT
TCTGTAGGTTTTTTTGTTTCTAAGATATACTCCTGGGTTCTGTTTTCTTAGGAAAGTTAC
TTGTAGTCTGCTGGTACTTCTTGAACTTTTAGAAATATGTGCCGGTGGATCTTTGTGTAA
CCAGTGTAGCTTGTCCTGCAGGTTGTTGGTTCATTAGTTGGCCACACCAATTCCATCGAG
TGCATTGGCATCTCATCGAGGTACTGTTTGGTGATCCGTTCTTGGATCGTTGGAGTCAAT
ATGGTAAATCAGTTGCACAATGCACATTGCCTTGCTAAACTAGCTGGTGCCCCTATTATA
TGCAGGTACAACTGGGTGGCTACAGGGAGCATTGATAGAACTCTCATTATCTGGGACCTT
GCTCGCCAAGCAATTCGGTCTACTTGCGAGCATGATGTGAGCGTAGAAATCAATCTACAT
CTTTTGCTTGTATAGTATTTCTGTGTCGCTGTGAACTTACCGTCGTTGGTGGTGTTTGAC
AAGCAGGAAGGTGTGACATGCCTGGCGTGGCTGGGCTCGTCGAGGTATGTGGCGTCAGGA
TGCATCGACGGCATGGTGCGCATCTGGGACAGCCTCTCCGGTGACTTGGCCCGCACCTTC
AGCGGGCACAGGGACGTCGTGCAGTCGCTGGCCGTCTCTGCTGACGGCAACTCCATAGTC
TCGGTCTCCACGGATAAATCTGCCCGTGTCTTCGACATCTCTATGTTCAAGTGAGAAAAA
TCATAGCAGCAACAACATGGTTGATTTGGTTGGTCATTCTGGCCAGTCAAAAGTGGGGGT
TTGCTCAGCTTGTATGGTCAGGAATTATACTTACAGGCTTGCAGCCATCATGGGGCACTG
AAAACTTTGGTTGGTACTGTACTTGTCCTTGACATGTGGTCAATGGTGCAAGTGGTACAA
GAGTCACAAGACCCTCCTAAGTTGAGGGTAGTCGGTCGTGTACAAGCACTTTATTTGCCT
AACGTTGGGATTTTGCTTGACATTCTGCTGCATTTCCTCCTTACTGCTGCTACCGATGGA
AGGAAGCAACGTGTGCTTGTTCCTACTGCTGAAGAGGCAATGGGCTTGCGCGCATGCTTT
GTGATGCATAAGTTGTTAATTCTCCATAGTGGCAGCATCACCAGACCGGAACTCAACGCC
AAAATTTTCCTGAAAATAACCGCAACAGTTTATAGATGCGTCTTCAGATGTTTGCAGAAA
TTTTCCTGAAGCTCGTTTCAGTCGAAACCATAAACAAAAGATTATTGATTGATTCCCGAA
GCTTGGTGCCAAGGAAGCATAAGTTCCCCAACAACACACCCCTCTCAGAAAAATTATGGG
AGCATCTACCCAACAAAAATCGCGTATTGGGAAAGTTGGCAAAAAAATAAGGAGCTCTAG
CAGCTTCTCTATTTTCATTTTTTTTATGATAAAAGAGGCATCTCCCCTGTATAGAAGGCA
TTTTTTCTTAGGCTGGCCATAGTGAGGGTATCATAGCTAGTAACATAGTCTTGCGACTAG
CAAAGATAGTGATGTGGCAAGTAATTAAAGAAGAGAGAGAGGATTAGAGTAACATAGGTA
GATACTGTAACATGTTAAATGCTATGCTANNNNNNGTCATGCATGTCAATAAATGAGATC
GTCTA