Map Locations of contig_57893 (9874 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_57893

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70394 2 2986 bp MLOC_70394.1 Available Available LOC_Os05g22260.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13105.m02251 protein crooked neck, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_70394






Contig Sequence (9874 bp)

>contig_57893 9874 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTTGATCTCCATAGATAGATCTTGGATGCGCGCATGAATTTTTTTGTTTCCCATGCAAT
GTTCTCCAACATGCACATGGCGTTTCCATTAGACCATACCCTAAATTTTCTACTCCCTCC
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CGATACTATATTTATATACCCAAAATAAAAAATTAAAATGATATTATTTAGTAGGAAAAC
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ATAATGGGTGTTTTCCAGGAAGGAAATATACCCAGCTTAGAGAGTTTTCATAAAAGGTTT
GGTGAATTCTTCTCCGTCTCTTGTCGGTATGGACACCTCCCGCCAAATTGGTTACTTTTG
CTATAACTCCAAACAATACAATGTTTGTTTGTGTGTAAAGTAGATTTGAATTAGGTCCTA
GTCCCTTATAATAAATAATTAAGTCCTAATTTAAACCCCATGGTTGTGTTTCACTCCCAA
GTTGGTGAAACAACAAACGTTTAGAGGCAGGTGCTGAAAGAGTGTCATTTTATCATCACT
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GTACGGACTCGAGTTAGCGTTCACATAATCATGTGTTTACCACATGAGAATTTTTATGAT
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CAAAACTGAGCTTCGCCACACCTACTGAAAACAATTACGAAAACTAATTTAAGAGATTAG
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GGGAGATTGATGTAAGGAGGACACATAATCACGTAAGTAATTCTTCATACATTTTTTCGT
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TTTCATAAAATACATGGAAGATTATTTGCATGGACACAATCAAGACTAGGGCGACACCGA
GGATAACCGTACAACCAACATAATCGAGGGTGACCACGAAAAAGCACACTTGGCGAGGAA
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ACAAGCTAAAATACTACCCCTCCCCCCTTCATAAATTGAATTGTCAAACATCTTATATTT
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AGTAAAATAAACTAAATCTTCTTTAGACTCCAATGCTTATCTCTATATGAGAAGTGCACT
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GATATTTTTGGGCACAACAAGATAAAGAGAATAAAATCCACTGGCTGTCTTGGGAAAAGT
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GATGCTCGCAAAACAAGGATGGAGAATGCTGAATCATCCGTACTCGTTGTGTGCCAGGGT
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TGCCATCGGTTTGACGAGGATGGTGCCCACATGCTCCTGAAGTGCAAACCTGTGAATAAG
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ATCAAAATAAATATTGACGGTAGCTTCTTTAAAGCAACTGGTCACGGAGGCTGGGGAGTG
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TACAGCATGCAACGAGTACAGATTAAAACGGATGCTCAGATGCTCGTCAAAGCAATCTCA
TCGGCGGACCTGGATCTGTCCCCAAATGATGTGCTGTTTCGAGAGATTAAAGCACAAGTT
TTCTTACACTTTAGCTGTTTTTCCATGTCTTACCGCCCACGGGCATGTAATAAAGTAGTA
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CGCGTACCTACCTTCGCCCAGGACCTTGTGGCCAGCGATTTAGTTGCGCACGTTGCTTAA
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GTCTTTTTTTAATAAGTACTATTGATTTATTTATCTAAACACCTCCTTTAAACATCTTGT
ATTGTACAAGGCCTTAACTCCTCGTGATAAAAATTCTAACACGAGCACTTAAACTACGTT
TTACAGAAAACCCCTCATCCAGCAAAGACCGAACCCCAAATCGAGCCGAGCCGAGCCGCT
CGGCCTCGCTCGATCTGCCCCGCCCCTCGCGCCGCCTTCCTCCGCCCCATCTCCTCGCCT
TCCTCCACCCCACTCCGGCATCGAGCTCCGCCGCGCCACCGTCCGCGCGTACAAGCAGAC
