Map Locations of contig_56358 (13223 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_56358

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69398 2 2167 bp AK356509 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69398






Contig Sequence (13223 bp)

>contig_56358 13223 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCTCTAGGACATATTTCCAACAACTGCTAGGTGAGCGATTATAGTGGTGGTGTTGCGAC
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GTTTTCTTCTTTAGTTAAAGTTATGGCAACTCATTTCATTTTTTTCCTTTCGTATCATTT
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CTTCCTCCACGCATCATCCGTCTCGCAGCTCCGCCGCCGCACGCGCTCCATCACCTAGGA
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GGTCAGAGCATCTGAGAGCCAAATGCACATGACATAAAGAAGTTGTTGGCTATTGGAGAG
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GAGGAGGTGGCATCACATGACTTATGAATTTGGCATGCTTTCTTTGGAATGTCAGGTTCT
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TCACCTTTGTGCAATAATACCGTCAATGTCCGAGACTACAACATGGGATACTATCTTGCC
GATGGCATATATCCTCATTGGGTTGCATTTGTAAAGATCATATCCGAACCACATGGTGGA
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ACACGCAACTACTCAACTATCTCGTGGACCATATGTGGACTCACAATGGAAATCAAAGAG
GAGATGATTGATTGTGCACTTCAAACAAAATTGATGTAAATACTTTTTAAGTTCGGTACC
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ATTTGAAAGTCCGTATATGAGGTATGTGAATGCACAGAGCGAAGTAAGAGGGGCCCTCTG
AATGCGTCCACGGGCATATGCCCGGACGCATCCGTAGGCATATATGGGGCCGAATTTTCC
CAGTCCGACTGTAGATGCTCTTAATTCGTTGAAAAAGATGAATACCACGTGTTGTTTACA
TGATACAAATTTGACAACGCTTAAGAGCATCTACAACCGGACCCCTCAAATCTGCCTCAA
ACGCGTGGGCAACCCGCCGAGTCATTGGCCGGTCACAAAAAGTCGACCCAACCGAACCCC
TCATATCTATTTCAAACGCCCAGACTGACTGGCACCGCTCAAATCCATCTCAAATATGGG
GACGATATGAGGGCTCGCACACACGCTCGGGCACGCCCGGTCAGTCCGCCACATAGGACG
CGACCCCATCTCGAACCACCTTTTCTCTTTCTTTATTCATTCTTTTCTTTCTTTCTCTTC
TTCTCCACCAATCACATGCAAGTGAACGCACATATGAGGAAAAATATGAGAGATACGGGT
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CGATTTTGCAAATTCCGGCTGTAGATGCTCTAAAAAGACATGGACAAAGACGCTTGTGTC
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TCCCCCGCCCACGACAACGAAGCGCCTACGATGACTTCGTAAAATCTCAAGATAATATGT
GAGCTCAGTCTCTTGGAGGTGCTTATAGACGTAGGGTGTGCGTGTGTACATTCATAAAGG
TGAGTGTATGCGCGTGTATGTAAGCACTTCCATCTGTACCGTGTTAAAAAAAACTATGAA
TTTGTACTTCCCTGCCCAAAAAAAAAGAGAAAAAAAATACCAACTTCCACTTGAGCAGAT
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TGCTTACACCGTAATTGCCACCCAAAGCTCAGCCAAACAAGGCTTACGCTTGGGATTACG
ATGAGTTCAATCAATTATTCTATGATATAAAGCCCTAAGGTTAGAATAGTCAAGTGTTAT
GCCCATGACTTCGTATATTGCTTCAATCATGTACTCGCTCCCTTACTAAATACTATAAGA
CTCTTAGAGATTTTAATATAAATTACATACGAAACGAATGAGTGAATGTGTATTTTAAAA
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TTATAAAAAATATAAGAGCGTTTAGATCACTGAGTATTTAGGAACCGTGGGAGTAACTAC
GAGTACTAGTGCTAAGAGCATCTACAACCGAATATAACAAATATGATCCTCTAAACATCC
GCGGACGCGTTCGATTATTGACTAGGCATGTCCTCTATTTGTCTGTTCGTGCATTCATAT
CTTTCATTTTTTCTCATATGTTCGGTCACTTACACATGATTGATGATGAAGAAAAAGAGA
AAAGAAAAAGAATGAATAAAGAAAAAAAAAGTTGGTCCAGGATGGAGCAGCCTCCTACGT
