| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location |  |
No map location |
Predicted Genes from contig_56903
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_69751 |
3 |
1759 bp |
AK251305.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_69751
Contig Sequence (8041 bp)
>contig_56903 8041 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTCACGATCAAAGTCTTCAGCAGACGACCAATTTCTTCAACCGAAGATATNNNNNNTTA
GGGGTCGATATTCATCGTATAGTTCAAACTCCTCAGCGACTTATAGATCTTGTGTACACT
CATGAACATGTTAGATACTTAACCTATAAGTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCA
CTAGATGCACTTACACTTCTCCCACACATTTGCATCTCATTGCACTATTTTTATCACAGA
AGAGGGTACTGAGTACTAACCACTAGCTTATCGAGAGCTTTGATGTTGTACTAAAATACC
TAACTGCTCAAATCGCTACACAAATAGCACACTGATTCCGTTTGGATTCTTGAGTTCTCA
TTGTCTTTAAAAGAGAAATTTTCGATTCTTAAAGATGATCTTTTGCATTGGCAGTTGCAG
GACACATATATATTAGTAGTCAAGTAGTACAAGTTTGACCAATTTTCTTTTTTCCAACAT
ATTGTTGGTCCAGTTATCGGCCTCTCTATAAGATTTTTTTTCACCTGTCCTTTGCTACCA
GGTAATCTGGTTCAAGCTCTACTACTGTTTTATAGAAGGAAGTTGGAGGCGTCATTGGAA
GAGACCAACATGTTCTTCCAGGTATGAAAAGAAATCCGACTACATATTTCTTGGTCTGCC
ATCACATTTCTGTATCATTGTTTTTTATTGCATTGAATGACATGATTGACATCTATTTCA
AAATGTGCATATACTTCAGCAATTGATAGTATGTGTGTTATAATTTTGTTGATTAGTTAT
TATTCCTTATTGCCGTTGTGTTTCTTCCAAATTTGAACATGACATATTTTGATAAACTGT
ATTAGATGGCACTAACTAATCTTAGATGTGAGCACACATTTGCAACCTGCACAAAAAAAC
CAGTGGATCCTAGGTAAGTTTGACATGCCTTCTCATATTTTGAAGAAATGGATAAACCAT
GTTTGCTAATTTAAGCTATTTGGTATAGATTCATAGATTTTGACGACCTCGAATATCCTG
ATACATTCAGAATTTGTATCATATGTGTGAGGGTAGATGTCAAATTCCCGGTTAATCGAA
GTGATGATAACCTTCCCTTCATTCTTATGGACAAAACTGTAAGTCTCAAGCATGTTAGAT
TGCTAAAATAAACATATGGTTATCATCATATAACATTTCCTAAAACAATTCTAAGGGTGC
CAAAATCGAAGTTATAGTATCTGGAAAAGATTTAATGAATAGATTCAATCTTACATTGCA
CATGGGGAGGAATTACATCATTCATGGTGTTACTGTGCGGCCTAACTTTGAAGAACTAGA
GTGTAGATACATTCAACGCACATATGAGTGTTCCTTCAGTGCAAGGACATTTGTTGAGTC
CCTCTCACTTCAATTTCCAACGTATCCCAAGCATTTGATGTCATTCCAGGAAATTCAGAG
GTGTCCAAAGCAAACTTTCATAGGTATGCATTCAGGCATATAATAGTTACTAACACAAAG
ATAATCTTAGTACCTAAATTCGACTAATGATATTTGATACAAACATAGTTGGCATAGTCG
CTCATTATGATAGACATGAACTCATCGGGAGATACCCAGGTGCGGAATTATATAGAGAGG
TCACCTTCATAGATATTTGGTATGTGTAGTTGATATATAATAGTTCCAACTCTTCGATGC
CGAATTATATAAATTAATTCAAAACGTCGTTGACATGCTTACTATTTTTAAACATTCCAA
