Map Locations of contig_57960 (9266 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_57960

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70429 2 2835 bp MLOC_70429.1 Available Available LOC_Os05g44050.1, FRAME:+3, EVALUE:4e-137, 13105.m04647 protein ras-related protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_70429






Contig Sequence (9266 bp)

>contig_57960 9266 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTAAATGTATGAAATCACTTTGAAGGCAATCATTTGTCAAAGTGACATGATGTAGACCTT
GCAGTAATAGTGGATAGTCTGTAAATTTTTTTTACAGTAGATGCCAATATTACCTTATGA
TATCTGGAGGTAGTTACATATTAATATTTGGAAGGGCACTTTGAAGGTAATCATCTTGTA
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CTCCCAGTCCCTCCGGCGCGCGAGCTAGATCGATCGCCCCGGACCCTAGATCCCGATGGC
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TTAACTTTTGCTCCTGTCAGCATTAGTTTTTTTCATTCTTTAACCAGATAAATTGTACAA
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CTGTTAGAACATGAGGGCCCACAACTGTGGGCTATCCTTTGACATTACTGTATTTCCATG
GCGACTTATGGACCTGTATTTCATTCGTGACCTTCTTCAATCACCTCGTAAGTGCCCAGG
GAATGATTGATGCGTCTGTTCCGATCTGTCAATTTGTGGACGTTTGTGTAGTTTTATCAT
TATCATCAGTAGCGTCATATCTTGTGAATACAGTCAGCGGAATAAGTGAAGTGTAAACTA
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GATTTAAGTTATAGTGAGAAACTCATATGTTGATATAGACGATAACAAATGTACGGAGAC
ATGATCGAAGCAATGTCATATGGTTGACGTGTACATATCACACATGATCAAACATAGGGT
TTACAATCAATAAACCTTTTGATCCGAGCCAAACATTTTCAGTCTTCACCTAGTACTAAT
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GGATCTGCCTGCCCCGCAGGCTCCGCCACCGTCCCCATCGGCGAGCCACGTGGCGGCGAT
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CCATCATTCGTGGGATCCTCCGCTCCGCACGACTCCGTTCCCTCCTTCATCCTCATGGAG
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GCGGCTCGTCCGGGTCCATCTGACCCTCTCCGCGCCACTCTGCGGGGGCTGAGCACCCCC
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CTGTTCGCGGAGGGCACTTCCCTCGTAGCCGCCAAGCGCCAAGACTTCTTTGCCGGGGGC
CCGCTGGCCAGCCGGAGAGACTGCGAGCCGGGTCCCCCCATGTACCATATATCCATATTG
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TCCCACGCACGAACACACATACACGAGAGGTAGAACACGAGCCGGCTAGCTCCTTCTTCC
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TGATGCCTAGTTGTCTATGGTTGATGCTCAGTTGCCTACAAATACTGTGAAATTGCTTAA
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TACCATTGATGCCCACTTGCCTGATATTCGTAAATAGTTGCCATAATTGCACTCGAGTAT
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TCAAAGTTGCTTCTGTTTAACACTAAGGTTGTCTCATCTAGCATCGAAGTAGCTTTAAAA
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GAAAATTTTGAAGCCCCAAATAAATGCATGCACGTGGAATCGGAGATGGATCCGCGCTAT
CGGATGGGCGCGACGCATGCGCTCGGTGAGGTGAAATAGTGGAGCTGCACTTTTATTTAT
TTGGGTTGGATGTATACCGAATCGAGTTGATAAGACACCAAAATACAAGGTATCAAGTGA
GAATAAAATACCAAACAAAAAATTATCACCTGAAAAATACCAATTAAAAGATACATCAAG
GAATGTGATATCCATTGACACCTTCCAAATAAAAAGAAATAAGATACTAATTGAAGGGAA
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CTCTTTATGGGGATAAAAAGATTTACGATAAACCCATAAAGAGAGTGTTTTAAAGAAAAT
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