| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_5737
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_70060 |
6 |
6661 bp |
AK364313 |
Available |
Available |
None |
| MLOC_70059 |
4 |
2342 bp |
MLOC_70059.2 |
Available |
Available |
LOC_Os12g36920.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-146, 13112.m03787 protein calmodulin binding protein, putative, expressed |
| MLOC_70058 |
1 |
2326 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os07g31620.1, FRAME:+2, EVALUE:8e-22, 13107.m03202 protein transposon protein, putative, Pong sub-class |
CDS Structure of MLOC_70060
CDS Structure of MLOC_70059
CDS Structure of MLOC_70058
Contig Sequence (12908 bp)
>contig_5737 12908 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCACGTCGGACCTGATAGCATAACCCCACCGCAAATTGCACCAAATCCACCCTACG
GAACTGCCGGATCCATTTTCTCTTTCCTCTCTTCTTCCTCCTCCGCGTCGTCCGTCTCGC
AGCTCCATCGTCACATGAGCTCCATCGTCGTTCCTAGCCTCTGCCCCGTTAGCTCTGGAA
GAGCAGTCTTTTGTGTCGTCCTCACCGCGGAGGACGTCGTCGGCGGCCCAGAAGACACTG
CGGTACGTCCCGCAACTCTCTGGCTCCGCCTTGCGGTGGATGTGTTCGACACAATGTCTG
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CGGTATTAACATTTTTTATTTACATGCGACATTGGTTTGTGTGATCGATGTACATGATTT
TGCATGGATTTGAAAGCCCAGATATCAGATATGTGGATGCGGGGAGCGAAATATGAGAAG
CCGTCCAAATGCATCCATGAACGTGCCCTGACGCGTCCGTGGACGTATAGGGGGGACGGA
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TGAGTTGGGGGCATAAACGAGTAAATACCATAAAACTACTACAATTCAGGCTATGGTTCC
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GAAAAAGCAATCGGGTCCTTGTGAGGAGGCGCACCCGCCGCAGCTAGGAGCTCGATCCCG
AGCGCCCTGCCTCACTTGTGTCGGCCGCCGCGCCCTGCCTCGCTTGTGACCGCCGCCTCG
CCTACACCGTCCGTCGCGCCTTGCCTCTCCTGCATCGCCCGCCATGCCCTGCCTCCCCTG
CGTCCGTCGTCGTGCCCTGCATCCCCTACCGACCCCTGCGACCGCTCCCATCCACGTTGG
CGAGCACCTCCCACGACCATGGAAAGGCTAAGGAGGGAAGGGGGAGGATTGTCCGCGGCT
CGTGGGACACGATGGAGAGGAGAGAAGAGAAGAGACTGGGAGGAAGAAGAAGAGAAAAGG
AAGAGGAATCTAACTTGTGGGGCCCCATGTTAGTTAACAGTTAAACACACGATCAAATAG
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TAAAGAGGTTTCATTAGTGGACTACTCCCTCCATCACCGTTTATAAGGCATGCACGTGTA
CCTAGGTCGTTAATTTTACTTATATAAAATATATTGTTTAACATAAAAATTATATCATTA
AAAAGTAGAACATCTAAAGCTTTTAATGATATATATTTTTAATATATATCTCTCTTGGTC
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GGATCTATATAAACATATTTTAAAATGTAGAATCATTCATTTTATTCCATATGTAGACTT
TAGTGAAATGTCTTAAAAGACTTATATTTAGGGACGTGTCAACAGAATTAAAAACTGATA
GTTTCTGGGAACCATAACCCGAATAGTAATAATAGTTTTATGCCACTTAACTCGGCATAA
ACCAAACAGCCCTACGTGTCGATGAACGAAACCAGATTCCTTGCATTTTCCGCCGCGTCG