ATTGTAGGGGCAAACTTATGGTTGTTGGGGTTTGTAGTGGCAAATTGATTCAGAATTCAT
ATAGGTGTCAACAATCGAAGGCAACAAATCTGTTGTCTTTGCCACTATGCTTCGTAAGGA
TTGCAAATACGGTAATCTAGGCATCTATACCGATATGTATTGCATATTCTAAGAAAGTGT
ATTGTTATGTCGACTTGAATATATATTTTGTCTTGACAATAGAAAAACTGGAAACTTCAA
ATTACACCACCCTTGCATTCAACCTGGATCATCCTGCAGCACGCACACTTGATGGTGAAT
TGTTCTGACTTATAATTAACTACAAATCAATTACTTATGATTGTTATTAATATATGCATA
AAAAATTAAACATTACTAATTGTAACATTTACATATATATATTTGAGAAGATATTCGCGA
GAAAATAATAGGGGGGTTAATTGACATGAAGTTTGTTCGACAATTTATTGAGTGGAGGTG
GGCTTTTCTAGCAAGCAAGTTGCCTACAAATGATCCCCGACACAGGATGTATGCAACGAA
AGCTTGGCGCGTGTAGTACAAATAGTAGACATTGGTTATGTCTATTATACATGATTATGT
GTTTTAATTCGTAAGTTTAGTTATCATGAACTTGGTTTGTATCCACTATGTAGGTGCCTG
TTTGGTCATGTTTGTTTGTGTCTATGGCGTTTTAATGGGTGTGTTAATTTTATGAATGTT
TTAGTTATTATCTAAATTTCAAAACAAGTTTGTCCATGCTGATAGAATTTAATTTACCTT
TGACATGCTCATAGATATTTAATTACCTTTGACATTCTTCTCTTTCTGAAATATATTTAA
TAAAAAAACGGTCGTCTAAAATATTCAAATTCCATGCTATCATTTTGTCAAGTAATCTTT
TCATATCATATTTCGTATGCCATGATAATGCACAGGCATTTAACTAGTTTTTTTAAAACT
CTTTCAGACCTTTGGAGGGATGGGGGCGATTGCAAACCCCACCCTCAGGGTGATTTTTCT
GAAGATGCTCTAAGGCCAACTCGAGCGTGCGACCCCATCCCGTCCGGGTGCGTCCGTTTG
GGGTAAAACGGACAAATAGCGCAGCACAACGCGTGGCACCAAAAAGAAAAATGTTTGTTT
TTGGTCCGTTTTCGACCCATTCCTAGCCCAAACTTGCGCGGCGTTTGGGGAGAAACGGAC
AACGTGCGGACGGGCGGGACGCACGCCCTTGTCCTCCCCTGGTCCGCCTCTTGGGGACTC
TGCCGATTCAATCCCCCAAGCCTCCACCAGCCCCTCCTGCCCAACCCCGCCGCCGGCGCC
GCCACAATTATCCGACCGCCTCCTCGCTGCTCGCCTCCGGCCGTCCATACCAAACCACGT
CTCACCATGGCCGCCACCACGCCCGCGCTTTGGTAGGAGTTTTGGCCGTCGTTCGGAGGA
GTTTTGGCCGTGATTCACTACCTCTTCGCCATCACGACCGCAAGGTGTTTGACACTTTGC
CCACAAAGGTATGGACAATCGAGATACATTTTTCTTCAACCACTTCATTTGTTCATCGGA
TGATTCGTCCTCGGATGACGAAGAAATTGTGGTGGCTGCACTGGTCGTTCATGACCACAT
TCAAAGGAAGTAGCCTCAGTACAGGGGGTCAGTGCTTGGCCGTGCGCCCAACCTGAATCG
CTAGAGAGAGAAAGAGAGGCCACGCCTTGCTCTATGATGATTACTTTGAGAATACCACAC
TCTTCAAACCGGAGAAATTCCGTCGCCATTTTCGTATGTCAAGGCATGTGTTCAATCGCA
TTCGTGAGAGAGTGGTTCAGCATGACCCATTCTTTGAGTGCAAAACGGATGCCCTTGGCA
AGCTTGGATTCTCCTGTTATCAGAAATGCACCGTCGCCATTCGCATGCTTGCATATGGAA
TTCCAGGCGATCTTGTGGATGAATACCTAAGCATGAGTGAGTCCACATGTCTACTATCAA
TGTACAATTTCTGCAAGGGTGTGGTAGCGGTGTTTGGCCCCGAGTACTTGAGGCAGCCAA
ATGTCGCTGACACAGAAAGACTGTTGGCGATCAACGTCGATAGAGGTTTTCCAGGCATTC
