Map Locations of contig_5743 (8806 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_5743

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_70096 8 1932 bp AK357295 Available Available None
MLOC_70097 1 734 bp AK365157 Available Available None





CDS Structure of MLOC_70096






CDS Structure of MLOC_70097






Contig Sequence (8806 bp)

>contig_5743 8806 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTCAAATCCTTGTGCATTAGTTTTGCAAATATAATAATCATCATGAGGCTTACACAACG
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TTATGATTCTTAAATCAGGTTTAAACAACATTAACAAAACAAAGTTGCTTCAGTAATTAT
ACATTTATCATGCATTGATAGACCTCACCTAGTAAAACATAGGCCACTCTTGGAAATTAT
CCCTATGATTTGGTTGGCACTAAATAGTCCTAGTACATGCCTAACAGATAAGGTTGGCAC
TGTTTATGTTTCTTAAATAGTGCTAGTCCATGCCTAACTGTCCATATAAACTGCAAGTCC
TTGGCAATTTTAATGTCTTTTGGTTAATGGCAGTTAAGATAGCATATAGTGCTACTGGGT
GGTGGATGTTCCATCCATGTGGTACTAACCTAATGAGCTATTGACTGCATACTGTAATAA
GGTTGGCATACCTAAACCTAACAGAACAAACATCTAGGGTTTTTTTAATGACCTGTTCAG
AAGATACATCACACACATGACATGAGTCGAATCATATTAATAGTCCATGCACAGTTCATA
AGTAGTACTCTCCAACAATCAATTCAGAAACCCTAAAAGCGCTGCGCGAGCACAGGAAAA
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TCCTTGAGGATCCTCTTGGACGCCATGGGATCAAACCCTAACCCGCGAAATCCGGCACAG
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