Map Locations of contig_57567 (13016 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_57567

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70194 6 1780 bp MLOC_70194.5 Available Available LOC_Os09g13870.3, FRAME:+1, EVALUE:5e-172, 13109.m01279 protein lipid phosphatase protein, putative, expressed
MLOC_70195 1 412 bp MLOC_70195.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70194






CDS Structure of MLOC_70195






Contig Sequence (13016 bp)

>contig_57567 13016 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGATCCGGAAGGGATTAGTGGGGGGAATCAAATATCTCTTCGTGGAAGTGTAGATTGAG
GCCTTCTCCTCCAAACCCTAGAAAATAAATAAGAATCATTGGCCAGGGAAGGAGACACAT
GCAAGAGAGATCTTGGGGGGCAACAATGAAGCTTTGGGGGAAAAAGGTATGTCTCCACGG
GGAAGAAGACCCACTTATATAGTGGAGGAGAAATCCGACCGTTTTTTGCCCACAAATCAT
GAAGGAGCGGTAGTACCGCTTGGGGGAGCGGTACTTCCGCTTGCACGACAGAAACAGGTC
GGGCATCCAATAGACTGGAGACAGGGAGGAGCAGAAGTTCCGCTGGAGCGGTACTACCGC
TCCAACCAGCGGTACTACCGCCACTTAGAAAACAGGGGATGTAGAGCGGAAGTAGCGCTC
ACGGTGTTACTTCCGCTACCAACTTTCGCTCAAAAAATAATTTCTAAGCAGAACCGAAAA
ACCGAAAACATAAGCGGAAGTGAGGCCAGGATTAGGGAGCGGCAGTACCGCCTAAGCGGT
AGTACCGCTAAACTCCAGGGGTACTTCCACCCAAGCGGTAGTACCGCTCCACTCCGAGCG
GTACTTCCGCTTACCAAAGATCAAGAGGACAACTCCAAAGTGCTGAGGAGGAAAGGTGGT
GACGAATGTGTACGTGAGTGATTCTCCCAACCTTTCCAAACGTGGACCCCTCTTGATAGT
ATGAATTATCCTATGACTCAAGCCCACCAACTCTAAATCATATGAAGTACTCCGTCTTCT
CGTTTAACATCCGAGGGAAAGAATAACCGTCTCGTGCCACCTGATAACCTGTGAAAGCTT
AAAGCACACGATTAGTCCGCAAATGTGTTGTCATCAACCAACAGAACTACTTAGGGAAGA
TTATGCTCTTACATCATGTCTATGGTTAGAAAACCTTAACCATCTTCAATCAACGAGCTA
GTCTAGTAGAGGCCCACTATGGACAAAGTGTTGTTTAAGTATCCACACATGTATCTAAGT
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CCCTAGTGCGATGAACGAGAAGAGAACCGACATTCAAGTTGCCGCTTCGCGAGCCTAGGC
GCCCGCTACTATTTGAAGGTCCCCGACCACGACACAAATTGCACCACCTCCAGGTCCCAT
CTCCATTCGTCTGAGCCACCATCACACCCTTCTTTCTTCTTCGACCTTTGAGACCAATGC
TTGAGACCCGCCGTGAGTGGTGGAAGACCCTCTCACCGTGGCGTCACAACAAAATCACGA
CCGAGGTGGACGCACGGCGTCAACGGTGCGCGAACCGCATTACGACGGGAGATCCCTACA
AGAAGCAGAGGTGTGCACGACGCACGAACCACTTGGATGTGGAAGACGTCGAAGGAGGAG
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TCCAACCTGAGGCTCCTTGGGCACCACTGCTGTGCGGAGGTCCAGATCGCCGAGAAGAAG