TTGGCATCATAGATTGTATGCACTGGGAGTGGAAGAACTATCCATTTGCTTGACAGGGCC
AGTACAAGGGGCATGTGAAAGCGTGCACTGTCATATTAGAAGTGGTGGCTTCGCACGATC
TTTGGACATGACATTCTTTCTTCGGCATGGCCGGTTCTCACAATGATATCAACGTGCTGC
AGCGTTCCCAGTGTTTGCTAGGCTTGAAGAAGGCCACTCCCCACCTGTCAACTTTGAGAT
CAATGGCCACCACTACAACAAGTGATACTACCTAGCTCATGGTATATATCCTCAGTGGTC
AACTTTTGTGAAGACAATCTCAAACCCCCGAGGAGAGAAGAGAAAGAGATTTTTGCCCAA
ATGCAAGAGAGTGCTAGAAAGGATGTGGAGCGTGTTTTTGGTGTGCTTCAATTCCGATGA
GGTATCGTTCGAAACCCTACATTGACATGGGATGAAGGGAAGCTTTGGTAGGTGATGTCT
GCTTGTGTGATCATGCACAACATGATCGTCGAGGACGAGCGTGATGACTCCATTTTTGAC
CAAGGATTTGATTTTCAAGGTAACAATGTTGAGCCCGTGCACCAAGAACCGGCCACGTTT
GAGCAATTGACCCAATTCCATCGTGAAATCCGTGATTGACACACTCATTTGCAGCTTCAA
AATGACATGGTTGAGTACATGTGGAATCTCATTGAAAATCAATAGATGTATTGGTTAATT
ATCTTTATTCAAGACAATTTCAATTTAATTGTAAAACTATTTTATTTGAGATAATTTTGG
TTGGGTTGTAAAACTATTTTTATTTGAAACAATTGATATTTAGACACGTAAATTTGTTTA
AAACATTGATAAATATGAATATATGAACATATTGACCGTGACAGACAGGATGTGACCGAA
AGATGCGTCCGTACATTAAAAGCACGACCACCGCATCCGAGGACAGTCCCGGACACGACC
CCATAATTCTGGCCAAACTGACGTCCGGATTGGGGCGCTGAAGTTGGCGTAAGGTGGTGT
TTCTTTACGAGGGACTAGACTAAAAAATCCCTTTTAGTCCCTAGGTAAAGAAACATGAGA
GACTTTTCCTTAAAGCAAGTACAATAAGGTACAGTCACGAGGCTGTAAGGATTAAAATAC
TATATTTTTGCTGAGTTGGATGAGAGAGAAAATGAGAGATAAAGAAAGCGGCTCTAGCAC
GTGCTCCTAGATGCTTTGTGAGAATGAAAGATGAATCATATATATTAAAAGTAGTACTCT
TTTTTATAACTAACTATTGTACAAGTTAGCTATAAGATAAGCTATAAGACCGTTTATAGC
CAACACTTGGCTATACTATTAACTCTTAGCACTTTAGTCCCTGTACTAAAAAAGAAAAGT
CCGTGGAAAGAAACACCGCCTAATACATAAGGTCCTGAACCTAAGCTTTCCCCTCGGCTC
CTGCACGCGCCATGTCGTCGTCATCCCGCGTCGGAGAGATCGAGGTTGTGGTGGCCGACG
GCGGAGCCAGGAAGGCGGCGGAGGAGGAGAAACAGCCGGACCCCGTGGTGAACGTCTACT
CGGCCGCGGCGTACGGGGATCTGGAGCGACTGCGGCGGTTCGTGGAGCTTGACGGCGCCG
ACGCGTCGCTCGCCGCGCCTGACGGCAACGGCTATCACGCTCTCCAGTGGGCCGCGCTCA
ATAACTACCCCCACGTCGCGCTCTACATCATCGAGGTTCGCCTTATACTACTCGCCGGCC
TCGAACTGGGCGCTGCTTTGGACCACCTTCCTTGCTGGATCGATTCGTGCGCGCGCGTGT
GGTTGATTGTTCTTTTGCAGCATGGGGGGGACGTGAACGCGGAAGACCATTCGCAGCAGA
CAGCGCTGCACTGGGCGGCGGTGCGCGGGGCCACGGCCACGGCCGATGTGCTGCTGGAGA
ACGGCGCGAGGCTAGAGGCAGGCGATGTGAACGGCTACCGTGTATGCAATCGTTTTCTTT
TTTGTTCTGAATTTGTTTTCTCGTTTTTCGATCTTCTGCAGTGTTGTTGGATTTAGTGTC
TGATATTTTGTTTTTGAGAAATGGGCGTCTCCCTTCCGATCTTTCCTAATTCAGACACTA
AATAGAGTATGATTTAGTGCCTGATTGTTCAGGAGCTTAAAACCGATAGCTTTGTGCAAA
