Map Locations of contig_5661 (11153 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_5661

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69555 4 3919 bp MLOC_69555.3 Available Available LOC_Os12g32330.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-117, 13112.m03299 protein peroxisomal membrane protein, putative, expressed
MLOC_69556 2 4753 bp MLOC_69556.2 Available Available LOC_Os12g32360.1, FRAME:-1, EVALUE:4e-48, 13112.m03300 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_69555






CDS Structure of MLOC_69556






Contig Sequence (11153 bp)

>contig_5661 11153 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCGCATCTTGGGCGTGACACGCGCGTCCTAGCTCGACGTCGTAGCTCGTGCCACCGTAG
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CTTAGGTCTGCGGAGCCCCGATTCTGACATTTGACACTCTAGGTAGGGGTGCGCATCCGC
TTTTCCGCTTCGGTTTCTCTCCAGCTTCACCAATCCCATGGCTCACGCTCGTTGTGTGCG
CGTCGAGCGCAGGGCTGCGCGGGTTGTGGTGAATTTGTGAACCAAGACGAAGATCCAGCT
CGCGTTGGAAGCCCCTCGATGATGCTTGGAGCTGAGAAAGATGGTCGCGTTCGTTCTCCA
AGCAGGGGTCTTCGGTGAGCTAGATTGGCATTCGATCCCACCATCTCGAGGGCGATGTGG
TGCGCCATAAAGGTCCCCTACGCCAGCGACGACTGATTTTGGGGTGGTTGGGGGCGGCGC
TGCACTGGGCGCAGGTTGTCGGAAACAAAGCAGTTGTTTTTATAATAATAGAATTGTTGT
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TGTCCATGCATAGATCCAACAGCCACGAGGTAACCGGCTTATAACACACTTCGGCAGTCC
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TTTCTTCTCTGACAAGTCCCGGACCCTCTAAACCCTGCAAGCACTGGACTTGCCACAGAA
AACGCAGACCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCATGGTCACCGCCGGAGCTCTCCACGCTGGCA
GCCGTGTCCTCCTACCGATCCGCCGAACCTTCAGCACACCCTGGTCCCACGTCCGCTCCC
ACCTCCACTCCACCAAGCCCTCTTCTGCACCACTCCCGCCCCCACCTCGGCCGCCGCCTT
CTTCCCATGCGGCGTCCACGCGCTTCACCGCTGCCCCTACCAGGAGGAGCGGATCGATCG
GGTCCGGGGTAGTCACGTGGTACCTCGGCTCGATCGAGGCGCGGCCGCTGCTGACCAAGA
GCATCACGGCTGCTGCAATTTACACCGTTGCTGACCTCACCTCCCAGGTGACATTCTGTT
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TCTTTACTTGATTTTGTTTTTACTTCTCTTGGGACTTGATTCTGTGACCCCATCTTTATA
ATATTGACCTATCAACTCCAACTGTGCTGCTTTATATGCATGTCATTACTCTATTTCGGC
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ATGTCTTTTGTTATATTTTTTTATTTGTGTTTAGCATATTGTAGTAGAAAAGGTAAACAC
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AATCCCTAATCTCCTTCATGCATTTACCATTTGTACTTTTAAGTCCGCCAGAGTTGAAAC
CTCCTGCTTGGTTCTAAAATGAGGTTTCTGGGCGCAAATTATACTCAATGAGTTAGTAGG