TGGCGCGGGCGAGTGAAGTGGCAGACTCAACTGGCTCCGTCAGTCGTCGCCGTGCTCTCG
CCTATATAACCGGACCAGACACTGCAGGCGAGAGCAGCACCCGCCACATAATCCACTCTT
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GAAAAGGGCATGGCGCCCAAGAGGGAGCTGGCCTTGGCCAGCGCCCAGGGCTCGGCGAAG
CGCCTGCGCGTGGGGGTCCCTCGAGCTGCCTCCGCCGGCGGCAGCGAGCCAGCGTCGCCG
GGAAAGCGGCTGCTGCGGCAGACAGTGTTCGTCGTGCTCTTTCTTGTGCGAACGTATGTC
CCCTTCGCTCTTCGCTGGCTACCTGCTCTTGTCTGAGCTCTGTTTCTTGATCTTTTTTTT
TTTAATTTCTTCTGTCCCCGCCAATTTATGGGTGTGGCCGTGTGGATGTGTGTGTGTGTG
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ACACATCAAATATAGCTTTCGTTTTCTTTATTTACATGTTTTTGCTTGAAATTTACAACC
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GAAAAAGGCTTTCGCTACTTTATATATAAAGCAAAGTCCTTCTAACCATTCAATAACAGG
TTGATTCGCCTATTATTTTTATTTATTTTTTAAAATTTTACTTTTGGTTTACTAAAGTGA
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ATAAATATAATAATCAATGGACCAGATTCACGATGTGTATACAACATGATGCACTCTCTT
TTCCGGCCAAATAAGTTTTTGCGCATACTGTTAGTACATATTGACTGCATTTTCTATATA
CACTTTCAGCACCTTTAAGGTATAGTTCTTTTTTTTTTAGATTAGTTCTTGGTTTTGCAT
GAATAATTCTTTGTACAAAATAATGTATTTGCTTGCATTTTATGTATTCATATAGTTTGA
CTTATTTGGCTATCTCCCCCTTATTCTGTTCCTGTTGTGGCTGATAATGTACTCCCATAT
AGGTTCAGAAACTTCACAAGGTTCAGATTCTTATCATGAGGTAAGAATATTTTCCATATT
CTAATATGGTATTCTAGTTTTGTTCAATAAAATACAATCAGTGTTCTCATTATCTTCGAG
TAATGTGTTTATTTGCAGGGTCAAAACATCAGTTCCATTTTTCTCAAAACACGGGCAACA
TAATATGTAGTGTATAGGAACTTGTGCCAAAAAACACACAAGTGTTTCATGTACCCCGTG
CATTGATGGAGATTGTGCGACTCAATTCTTCTAAATAATGCAGCTGCACTAATAAGTAAT
TGGGTAGGCATAAACTGCTGGAGGGGTTGGGTGTGTATGTGTGTGGTGGGGTGGGGGTTC
ACCCGAGCTTCTTCAGGGGCCTATATTAGATCCACATGTAGGCAAGTGGTTTGCATATTT
GCTAGGAACATTTATACATCAAGGGCAGTAGGGCACTCCGCTCCTTTTCCCTGAATTTGC
ATTTCAAGATTTCGTGATATCTTCTGTGACATGTATTTAATGACAAAAGGAAATAATTGC
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ACCATTTGGATAATTAAAAGTGAATCTGAGGAAGGATGTGGGTAGTAATTCATTGGGTTT
AATTACAAATAGTTATACCATTTTTTATGTGATGATGTACTCATGAGTTCCATGAACCAT
CCGCATGTTCTTCTCTTAATGAAAATATGCAAGCTTTGCAAGTTTCATTATTTCGGAAGA
AAAAAAATGCTTACATGTGGTTCTGTCTTGTCTCTATGCTCTTTGGTCTTAGCAAATTGG
AAAGTTTACAGCAGCAGATGGAGGATATAAGCCATGAAGTGGTTAGATTCATATTACTCT
AAAATAATGTCTTAACATGGCCGTCCTTTTTTTTCTGGTATTTGTTGCTCACAGTTGTTT
TGTCGTGTAAAAACTGCAGAAGAAATTGGCTTGTTTGCGTTCCGACCAACATGCTGATCA
ACACCCAAGGTAGGATGATCTGTAGTCGCGCCGGGTCCGCTGTTTGTTCCTTCATTTTTA
ATCTCGTCTTGAAATATTTAATATTTCCCCGTTGTCAAGATGCCATTTATGTAGTAGTTC
ACAATACCCATCTGATGGTCCCTTAATGGAACAAAGTAGTATGTGAATGTTAAATTCAGA
AAATGTCAATCCAATAATTATCACAATGCCGTTCATGTTTCTGCTTCAGATCAGAGTCAT