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CGCCGGCTCCCGACGCGAGCCTCGGCTTCCTCACGAAGCGCGACACGGAGGTCAAGCTCC
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ACCACACCCTGTGGCTCAAGTATGCCGAGTTCGAGATGCGCAACCGCTATGTCAACCATG
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CGCGGCGTGTGTATGAGCGTGCAGCGGACTTGCTTGTGGATGATGAAGATGCAGAGGTGC
TGTTTGTAGCATTTGCTGAGTTTGAGGAAAAGTGCCGGGAGGTGGAGCGTGCTCGTGCCA
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TGTGGCTGATGGCCGCACAGTTTGAGATTAGACAGAAGAACATAAAGGCTGCAAGGCAGA
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GGTCTCCAGCAAATTGTTATGCCTGGAGGAAGTATGCAGAACTGGAAAAGAACCTTAGTG
AGACTGATCGTGCTCGATCTATATATGAGCTTGCTATTGCTCAGCCAGCCCTTGATACGC
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TTTTGTTGAGTTGAACTATTGGATATATTTTCCTATACATTCTTATTCCATAAATAAGCG
CTCATGAAGTTCTATGTTAACGTTGATTTATACTCCCTCTGTTCACAAATATAAGATGTT
TTAACTATTTTCTGAATCGGATGTATATAGAGATGTTTTATTGTGTTTGTTCACTCATTT
CAGCCCGTATGTAGTCCATATTGAAATGTCCAAAACATTTTATATGTGTGAACAGAGGGA
GTATCATATTTGATCAGCTCATCTATCTAAATAGTTCCAGTGTTTATGCATGGGAGTATG
TGGGTATTATTTGCCACCTTTGTTCATGTGTGCTGTGATGCGATATGATGGTTAATTTTG
TACTCCCTCTATTTTTATTTACTCCGCAATTAGCTTTATCTAAAATCAAACTTTATAAAC
TTCCACCATGTTTGTTAAAAAATATATTAACATATATACCACTAAATCAATACCTTCATC
ATTGAATATATTTTCACATCATATAGATTTATAAAGTTTGACTTCGGTCAAAGCTAATAT
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GAGTCTGGATCTGTTATTTCTTTGCATTATATCCTGCCAGCGGTAAGTAGTAACTACCAA
AGCATTTTTAAACCATGTCTCTTCAACCTCTGCACTCTATCAGAGTTGCTCGAATGCTTA
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TTTGTGTAGGTCTAGGTGGGACTTCGTTGTCTTGTATTCTTCAGTCTTCTCCCTGGCAAA
GCAGAGCCAATGGAACTATATTTTGTCTAGTCAGCAACTGAAAACACACACTTCTTTGTG
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TGTTTCCGATATTTTTATCTATAAGATGCAGCATTGATCCTTGTTAGATGTTAATGTTAC
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GATCAGCTTTGCTGAATTCGAGGCCTCAGCTGGCTTGGGAGAAGACGATGGAAGTGAGGA
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GGCATTCGACTACTTCAGGACCAATGCTGCAGAGCTAAAAGAAGAAAGAGCAATGCTCCT
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GAAGAAGGCGCCAAGGAAAGTGAAGAGGAAGAGACCACTCCCCACGGACGATGGCTCCAA
TATTGCGTATGCTATTTACTCAGTTCTTTATTCTTGGTACTATTGTATTTTATTTTCAGA
AGTTGGTGGCTTGCCATGTTTAGCACGCTATGTGGCCATGCACGGTCCGAGTTCTATTAA
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GGTTACCAGCAATTTAGAAATATACTGACATCATTTGTTAACAGAATTCAGAACCCAGGA
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CAGAAGGCAAACGACACACAGGATGACTGATCTGAACATCCAGAGGCCGCCTGTTGTGAA
TGGTTTCCCACCGTCAGAGACGAGTACTACCATGCAAAAATCAGACGTAGAGAAGTTTTC
CATTACGCGCGGGTGTAGGCGTGGAGTTTGCGCTGCCTCTTATACCCTACATATGGCCTT
TTTGCAGCTTGTTCAGTGGAGTTATTGAAGCTGTATTTCTGACGGATGGATGCTGAATTA
TCTGGGTTCTGTTACCCCTGGATTGAACGGTATGTTCGTTGTTAGGAGTCAACTTTTATC
TTGGTTTTGTTACCCCGGTTCCTTGGGTTGAATGTAACTCAAACATGTATTATTTGAGCT
TAGCACTATATCATGTTTCTCCCATTTGGTACCTGGTGCTAAACTGCCAGATGAGTGTTT
TCCTAACAACGAAACGGAGCGTCTGCAGTCAGAAATTCCATTGGGGAAATTGTACGAGCT
GATGGGCCTGAAATATTATGGCCTTTGAGTTTGGCCTGGAGATTTGAACCTTTTCTCTTT
CTCTGTGCATTTATTTAAATTCTTTCATACATTAGAGGGTGCTTGGATACGTTTTAGTAC
CATGACTAAAAGTAGTGAGACTAAAACTTGCTAG