CCTGAAGGTGGAAGTGAAAGTAGTAAATGGCCATTGGCCAATTTTCAGACCATACATGGC
ACCTCATATTCTGCAGAACATGAAAATATTTGTATACCAGCTGTGCAGTTTTCTCCTGAA
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ATAATAATGCCAGAATTTGTTGTTCTGTGCCTTCCAGCTGTGTAGTCATGCTACTAGACT
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TATGACTGATGGACAACATAGGAAACACGTAAAAACCCAAAGGCTGGTGATTGTTTTGCT
TGGTAAATTACTTCACTAACAGTCTGATGTTTATATGTCGAGGTGCAGTATTTCTAATTT
CTGCCGACATCCCAACTATACATGCACGCACACAAAATGATCATAACTTTACGCTTTTAC
TGGTTTCTAAGACCCTTCTATATATCTGGTACAAATGTCCTTACTAAGTGCTGGCTTTAA
ATATTATATAACAGTTTGAAGCGAGCCATGATAAAGTTTATGACCTATGGATCACGGACC
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CTGTAGACGATGATGTGAGAAGCTATGTTCAGATAAACGTACATGCAGTATACCTTCCCT
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CTCCCTCTGTAAACTAATAGTGATCTATATGATCTTGACAGTAATCTGAACTGAGGATTT
ATTTTTCAGCCGCTAGTAAGCAATTCCTTCGCATTTCTTTGGACCATCTATCTAACATAC
ATGGCCGGCTTAAAGAAACCAGGCATGGAGGTGATCATGAGCTCTTAGTCATAATCAAAT
GACTGAGTTTCTGCCAGTTATTTCTGAAAGGAAGTCTTCATGGGCATTACTTGGAACTAT
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AGAGATAAACTGCTTTTTGGCATATTTCATTTTCAGTAGAGTAGTATCCACCAGGCTTTT
CTAGTTTGCCTACAGTTTTGGCCAGGCATTTCTGTATGGATGATAGAATGACACTAGGCA
TTTCTCCTATCTTTCTGAAGTTTGTCATATCGCACTTCGAAACACAAGCAGTTTTTACCA
AATTGTCTGTGCCCAGTTATGCAGATGTTAGGTAAAATTGTTCTTGACCCTAAGATAAAG
TGGACAAGGCAGGGTTTACGCTTGAAGATCTCTACATACAATGCAACTTTTGTTAGCAGA
TACTTATGTACATCTCCCTCCCTTGTATGCAGAAAGGAGACGATTACACAGTTCGTTCAC
TTTTTCTTGACGTTGGTTTCTTTTAAATATTTTTGTCGTATTTTTTTGTAGATGTGAATG
ATGACTTTCTATTGATGGCATTCCTCTGGTTGCAACGAATTAGTTTCTGATGTACATATA
ATAATGCATATGCTTCTGTGTAGACACTCAAGCCACCCGTAGCTAAGCCATCAAGCCATC
TTCAAACTTAAACATTGGTAGAGCCAAGGAGACTGCGTGAGCTGATCATCATGCCTCTTG
CTCTCATGTTGAAACCTCAGGTTTACACTGGACTCGGGGAATCGCTGCTGCCCTGACTCT
GATTCAGCAGAAGTCGATGATGTCACTGTTCCTCCAGACTCAGAGTTGGATGTCATCTCT
TGCTTCCTCGTGTCACCCCCAGTTGCCAGTGTCAGCTCCAGGTTGAAGTCCTCGATGAAA
GGAGCGGTCTTCTCGCCCGAGTCGACGTACCATTGTGGTCGATCTGTATCCAGCATCTGT
TCTGTTTGAGTATCTTCTCTTGCCTGAGCTGGGCTCATCTTAACAGCCTGCATCTCCTTC
ATCAGTCGCTTCTGAACCTCGTATACGCGATGCAGCTCGTGAACCTGCTTTCAACGAAAA
ACAGACCGTTCAAGACTTCCACTAATGTACAGTAGATAGAAGATGTCACCACTTCTAACC
AGACATTGGTTTACCTGTTGTCTGAATATGTGCTCTTGCCTCAGGATGGCCATCTTCATA
TGTTTCTTCTCCATCTCTCACCAACCCACACGAAATATCAGCTTCACCTGTTTCATCAGA
GCCTGACACATGAGCACCAAAAGTTTTTCTCCCAACAATAGCAAGACACTGCATATGCAT
TGCAATAATTGGAGCTTTGTTTATGTGCTGGTTACGTGTCTGCTTGTCGTGAATTATCTC