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CCGCGTACGCCACGACAATGATTTGCCGATATCGTTGGTATTTGTCCAAATCTTCTCACT
TTGACGTTACCAAGAGCCGCAAGTTTCCTGTCGCTTCGGACCGCCAATTCAACAAAGCAA
AGGGGGCTGTGTGGAAAGATACCTTCCCAGGGCTTCCACGCCATCACACACAGCACATAT
ACACGCGCGGCTCGCGAGCTCGCTTCATCATCAGAAAAAACCAAATCCTCTATTCCTGCA
TCGCCCGCATCTGTTCGCCCCCCTCTGCGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCGACGATGG
GGCTCGAGATGGAGCCGATGGCGGCGGCGATCGGCGTCTCGGTGCCCGTGCTCCGCTTCC
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GCCGTCGCCGAGCTGGCCTCGTCACCTTCCTCGGCGCATTCGGCTTCCTCATCGCATGGT
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TGGTGCTATTTATGATTAATATTTTCAAGGAAAAAACAAGATGTTGTATTATCTCAGGAT
GAAATTTCTTCTATGCCTGCAAAATTTTGGATGTGTGATCTCGTAAAGATTGCAATGAAT
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TATTGGTTTTGTGCTCATGAACCATTAGGGCCAATTTTGGATTGCATGCCTTCAATGAAT
CTTTTAATGTTAGTTACATTCTGTACTTCATGGACCACTGTGTTTTTTTGACCTGGTGGA
TCCCTGTGTTTGCTAATTTATCTGCCTTTCTAGCCAGTTAAACCTATGCACACATCCATA
GTTGAGGAAGCGAAAGGGAAACCATTTTTCATCTGTACTGCGTGAGATTTTAGTGTTATT
TCACCCCTTGTTTCTCACGTGAATCGGTTCTTCCGTTGAAAGGTTAAGTTTGTTTTGGCG
GTACTATGATGCGATTATGATCTGTCACATTGAGGGGTTGAATTAATATGACCTATATTT
GTTTAGAAGGAAATTAAGGGAAGAAAGAAAATAGTTCCCATCCAAATATCCCTGACAAAT
AGTCAATCCAGATAATTGATTCTGTTTGTTTCACTTAGAAATTATTTATTTCTAGCTGGA
GTCATCCAAACCTACACATTTTTTCATCAACTTAATTAAATATTAAGACATGCCATGTCT
GAAGATGGTTATTCCATAACCAAACACACAGGCTTGATACTAGTGATGTTTTATTCACCC
AGCGAACTTATAGTTTAGTATTTCAAACTGCCTCAATGAAGTATGAATGCAGGCATCGTA
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AACGAATGTTGAGCGGTAATTCTAGTTCCGTTCTTGTCAATATTAATGCCTCCTCACCAT
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TTAAATTAATGGACACAAGTGTCTGAGTAATCATTCTAATTAGTAATTATATTCTTATCG
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TTTCCCAGGTTTTGCTAGGCTACCTATTTCTTAATGGGTCTATTGCATTGCATAAGATTT
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CCTTGACACAATCTCTTTATCCCACACCATAAGCTTTAGAGCACTATTGGATAGAAGGCC
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AATGCCTGTCTCGTGCCATGTTAGCCTTCTTGTTGGTTCTGCTACAATACCAACGGTGGC
ACTAATATTTGTGGTTGTTGCAGTCACTTGCCTGTTTCTTCTATGGTTATTCTGTATCCT
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CTATGTGATATTTTTCTAGCGTTTTCCCTTTTTACACAACCTAGGTGTTAGCCAACTTAC
TCTGAGCAGTATTCGTTTTAATGTTCAAGCTAGATTTGACATGTAGTCTACTTGCATGAA
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GTTGATCATATTACATAAAAATTAACATATTTTGAGTTACTTACATATTTTCTTCTTGTT
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AGTGGTCGGACTCTTCCCCGGACCCGCGCAAGTGGGAGCTATGTGCACCAGGCTGCCTTT
TTTTTTAGTAGTCAAAATGATGCCTTCTACCCAGGGACTGGTGTAGCGTCCCTCTTATAA
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TGCAGGTACAAAATAAACCTTGTAGGCCAAATCTTAGCTCTTGTGGTCAACCCTCTGATA
GCATCAAGCCATGTCCCTGTGCCTTCTCAGAATTCCCTTTTTTGGTTGCAATGCAGGTGC
TTTAATGGTTTTAACGTTGAAAGTCATTTCATGCTCAATGAACTACAGTGATGGTCTCTT
GAAGGAAGAAGAGGGTCTACGTGATGCTCAGAAGAAGTATCGCTTGACTACGATGCCTTC
TCTAGTCGAATATTTCGGTTACTGCCTCTGCTGTGGCAGCCACTTTGCTGGACCAGTATA