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GCCTGAAGACTCCAGTTTACACAGATAAGAACATAACATCTGAGAGCAATGCGGCTATCA
GGATTGGCATCTTTAATGGTGATAACATGGTCAAGGAAGGGCCGCTTTCGAAACTGAAAA
TTGAGATCCTGGTTCTCCGTGGCGACTTCTGCAACGATTGCCGGGGAAACTGGACCGGAG
AGGAGTTCAATAGCCAAATCGTGCAAGGTCGGGACGGACACGGGTTTGTGTTAGGGGGCG
ATTGCAGTGTATGGCTGAACAATGGAGAGGCCTCCTTCGGCAGGATTCGTTTCAAAGAAG
GATCATCCAGGACTCGCAGTAGGAAGTTCGTCGTGGGAGCAAGAGTTTGTACGAGTGAAA
AGACTGGTGTTCGAGTCCAAGAAGCTGTCATGAAGCCAGTCACGGTGCTGGATCGCAGGA
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CAGGTTCTGTGTTTTTGTTTCTTAATCTTTTATTTGCTTCAGCAAACGAGAAGAGGTACC
CTCCAAAACCGAATGATGAAGTGTATCGTCTAGAAGAAATCGCCAACGATGGAACTTACC
ACAACAGGCTTAAAAATGCTAAAATCTACACAGTGGAAGACTTCTTGAAGGCTTTGAATA
AGGACGCAGATGACCTCCGTGCAAGGGTAAAAATACTTGGCCCGGAACTACTTCTCTCTT
TCTATACTTGTAATATTTTTACCGCGATGCTTAATATTGCTGCAAATTCTTGACATGCAG
ATTCTTCTGATAAAGAAGGTGAACAACTCTTGGGAAAAAATGGTTAAGCATGCTAAGGGA
TGCTGTCTCACAAACATACATGATAGGATCAATGGCAGTCTTCGTCAACAAGTTCCATTT
GACTATGCGATGAATGACAATCTTCCTGAACAAGGTCTTTCTAGCACACATTCTTCTCCG
GATGCAGTCAGTCTTGAGCCGGATGAGGCACTTCAAGGTTAGTTAGATACTACCTCCGTC
CCAAATTATAAGACGTTTTTTTGGCTATTTTAGCCTACCAAAACGTCTTACAGTTTTGAA
CAGAGCAAGCACTTGCTATATTACCCTTACTACTATGTTTTTATCCTTTTTGCAATGGCC
TCAACTCCCGAGCATGAATCTGCCGTTTCAAGGAACCACAGCAAACGGAAACCAGTTTCA
GGATAGGATCGACCATGTCAATGAACCATCTCACCACCATGAGTATGTCCAAGATGATCA
GAACACAGTTAAGCAAAATTATTACCAAGGTAGTTGTTGCTTCTTGTTCTCCTCTGTGCC
TTTTGTATGGAAATCCTTGCTATGCTCATACTTGCCAACTTTCAAGTAGGTCGAGCCTAT
CCAGAAAATGGCAATCTTCCTGAACAAGTTCGGTTTAACTATGTGATGAATGCCAATCCT
CCTGAACAAGCTCCCTCTAGCACACACTCCTCTCTGGATGCGGTCATGCTTAAGCCAGAT
GAGGTACTTCAAGGTAAGTTACATATACGTTACCTTACCCTTACTGCACTCTCGTCTTTC
TGCGATGGCCTCAACTCTTGAGCTTGAATCTGTCGTTTCAAGGAACCACAGCGGATGAAA
ACCGGTTTCAATATGTCACTGAACCATCTCACCCCAGTGAGCATGTTCATGGTGATCAGA
ATGCAGTTAACACACATTATTACCAAGGTAGTTGTTGCTTCTTTGTACCCCTCTTATCTC
TTCATTCCTTTTGCTTTATGTATGGAACTCCTTGCAATTTCGGTGACTTGGATATGCTCA
TACGTGGACTTTTTTTTTCAGGTGTTCCACCCCTTGGCCAGCAGCAACCTAAAATATTCA
TGGCACCTTCACAGTTGGATGGTGAACTTCTGTGGATCTTAGAAGGTGAGCAACCGGTTT
CTGCACCAACTTATCAACAGCGAAACTGAACATACCTGATCTCACATTTTCCTCCGCTTC
CAGGATCAGTTCAAGCGAACATCCATACGCAGATGGAAGTTCCCATGTCCATGGATAGCG
GCAACGGCATGGAGGCATCAACCTTTGTTCAACACAATCTTCTGCCGCAACAATTTATGC
CTACTCAGTTCCAAGAAAACATGCCTGTGATCCATAGCTCTGAGAATCCACTTAACCATG
TCTCTGGACCATCGATATGGCACAATGATCCTATCACCGAACCGGAGCCTAGTGTTTATC
CATATCCTGGACTGGATCATGGAAACTTTTAGCAGGCAGGCAGATTCTGCAATGCAGTTT
