Map Locations of contig_57606 (10840 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_57606

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70219 2 1255 bp AK374727 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70219






Contig Sequence (10840 bp)

>contig_57606 10840 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACGGAGGGAGTATAAGTCTTTTTTAGAGATTTCACTAGAAGGCTACATACGGAGCAAAAT
AAATGAATCTATACTCTAAAACATGTCTATATACATCCGTATGTAGTCTTTTTAGTGAAA
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TGGTTTGGTTTTGTATGTTTGTTAGTTCCACGTAATTATGGAGAGTATCATTCTTTGGAC
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GACGGGAGGATCACGTTAATAATGGAAAGTATCATCCAGCGATGTACTGGAGGATCACTA
GAATATTGATGCCCCTGTTGCAACACACGTGCAATTAGCTAGTATCCATAAGTTCCTTGT
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GAAAATCTAAAAGGCCTAAAGTGACGAGAAGAAGAATACTGCACGACTGAACGTCTTAAT
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GAGAAGAAGAATACTGCACGACCGAATGTCTTAATATCATTGTCAACAAGTAGACAAAGA
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ACGAGGAATTGCGCAGTGGGTGGGGCGCACAACAACCGGCTGTGCTCGGGTGGTCTGCTA
TGTTTGACCCACCTCCCGAACTGCTGAAATGACTGGATTGCCCCCACGTTCGTCTTCCTT
TGCCCTCACCACCCTTCTTTTAAATAAAAAATAAATAAAAAGATAGATGCGGAAATTGCT
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TCTTCTCCTTTGCCCTCACGGCCCTTCTTTTAAATTAAAATTATTTATAAAATGGGTAGA
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TCATTCAAAATTCAAACTTCAAATCTCATGATAATTTGTCCTTTTTATACAGGTCGCGTT
TCAAAGTATTTCGACCAGAAATTTTACACACACGGATCAAATCCTTTTTTAGTTGTATAT
TTTTTTAGATCTTTTGAAACTAATTTTTTGAATTTTTTTTTTAAAAAATGGCCTCCATGG
AGGCCGAGCTCCAAAACGCCATTATCGAGTAGATGTCTCTTTTAGAATAGAGGGAATTTT
TAAGAATTTAAGAAGGATACTAGTCCCTCCGATTCTAAATATAAGACCCTGAAATTTTCC
TATGAACTACATACGGAGCAAAATGAGTGAACCTNCACTCTAAAATATGTCTATATACAA
CTGTATGTAGTCCATCGAAATGGAGAGAGTATAAGGAGGGTTGGATGCATTCTGTTGCGT
CGTTGGCGTTGTTGAGATTCCTAAGAAAAAAATACTTTGTTTTAAAATATATGTTGTATG
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CCATAATATCAAATTGGTATGATAGATTCATCACGAAATGAGATTTTATATTTTTTGTTT
AATATTGTGGATGTCAATATTTTTTGCTATGACTTGGTCAAAGTTAAAAAAAATGATTTT
ACAAAAAGCTAATACCCTTTATAATTTGTAACTTATGTAATATTTAGTTCGATGGGTGCG
AGAGATGATGGAGTGTGTTTATTTTATTTATAATGCGGAGATTTGGCAGGACTTTTGTAG
TGTTGCATGTATTATCCGCTAACCAACATATATTTATATGGAAAAAAATTATGAGTGACT
GCATGTACTATATTGGTGCTTTAATATCATATGGTTACTTTATTTTTTCTAGGTGGTGGG
AGGGTGGGTGGGATTAATTTGTTTTATAGGCTGATCGTTGCTGACAATTTAAAAAATCAT
TGACTCCGTCAAAATCGTAAACTAAATTCAAAATTGAATACCTCAACTGAATGAAAGAGA
