Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_57986 (5094 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_57986

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70445 1 1106 bp AK358757 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70445






Contig Sequence (5094 bp)

>contig_57986 5094 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATATATATAATGTGAATAAAAAAGAAAGAAAAAACGGAAAAAACATAACTCAGTTGGT
TACTCGGACAAGTATGGCCACTTAGGTGTGCAAGTTCGAACCTTAGCAGTAGCAATATTT
CGTTCTCTTGATTCGGCATTTTACCAGTTCAACCCATTTGATTTAATACCTAGTTTTTTG
AAAAACTAGTTGGATTTTCATGGTTTGATTACAAAACAGTCCGTCGAGCTGAAGGCGCCG
ACTAGGGGTTTCCCGAGCTACAGCATATCTTGAGCATGTGGGTTTATACCAACGAGGTAG
GACCAACTATGTATATGGCCCATGCCGATCAAGGATGTGGTCCAAGAAGGAAAGGGACCG
AGGGCATCTCATGGAGTCCATCACCTTTACAGGTTCTCTTCGGTCGGCATTTTACCGATT
CAACCTGTTTGGTTTAGTACCTGGTTTCTTGAAAAAACAGATGCATTTTCATTGTTCGAT
TGCAGAACGGTCCATCGATCTTAGGAAAGTACCTAGTATCATGCTGGGTTGATTGTGGAA
CGGTCTGTCGAGCTTAGGAAGCTGTTGAGTCCATCGGTGTTGGTTACTCGTGGGCTCGTC
CAAAATTTTAAACAATGATTGCAGGTCTCCTATTTACTAAGCTCAGAATTTTATTGTGGA
CTTAAGTCCATTTTGCATCACTATTTTTTTAAATATAAACAGCCCGATTAAAACCATGTT
TTTACACATAATATCATTGTTCTTCTTCCTTTCTTCCTTCTATTTTGCAAGATTGCAACA
AGATGGGGAAAGTGTCCAAAAACTATCAAAGGATTAAAATGAGCCAAAATGAAGGAAACA
ATTTTGCACCTAGGGAAAATCCAAAAAAATATATGACGCTCATATACATAAAGAAATAGA
CTCGGGGGTTGGCCCCAGGCAAAAGAATGACTTGTGGGGCCACTTGGCCTGGAACTAGGC
CACACCAACTCGCCACATGGGGCTCGCAGAGGTCCCTTGACCTCAACTCCGACGATCACC
AGTCGTTGTGCGGCAAGGTGAACAGATCTTCTGTGTATGAGGTTCAAATCCTAGCAATAG
CAATATTGTCCTCTTCGCTCGGCACTTAACTACTTCAACCCATTAGGTTTAGTACCTCAT
TTCATGAAAAACCACCTGAGTTTTTCTAATTCGATTGTGGAACGGTCCGTCGAACTTAAG
AAACTGCCGAGTCGGTCTAGGTTTTTCCCAGTTGTTCCGGTGGTTAGATACGTCTTCAAT
GTATCTATAATTTTTTATTGTTTCATGCAATTATATTATTATTCTAGAATGTTTTTTTGG
GCATTTACATGTTGATTTATATAATTTTTGAGCATTAATCTATTAACCCAATGGCAAGTG
TTAGTTGATGTTTTCTGCATGTTTTTGACTTTTCAGGTTTATAGTATCAAATGAAGTCCA
AATACACAAAAGAGTTAATGGTTTTTTATGGACCAAGAGAAGACCTAAAAGCTTTGGGTG
TTTTTAAAAGAGAACTCAGGAACTTGCAGTATATATTTACCGACCAGCGCAACATTGAAT
CATGAAACAACATCTCGTTGAGTGACTGCCACGATCGCTTAAATCGGAAAGGTACTGCGT
TCGATCCTTGATCGCACCCCCTCTTTTGGCTGTTTTCCACTTTTTTGCATTGGTTATCTG
TATGTATACCTATTATTAAAGGATGGAGTGCTTCTGCCTGTACATCGTTGGTCATTTTAC
AGAAAATCCCCCTATATTTTTTTCAAATCAACCCGTAGTCCGGACATTAGTGACATGAAG
GAACCGTTTTTTTATATTTTCGCAAAAAGCCCCTTCTATTTACGTTGAACCAACCTGCAG
GCCATCTTTAAATGAGATCAATTTTTTTCTTTTTGCATTTTACACAAAAAATCCTAACTT
TTACGATAAATAATCCGCAGTCCATCTTTTTAGTCAAAAGGATTCTCATTTTTTATACTT
TCACATAAACTCCCCTGGCATATGTGTTAATCCCGAAGTCTATTCATAATACATATGTAT
TTTGAAATAACAATATCTTTTAAACCGTGAATCTAATTTCAACATGTTATATATGAAATT
TGATTAAAAAATGTGTAAAGTTTGAATATGTTGTTATTTTACATGTTAAATATTTTTTAA
ATACTATATAAGGTACAATGTTAATCAATGTTTATCTTTATTTTGCATCAACGATGTGTA
TTATAACATGTAAACTTCAACGTCAATGTTTGGGAAATGTTATATTTCTTGGACATGATG
TACTTGTACTGGGTTTTCTCTTTGCACATATTTTATGACATAAGACCTTACGTACGTGTC