AGGCTTAGGTTGGTTTTCGAAAGATCTGTTTGCCAATAGAAAACTGCAGAATGCATGTTG
GTTATTGTTTGATCAGACAATTCAGCTGTATGATTTGTAGTGTTTGAAGTTTTAAGCAGA
TAATAACATATATCTTGAGCTTATCTCTGTAGCAAGTAATTACCCCCCCTGTACCAAAAA
ATACTTGTCGTTCCTATATTACATTGGATATGATGGGATCAGTCATTAGTGAATTCATTA
TGTCACTATAATTTGGATAAACTAGCATAATAAAATCGTGGACTGTCAAATCAAGTTGCA
AATATTCACACTCCATGCATATACACGTATTTTAATATTTGTGTACCAATCAGCGCGCAT
GTGGACGTAAAGCACAATGGATCCATGTTGCACTTGATTCTTGATGCGTGTATTTTTGTT
GAGTACATCATTGATGCATGTATGAGAAGGATAAGAAAAGGTCAGCCTCATGATGGATGA
AAAACTAGAGGGCCCTATGACGTACGAATAATTCGGAGGAACGCTTGTTTCTTGTTCACT
TTTACGGGTGACAAGGTGAGTAATTTACTTCAACTTTAGGGGCAGTCTTGATGGCAGATG
GAAAATTCAGAGAAGCAATTAACGAAGAGTTTTTTTACTTACGAATGATGGGGTGGGTAA
TTTATTTTAACTTTGGGGGCAATTTCGAGGACAAGCGAAAAAATCAAAGAAATAATTAAC
GAAGAGTTTTTTTCACTTGCGGGTGGCATGATGGGTAATTAACTTCAACTTATGGGCAGC
TTATGATTATGATAGGTGGACAGACCAAAAAAATCAGAGAAACGCACCATCCTTTAATAT
TAGGTATATAGATATAGATATAGATATAGATATGTTACTCGTTGACCTGAGCTAACATTA
TTGCTTGCAGAGCTACTATGGGAATATGCTATGAAAACATAATTTTGCTACTGGATAATC
GACCAGCGTACTTATAAAAAGAGTGAACTTTTTGGGAAACTTTTCGAGGCTTGATAATTT
TTTCTATTAGCTACAACTTTCGGTTTAGTTTCACATTAGTAAATACTCCCTCCGTTCCTA
AANNNNNNNNNNTTTAGAGGTTCCACTAGGGGACTACATACGAATGTATATANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNTTATTTTGCTCCGTATGTAGTCCCCTAATGAAATATGTAAAAA
AACTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTAGATCATAAGTTTGCCTCAAGTCAGCCCAAGTTT
ATGCACTGTAGGTTTGAATTTTGTTAGCGTGAGTAGGTCTTGTGTTTTACAATTCTTCCT
TTGGAACATTATGTTAGGCACTCCATGTTGCAGCTCAGTATGGCCAAACAACATTCTTGC
ATCACATCGTCTCCAAGTATGGTGCGGACTTTGAAGCTTTGGACAATGACGGGAGGAGCT
CTTTGCACTGGTACATGAATATGAAGAATGTCTCTTACCTTTTAAAGCATGTTTGCCTGG
TTTCACATAACATTGCCACCAGCAACATAAATGCATATTGTATGATTTGTTTGATACTTC
AAGATTTGTCGCCTAGCTTATACCAAGTAACATAGCCACCATGAATACCTGATACAATGC
TACATACAATGCTACTGGAAAATGGATTGTTGCATTGAGGTCTGAGCAAGTGCAACTGTT
ATGACCGTCGCGCATTATAGCCGCTGGCAGGCTACGGGCAGTAGGCCCAATAGCAGTTAG
GGGCTTGGCCCACTTATCGTATTTTTATTAGCAGCTAGGAGATTATATAAACTCATGTGA
AGACCTGTTTTGGAGATTAAGAAGTAGCAAACCTATTTGCTCGGCTTCTGCCGGGAAACC
CTAAATCCTAGCCGCCGTTGCGGCTCCTTCCCCTCGCGCGATCACGACGCCCCAGCGCCG
TTGGCCTTGCCCCCAGCTTCACCAACCCTCCTTCCACCCCTATAACCTAAGGCCACGCCC
TGGTAGGAGCCTTGCTCCTATCAATATGGTATCAACTGTCTCGGGTGTGATTATGTCTGC
T