AGGTCATGTAACATCATGGTTTTGTCATTATAACTTAGGTATCAAGCATTGTAGACCGTA
TGTTTGGACACAAAGTGCTTTGCCCCCATTCTTCATATTTGTTGTTCTAGACGTTGTACA
ATGATGTTGTGTAGGATCTGAGGTTGTGCTGCAACTCGGGCAAAACATTTTGTTGTCTGC
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CAGAACATATCTCTTAGCTTAGGTACATTTCTGGTACATGACTACATGATGGAAACTGCT
TCGGCCACAAGCAGATTCTTGAACTGCACACACATAGGGTGATATCCATCTGGAGCAATA
ACACCATAGTTCCACTCATAAAACGGATGGCCTTAGGTATCTCAGGAAAACGTTCAGGGA
TAATCAAGTTTCAGAACACAATACCTGACGGTGTGCAACGACACTACTCAGAAGCTCCAG
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CTTCATACCAAATCACATAGCAGCTATATCACGGTGATAAACGAGAAGAGGGGCAAATTA
TGGCACCGCATTTTTTTCTTTGAGAGAGCATGCAAATTGCGTGCCTTAGCTTTATAGAAG
GCAGAGGGTAAAAATACAAGAACACAGGCAAGCTCCCACCACAGATCGGTGGAAGCAGGC
TATGGCACTGCATTCATGGGAGAGCAATTAACAGGCAAGCATAAAGGCGTAATGAATAAG
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AACGCCTATGTAGAACGGGTGATCTTGTAGCTCTACAATCTGATCGTAAGTGGAAGCAGG
TTCAGGCTTGAAAGGGAAAAAAATCAAGATGATGATGAAATGGGATGTTTGCTTGGTACC
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GGAACAAAGCTAGGATTGACCTATTTAAACAGAAGAAAGTTTGATCACTTCCAAGGAGCA
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TTTGCATTAATGTCCATGTTAGAAGGTGCAACAAGATTGTGACAGAGTAGTATATATGCA
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AAACATATCTGTCAACAAACAAAGGATACAACACCCTTACAGTTTCGATGTCAGACAATC
TGGTTTGCGGAAGAACGTTCGACGGCAACCCAACCTCATCGTGTTCCCCATGTGTGTTTT
TGATACCTTTACAGTGAATTATAAAAGCATCAAACAACATCGAGTCCTTGTCTTGCACAT
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GAACTCTTCACTGTCTGCATTTCCCAGACCCAAAACCTACACCAGTATTCATAAAAATCT
GGGTCTACAAAGATAACTTGATTGGCAAGTAATAAAAGGAAGCATACACACATGTCTGGA
CATCTCAATCACCGATATCTGCATTCCCAAACATATGCCAAGATATGGTACTTTATTCTC
ACGAGCATATTTTGCCGCCAATATCATACCAGATATTCCACGATCTCCAAATCCTCCAGG
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GCTTACATAACCACAGAGTAGGAACCAAAGACAATCAGCATACTAACCTTAAGAGTTTCC
CAAGCTTTAGCATGAGCATCTGGTGCCTGTACAAAAATAATGCCACAGTAATGTAGTCAA
ACGCACAACAAGAAAGCTAGCAAGCAAGCAAGGACACACACGAAATAATTGCTAATTTGA
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GGCATGTTGAGCTAGCAGCATACATCAATATCTATAACACTGAGATACTAATCGGCAGCA
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CAGGAGTTTAACGATGATAAGATCTTCTTGAGCTCACATGGCCACTCCGTTCAGTGTCCA
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AAGTGGGCTGCGAATTCGGCCCATTATCTCTATCGACTTGATTTGTCATCTTTTTTCGTA
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CCATCTATTTCTCGCAATTTAAAAAAAAAATTGCACCACAGGTTCCAGTGCGCCGAATGA