CTACCTTGAGATGGGGACACTCTCATGTGTAGCTTCTGAATGATTGTACTTCTCTATAGC
TCTGTACAAGTTCTATTATTCTCCACATAGGATAGGAGTATCCAGCTTAGCCATTTTGCC
AATTAATAAGTTATATACTTGTGTAAATGAGTATCCTATGCAAGCATAAATAAATGCTAT
GGTGGTGTGTGACCTAACGCATTAATCAGTTTATCTGTGACCATGTGCACTGGTCTATTA
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TTTGGTATTTTCCTTGTGAATTAGCTGAGAGTTTTAGAGCAATAAGGCGTATATCATGAA
TACTACTCCCTCTGTTCACTTTTGTAAAACGTTTTAGACATTTAAGACGTCTTACAAAAG
TGAACGGAGGGAGTATCGTATATCATATATATGAAGGTAACAGAAACTGTGTAGATCATA
TATATGAAGGTAACATAAACCGTGTACGTCGGTCAGGCAATTAGGACAGCTAAGATCTTG
AGTTCGTGGAGGCAACAGTGGTAAGGAGCATTTTTAGGTCTGATGATCTTAAAGTTGGTA
TGCCTGCACAATTCTAATTTTGGCTCCTAATATACTTGATTTACAAAACTATTTAGGATT
TCCTATCTGTGCCTTGCAAAGTAACCCAAACTCCATTAGCCTTTCATTTCAGTTTAACAT
GGCGATTGAACATCGACAGAAATTCTCACACCCATCCCTGCCCAAATAGAAACCTACCAG
CTCTAAACTGTAGTACCATTTGATTCTTTGAGGTAGAATTATAGAAGATGTGAGATAATT
CTGCATCTCCATTCCTTTCTCTACGTGCTTGCATGCCGTTATGCTTCCCGAGAGAAACTA
GTAAACAGTTTCAACACAGATGTCAGCTCTGAAAAGATCAGAGCGCCCTAAAACGACAGG
AGGAAGGCAAACATAAACATGCCATTGCACTTTCTCAAGGCTGAGCATCAGCACCTTCCT
TTGCTCATGGAATTACAAAAAATGAAGAAGAGAAAGAATGAAGGACCAATCAAAGGACCG
TGGTTCGCAAACTTTAAAGATATTATTATCATGTCCCATGAAAGCTAGCTGAATTGCATA
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GAGACCTTTGCTCACCTCTGCCAAGGAGTCCTGTTTCTGAATTCTTCTCTTGTGAACAAG
GTAAGGCACTCTCTCTCTTTTCTCCCCCAAGAAGATCTCTCTTGCTAGCTACTTCTAGGC
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TGAGGCAGGGAGGGGAGGGAGGGGATTTAAGATTCTCTCCTGTCATTAGTTCTACTGTCA
TGGTGGGGCCTTGTGGCCATGCCAAACAAACCCAAGTCGGTTAGGCCAATGGAGTTCATG
CATGATAAAGGAGCCAAAGATGCTCCTATGTAGGTAGTGCCAAGAAAAGGATAGGACCAA
GATAACAAGCCCCAGCTATTAATATTCTCATCTACAGCACCAATAATCCGACGTGCGGCC
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TGGCACGACGGATCTTGTTCATGTTACGACAAGTGTGGGTTTCTTTAGTCTCAAGTTTAT
TTGATTGCTGGTGTGTTCTCAGTGGGGTTGTGGAGCTTTTGTTGGTGTATTAGAATGTTT
TTTTTTTGTGTGTGGATCACTACATCATAGGGTTCAGTGAACAGACAGCTAGGCATGTCA
TGTTTTAGATCTCACATACTCTCATGTGCACTGGATTAAGATTATCATCGCCACTTGTCA
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GGAAATACAGTAATAAGCAGTAGAAAACCCATCATTTTTACAGGGTTGGTTACTTTCTTA
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CCAACAATGAATCCTGACGAGATTCAGAATTCAAGTGTGGATCTTGTGTTGGCTCATATG
CTGCTCAAGATTGGGCAGTGTGATTGGATAGCGAGTTATGTGGGAGTGGTTGGTAACAAT
AACATGTATTGGTCCCGGTCCCCCTCAGGAAGGATATGTGAGGCCTGCAACGCAAGCAAA
CTGTTCACTCCCATTCCAAGGATTTTGACAAGTCAGGGCCTGAAGATCCAAGAGCTGCAT
