Map Locations of contig_57985 (6466 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_57985

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70444 2 1479 bp MLOC_70444.1 Available Available LOC_Os03g51430.2, FRAME:+1, EVALUE:2e-159, 13103.m05591 protein SEC14 cytosolic factor family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_70444






Contig Sequence (6466 bp)

>contig_57985 6466 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCAGATTAAGGGCCATGTCGTGTGTGGGATATTTCCTCGGTCAGAAACGTCGCACTGAG
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GGCCTTTATCTGGCCGTGGAGAGAAATATTGCGATGAAGCATGCTTGATAAGATATCTTG
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GCAGAACCGTGGTTGTATTGAGGCCTGCAAAGCAGGTAAGAACTAAATAATGTTCCTATC
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TGGCCCATGCAACCCCCTTCAAGACGGCCAGAGACAGTATGAATGTCTTGCAAAACCATT
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TCCCAACTTAAATGTTTCAAATGCTCCCAGGCTCTCAAAGTATTGGTTGACCCGAAATCA
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CATGAGGATTACTCTAAGTTGATGACAAAAGATGACATCAAAATGACAAGCTTTTGGGCG
GCAGATGGTAACCATGCCGTCAATGGCCACTCGGTTCCTGAGGTTCAATCACGGTCATCA
CAAATTGTTGCTAAAGCAAGTTAGAGGAACATCGGCCATCCATCCCACCTGATGTTGGTA
AAGCAAATTGAGATTCATTAGGCAGCTATTATGAGTTTACGATGGCCTTCGGTACAGCTC
TGAAAGAGGAATAAATAAATGTAACTGCAAAATATCTCGCTTGTGATGTTACAAACAGCA
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CACACTAATTAAGATCCAGTGGTATTTATTTTTCGAGGGAAAGATCTAGTGGTACTCCGT
ATTTGGTAGTACTCCTTCCCACAAAATAGATCCCCTGTGTTTGTCTTAAAACAAACTTTT
TTATTAAGTTTGAAAAAAAATTATACTCACTTCGATTCAAATTAATTGACACTCTGCTTT
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GAGATTCATTCATATACCAAATCTATGTGCATTACAATATCTCTACTATTAAAGGGGGAT
CTGCCGTAGTCGTGATGGTTCGACCTCGAGCGATCCCCCTCCTACC