Map Locations of contig_56308 (3955 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_56308

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69359 8 3424 bp MLOC_69359.6 Available Available LOC_Os07g01940.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-26, 13107.m00116 protein sister chromatid cohesion 2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_69359






Contig Sequence (3955 bp)

>contig_56308 3955 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATATATATATATATATATATACTTTCGTGTTCTTGGGGACTCGGGGGCATATATTGGACC
TTTTCATTTCCTTCAAAACAAGGACGAAAATTTATTATCCATGCTTTCCTGGATGTACTA
ATTTAGTGCTTCATCTGTGCTGACCATTTGATGGTTTGATTAAATTATGTGTGTACAGTG
CAGATTAGCATTTAATACCTGTATGTACTAATTTAGTGCTTTAGTCGTGGTGACCATTTA
GTGGTTACTGAACTGATCTGTCATGATTAAATTATGTCCGTACATAACAGACTAGCATTT
AATAAATTCTCTGTTGGTGAAATCTAGGAGATGAAGATGAAGAAGACATGTAAAATGAAC
CAGCTAGCAACTGCTTCTGATTTAAGTGCGAGGAAATCTCCTGCAAACAAGTACATGATT
AATCTATGCTTGATTATTTTCCTTTCTCTAGCTTTTTATGAAGTGTTTATGGGGAACTAA
TACAGTTCAATTATCTTTTTCTTTGTCAGAATTTCTGCTTCTATATATTCTGCTGTGCGG
AAACTATGCTTGATATTGGACTTCCTTAAAGAACTCCTCACAACGGTGGGTCAGATAGTT
GTATCCTGCAATTAGCGAAAACCTGCTTTTCTACATTCTTGGTGGACAATGTGCAGCCTT
TTACAACTGAAGGCAATCGGTGTTATTTGCACGGTAGATCTTTGATTATTGACTCGACAA
TTTCCCACCTCTTCAGTTGCCCAAATAATTTCCTTCCTCACTTTCAATTCTTGCACAGGT
TTTTTCATCATACACACAACATAGGAGTTACTTGGTTGATGAAACACTTAATCTTGTCCG
CAAGTTACAGTTTTCCAAAAATGCTATTAGAACATCGCTAGTTGGAAGGCATCCTAATTC
ACTTGGTTCAGTGCAAATGTTCACTTGGAAGGCTAGCTTGAGAGAAAATTCTCCTGTAAT
AAGAGTAAAGGCCTTATGAGCGGTGAGTATGCATTAACCTTTAAAACTACATATGATGTG
TATCATTCTCATTTGGACATCAGACATCGCTAGTTAGCCTTAATTCTTTGTAGGTCAGCA
GTTAGTTGAAGGCTTGAAGCTGATCCTGAGGTATTAGGTGACAAACGTGTCCAATCTGCT
GTTGAAGGAAGTCTTGTGATTCAGCTATTTCTGTTCGTGAAGCTGCACTCGAGCTTGTTG
GAAGGCATATTGCTTCACACCCTGATCCTGAAGGTTGGTAGACTTATGAAGTTACCTTAT
GAGTTATGACATGGTCTTGGGTGTTGTTATTGCTTTTCTGCGACTAACTTTTTTATCTTT
CCATCACAGTATATTGAAAAAGTCACTGAACGGACAAAGGACACTGGAGTAAGTGTTCGC
AAACGTGTGATCAATAGTATCCGTGATCTTTGTGCTTCAAGTCGGAATGCGGATACAAGA
TATGCCTTTGTGGAGATTATTTCGTGTGTTAATGACGAGGAGTCAAGTGTGCAGGTAAAA
GTTTATGTATCAAACCATTAACTGGTGCTCCTGAGTCATGGCACCACATTATCATAGCAG
ACTTGATATTGTACTAGAGATGTTTCATTTATTGTTGTTTTCTTCAGTGCGGTGTATGTT
GGTGCATGAACTGAAACAATCTGTATAGCTGGAAAAAAATAGTGGAAGTTAGCTAGTTCC
TCTGTGAAATCCCCTTACATTTGCAAAATAAAAAATTATCCTTATCAGCAAAATTGTATA
