Map Locations of contig_56998 (10521 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_56998

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69819 1 247 bp MLOC_69819.1 Available Available None
MLOC_69818 1 1489 bp MLOC_69818.1 Available Available LOC_Os03g22350.1, FRAME:+2, EVALUE:7e-170, 13103.m02686 protein Brix domain containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_69819






CDS Structure of MLOC_69818






Contig Sequence (10521 bp)

>contig_56998 10521 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACCAGTCGCAATGTTGTTCTGGTGATACTACCAGGCAGAATCATGACCATCGTTCACCA
ACATTGCAGATGAGAAGTCCTGATTCCATGATGCAGGAATAGGCGCTTGATGTGCGTTCT
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GGATGTACATCCGTCCATGGCCATCATCGACGTCGCGCACAGGGCGCCCATGGGCCTTGG
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AGGGTGGTCGGGCCGGGGCATCTCTCGCATGTTGCGACGCAAAGGGGAGGTTGGGGGAGG
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AGTATTAGGTAAAGAAGTTCATGTTTGATTTTTTTGAAATTCAAAAAATAATTCTGTTTT
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TAAGTTATGTTTTCAAGCCTGTGGTAATACTATGTTCTTTAATTGGTTGGCATGTGCCAT
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GTCAAACTTTGTTAATTATGTAGAAAAAAATTTAACATCTACAATACCAAATTAATACTA
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TTGTTTTCTATAAACTTGGTCTAATTTTCTAAAGTTTGACCTTGGACAAAGCTGATAGGC
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GAATACATGTAACCTACAAACGAGAATAATTTATATTATTAAAAACCTTGTCATTTCTAC
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TGGAAGCCATATGGGTAGCTGACCAAATAGACCATGCAAACTGGCATTCAAAGAATAAGT
GTTTTATTGTCTCTTCTTGGGGACAGAATACACATTTCGTATTGTCGTGCCAGTTTCGTT
TGACTAGGTTATCTTTAGTTAAAATGACCCCTTTCCGAAGGTACCGCACAAATATCTTTA
GTTCTAGTGGGACCTTCATGCGCCATTTTTTTGTTATTATTGACTAACACTTGAGCCTGT
GTTAGCGCCCTATACATGGAATCCACCGAGATTTTTCCATTCTCATATAGATTCTAACGA
AACTCATCGGTACCTTGTGACAGCTGAACCGTGGCCATGCGTCCCAACAAGGCATTCCAA
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TCTAGGAGGATGGTATTCCCTAACTACTTGTCCTCCTAGAATCTAATTTCTGAACCATCC
TTAATCTTAAATACGCCAAAGCGAAAGAAATGTTTCTTAGCCGCCATTAGGCCGGCCCAA
AAATGCGAGTCACCAGGTCTC