AAGAACAAGCGAAACATTGTAACGGGCGCTTTGCGATTCCCTGGGCAGCGCCTCCGCCAT
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GTTGAATCGTCTACCTCACCTTCATCGACATCTGGCTCTGAAGCAGGACGTGGGACACAA
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TCCGCAATGTTAGAAAATGTCATCCACCTATGCCTACTCCTTCATTCAATTTTTTACAGG
TACATAGCCCTATACCTTCACCTTCGTAGATGACCCTGTTTTGTTGGCTATGTTTATTTA
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ATTCAAGAGTCGCTCTTTAAGTTTTTACCGATACAGTTTATAAAAGAAATATGATAAAAA
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AAAAACCAACATAAAAAATACAAATAGATATAGAGTATCGTTAAAGAAAATACAATACCA
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GTTGGTTATGTGTGTCTTACGCTTTTCTTTTTCCCGACGTGAATCGGAAGAGGAAAGATA
ATAGACTCAAAATGGCTTCTCTTTTTCCCGAAGAAGAGAAGATAATAAAGTCCTGTTTGG
TTTCAAATAAGTCACCAACTTATAAGTTGAAAAGTGCAAAAAGTGACTTATTTTACCAAA
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ATAAATCAGATGACAACCAAACAGACGTGGCTTATAAATCACCTCACTTATTGAAACCAA
ACAGGCCTTAATACGTTCAAAATGGCTAAGACCTGCGGCTGTGGTCGTTCTCGCATGGCG
GCACGCACCCCATAGCAGCAGTCAACAAAGGTTGTCGCCTCGAGTATCTGGACGCCTCAA
CTCTCAAGCGTTTGGCTGTCCCCACAGCGCCCACCACAACGCTACCAGACGGTTTCATGT
AGAGCAGGAGTAGATTCAAAATCATTTGAAAGCAAAATTCCCCACTCCACTTTTTTTTTG
TTTCCTCTAAAGGACAAAGCAACCAATAATAATCCCCTCAGTCCCTCACCAACCCTCGTC
TCTTCTTCTTTCCCAGCCCCGCAATCCATCCGTCGCGCGCCCAACCGTCGCCGGCGGCGC
GGAGCACCGTCTTCTCCCCGGCATCCTCCAGGGCGGAGCGCTGGAGATCCGACTCCGCTC
GACTCCTTCTCGCGTCGGTAAGGAACGCCATCTTGATTGCTGGATGAGTTTGGATATATT
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ACCCACCCGAATCTCCTCCTTCTTTTCTTTTCCTTCTAATAAATTTCTCCCTCGCTGCGG
GCGCCGCTGCTTCAGCAATCTTAGTCCACCTGCTCCATGGTTTTGGTTAGGTTCTTACTG
TTCAGAGCGCACTATCGGTCCCTGCTAACCGCGTCGAACAAGATTTGGTGCGAAAAATAT
TGGTACGGCCGTCCGCCCCCCAGAGTCAAGTGGCAGTGGGCAAACAACTGCTCCACCGAC
GGACGATCTTTAAAGTGATACTACCAGCAACAGGTAGCTGCTCTAGGCCGTACCTATTCA
ATCTTTACTTCCAGTTGGCTTGAAAATTTCGACATCGAGCCAACCGTTTCCAGTGTTTAA
TGGTCAAGTGGTCGAATCAGCAGAAGGAGTTTTGGCTATTAGTTTCGAAGCTGGCCTGTT
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GAGGCTTCCACTGTTCTATTCAGCGATTGGCCCTGTTTTTTCGAGTTTCCGAGGTACATG
CAGTGTGTTGATTGTCTGGATAACTCAACAGTTTGTTTGGTTCATTCATGATTCAGTTTA
