Map Locations of contig_57630 (5376 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_57630

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70226 1 646 bp AK359455 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_70226






Contig Sequence (5376 bp)

>contig_57630 5376 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACTGCTTCAAATTCAGTTGCTTCCAATCCCAGATCACCCTCTTAACCATTGGGACAAAA
TGGCAAGCCAGCCGTGCTATGCATATACCATCCTGTTAGCAGCAGCGAGTTTGCTCGCGG
CGAGCAATACGAACTGTATTGTTAATATCTTGATCTTGTGACTATTTTTTGTGCCGAGAA
AAGGATACAATGGTTGTATCAGAATAGTTAGCCAGCACCATTGGTAAATTATAAAAGTCG
TTTGGAGCCTTTGGTGTAGGAGTTTGTACGCATTTGTATCTTCCATAATGACGCGTCTGG
TTTTGACATTTGTTTGTTGTTTCTTTGGTAGGGAAGAAGATAACTTTCGGTGATGACTGA
GCTTGGTGATTCCCCTTGAAACCGCGCAGAAACTCCAACTCACCCCTAGTGAAACGTGAA
ACTAGTGAAATGCCAAACATTTTCTTTTTTGCTTGGAGATTACTTCTATTTTTAAATTAT
CTTATTATTATTGTGGACCTGGTGGTTATCTGCCAGACAATATCGACTGTTTTGGAGATT
TATATTATACCCGTGATGAATTTTGGTCAGATATATTATCTTATTATTATTGTGGACCTG
GTTTTGTGTTCATGCTTTTACATTTTAGTTCACTATTTCTCACGATTTGTGAACCATTTG
GTTTTGGAATCCAATTCTATATGGTGATTCGTGTAGTATCTTCTTTTGAATAATAGTATA
CTCATGTGTACGAAGTTGAAGTTGTAAAAATTATATTTTCAATTATACTATATTCTTGTA
TATGAATCTTTTTGTATGATTCCCTGTATATCAAATAGAAAGGATGTGAGAGGATTGGGT
GGAAGGAAGGGATTCATCCAATCCCGTGAAATCCCTCCCTTTCAAAACTTTCCCAATCCC
CCTTAACCAAACGAGGCCTAAGGAGAAAAAAGTTCAAAAAATCTTATCTCACTCCACGTA
GAAAGTAACGTACCGCAGCACATGTGATTTGATTCCGTTGGCGTTGTTTGATTGGATAAT
CACATCGCATATGGCGTGATCATCTCATGTCATGTCATCCTCCTCGTATCATTAGCACTG
CCGAACAGAGACAAAGAGAACCAGGGAGGAATACGCAAACCAGGACGGAAAGCGTAGTAT
AGTTACGAAGGCGGGTTCCGTGGAATGGAATCACAAAACGGACGGCTCAAATAGCAAGCA
ACAGAGAGGCCGCGCGATAGCGTAAACCCCCGCCCCTGAGCTACTACCTTCGCCATGGCC
GCCGCTGCCTCCTGCCGCCTTCTCCGGCTGGCACCACACTGTCTCCGGAGCCCGAGGCAT
TCCCTCTTTCCTACGCCACTCGCTCTCTCCTTGGGTTGGCGCCGCTACTGCGCCGCCGCG
CCCCCCGTCGCGGCCACGGCGATGCCGACGGGGGACGCCGTGGGGGAGTTCCGGCGGAGG
ATCAGGGTGGCTGAAGTGAAGGGAGGGGAGGACCAAGGCACTTCCTGGGTCGGGAAGGAG
CTTACCGTGCGCGGGTGGGTGCGCACCTGCCGTGCCCAGAGGACCGTCACATTCGTGGAG
