Map Locations of contig_58119 (10355 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_58119

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70529 1 1158 bp MLOC_70529.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70529






Contig Sequence (10355 bp)

>contig_58119 10355 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GACAAGTTCTTTCAGCAAAGGATCCAGACAAATAAAACAACAATGAAGGAGCAAGGCCGG
CAATACATGTTTGTTAATTGTTGCATGAACAATATAGTAAACACAACCAAGACATCCAGG
TTCGGTATCGATCACCGGGAATATACACCTAAGGGGTCTACTTAATCTATATGGACCTCT
TATCAAGGTAACCCGTCAACCAACACTATATGCTCAGAATTGTCAGTATCGAATATCCAA
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TCACACAGTCTGTGATACACATGGATATACTGACAGAATGAGAAATCTGAATGTTGAGCA
ACATCCTTGGAGCATGTGCTCTCGTGTATGGGAATCAGTTAAAGGATACCCTGCCGAGAA
CAAGATGCTCCTGTCAGAACCACCATCCGTCAAGATGCTACTATTATAATGTAGTACTTC
TTTATACTCGCCATGACAGTCGATAGTCAAGTCTTTGGTACATATTTGACACCTAAGACA
GTGGAACTAGCAAAGATGCTACAGGAATCCCGCCGAGAAGTCAGATTCCGCCAGGAAAAC
GGTTGTTATTCACAACACTGTTCTAAACCCGGAGGACATACACCTAGTTGACCAACCCAA
TGCAGGGAGTAAAATGTTTCGTGTCCATCGAGGAAATTTGTTCACAATCCCATGGAATGT
TTCAGTATGGTATATAAGAACGACACGTCCATCGAAAATCACTCTCGGACTTGTGAGAAG
GGCATGTAGGTTTGTCATGATAATCGATCACACTCCAGCTAAGCCGACAGATATGAAATA
AATGGGAGCCCGCATAAGCATGAACACGTGAGGTAATACTTGTGTGAATAAGGATACAAT
GAAGCAAACCACCCCAGAGCCAAGCAGTCAAGCCATATGAAATTCAAGGGGGAACATCAT
ATAAACATAAAAGGATACCCGAGTTGGAAATAGTTTCCTTAAGGCCCTGTTCGGAGGTAC
TCCGCTCCAAAGCGCCACTACCGGAGCTGATGGAGTTATAGTTAAAATTTGCGGAGCCCC
GGTTTGCTGGCTCACAGCTCCCCGGAGCTGGTGGGATTCTGAACAACCCCTAAGTCAACA
TATTCATGCTTGTTCCCTGAGCAATCAAATCTTGAGGACGAGATTTCTTTAAGGGGGAAG
ATTTGTAACACCCTGTATTTTGGTCCTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTCTTTGGATTT
TTTCTTTGAAGTCTTTTTCTGTGGCTATGTGGTATTGAAACTTGGGAAGATCATCTCTTC
ACAAGTGTCAAAGTGGCTTGTCATTCTCAAATCCATCCCAAGATCATGTCATTTCCATCT
TTGCGCTAACCAAATTCTTTTTGGTGGGAATATTCCTTTTTCTATTAAAGGAATAATTCT
TTTTTGCTCTAGGTTGTGAATCAACCTATATTTCTACCACTCCCAAAATTCCCAAATAAT
TATCATAAATACTTTGGGACATATCTTCCTCAAATATGTCCAAACCCTTCCTAGAAATTT
TCATAACTTATTCACAAATATTTATTTTTGTATTCTCCCTAAATGGCACTTTGAGAAGCA
AGTGTAACTTATCTTTTCTTGATTGCCCTCAAGCTTTTTGAGAACTCTTTCCTATCCATA
TCATTATCTCATGCCAAAATTAAACTTGATTTGCCTAGTAATTTTTCCTCAGCTATTTTC