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ATGTCCCCGTCACCTCCCCCAGAGGATTAGCTGGATTTGTTAGACTTGTCCTCTGGGTTA
GTAGATGCATGATTTTGTTTGAGTGAGGTGATTGGGTGCTTATGCCCACAATCTTCTTTG
CCTGCATTTGTTGGAGATCAAAATCCCAGTCATCTTTGTTTTACTCCCTTTGTCTCATAA
TATAAGAACGTTTTTTAAAAAACATCAGTGTCAAAAACGCTTTTATATTATGAAACAAAT
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CTCCCGATCTGTTTTTTATGGATTGGCGATTTTCTCCCAACAGACCTCCACTACTCCTCC
CGCTCACCCTACCGATGTACTCCCTCCGTTCATGCATATAAATCTTTCTAGACGTTTCAC
TAGTAAACCATATACGGTTGTATATAAACATATTTTAGATTGTAGATTCACTTATTTTAC
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AGCAAGCACGGTTTGCCTGTGCTCGTGGTGGGTGCCGCCGCCACGGCCAAGGAGGAGGGG
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GACCTGCTGAGTTTCTGACGTGGCATGGTACCATACGTCATGGACCCTGGCGTTTGTTAG
CAGATCACACTTTTTTTAATAATGTGTGCCACGCCACCCAGACGCCAGGACCCTTGGCGT
TTGGTACGAGACGCCAGGGTCCTTGGCGTCTGGTCCTGGACTAGACGCCAGAGTCCCTGG
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AAAAGAGGCTAGATTGTTTTTTTTTAAAGCGAAGTCAATTCTGCATTTTCTTTGCTCTAT
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TTAGAGCAAGTACAATAGGATGACGTAGGCGAGCTGTAAGACTTAAAATAATATATTTAT
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GTAGTACTTATTTACATCTACCTATTGTATTTGCGGGCTATAAGCTTAGTTATAGATGAC
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AATGAATTGGCCTAGTCATCATCTCAAAACATAAGAATAAATCTAACCAACCCAAAAAAA
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TTTACTTTCAATGCACCATATTTTAGGCTATGCAAAGTTATAAACGTAAAAACATAGTGT
AAAATACACATAAAATGCACTTTTTCTGGTCTTCTGACATATATTTTTGTTTTCTTATGC
CAAATTTTACATAATGAATCAATATGTGTATAGCTATTTGTATAAAATAAAATAAAATAT
GCAACAATCGTAAAATTACCCCGGGTGAAGAATAACTCATTCTACATCCTGGGTGATGAA
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AGAAACGGATCAAATACTTCAAATGAAAAATAAAGAGTCTACTATCACAATGAGTATACA
TCTATAAATAAAATTACCTTTCTACTACCTAGAACAATGGTTCTACTGTATAGGTTTCAG
AAATAGGTGTACATCTAGCCATTGTATAACTAAAATGCACACAGTTAATATCAACACACA
CAACGAAATTCACCGAAGAGTAAATTCATACAAAACAAAATCTATGCCTAGGCGAAAAGG
ATAAAAATGAAGCGATCAGAATAGCGATTGGTAAACTACAATAATAATCATATCTGCAAC
AACCATCTCTTGACATCACAAGTCGTGGCGGCACCAGGATTAGGTGAAGGCCCAAGCCGC
CCTACATCGCCTTTTGTTTGCTCTAACACTATAAATACAATAAATGCTCAACGAACGAAT
TGGGCCTAGGGCCCACGCCACGACCCAGGCCGCCTTGGGTCTGTCTCTGCCGCTGATTAC
AAGGACAATGAAAAAGTTTTTCTAACAATCTCTTCAGAAAGGAAACTCTGCTCAAGCGCC
AGTGTTGTCGAATCCAATCACTGAAGGCTAAATTTGTTGGGGAACGTTGCATG