GTCAGGACACAACACAGTCTTGCTGCTGTCGTCGATTTCCATGGTCCATTTTCTATAGTT
TCCAATTGCCATGGACTGGCTCAAGTCTCCAGGCGTATAGTTAGCAAATTTGTTTCTGCG
GAAATGTTGATGCTATTACCAGCTTTGCTTGATGATCCAAGACTTCCATAGTTGAGGAAA
GTTCTATGTAGTTTATATGTCATTAACTTTGGATAGCTTGGTTTCACCTGTTGTGGTGCT
GTATATGACGTCTTGAACTGACCATGGTGTCCCTGTGTTTCCTGGAAAAAAATGGATTCT
GAGCTTAGAAATATATTTTCCAGAGATTGGGTCACAATGGTTTCTCCCAATAAGATTAGG
GGCCCTTATATAGGCACTAGCAAACAAGAGTAACTCTAGCAGATTCCCTAAAATTTTGGC
CTTTAAAATCCTCTTGCTTCTCCCTTTATAATTTTTGAAAGACTCTCGAGGTTCTGTGCA
AAGTTAGAGTCTGTAAAACCAAGCCTTTGTAAATTTGAGCCCACATGTCGGTGGGAGGGG
ATTTTTTTCCATTCTTCGACCTCTCCACGAGCCTTCTCCCCACTACAACGACAACAGTCG
AATAAGCGGCTACAGGCAGGAGGTAGTTGAGGTGAAATTTCCTTGCCCCCATCCACAGGA
AGATATAAAGTGTACTCTAAAAACCAAGGTTGGAAAAGCGGTAGGCGTAAGCGAGGCGGT
TGGCCTTCGCCTAGTTCGCCTAGTGCCTAGGCGGTGCTTAAGCGCCCTAGACCCGGCCTT
GACGATAATATAGTTTCTACTATTAGGGTGTATCTGTGGTCATTATATGTGTATTATCTT
AATTTAAGGCATATATATAAGTTAACTACCAAGTACTGCCATTGGAATATGGCTCGCTTG
GATTAGTGCAATATGGCATGATTTCTCTCTAGGTTAGAAAATTTCTTGCTTGCCCTGCCT
AAACTATCGCTTATGCCCTAGGTGAGGCGTTTGGCCATCGCCTAGTGCCTAGGAGTGCCT
AAGCGCCTCCTAGGCACTGCCTTTTCCACCAGAGCTAAAAACTCCTCCCCGGCCTCTAAA
TATAAAGGTTGGTGGGCTGTTTTAGAGTGCCTTATTTTTTTTTGAAGGATAGAGTAAGGT
ATAGGGAATCTGCTAGAGTGGAAAATTGCCCTCTATTCTTTATAATAGCCATTATTTTAA
AGATGGGGGGAATTTAGGGAATCTGCTAGAGTTGCTCTAACACGTTTAGACTGTGTATTC
TCTTTCCACCACGTATTGGATAGCTAACCTGAGTCCTGACTGCCACTTGTAGGGTTTCTT
AGGTGAGTTACGAGTTTAGAAAATCTTTCCTTGGCCAGCCTTGTGTTAGTCACGAAAGAG
ACCCTCATCCTCATGTGTATAAACTTTTCACCCCATATTTGATAACTAGCCTGACTGCAA
CTTATTGGGTTCCTTAGGAGAGTTTAGAGTTTGGAAAATCTTTCTATGGCTGGCCCTGTG
CTATGACGAGAGAGACCTTCGCCCTCATGCAAATTCTCTTTCCACTACATATTTGATAAC
TAGCTTGGCTGACATTTATAGGGTTTCTTAGGTGAGTTAGGAGTTTTGAAAATCTTTTTG
TTGACAGTCTTGTGTTAGTCATGCGAGAGGCCCTCATCCTCATGCACTAGTAGAATGATC
ATACTGGTCTTTGTATACATGATATAACGAATACAAAGTTCCTCTTACCCTATCAGATAA
ATACATCAGTATGGAGGCTAGACATTTCTCTAGCAAGAGCCCACTCCCGCACTCTAGGTG
AATCTTTGTGGGATTCACTTGGTTAACCTTTTGAAACATGAGTAAAATAATGTATTTGGA
CTTGCAAAGTACTTTGAGAATATTTAATTTTGTTCATTTGCTAGCATGATTATAAAACTT
