Map Locations of contig_5803 (7264 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_5803

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70470 4 3165 bp AK366396 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70470






Contig Sequence (7264 bp)

>contig_5803 7264 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCATGTGACATGGGTGCTGTGGAGGTGGAAGGATACGTGGA
AACGATCAAAGTCCCAAAGAATTGCCCCGAACTTCTGGAGCCAGCTGACACCAAGAATGG
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GTTCGACCAACTCGGCTAGAGTGAGACGGAGAAGTGCTGGTGGGGCCTGGGTAGCTGATG
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ACGCCTTGGCGATACCGGAGTGGAGGTTAGTAGGCCGCTGAAGCTCGCCATCTTTGCAAA
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AATGAGCTTGAAAGAATCATATATCCTTGTCATCATAGCTCATAAGGCCATTCAGTAGGT
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AACATATCATGTATATTCTCTTGAGATTATATTCTTTGGCTAGGAATACACAAACCTCCT
TACCTCTAGCATAAGAATAAAGCTAAAGAAAAATAAATGTTGTTTTGTTATCTTGCTAGA
GATCATTCCATAGAAGAGTAGACGTCCCTTTGAAAACTTTGCATTTAGTCATATCTTTAA
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GGCCATTGCCATTGCCATAGTATGCTCTCCATGTTAGATCAACCCAGGGAATGCCAAGCT
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GATGCAAAATTTGGTGAAGTTTGGACATTCGAGGTGAGCGTGACAAAAAAGACAATTTTT
GGCTCTGTGACTAACTTTACTTTTCACGCACTGTTCTGAACGGTTTTTCTTTTTCTTTTT
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TAACGTGGTCATGAGCCATCTTCCTTATCCTTGATGGGTTGATGACGAGGCCCCTTGGCC
CATGGTATTTTGGGCCGTATCTTGGATGAGTTTGATTACTTCTGTTAGTTGTCTGGAAAT
GGAGGAGTAAGAATCCTCATCCTTTTTCACAGAGGTGACCCTGAGTTGTCGAACTCGTGG
GAAAGTGGTGCCCTTTGAGCTAGGGTCTCAAACAAACTCTTGTCAAAGAATTAACTCTAG
CTTTTTAACCGGATCAGAATCAAGTTGCAAACTCTTAGAATAAAAATAGGGGCCATTTGC
ATTTCCGTCCCGAACTCGAACCACTTAATCAGATTAGCCTTTAAATTTCAGCTATGCTCA
AATTTGTCCCTTAGCCATCAAGTCCCCTTATAGACATGCTCTTCTGTGTAGTTACCGCAA
AGTCAACAGGCTTTGACCGTCTCGGTGAACAGTAAATTAAAAATAGCAAAATAGTTCATT
TTTTTGAAATTTTGAGGGATCGAAGATACTCGGGTGTGCAAGGGAGCGCAAATTTTTCGT
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CTATGAATAGTAAATTTGAAAAGTAGTGCATTTTTTCAAAGTTTTTTGTCGAGCCAATTT
TGTTTTTTTCTCCACGAGCTCCTACAAGGTCCAAACGCAAAAAAAATGCACGCACCTTGC
GCACCCAAGCATATTGGACGCCAAAAAAATTCAGATTTTTTTTGATTTTTTTGCTATTTT
TTTGAATTTACTCTTCACATGCGCACAATTTTAATTTTTTTCCTTTGGTACAAGCTCCTG
GAATGTTTAAATAGCATGAAAATTTGCGCGTACCTTGCTGACCCGAGTATCTCCGACCCC
ACAAAATTATGTTTTTTTAATTTGCATGCTTTTTTTTCGAATGTACTGTTCACTAGATGG
TCAAAGCCCGTTGACCAGACACAAACAACATGAAAGGGTAATTCTATAACTGCACTTCAC
GCTAAAGGGGCAAATTTGAGCAGACTTTGAAATTAGCGACAAATCTGAGTAGTGGGTTCG
ATTTAGGGAAACAAATGTAAATGATCCTAAAAATAGGTACGGGTAGGAGGTCTTAATGCT
TAAAAACATATATTTGTGAAAGGATCAGATATAATCTTAATTTATGTGCTGGAAGTCATC
AACCGAGATGTACTTTTTACGAACCGAAGTGGGGGATGTGTCCAAATTACATCTTGACTT
GCATGCGTCCTACATCAAGAGTTAGTTGTCCAACCGTAGACCCTATCTTGGATAATTAAG
ATTGTAATAATCACACAAAAGCATTTGTTTTTTAGTGACCACTTCTTGAATCTCCAGGGA
TAGGATCCATGTTACCGTACTAAAACTTTCTATCATTGGTGTTCAAAATAACACTTCACG
GTCTCCTTGCCTTTAGCCTCTCCGTGTCTCGTTCCTCATGATCCTATGTACCTGTAGGGA
CGAAGAACGCAAACGAGACAAGAGACAACTACATATTTCACTTATACGAGACGTTAATTC
AAAGCTCTTCCATTGATCTTGCCAACAAATACATCGGGTTGCAAGGCTCTTGCCTTAAAC
CATTCCTTACCGGACTACTCACACATGAAGATTAGATCACACGAAGAACTCACTAAAGAA
CACATCATAAATATTGTTCTATTGATAATATGTCTTACAATGGAGGCCTTGTGTGATACA
CGATTACAAGTACGGTTAGCCTGCTGAGAGCTATGGTGATGGTGGCTATGGAGATGGAGA
TTGGAAATGGTAGCGGCTAGGGTTGGTGGAGATGGCTTCTGTTGATGATGACGAAGATGC
GACATTTCTGTCTCTCTCTTAGCTCATTTGGCATTGCACCCTAAAGATCGTTTAGGTGGA
AGAGGAGCATCAATTTCCATGCCATACGGTCGCGCCTACGGACATTGAAAGGACGTGGAT
GTCG