TTTATTACATAAAGCAAATGATTGGAATTCTTTACACATGAAATCTCCTTTGTGTCTCTT
ATAGGGTTTTAAGCCCCCCCCCCCCTGCATAATTGACTTTGGTTCTTAACCATGTTTGTT
GTCAAGGTTAAGGGAACTGATAATGAGACAAAAATCCACACGCTTTCTTATGTTCTTGTC
TTGCAAGCATTTTGTATTGTCGATCCCACACTCTGCACTCCAGTAACCGATCCTTCTCAA
TTTGCTGTGACACTTCAACTGTACCTTAAGAATAAGGTGAGCACGAGTTTCTTTCTCTTG
GAACTATGTGCTGTCGTCCTGTAAAAGTAATTTATGCTTATATTACATAAACTTCTTATA
GCACATTCCAGGAGCGAAGATAATGGGTGGTTAGGTAGCATAAGGGAAAAAAAGTTATGA
GATTTCTGGCTATGTTTGTCATGTCCGCACAGAGGAGGGCCTGAGTGGTGACAGTTAAAG
TGGGATAAGTTTTTATTAGAAAGATGGGGTTATACATTAGGGCATCTCCAATGATCGTAT
GATCATCGTTGGTAAAATTGCCACATAGATGATTTTGATGACATGGCGTATAATAAAGAA
GAGAGAGAACGGCATCGTATGAACTTGAAGCAACGGTTCACGCACAAGCTCCGAGGCAAG
CATGGTTATTTTTTCAATATTTAGCGGACCCTCTTAATTATTTTACATACAATTAACATA
CACTTCATTGAAGAGCTTGTATGATATGTTGTTGGTTGTTGACGTGGACACTTATACGAA
CGGTTGAACATACGGACTGTTGGAGATGCTCTTATAGACTGAGATGCGAGAAAGAACAAT
TCGTTGTTTTTGCTTAATACCTATTCTTATTCCAGTCTGTTGCAGCCCTCTCATGTCACT
TGCATCAGTTGCATCAGGGTTAGGCATGCACATGGACCAAGAGGTTATATGATTTTTGTC
TTCTGATTCGCTTGGATCTGCTTATTACTTTCCTTTTGATGGACAATACTGAAAGTCATT
GATATTTCTGACCATAGATTTGGACCTGAAAGCCATTGATATTTCTTTTCTTAGCTGTGG
ACCTGAAAGCCATGTTGCCAGTTTAACAACCTGTAGTTCTTTTTGTTGTTGCTGCCAAAA
TCGGCCAAAACATTGGCAGCCAATATTTTTGTTGGGGTTGCCTTGGGCTCAAGCAAAACA
TACCGTATATTTTAGCTCCTCACATGCAATTTTGATGCATGGGTAATTCCTGCTCGTTCT
TTCTGATGGCCAGGGTTCACCCATGCTCTGTTGCTGGACAAGTGCATATGCCTTCCGCAT
TTCACTGTTGTTTCATGTTCAAGGATCGACAATCTCCACTCACAGGAGTATCCCTGGCTG
CGTTATCTTTGTGATGATTCTTAGAAGTGCAGGGATGCGGAGGGTCTTCAGGCCACTGGC
ATTGGGGTGTACATCAGGAGAAACCTTGATAGCATGGATTACTTCCATCATGATACAAGC
ATCGGCCCCACAAGCATCTTCAGCCTTCCAGGCAGAAGCCAATATCCTTCTGATCAGTGC
CTAACTTTCCATGGTAACTAGGTTCTTGCGGTGGCGGCCGCCAGGAAATTAGACCATCCA
CTGATGCGTTGGGACACTAGGGATATAATTGCAAATTTTCTCCAAGCCACTCGTACAGCT
TTAGTGCACATATTTCATCAAGAGGGAGCTCAATGGTGTGGCAAATAACTGTGCACAACA
GGTTCTAAGGCGAAGCCTTGATCAATACTTATGCTCTAATTCAGCCCATTTCTCAACATG
TTGTCCTGTTCTGCTTGCTCTTCAGTCTGCTACTCCATTGCACAGCATTGTAATAAACGA
TGTATTATGTTGTAGAGTTGAATGCAATGTGGCACCCCTGGCGCCCGTGCTGTTCAAAAA
GAAAAAGAAAAGAAAAATCCCCATGAGTGGCTTCCTTGTGCAAGTTATTTAGTTTTGTGT
GTGTCAATGGTGCTTGAGAGCATCTCTTCTGCCGTCTGTCGTGGTAATTTTGCAGAAAAT
CCCTTGTGTTTTGTTGAAATAAACCCGCAGTCCTTCATTAAGTGGAAAAAAAACCTTGTT
CCGTTACCTCCGTCTTCCCCATCCCGCAGACCTTGTGCCCCCTTCGTATCCAGATCGAAC
TAGAGAGAGAAGAAGAGGGGAGCCCCCGCCAAGCGCCCCCCCCTCCCCCCCCCCC