| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_56583
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_69539 |
5 |
2251 bp |
MLOC_69539.4 |
Available |
Available |
LOC_Os01g32780.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-63, 13101.m03305 protein universal stress protein domain containing protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_69539
Contig Sequence (12013 bp)
>contig_56583 12013 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGACGGAGGGAGTATGTTGGCTTCTTTGTCTAAAAAAACTGTGGGGTACTCGCAGTTTT
TCAATTTACTTGTTGATTGCTTGCTGTAAAAAAAATACTCCCTCCGATTCATATTACTTG
CCGCTCGAACAGATTTATCTAGAGGTATTTCAATGCTAGATGCATTAATTTGAGCGACAA
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GATCCCTATAGTCAAGAGTAAACCAAAACGAGCTAGAACTATTTGTCTTGTTTCTCCATA
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TCTCATGCCAGAGCAAGCCGGGAATGGCTCGGAAGTGCAGGGAAAACGGTTATGCTCATT
GGCGCCAAAGTTAATAGTGGCGAACTCAAAGTAAACATAGCTCAGTATTACCGACAAAGG
ATACCGTAGCTCCACACCTATGAGAAAGTATTGGGGCTATTAAAAACAAACACGTTAAGT
GGACAAAGTCAAATAATTCAAGATTATGATTCATGAACTTATCTCATAGTTCAACCGTAA
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ATTCACCCAAAACCTATTGCCCATACTAAGAGCTTGAGATAGGCAACCACTCAAAGATAT
AAAAGTATGGCCACCGTTCATGTTTCCACTCACACATGAGGACTAATTTCTTGAAAACAT
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AATAGCACTTTCATTTTGTATTCTTGCACTCTTAGTCTGTTCACTATTGTTCTTCAATAT
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TGTAGTATAGGAGAGCTCCTGAACCCTACTTGTAGCGAGCCGGTTTCGATAAGGATCCAA
GTCTCCTATACTTTTATGCTATCCAATAGCTAGCACACATGGTACTTGATAGAATACCAT
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GGGAGTATACGGTTATAAATATAGAGTATATTATAAGAGCGTTTAGGTGTAAAACGAATT
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CATGGGCTAATCGGTAATCAATTATTATATACAAAAGTTTCTGTAACGGACGCAATACGT
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GGTTCTTTGACCCATCTGCTCTCTTCTACTTCCTCCGTATCTAAATATAAGTTTTTAAAG
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CCATATACATTCGTATGTAGTCCATTAGTTGAACTTCTAAAAGACTTATATTTAAAAACT
GAGGGAGTAGCCACCATGGCAGAGAAAGGGGAGAGGTCGATGGGGGAAGATCGAGTCGAG
CCTCCGATGAGCCGTGAGTCCAGTTCATTCTTGGAGCTCAATATGAGTGGCCCACGTGTT
GAAGCTACAACGTCCATCGAAGTCAATGTTGATCGGAGTGCTCCATGCATTGCAAAGCAT
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TCCTCCAAAAAAAAAAAAGAGGAAAACTAACCCGTGTGCCATCTCCGTGGGCTCAAGCAG
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CTCGCGCCCCGCCGCCTCGTCCTCTTCACCGTCCAGCCCTTCTCCCCCCTCAGCTACCTC
CCCGCCGGCTCCCCGCGTAAGCCCCGCCCGCGCCTCTCAGGCTCTCTTCCATCCATCCAG
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GGCCCGTCGGTGGCGTCGCCGGAGCTCATCAGGTCCGTGACCGAGCACCAGCGGCAGCTC
GCCCAGGCGCTCGTCGACAAGGCCAAGGCCATCTGCGCCGACCACGGGGTATGTGATTCG
CTCGCTCGCCCGCCTGATTTCTTCCCCGATCCGGTCAATGGGCGCGGCGATGGCTCTGAG
AATTACTACCAAATTGGGGGTGGAACTGGATCTTGGTTTAGGGGATTAATTCGTCGGCTA
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TGTGAAGCTGCAGACAAGTTGAATGTTGATCTGCTCATCCTGGGCAGCCACAGCCGTGGA
CCTATTCAGAGGTACCGATCATAATCCTTTTCTGCTCATCCGGATTTCATTTTGAGTTCT
GGACATGTGTTACTCCCTTGCGCTCTTTTCTAAATCAATTACCCAATGTCCTGTCAATGC
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TCATGTAGTCATATAAGGCTTACCTCATTCGAATGGCGTGCACAAGTTTCCAGAGAAACT
GACCTGAATTGGAGATGAAATTCAGAGGCACCTCTCTTGAATACCAATGGTGTTTGTTAT
GTAGAGCATGTGTTGTTGAGTCTTATGTGTAAACTAAACACTTGGTTATCGCCTGATTTA
TCTTTTTCTGTGTGTTATGCCTGGTTTCCTTCTTAAGAGATTTCCTTCATATCACCTGAG
TTATTGTACTTGCCATGTTGTTCTTCGTCTACTGTTGTTATTCATGCTTTTTGTAGCTTG
TACAAGTAAATTTCCATACCCTGCGCTGGGATTGATTGTTCGGAGCACTAGCCTGTACTT
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CATAGCATCTCAGACACATTTGACAGGATGGTACAAATCATCATGGGGATCAAAGTTTCT
TCACCTCCAACTAATCTGATTGCTTCCATGGTCACTGCAGGTTCTTCCTTGGCAGTGTGA
GCAACTACTGTAGCCACCATGCAAAGTGCCCGGTTCTTGTTGTGAAGAAGAAAGAATGAA
ACCCAACCATCTACTGTACTCATGCACATTGTGTGAAGAACCCTTGAGATGTGTATCTAC
ATGTTTGTTGTTTGTCATAGCATCTAGTTGCATATGAATAAAGATACTGTGCCAATTCGA
AAACCACTATGTATTCAGTGTTGTAGATGAACGAATAATGCCAAGAAGCAAACTGAGTGG
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AAATTGAACATGTGACACACCATATGCATTTTTATTTGCTTTAGTTGACGAGGACTTCAT
CTATTCCGAGCTACGGAGCTAAGCCCCTTATTCTCCGATGACTTGCATAACAGATTTCTT
GGCACCTTGTATCGGCTATTACTAAAAACTGTTCAGGATTGATAAAACTGCTTCAGGATT
GATAAGCAGGTGTACAAGGTAGATCACCCGAGGAAGGATGACCTGGCACACCTCCTGGGC
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CAGCAACCGGTGGGTATACCTCTTCACAAGGCTCCTTCGCAGCCCCGTAAGGCCTCGTTT
GGTTAAGGGGGATTGGAGAGGTTTTGAGAGGAAAATCCCCGAAAGGGCCAGAAACCCCAC
AGATCCTCGGGCG