CGAAGTTTGTGTTCAGAAAGGAACTTTGTGAAGGAGGTACTAGCTAGGCATATACAAATG
AGTTAATTTTTTGTCACATCCTCCATATCATCAAATCATAGCTCTCCTCCGAATTTGAGC
TCATGTCATCTATGTATGTGAGCTCACCATCAAATCTTTGATTCTGGTCACATTTTTAGT
TTCTGAAGCAACTGTATTTTATATTGCTTCATTATTGCTGAACATTTAACAGGACATGCT
CCTACCCATATAACCTATATCCACAAACTTTGAGACCATTTTACCTATCCATTTTCCCTC
TCCTATTTTTCTAAGTTTTTGTCCATAATGAAGCATTGTGAACTAAGTACTATTTTTCTA
TGTCCAAATGGTATGCAACTTTTAGAGTACGTTCATAGGCCCAAATAACTATCCTTCATC
AAAATTCAACGCAGTCCAACGATCTAAGTGAGGGCTACTTGAACATATTAAGTTCTGTCC
AGTTTGACACTTTGTGCAACAAGTGCTAGTTCACTTCATCCGTTTGATCACTCTAAGCCA
AAGATCAGAGTCTCTCTCCACATTTGTATTGTTCACTCCACAACACACACTTTGTTGTTC
TGTTGTCTTAGAGCAAGCTATGGTCATATCTATGGTTACTATTCTTATTCATTTGCACTT
TCACACTCAGTTGTGAATGAACAATCGCCTTTGGCTGCTCAGAGCACGAGTTACTGTCAC
GTTCACGCGGTGACTATATCTTTGGCATGTCCGTCCACGCGCTCTCGCAATTGTGACCAC
TGTTCTCGTATGTTCCCAATGTTCTCGTACGTTCCCTCAAGCTATCGGTATCTCGCCATG
TCTAGTAGCTCCACTGTACCATGGCCATCACCCTGAATCTCTCTCCCCCTCTCAGGTCAT
CTCGTACGCAGGGCGGAGGCCGTGTAGAGGGGCAGACGCGGGCTGCTCCGCAGTCGGCCG
ATCGCCCGCATCGCCCGCATCGCCCCGAGCCTTTTCAAGCATGCTTGGGTCTTCTCTCCT
CCTCGTGTAGCCTCTGGAAACACCGCCCCTCCCCTTCGCATCGTTGATTCATGCCAGAGC
GCCGGCACACGCGTCATCGTGGTCGTTCTCGCCCCATCTTGAGGTCCGGCTATATATAGC
CCTCCCCGAGGCTTCTCAACCTCACCAAGCTCTCCTACATGCTCCTAGACGCCTCCCCGG
CCTCTCAATTCGCTCCCGGAGCTCCTCCAGACCTCTCACTCCCGCCATGAGCTCCGCCTC
GGTCCACGTAAATTCAAGCTCATCGGAGCCCCATTCACCCTCGGAACCTCACCACAGCGA
TCCCCTGGCCTCCTCAAAAATCCACACCACCCTAGCTCCTTCCCGGTGGCCGAGCCGAGT
GTTCCCCATGATGGCCGACGCCATCAGCCGCCATGGTCAACGACCCACTCAGCCCCGAGT
TATCCTATGAGCGTGGACCAAGCTGTCGGAAGCCCCCCGGTCCGGCCAGTAGCTCGAGCG
TCGCCGGAGGTGGCCGCTGGAGCCGGGACGGGCGCCGACATGCACTCGGACCCTCCTCTA
TTCCCGTGGTCGCGAGGTGGAAGAAGGTGGGCGACAGAACATAGAGAATCAACACGGGGC
CCGCCTATAAGTGAAACCGATGGTCGGCCCCGCAACTTTAGTTGAAACGTATTATCTAGA
ATATGCTTTCCAAGTTAGAAAGCGTACTCTGGTTCTTCTATAGCTGGAATACATGTTCTT
TTGCACAAGGCGTATTTTCACGGAAGACGTTTACTATCTACTTAGTCAGGGGCTGGTTTG
TACATATTTGTTTTACAAATAAGTCCCTAACTTTCAACTATCCATAACCGACCGTAACTC
CGAATCAGGTGATTCCAAAGCCCACATGATCTGTTTGTCGAGCCCATTCTGTTGTACCAT
TTTCATGATGTGATACACTGTGAAAATGACCATTTTGCCTTTGCCCCTAATGAGCCCCCT
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TTTTATAATTGACTATTTATATACTTTGGGCATGTTAATATTTTTGGAATGCTATATACA
TTCTTGCGAATCCCTGCTTATCTTTACGCCATGATCAATTGCAACTAGTTGGTTGAGTAA