CTCCTTGGGTTTGTCAGTTTCAACTAGTTGGATTTTCACCATAAACTCGTTTAGTTGTTT
GGTCACAAGGAAAATTTCCAGGTTGTTCCGGTTTATTCGACCGCTTAGTACTTCAATCTT
TGCAGTGTTTCATGTATGGCGATGCTGACAGTCAGATCTTCACAAATTCTATTTACAATT
TTATCTCGTTACTTTATGGCTACTCCATAGTAAATTTGCATTCTTAAATCTTTTCTCAAG
TGATGGAAGAAATAAAGCCAAAATTTACATTGATAGCAGAACACTGATGCTGGCTGTACC
ATCATTGTTATGTTCAAACCTTTGTGATTGCATATGAATATTCCAGCTCTGCTTAGGAAC
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GCATTTATCCTTCCTATAGCCCTATCATATTTTTATATATCATGCAGGCCCATGTAATTG
CTTTTCTATTCTTTTGTGATGCTATTTGAGTTCGTAACTAGGGAATTATCACCTACTCCC
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GATGGAGGGAGTATTTAGGAACCAGTTACAGAAAGAGAATTGTGAAATAATGAATACACC
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TTAAGTTTTGTAGATTCTTTGACACAATTGCAGTACTTAACTGAGCTTAGCGTATGACTT
GAAATTTTATTTAAAATTTTATTTTCTGCTGCGTTCCTTACTGATTAGAAGAATCAAGAG
TAAATTTATATGTCAAACACTATCATTGCTTGAAGTTTGTTTAATTTTTGCATGCTTGAT
TAGTTGCTATGGGATTTGATAATTTGTATAGAACAGGCTTTCATCCTGTTTTACAGAGAA
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TGAGGAGTGCACTACTGGATGACGCCAACTTGTCGCTGTGCAAAAGCACATGAGTTGCAG
AGCCACAACAAGAAGCACTAGAAGGAGTCGACCACAAGCGAATCCACATCCCCTGGATAA
AATCATTGGACTACAACGCAACACTACACCGAACTTGCTCTAGACAGAGGAGTGTGACCC
TGCCAACGAGCAGAAGGGATTGAGATGTACCGCCCCGACCAAACCCACAGTTAACCCACT
GGTTCCTAGACGTTGTGCTTGACTACCTCCTAGGATCTAGACTGGCCCCACAGATCAACA
CTAGTCTTTTCTGCGCACGTTGCCCTCACTCGTGCACACTCAGAATCAACGTCCTAGTCG
GTTATCCATCTTCAAATTGCTCCAAGCGAAGCATGCTTAACTTTGAGGTTCCTTTCGTAT
GGGTTCCCAGATAAGAAGGTGCACCTTGTTGATATGAGTAGTCCATCATTTCTATTAAGC
CGGGGTGTCACATACACCTACACTCAAAAGGAATTGACGTTCACGTCTGCCCAATAGAAA
TGATTCCCCTTGGCACCACATGCCATGATGGGCCACACGTGCCATGCGCCACATGCCCAC
ACACCTAACCCGCACACGCCCGTGTAACTGTGAGGGTCGGCTCTGATACCAATTGTATCG
CCCTGGCCAAACCCATTGATTCCTTGCCATTACACCTGGCTACCACCTAGGATCTAGACT
ACCACCTAGGATCTAGTCTCGCTCCACAAACCAACCGATATCAACTTCCTAGTCGGTCAC
CCATCCTCAAGTTCCTCCAAGCCAAGTACACGTAACTTCTAGGTTCCTTCGTATGGGTTC
CCGGAAAAGAAGGCGCACCTTGTTGATACGAGTAGTCTATTATTCCTATTAAGCCGGGAT
GCCACATGGGACAACCGCCGATGTAGTACCATGCAGAAGAGAGGGGCCAATGGAGCCACC
ATCATCTCAAACCGAAGATGCTCTCAGTCACCATCCATGCCTGCCGAAGAAGCCATCGCA
CCACACCCAGAAGGGAATTGAGATATCTAGCGTCACGCCTGGAGGGGTAACATTGCGTCA