TTTTCTTGGTAGAGTCCACGCGCGTTCTTACCAACAAACTATACTTTTTTTATAACGAAT
ACACAAACAATTTTTATAGGATGTACATGCACTTATAAAATTGATGAACATCAGAAATAC
ATGAAAGTTTATTTTAAAAATATCATAAGTACTATTCATCTGATAGTAATGAATGTTAAT
AGTTGATTTTTTTATGTTTCATCTATTGCATGTGATGGCTATACATATATACTTTTTTTA
ATATACTTAATTTATAAACACGGCCTCCTCAGTGCCGAACGACACCATAACGATGATGCC
TGAGTGTGGTCGTGGGTGCACACCATCAATATGACGAGTCAGAATCAAAATTCAGTTAAA
ATGATAGTGTTTTAGGTAAAAAAAACTTAACTACCCGCTGCAACGCACGGACATATTTGC
TAGTCCAATAAAAAAAGCTGAACGGCGTACGAAAATTGTGCTTTGTCATACCAAATCTAG
GCTAGACAAAAAGGTGGAAAAACAATAGTCCTTCTAATATTAGGTATAGATAAGAAGACA
TGATTGTATGGCGCGGGCTGGGGCTTCATACAGGTAGTTTGTCATTGGGAAAGGTGGCCC
AACAAGGTTGGAGTCCGGCCTGCCGAGCAGTCAATTCGAAATGGGCTAGCTGCATCAGCT
CCGACTCCGACTCATACCTGGAGTCCCGGATCGGGCCTTTTTATATCGATGCTTCCACCC
TCAAATGTCAAATCAAATCGAAGCGAGCGTTCCACAGCGAAAACATCCCTTCACCAAAAT
CTCGGTGCTGAACCCCCAAATCTCGGTGCGAAGGTGAGACGCCGGTGTGTAGATCCACAG
ATTCGCAGATGGCCGGTGACAAGGGCCCCTTCACCAAAATCATGGAGGCGGTCAGCGTTC
AGGATGGCCAGCTTCTCAAGCTGTGCAGCGCCAAAAGGAAGGCAGATGAGGCGGCTGCCG
GCGAGGAGTGCGGTCCCAAAAGGAAGGTGGAGGCTGCGGCGACCGGCACTACTTTGGGGG
AAGAAGAAGCTGCTTCAGAGAAGCCGCCAGCGGCGAACGCCGCCGCAGAGTCAGAGGCAG
CGTCGGCGGCAACCAAAGGAGACGGGACCGCTCCGGCGAGGAAGAAGACGCGGCTACCGC
AGGAGGAGGTGGACCGGATCCTTGCCCGGGCGGTGGACACCAGTCAGCCCCCTCGTTTCA
TCGAGGCCCTGAGGAGCAAAAATCCCAGCTTGCTGCCTTCGCCGGAGGAGGAGACGGACG
CGTCCAAGGTGGCCTTGTACGCCACCGCCCGTATGTACTACGAATCTCGACAGAGTTTCG
CCGAGTACCAGGCCTGGGTCCTTAGCCAGCTCCATGACAAGGGCTACGTCGAGGTGGATG
ACGAGGCCATCGCGGCCCGGGCCGAGCTCAGAGCATACAGCGACCAAGCGCGGAAGGAGG
CGTTCTGAGACCTCACCCGCTCCGATTCCGACCAAGACTGATTTATTAATCAAGTCTTTT
GAGTTCCATAGCAAGTATGAATCCATGTTGTATCTCCGGAGATTCGGAGTTGTAGGTGCA
CTTCGATCTGTCTGTCTATCTGTGGTGAGGTGCTTATCTAGCATACGCTGATGAACACCT
TGTATCCTCTGTAATTTGTGAGGAGAAGGATGATGGGCGCCTTGCTTAATAATTCACCAA
GTTTTGTATCCCTGATGCAGTTCTGTTCTTAGTTTCTTACCTTGCAGCAATCTGAGTGCT
TGGCTCGACATGTTTTTGGCCCTTCTGTTTGTGACACTGCATTGTAAATTTGTAATAAAG
GAAAAAAAAATAGTGTGCTATACTAAATAGCGGAACCCTTGAAAAAAAAAAAAGAGTGCT
ACAGCGTGCTATTAGCGAGCTATTTTTTTCCAGCAATCGTAATTCAGGATCTGCTGGTGC
TTTGTGGTTGAAAATCTGTAGTTTTGTTTGACTGTATAATTTGTTTCTCCAGGGCATTGT
GGTTGTCAGATTGACTCCAATACTTGTTACATTCTCGCTGAAAAATGCTGGCTACTATAG
TAGGGTCATGAAAGTAGCTTGTTCTTCATGAAAAATACACACAATATCAACTGTAATCAA
ATTCTGAACAGTGAATTGACAACTTCAGCTGTGTTTTCTCCCACAACAACACCGATAAGA
ACCGCAATGACAACTGACTAGTGACAGGGGCGTGCCCTTGGCGCGCCTCCTGGGCGGTTC
TATGCACTCCAGCCTTGGTGGTGCAGCTGTCAACGCGCATATGTGCGGTCCTATGTACAC
CAGCCTTGGTGGTGCAGCTGTCAACGCGCATATATATATACTACTCCCTTCGTTCCTAAA
TATAAGTCTTCTAAGCGATTTTACTAAAGGACTATATACGGAACAAAATGAGTAAATCTA
TACTCTAAAGTATNNNNNNNTACATCCGTATGTAGTCCTCTAGTGATATCTTTAAAAAGA
CTTATATTATGGAACGGAAGGAGTATATACTAAAGCCCAGCGATCCTCTTTTCCTGGTTT
TTTTATTTTTTTTCCATTCACTGTACATTTTCACGGCGATGTCAACATTGATGAACAGTA
ACCCAATGTAAGCAGTAACCTGATTGTGATTAATCTGTGTAAACAGTAACTCATTTTTTC
TGCATCCACTGTCTATTTACGTGTAATCACATTGTAAACAATACCCTTGTGAACAGTGTT
TAAAAAGAAAAAGGAGATTTCTTACTTGCAGAAAACATGATAATTATTAGTATT