TTACTTTTATGGTAATTATTTTCTGGTGCTAGTGATCATGCTAGGTCCATCTTAAATTTT
ATTATATACATTACACTTGTAATATTCATGACCATAAGTATGCCATACTCATTTGCATCT
AGAGAATGATTTATTGTCGTTGATATGTTAAATAGTTATGTTGCTCATCCCTGTTCATGT
TGATATCCTGGTCTTATGCATTATCATTTCATCATACTTTTTATTATTACGACTCCACTC
ATCATCATGCAAGTTAAACTAGACTTCTATCGAACTTGAACACGTGTTGGCTGAGTCATA
GTGCCATCGAGTCGAGCTAACCAGTGCAGCCACACTTGCATATATGGGAAGGCCTTAATG
CATTCTATTGTCATGTCTCTTGTCGGTGCCCCAAGTAGGGAAGGTTATGCGTGCACGCTA
TCCTAGCCGGGTAGGCGGCGATAACCTTGTCTACTCGTAGTTGTTGTAGGTGCCTTTGTC
CACGTTTGGGGTCGTTTTTGTTTTGCCATGGTGGTGGCCATTTGATGTCGAGAGTGACAT
CCGGCACCACCCATGACTTACCCCAAAGGGGAGTTGGTCGGAGGGGCGGGAGAGTGTCAT
GCAATAGATTGGTTTTGTATGAACGCCGTAGGTCCACCTGCCTGGTGTGGGTACATTGTA
CTAACCTTCGCAGAGTGTGTATATTCTATAAATAGCCGTGCCCACGGATATGAGCCCAGT
TCATAGGAGGTCACACTATGGGTCAACAGTAATAATAACCTGGCTAATAAATAACCTTGG
TTCAATGAGAAAGAAGTTGCTTGATCTTTATGTGGTCACGGGAGGATCACGGCGGTATTC
TTGATAATGATAAGGTGATCTTTGAGAATCACCACGTTATTCTTGATAGTGGTAGCGTGT
TCCCATGATGACCATGACGGTAAGAAAGATTGGTATATCTATGGTGGTTACAGGGTAACC
TCCGAACAGAGTAAGTTGGTCCATGATATGTTAAACATGTTGAATGCTAGTGTCATATTT
GTTCATGCCTTGAGTAACATGTTCATGCCATGCTCATCTGATGTTATTCTAGCGGTATTT
TGTCATATTGCTCTCGATGTATCATGTTCATCATTAAACTTTAACATGTAAATGCCATGT
TGTTGCTTGTCTTTGTTGCTTTGGTCATTGTGTTCTTGCGAGTAGATTCAAAGTACTAAC
CTGACATGTCATGCCAGTTTGCTAGTCATGCCATGATTGATTGCTTAGGATCCCAAGTTT
GCGAGCTAGGATAAGCGGTCCAGCCAGAGTCCCTGTGGATTGGTGTTCATCACTGTCGTC
GTTGTTCCGCTTCTAGTAGTTATTCCGCTGCTTCAAGTTGTTTTGCGGCTAGCATAGAAT
TACCTAAGCACGCGTAGTGTCGTGTGCCCATGGAATCCACCGTTATATCGGAACCCTTGT
ATCCCCGAATATTTGTAATAAAGAGTAGATTTGTTCTATGCCAGGTAGTGTCGTATTCCG
GAAGACTTGATCTCTAGTCTGGAATACGGGGTGTTCCAGTCTCTCTGAGTCGAGGTTCCA
TAGAGATGGCGATATTGATGAAGATGATCACCGCGGCAATGGTTCCTCTAGTGGCACTTC
AGCGCAACCGAAAGAGAGGGGGAGAGAGTACCCCCCTTAAGCTTCCTCCTCCATGGCCTC
TCCCCATCAAGAGAGAGGTTCTTCCTCTCGTCCTTGGCCGTCATGGCTCCCGGAGCAGCG
AGAGCCCCTCTGAGATTGGATCACTCTCTTTGTTTCTCTCCTGTTTTCGCTGTTGTTTTC
TCTCAAGATTGGTTTTTCATCGATACAAAGAGTTGCGGTGGCAGATCATAAGATCTATTT
TTATTTCTAGCATTTCTAGTATGTATAGGATTTTTCAGCATTGGAATCATGCCGAATGAA
GCCATGTGGGCCACACAGCCATCACGACATGGCCTAGGGGGCACCTTGTTGGCCCGTGGT
CCATAGTTGGCTCCCCTCCAATGATTCATTGCTCCAATATTGTTTATTTCCTCCAGAAAA
AATATATAGAAGTTTCGGGCGATTTCAAGAACTTTCATTTTCTGCACAAAAACAATACCA