CGCCTTCGCTGCTGAGTCCAACAGGATGGACATGGGTTGTCACCCAGGACTTTGGAAGGG
GATGGAAGAACTGCGATGACGCCCCCAAGAGGGATACAACATCCAAAGGCCTAGCTGTCA
CCGGCATATCTGTGGCGACCTCGCTAGGACTACCCAGTGCCCACATTGCGAAGGAAAGCA
GCCAACACCGTGGCCACCAGGAGCAGTCCGCGCCGCCTGCCTTCGAGGGCCGTCACAATG
GTTTCTGGCCCTGCAAGAGGGGCGTGCCAGGAGGGAACCTCACCGTCACTGCCACCTTAG
AGCCACACAACCCAGCCTTTTGAGTTGTTCTTGAGAGGCCGGGGTGATTGTTTGGGTCAC
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GGAACTTGGTAATTATGTTGGTTGCCCAGACTTGTTATGTTATCAGCTCCCCAGATTCCT
GGACTAGGATCAGCATTTTCTAATAATCACCTGTATTGGAGGTCGATCGATGTCCCAAGC
CTCTATCAACATTCAACTCTTGTTTTGTTGTCTTTTCAAATGATCACAATGGGAGGGATG
CAACTTTATTGTTTATTGTTTGGTTGGCTGCAACAGGTTGGACGTTCCTGGTATTTAGTT
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TTCCATAAGTTGGATCTTTAATTGTTTGCTAGTGAGCATCAATATTTGTAGGCCAGTTGT
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TATAATGGCCTTCTGAAGTGGTTCTGTGTTAGGAACTTGACTTGGTCTCCATGCTTCCTA
GGGTAGAACCTTTGGGCTGTGATGTTTACCACGAGAACAACTTTTTATCTACTGGGGTTT
GTAGTTATAGCCTGCATATTTTGCACAGGTGATAAATCATGTTGATAATGGATTTCTCAT
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CTTTGGGCTGCCATGTTTTTCATTTGACATTCCTTAATCACTGGGTTGATGCGTAAAATA
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ATAAATATACCATTTTCCAATCAAGCACGCAAGTTATTTGGAATTGTAGGAGCACTAAGG
AAATAAAAGGATAGAAAATTATCTACAAAAGCAAGTCAAGCAGAGTAACACTGTCTTCAT
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TTTTGTCTTTTACTTCATGAATCATAGCTGCATTAAATCCAGTCTATCTTGTAATTATTG
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GATATCCAGTTAGGATGTTACACTATAAAGTCCCATGGAGCCAAAGTAGCAAGACTCCAC
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GGCAATACTGTGCCCTTTTGGGCTGTTCCGGTGTGTTCTCGTGCTGCTAATTTCGGACTT
CTTTTTTCCACCGCTTACATCATTTTGTGTGCCATTGAAAAGATAGTTCCAATTTTGTAA
CTCACCTGATTTGCAGCTCATTGGAATTGTCTTACCATGTGTCATCTTTGGTGGAATTTA
CTTCAAGAAGAAGAATATCTATGATTTGCACCATGGCATACTGGGTATTTCAATATTCTT
GGGCATATGAATATGTTTATGTTGTATGTACAAAATAATAATTCTAAACACATATTTTTG
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AAGAAGGTCACAAGAGCTTCCCAAGTGGACATTCATCATGTAAGTGATGACATGAATACT
TAATAATACCTTATGTTTCCTTTGATAATATTGGTGTCAGGCATTTGTTGGCCAGCTATG
