Map Locations of contig_56473 (8048 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_56473

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69475 1 307 bp None Available Available None
MLOC_69476 6 1414 bp MLOC_69476.1 Available Available LOC_Os01g29469.1, FRAME:-3, EVALUE:6e-104, 13101.m03062 protein dual specificity protein phosphatase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_69475






CDS Structure of MLOC_69476






Contig Sequence (8048 bp)

>contig_56473 8048 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGATACGGTATCATGATATGATATTTAACCCTCTCTTTCTTCATTTAATTCTATGACACC
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GCTTGACATAATCCTTTTATTTATAAAGCGCAAGTACGTTACAACATGATATATATGTGG
TAAAACATACATGTCAACATGGAACTATGGCTAGTTTTCTATATGCCATATGCCCATATA
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ATTCTCTTCTTTTTAGTTGGTTGGAATCATCTAATATGGTGGCATTCCTTACTTGTATGC
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GATGGAAGGGTGGAGGTGTATGTCCCCAATTCTTCTAGTCAACCACCAAATGAAACGAAG
ATGAATGATAGAGCCATGGTAATTCAAGAGGAGGATGTTCATATTGATGTTGATGCTACT
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GTGGAAGTTGAACAGATTCATTATAATCCCATTGGCAGCTTGGATGTCATTCTGTACCAG
CAAGACATGGATCGTAGCCTCCCCTATAGTCGTATGTATGGGTATGACTCCGATGACGAG
GGTCCGACGAAGGATTTGGATGAGGATGGATTCACTACAAAAGAAAATGAAATTTTCAAG
AAGGTGACGGGGAAGGAAAGAGTGTCGGGGAACGTCACACGGGAAACAAAAAAATTCCTA
CGCTCACCAAGATCAATCTATGCAGATCAGCGTCTACAAGAGGAGGAGTGCATCTACATA
CCCTTTTAGATTGCTAAGCGGAAGCGTTGAGAAACACGGTTGATGTACTCGAATGTCTTC
GTGATCCAATCACGATCCGTCCTATGATCCAATCACGAACATCCCGATCAAGTTTGAACG
GACGACACTTTCGCATTCACCACACGTACAGCTCGATGATGCCTTCACCACCTCAATCCA
GCGAGCGTGGATGAAGTAGTAGCTGAGTTCTCCGACGGCATGACAATGTGGTGGTGGTGG
TGGTGGTGCGATCTCGGCACAGCTTCGCAAGCGTCGTCGCGGTCATGAAGGTGGAGAATT
ACTACGAGAGAGAAAGATATGGCATCGCCAAGGAATTGTGTGTTGGTTGCTTCCCTCTCC
CTCTCTATTTATAGGAGGAGGGGGTAGGTAGGGCTCAGCCTTGGCCCCTCCTCCAACGGA
GGGCTGCCCGGACAAAGTGGGGAGGATTCCTCCTCCCACAAGGGAGGTGGGCGCCCTAGG
GAGGACTCCTTCCTCCACAAGGCACCTCCTCCACCTACCCTTGGGCGCATGTGCCCCTTT
AGGGGTCAACTACCCAGCCCACTAGGGGCTGGTGCGCCAGCTCTTAGGCCCATATGCCCC
CCGGGGGG