TGGTAATTCTGCTGAAAACAACGTCAGTCTGGGTTAGTTCTAAACAAATCATATAAAGTG
CATGCGTCCGTCCGGGTTAGTTCTGAAGAAATCATATAAAGTTTATCACAACCATATAAA
AGTGTTGTAAACATAGGCAANNNNNNCATGAATACTTCATAAATTATTGATGTGTTGGAG
ATGTATAAGCTGTCTCCAGCAATGCCACTACCCTTCGTAGCTGATGTACACCCTGCATGA
GTTGAATAATGGTGAGCTCGAAACTGAGTTCTATGTAAAACTGGTCATACTACACAAAAC
ACGGCCCTAGACTTGGTTCTTTGTTAGACCACCTATGCCAACAAGGGACATGTCTATCCA
GCAGGTAGCCTACGAAGCCCTTCTCTATCTTCGAGAACTTCTTTCGAAAATGAAAGAAGG
ACAAGCTACCGCCACCTACCCAGCAAGAGGGGACTTGGAGCCCCTTCTCAACTTTGGATT
TCCCAAAAGACGAAGACCCAACCCTCAAGCTCCAAGTCTGCTTCACAAAAGCGACACATC
ACCTTCTTCGTTACCTTATTGAAGAATACCTCAATTCCTGCCCTGGATTTCCCCTCACCC
CTACACGTCCACTGTCTCGAGAAGAGCACAGTGGTCGATCAAGAACAACATATCGCTACC
CTGCAAGTCTACATCACCAACGAAAAGCAGAAAATTGAGGAACGTGAGGATGCCCGCAAC
CGAGCCCTCTAGAGAAGGCATAGGAACAGATTTCCATATCGACGTCATGGAGGGCCATCT
CAAACCACCGATGTGAAAATCCAAGGCCAAACAACAACCTTTGCATTCTCGTCACATTTT
TCACATGTGGCGAATATGGGCTCCATATCAGGACGTGCCCCAACAAACACCCGACAATGG
CATACCCACTTGTGCCCTAGGAGGACCTAGAAGCTGAGTATTGAGCATCCTCTTCTCGAA
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TCCCCTATGCGAAGCCGAGTCCATGTAATGGTTCAAATGAAACCATGTTGTGTGTTGTTT
GTTTTTGGTTTGTTTGTTTAGGCATAAGTCGCACTTTTGCCCTAGGCTACATGTACGCGA
CTATGCCGATTATCTAATCTTGATGAATGTGTTGGTCCTTTTAGCACTTATTTGATTGCA
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GACTCTTGCGACACCCAATCGTAGCCTAGTTCAACTCACCCAATCGACACCGAGGACCAA
CCTAGACCTCACAAGCTTCCCCAACTCAAACCTCTGATCACGTGCTTAATACACAGATTT
TCCAGAGCACCTGTTAAGCTTCAGCAACCCCTACTCAGCACATGTCTCATAATGGGACTA
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GGAAATTGGTGGAGGATATACGATTAGGTGACAAATGATTTGATATGACTATAATAGGTG
CCTTGAGGATATGGATAAGACTCTTTTGTGGATCACGACATTTTCGTAGTGATGGGTGAA
CTTGGTGGATCAAAGTTGGTAGACTAGCATGACTTACTTCTCCTGTGAGTAAATTGGATT
TAGTTGGACAACTGAGGATCACACGTTGAAAGGTCTTGGTGGTATGATAACTTGACTCTA
GAAAGTAGTGGTCATCAATTGATGATGCTACATCACTGGCTTGAAGGAACCGGTAGGAAT
TCTCGTCGTACGTAAGATTACGGTTTAATTAGGTAATCCTAATAAAGTGTCGATGATTAA
TGTGACCACATGGTTCGGAGTAATTTGGATTTAGTCCAATGATCTTGATCGTGGTACCAT
GTTTCTTGGTGGATGATAAGTAAAATTAATTGGATGATGTAAGGGATGATTTAAGAATCA
ATACAAGCTTGACCTTGGAGTTTAGTTGCTCATGATAAGGGAAGTTAGTGGATATATGGT
GATAATAGTCCCTGCAATGTTTCGTGGATTATAGGAACTCTAGGAAACTATGCAGAACTC