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TGATAATCGACAGCCTGGTGCATTGGCCACTTTGCTGCGATGTGGCAGTGAACCAGGAAG
TGGCAGGCTTGAAAGTGCAGTGGCGTGCCGCCTTCCAGTTTAGATGCTTGGTTGCTGCTT
GGTGTAGGATTAGTTGTGTGATAAGTGGTTCTGGAACTACTCCACGGCATAAAAACGTTG
GGTTTGTCATGCCTGCCATTTTGTGGACGTATATGTATATCTTATAATGGTCATGTGTTT
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ATTTAGGCTATTTCAATATCAAAATTGGGTACAAGTCTCAGTCTTTCATTAGGCAGATCT
AGCATCTATGGTAGTGTTGTTACAATTCCGTCAAATAGGTTGTCCACTAACTGTGTTTTC
TTTCACCTTGTGTTTATCTATTCTAGGGTCTTTTGCCGGCCTAGGCTTCCTTACGTGGTA
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TGTTCTGCCTCTACTTACTGCTGCGCTTGTTGCCGTTTCTCGAGTGGATGACTACTGGCA
TCACTGGCAAGATGTATTTGCAGGAGCTATTATAGGTTTGCCATTTTCATAGTTCTTCAA
ATTCACATAGCTGACCTTCTATATTGTTCTAACTGCACATACTTATTTTCTTGTCATTTT
GTTCCCTATTCCCTTTGCAGGTCTCACAGTGGCTTCATTTTGTTACCTGCAATTTTTCCC
ATATCCTTATGATACAGATGGTGCCTCCTTCTACTCTTTCTACCTACCGAGTTTTGTGTT
CCTCCGTGTTTTTCAGCGACAACAGTAACAATTTCCGTTGCAGGACTGTGGCCTCACGCA
TATACCCTTCAGCTAGCCGAGGCACGCAACAGTGGCATTGCAAACTCCTTCAGCGTGCGA
CCACCCACGGAGACCGAAGAAGGGGAAGGTCAGGGCGGGATCGCCCTAAGAGACACCAGT
CCTATTCTTGACACCATGGAGTCTGGCAGGAGATACGGAAACTAGGAGGACCGGGATCAG
ACGACTACCCTAAGTACCATGATCGTCCTGACCTTCTTCGTGGGCTTGTTTTCGACAAGC
ATAGCAGGGGAGAGCTGCTTTCTCACGCACAGTTTGGTGTATTATAGAGCTTGACGTTTC
GTCAACCTCTATGGGTTTTTCAGTGTTTATTAGAGGTTTGGTTTATGTTGTGTTAACTGG
ATAGTTAGCCTTGTAAGGATCAGCTGTACATTACCTAGTGGAGTGCTTCGTCGTCCATGG
CGGTGAACATGTTGCATTATTTCTTGCTCTCTCTGCCCCGAGCCCCTGAGCGATGGTTCA
TATTCTTGCTCTTGAGCTTGAACTATGTAGGTTTGGTTGTCTACACACACAGTGAAGCCA
GAAGCAAAGGCTTGCTAGCTGCTAAGCTGGTCGGACCGGGACTGTAATGGATTAGCCCAT
TGCAAAGCTGTAACCGGGTAATGTTCCTTGTTCTTCTTAAGAAGTAGGGCCTGGAACCAT
ATTCAGTTCACATGGATGGTATTGTATTCAACTCGAGTGCTGCCTTTTTTCATATTTTGA
TTTTGAGGGAACCTGAGGGGATTTCTTCCTACGGTGTTTTTTATAAATTTTTGGTCAGCC
CAAGTCGCCTGGCCAAGCACTTGGGAGTTTCGTGCTTTGAGTGACGAGAGAATGTGATGC
GGCCTTCGTATTATCTTGCATTAATCTTTGATTTCGGCATCCATATATAGCGACTAGACT
AGAGAGAGCAATTGTCATCACACATACAATCATACGGGGAGGATGGGGAACACAGCTGGC
AGGCTGTCCTGCATCGGCGTGTCCTGCGATTTCCGGCTCAGCTGCTGCGGCAAGAAGCTT
CCTAGCCGTTCTCGGGTGCTGGAGCCGGTGCCGGCGCCGGGGCTGGCTGGCAGCTATCCA