TGAGATGAAAGATTATCTTGAATGGACTGAAAGGAAAGGAGTAAGTAGCCTTCGTCTACT
TTTGGTAGGTTTATGCCATGTTTTGCTTAATCCTGATTTTGTACGATCTTCAACAGATAT
GGGCCAGCTCAACTCCTTCACCATTATTACCTACTCTGCGCGCTCTAGTTCAGGCTGGAA
TATGCATGGGGTTATATTTGTATCTGTCACCTATGTTTCCGCTTTCACGATTTAGTGAAC
CTCTATATTATGAGTGGGGTTTCTGGCACCGGCTCTTCTTTCAGTACATGTCAGGATTTA
CTGCTCGTTGGAAATACTACTTTATATGGTCAGTTTCAGAAGCTGCAATTATTATATCTG
GCCTGGGTTTCACCGGTTGGTCTGATTCTTCTCCCCCAAAAGCCAAATGGGACCGTGCTA
TAAATGTTGATATTCTGGGCGTCGAACTAGCTGGAAGTGCAGCTCAATTGCCACTTAAGT
GGAATATTCAAGTGAGCACATGGCTAAGATACTGTAAGTTCTATATCTTGATATTCCAGC
AGATCATCATTGTTTTTAACATGCTTTATTGGACGATATAATGCCTTTTCATCGAATTTT
GTGTTCTCTTTATAAACTACTCCTTCTATCACTCAATATAATATCATTTTTCAAGCTACG
TTAGCTTGAAAACCGATCTTATATTGTGGGGCGGAGGGAGTAGAAAGCAAAATATGAAAG
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TGTGCAATCTAAGACTTGGAGAACAAGGAAGCATTATCTGTAATTCTGCATTTATTAATT
TCTCTAAAAGGTTCAGTATTTTTCTTTGTGTCTGTACAATGAATTAGTTGATAGTACATA
ATGCTAGATTTTGAGGACCTGCAAATTGATTTTGTTGACCACTTGATGATTCTTTGGAAC
CTTTTGGTTGCCAGTTTTTGTAGTGTGGATGAGAGAAGCATGTATACCTGTAATTCATGA
TCTTTAGCTGATTTCAAAACTTTGTACATGTACATTATGGACTCATGTATTAGTAATTTG
TCTCATCATTGACTCCTTGAGAAATGATCGGCTTGAAGTTTACCTTTGCGCTAAGTATGG
TATGCGTCAAGCAGTTTGTTTTTATGCAAATGCCATATTTGGGGCGATGCACTTTGGTTG
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CGTTGCTCCACTATTATTTTCAGATGTATATGAGAGGCTAATTCAGAAAGGGAAGAAGCC
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TTTCCCTCTCCACCTTCTGTATAATTAATAATTCCTGTTCACCGTATATCGAACTTGTCA
TGGAGCAGAGCATCCTGAAATTTGTTGAACAGTAGTTAAATGAAACTAGAATGCTCTAGC
GGGAATTCAGAGCTGCTATTGTCCCGGTAGCGGAACCTTAGTACTTGCCTTTAAGAATAC
ATGCACTATGGGTCATTGCAAACTTGCGTTTTCCCCATGGTAATAACTGGCTTGCCTTGT
GACATATTAATAACCTTTTGCCTTAGCAAGCTGTTGCTTGTGATGATTGATACTTTGCCA
ATCCAGCAAGTTTTGGTCTGATTTTTTACTGTTCTACAGGGACTGTACCCAGGATATATG
ATATTCTTTGTTCAGTCGGCATTGATGATAAATGGTTCAAAAGGTAGCTCAATCCTTCCC
TTTCCTGACATTTCTGAAGTGTACTTGATTGAAAGCTGTGCGAGCTTGTAATTCTGATTT
GGCTTCCTCTTTTGGTACAGTTATATACAGATGGCAACAAGCTGTGAGCAATTCAGGCCT
CCGCACTATCCTGTCTTTACTAAATTGTGCATACACCATGATGGTGCTTAACTACTCATG
CATTGGCTTCCAGGTTAGTTTCATGCCTCTGAATCTGGCTATACTTTACCCTATAGCAAA
CTGACACAATCTGATCAGGTCGCTTGTCTGTAAAGGAATAATCTGTGCATATAAGGTTTT
GCAAGTATTAGTTCCCTTTAGGTTTCAGAGGATGATTATTATGATCTGTGCCACACTAAA
TTTCTCCCTTTGTTTTATTAATTCTTACCTTTGATGATTATTATGCATATAAGCTTTTGC
AAGTATCATTTAGGTTTGACTTAACCAAAATGATATTCATCATACGTAGTGAAGTCAGGT
TGCTTCACAAATTTAGTTTAGATAACTTAGATTCACAAGTGCTTTAGTTTCTTAGCAAAG
TTACCACTTGGATCATGATGTGCGACTGGCATATCTGAATATTCTGAAAGGAGAAAAATG
CTTATTCCGGACAAATCCCCCTGCTCTACATAGAAATTGAAATAGCTTACCTATTCAGCG
CCTGCTCCTGCATGCGTACACCTGTTTCTTCTCGTTTCTCTCCCCCATGGACTCACCAGT
AGAGGAGACAATGGCTTCGCAGCTCCTGGTGGGCTGTCGCATGCTCTTCCTGGCGAGTCC
TCCAGTGACCATTCTGCTTACCCCCCCTGCTTTACATAGAAATTGAAATAGCTTACCTAT
TCAGAGCCTGCTCCTGCGTGCGCACACCTGTTTCTTCTCGTTTCTCTCTCCCATGGACTC
ACCAACAGAGGAGACGATGGCTTCGCAGCTCCCGGCGGGCTGTCGCGTGCTCTTCCCGGC
GAGTCCTCCATCGTCCATTCTGCATCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCTCCGCTCCCGCC
CTACACCACACACCCACCGCGAC