GTTTCTCTCCTGCTGTAGCACCCTTACAGCCTTCACACTTGTTGCAGCTAGTACTGTAGC
CAACCAATCATATGAAAAGCAAACTGTTAGTGGCTTACACTTGCTGCAGCCGCATCTTCA
AGATCTGAAGCTGAAACCCACTGGATAGAAGGTTTCTGTGAACATGCAACACTGGCATGT
AGGAGAGCCTGGAACAAAATGAGACGCATACATGAATCAAAAACAGTGTTTACATCTATA
ATAAATGAGACAACATTTATCATTAGCACAACATAGAAATGGGGAAGTCCAGCTGATTGC
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AATCCTAGTTATTGGAATCGTGTTCATCATTGGCAAGCTTAATTCAACTCTACATTAAAC
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CTTGACCCACCTTCACCACTGATAAGTAAGAATCTGACAGATTAGTGTACTTCCCAACCA
AAGCAATTTTAACCTGCATGGAATCCATATTCAGTAAATTTGATTTTGCAGCATGCAATC
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CGGCCATCAGCGTCCAATCTCGTAATTCAGGGGGGCCAGCAGACCTATAAGACCAAAACA
TGATTGCTTCAAGACATACTAATAATAATGCCATGTATGAAACTGGTAAGATATTACTAT
CTCAAATCACAAACTGCGCACTAATCATGAAAGAACAAGCATTCTTTAACATTCATTAAA
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ATATTTTTACCAAAAGTATACAGGTAATATGAAAATTGCAATGGTTCATACGTGCAAACT
TGAGCACATTTAACATTCATAAGCAATGGTTTTCAATAACCATTTGACTCACCTCGAAAG
GTTTAGTTGTTTGATTATAGCTTCATGAGCCTTTTGGTTCTGGAAAGCAGCACATAAAAA
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ATAGTCAATGCTAAGCTTTTAGTTTACGATTGAAACTCACCCTAAGAATAAGGGGAACAT
GCCATATATTTGGAACATCATGGATGTTAAGTATGTTCTCAACCTGCAAGAAATAATATA
GAATGTAAGTAGGGAAATATTGTGGACAAAATGGCCCTTTTCACATTCCTCGTTATGAAA
GCATACCGGTACATGACAAAATTGTGAAAGCTTCTCCTTCGCGGATCCTATTAGTGGCTG
AAAATTGAGATAAACATAGGAAAACCAAGCCAGATTAGAATGGATTCAGGAGAAGGACCC
GTTATGAAAGAAAAAGAAAGTCCAAATTCCTCGCACACATTTCAACTAGTGTTCGTGATA
TGGAGAGGCATCTTAACTGGGAAGATGACTTTGACACGATTAAAATCTATCAATGTGAGA
GATGACATATCTTAAAGCATATGATATTATTCTTCATGTTACCTGTGCTGATCGGCACGC
TAGAAGATCAGGAGTAAGACCCAAGGCCCTTAGTTCTCGTACACTGTGTTGTGTTGGCTT
AGTTTTCTAAAAAAAAAAGGCGACAAGAATATGAGGGTTCTATATTTGTGATTACTGATT
AGCTGTACTGACAGAAGACGACAATGCAAAAATATATAAAGATGAGTGGCATGTCCAAGT
ATGATGTGATTAGTATAATTCATGATGGGAGAAATATTTACTTGCTCACCAACTACACCC
AACACTGGAACAAGGCTCACATGTATGAGGCAGAAATTGTCCTTACCTACAAAATATATA
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AATATTGTCTGACTTTATAGCGTATATCACGTGAATTTATGGCCTGAGTTAGAGCAGAGG
TGTAGCTGTAATTGGTGGGAGGCCTTGGCACTACAAGGATGACCTCCATCAAGTGCCATG
ATCAACTGATCATGGTGATGATTAGATAGAAGAGGTGCGTAGGAGATAGGGCACATGAGG
CATGATGGACCGGCTAGAAAATAACTGAATGCAAAAAATACTAATAACTGCTTGACTGCC
CTTTATTATGCAATCAAATTACAACTGGGGAAAGAATCCAACTACCCGACCCATACTTCC
GTAATGCAGATTCCTTAATCTAAGCTTTCCTAATTCAAACTCTCCTTCTTGGCTCATCTT
CAATCCTATAGAGATGTATTTTAATGGAAAAGGAATCGGACTAATTGGTAGAGGCTAGGA
TTCTACCA