CCGGCGCCGGGGCTGGCTGTCAGCTACCCACCGGCGCCGCCTGCTCCTGTCCCTCCTCAT
CCTGCTCCATGTCCAGGGTGTGCCAACGTGCACGGCCAGGGCAAGTAGTTAACAGGAATA
TGCGCATATCGCGTCGCGGTGGAACGGAAGACTCTCTGTCTTTTGTTGTTTGTGTGGCAT
ATGCTTTTCTGGTGTAAAGTTGTTTCTCTTGCTTGTTTGTAATTGTAATGTACTCCGATC
AGTTCATCAGGTATTGCCCCTACATTTGATAAATAACTAGCAAATATGTCCGTGCGTTGC
AAACGGGAGACGAAATATTACGCTCTAACCAAATAAGTATGGCTCAATACCTTGATGTAT
GAGCGTCCTTTATTTTTTTTTAATTTTAACACAGTGGTTCATCATGTTGACACTTCTTTA
TTTTTTTCCACCCTCTTTATTGATATCCGGCGTGTCCATGTAATTACAATGGATTTGACG
TGGTAAATCTCAAGACTATGAGCCAGCCACTGCATGCCACACTTGTTATTGTGTAGCAAA
ATGAGATTTTTAAAACTTTAACAACTAATCTCGTTGATCACATACTACTTCCAACCCCTA
GGCATATAAACACTTCTCAAAAACTAAGTAAAAGCTAAACCTAGAAGACTTAACCGCTCA
AATTCTAAAGCTATTTAGATCATTCTTATGAGGAACTACTAAAATAGACCACATGACAGT
ATGAAAATAATAANNNNTATTAGCACAATTTCAAACAATATGAAAATCAATATTAAATCA
CTGGTACATAAACCTCATATCAACAGTTTAGTGTCCATCGCTTTTGCGAAATGAACCTCT
TTTGCCTGGTTTTTATTTTTTATTATCTTACGTTTTTATCTTTTCTTTTCGGTTTCACAT
TTTCTCTTAGTTTTTCTATTTACTTTTTTATTTATTTCTTTTTCATTTTCCTATTCATAT
TTGAAATAATGAACATTATTAGAAATCGTAAACATTTTTTAAATTCATGATTTTTTTACA
AAGTCCTAATTTTCTGAATAACAAACATTGTATGATTTCATGAACATTTTTTTAGAACTC
ACAACTTTTAAAATTTGGATTTTTGGGAAATTACTAAATAATAAGATAGGAAAAATAAAA
AAATTAATGAGAAAAGAAAAGGCATAAAAGTAAAGATAGAAACATGGGCCAGCCATGAAA
ACGTACTGGAAGGAGGATGTGCATGCTAGCTGTAATAAAAATAAAAAAGGAAGACTTAAA
AAAGCGGCAGGAACGAGGGTATGCCCTCTAGCAGCATGGGGCTTCAATCACTACGCTACA
CATGCATTAGGAACAATTTCGTGCTTAAACTTATAAGAACGAAACCCCATGACAAGAAAA
TATGAATCGTTTTCTTAACTTCTGGATGGCATAGTGGGTAATTTAGGACAACTTTAGGGG
TAAAAACTATGACGTACGGCAGAAGCAATAGATGCTTTATTAGTAGGTATATATTTGCAA
GTGTCATCCGCAACCAAATTTTTACTCCACTTGGAGAATTGCATGGCTGATATATATCTA
AACATGATTTTATACATTTGGCTCAGACCGTGTGTGTGTGTGTGCAATCTTGTTCTAGAA
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CTTTTATCTTGGAAAGGAGCCATCCAATCCAAGGTACACATACCACTATGTTACTCTTAT
GTTATATAGTGATCATAAAGGCACAATTACAAACTTGATGTTTAACATTGACGACCTGGA
CTATCACACCTACAAATTTGTTGTCTTAGAGCATCTCTAGCAGATCCCGCATTTCTGCTA
AAACTGTAAAATAACCGTCGTTTTGCTGTTTCGGGCCAAAAACGCACGCACACCAGATCC
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CTGTCAAAATCACGTTTTGCGCAGTCGACCCGGCGATGACCTCTATTCTAGATCGATTTG
GCGGGAGGGACATTTCACCGCGACAGTTCACCTCTTCCCCCGCCGCCAAGGATCTT