GGCCAATGTGTTGCATTAGTGACTGAAAAATTAAAGTAACTTATTTTTGTCAACGATGAA
GTATTATTATTTTTCTTCAAGGGTCTAATAAATCTTGAAACTCTATTATTTAGGTTAATG
ATGGATCTTGCTTGTCCAATATGCAATGTGTGTTAACTCCTGAAACAGAAGGCTATGACC
AGGTATGCATTTGTCTACTTACTGGATCTAGAAGTTAGAACGTGTTGTATTACTAAACTG
CAACCGTTTGGAGGTGCATAGAGTCTAAATGCTGTTTACGCTATGCATCTTCCATTATTC
TTATTGTCAGGAAAATTATGTTGATCAATCCAATTGTTACATTGTGAAAACAGATGCGCC
CACTCTGATATTTGCTCTATGCCACCAACAAATCTTAATCATATTGGCAGTACTTCTATT
AAATATTTTAATATTCAATTGGACAAGGATACAGTAACTTAAAGAATAAAGAGTTACTGA
CGTGCCTCCAGCACCCACCTCAACTCTGGGCTTGTTGTGCATAGTAAACTTTATTTGAAT
GGGTTAAAGTAGTGAAGAGTTACCCATAATTTTGGATGTTGTGATATGCCAATTTTTACT
ATGCTGCTTAGAAGTAGTACCTGTTAACGCTTAAATGATTGTAATACATTTCACTGGTCA
ATCTTTTCGATGATGGATGTCAGATAGACTCTATCACTACGGGGGCCTCAGTTTTAGTGG
AGGGAGTTGTAGCAAGCAGCCAAGGCGGTAAGCAGAAAGTGGACCTAAAGGTTTCAAAGA
TCATTGTGGTATGCGTTTCATTCTGCTAATTTTTCTTTACTTTTCCCTTTAAAGTGCATG
CCTCCAAAGTTTCGGCCTAAATTCTGCATTTTCTTCTTAAATGTCAATACTTCCTATTTT
GCACGGGAAATAGTTGCTAAGTACTACCTCCGTACAGATTTATTAATCCACATCGTATTT
TGGGTCAAAGTTTGACCATATATTTGACTGCAAAACTTTAATGCATGTCAAAAAATATGT
TTTTGGATTATTTGAATCTAGTTTCCATTTGATATTACCTTTGCTACATGTAACTTATAT
TTTATTAGTTAAAAAGTTATGGTCAAAATGTGACCCAAAATACGTGGGGGACTAGTAAGT
TACGATGTCTCTTTTGAATGGTAATGTCACTAATAAGGATTGTTACAACCAAGTTGTTAC
ATGCGCAAATACAAAATTAGGTAATATTCTAGTAATAAATATGTAATTTATTTAAATAGG
GAGGAGAGTTATTTAGATAGGGAAGAGAGTTATTTAGATAGGAAAGAGAGAGGATTAGAG
TTGGAGATCAGAACTGTATCCTTTGGTTGTTACTTAGGGCTCAAGTTGTATGAGGGACAT
CTGACAGGCTCTACTAGTCCGTCGATGAACTACTTGGTGGATTTAACAAGAAATAGCCAA
AATAGAGGATGATCACGAAAGATTTCCGTCACCTTTAGATACACGTTTCATGTGAGCCAG
AACATGTCGGCTAGGATTTATACAAGAAGATGAGCTCTACCTGCCCAGATCCGCAGCTTG
AATAACCTACAAGCAGTAAAAGAAGAGAAATGCACTCAAAAGTAAAAGTGGAGCTACAGT
GCTCGTTGTCGGATTTTAAACAAGGACTGGTGAAGTCTTGTGAGGGTGGAGGAGCATAGT
AACTCTCGTCGAACCCATATTGTTATGGTTGCTAGGGTTTGAGCGGGAGAGAGAGAGCTG
CGAGGACCCCCACGGCCGGGCAAGAGGGAAAAGGGTTTTCCTTCTTAATTCTTGCCTGAT
TAGATTGATACATCTCCTCTCCATATATAGAGAGGTTTACTTGACTCCCAAGTAAGGCTT
ACTTGACCCCTAAGCAAACCCTAAGACTAACGGGCC