CATCGATATTGGATTTGTGGGAGTGGTGGATCATGTAGTGATTGATGGCATTTAATGACC
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GTATAGGAATACATCACCTTAGACCTTGGATAACTTAGCTGAGCCCTTGGATTTATAGTG
CCTTATTCAAGCTTAGCGGCTTGTATGCTTTCCCGAGGATTTTTACATAGGTATACATGC
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TTGACTTATATGAGATGATACTTATAATGGTATTGTATGATTCTATTTGGATAAATAGGT
AGGACTATTGGCATCTAAGAACCGTGCTCAAGTACAAGATGATAGACGTTCACTCACATC
CTAAGCTCTTTGAAACACCAAAGTTTTAATGAGCCATAACATGGTTGGGTTATGACTACA
AAACTTGGTTCTAAGACATTAGACAATGGCCAATACTGTGCGTCGATCGCCACAAATCAT
GCCTATAAGAAAGGTGGACATGAAAACTAGATTATGTTGAACCACAAACCCGTGTACAAG
TGACCATCCGGAACAAATCCCCTCTCCTCTCACAAATCCCACGAGCAATGTGCTTATGTG
ATGCTTGGAGAAATATTTCGTTTTCCTCATGGATGACACACTTATTTACCCAATAAGAGA
AGGAACCCCTTAGTCATGTTTGCATAAGTCCCAGAAACACAAATTGGCATTCTTCTCAAG
TATAAGGTTTTACCTTGAAGAAGTGAAATCCTTGAAGCACCCTCCAAGCAGTAGGAGACA
GTCTTACCCAAGCAAAATGAAGAACCACTATGGCTGGGAAACCACAACGATGAAGAAGAA
ACAATAGAACTAAACCACCACTCCTCTGCCGGCTACATTAGCTAGACTATCTCAAGAAGC
ACCAATGTTCAAACACAAAGAAGCCTTTGGACATCAAGGGAAACTAAAGAGCCCTTTTTG
ATCCACCCAAGAACGTGAATCCTGACCGGTTCATGGTGAAACCCCTGTCAAAGTTAGTTC
ACCCACTTGCCAAGCCTCAGACCTTGGGGATTGGGAGGCTAGTCTATACTTTTGGGTAGC
CAACTCATCTAGGACCACTCAAATACTCTCCTAGGTGGTAGGACCCGTTTTAACACAAAG
TCTCAAAAACTTAGTCTTATGCATGAGACCCAACCCAGACTTTTTCACAAGTAGCTACGA
AGAGCCTAGAAGACCAAGCATCCATAGACACGCCGGAATGTGCGTACGGGATGACGAAGA
CAAATGGCTGAAGAAAAATGAGGAACATACGTGGACAACTACTCAAGCTGAAGATCTCGA
TGAGAAGCCTACGTTGATACGCTTAAATACTGTCAATAAAGAAGACCACGTGCGATAGTA
GACCACCTACCTTAATAAAATCAAGGATTTTCCGCATCGAAATGAAGTTGTACCAAAACC
TTGACTTTTTTATTTTAACATAAGGAATCTAGATGTTACTAACCACCGTGAATTACCCCA
AGACCAGCATGCTGACACACTACTTGCCAGGTATTCCGACCTTGGACTGCTGTTGGGGAA
ACCGACACCTATGGGAAGCTCGAAGAGTCCCTTGATCGTTCGGCGTGGGAAGAGAGAGGT
GGCGTCGAGAGCGGAGCTAGCGATCCCATACGGCAAGGTCCTTTATCCATGTTCGGGCTG
CTTGGCGCATAAAACCCTACTCCTACTTAGTTAGTATAGGGTGTTCACTGTACGGTGATT
TGCGATAGTAACTTCGCTGGTGATTAGGGAGTCTCAAATCCCAAAAAGTACAACCCCCGA
GAATGAGCTTTGGGACTCCCTTTATAGGTAAACGGGTCACCAACAGTGTGCTCACGGGTT
GCATAGTGAACAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGCAGTAAATGCCT
TGTCTGGCCACTGACCTGCAGCGAGGTGGTCGCCATATGTACCTAGGTGAATCGACGCCT
GGGTCTTGTGCTGGCGCATGAAGGATGCGCTGGAGCAGTCGGATTGTGGTAGAAAAAGAG
GAGGACACCTGGCGAGCTGAAGGGGCTTGCTGGCC