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ATTGGCCTAGTCAAAATCAAGTGAATCAATCCTAAATTGAATACCTCAATTAATTGTGAG
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ATGACCCAATTTTAATTAGAGACCTTAATTAAATATGGACTCTTTAAAACTAGGGAGCTT
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ATGAATGGGTTCATATTTCTATGTAGGATTGATTTATATCATTCACATTTTAAAGGAAAA
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GCATGATAATAATGTGGTTTGTGCTACCATTAATACGATGTGATCTTTGTCGGATTTTTT
ATTACGATATGATATTGATTGTCTACGAACCATGTTGGACACTTAACACATTGGGCCCTC
AATGTTTCAGTGGAACCTATTTTGACGATCGAGGTTAATTGGAGCTCCATTTATGGTCTA
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TGAGGTTTTGATAATTCATGACAACATACATTATCCATTGGACTAACAATTCTACCTAGT
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TAAAATGGCTCATATAAATTTAAGAGCCCCCAATTAACATGGAAAAAGGAAGTATTTTAA
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TAATGGTTGGTTGAACAAACAAAAAATAAAAAGGTTGAGCATGAAAGTGAATTAGCTCGT
TAATGTGCTCGGTGTGATGTGGACCGAGCTTGTAGCGGGTCAAGGTCGCAGCCCCCAAGC
CGGTCCCAAGGTGCCCGAGCGTAGAGCTCGGCTTGATGAAGTGGCGACACAACACAGTCG
ATGCGGCAAGGCGAAGCCCCTGATCTAGCTAACATGACGAAGCTGGTCGGTTGGTGACGC
CGAAGTCTCCAGAGTTGGTTGATGAAGAGATGGAGAAGCCCCCGGTCTAGCCGAGGTGAA
CAAAGCAGATCGGTAAGATGACACTAGAGCCCCCATGCTAGCCGATGTGTCAAAGCATGT
CGACGTGATGGACGTAGGCTTGGAAAAGCGATGGCATGGAGATGTCGATGCACGTCGGAA
TGATGTGGTCAATGTTGGCTTGATGAAGAGACAACGCCCCCGACCCATGCAACCAGTGGG
TGACGAGGTTCTCTTAATGATTATTCGGCCCTCACGATGCCGAAATCTTGGTCGTATCGC
CGAGGTGATGATCCGACGAGGTTGACCTCGGCTTGACGAAGCGATGACCTATCTAGCGCA
GGTCCGCAACCGTGGAGCAACGTCGTCAGACTGTTTTGACACCAACGCAATAGTGAAGCA
TATATCGGAAAATGCTTTTAAAATTGTGGGCACGTGTTTTAGAACAACACACAATACCCT
CATAAAAATTCCTTCAAAAAGGATATCCAATACCCCGTTCGTGAAGAAAGATGAACTCGG
GTCAGATTCATTTTCCCGCAGAAAATAGATCCAAAAATTGATGCACTCATCGGATGTTTC
TCGGTGTTCGGACAATCGGATCGAGGTGAAATTTTGAGGGTGATCCTTATAGTAATTCCA
CAGCCGATGAACGGTGGGATTTTCCAATGGACGTGCATGCTAGATACTAGACACCTTTCC
CTAAACTCATCCAGATTCCCATCCAGATACGTCAGGGCTTTGGTATATTGAAGATTGTCG
AAGATTACTCCATCAGATCGCGACGACATTTTGCAAGGTTGTTGTATATTTAATTCTGCA
CAATTTCACTGAAGCAATCGTCAAAGAGACGTTCAAGGATTCCTCTATCAGAATTCACTA
TCCAGAAAAAAACTACTGCCAATAAGCACACAAGCCATCAATCCTTGGTGATCCAACATC
GAAACTCAATTAAAGCACCAATGTGAGTGTCAAAATTGGCAGATCTCGGGAGGGGGTCCC
AAATTGTGGATCTTGGATCAGTGGGTAGCAGGATGAACATAGGGACAATCTTTACCCAGG
TTCGAGCCCTCCTAATGGAGATAATACCCTACGTCGTGCTTTTTTTTTGTATTCATGATG
AAGTATCGAGTATAGAGTTGNTCTACCTCGAGATCATATGATGTGGTATAAACCCCTAGG
AGTAATGATCTTAATCTGTCTAATAACTAGCCTCCCGCCGGCTTATATAACACACTGGAA
GCCTAGGATAACAAGAGTCTGAGTCGGCTACGTCGATGGAGAGGAGTCCTTCTCTTGATC
ACCAAGTCTTGTGGAATCTTCCTCGTATATGTCATGGGCT